Ортобунявирус - Википедия - Orthobunyavirus

Ортобунявирус
Структура ортобунявируса (слева); трансмиссионная электронная микрофотография из Вирус калифорнийского энцефалита (верно)
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область:	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Негарнавирикота
Учебный класс:	Ellioviricetes
Заказ:	Буньявиралес
Семья:	Peribunyaviridae
Род:	Ортобунявирус
Типовой вид
Ортобуньявирус Буньямвера
Разновидность[1]
см текст

Ортобунявирус это род из Peribunyaviridae семья^[2] в порядке Буньявиралес. В настоящее время известно около 170 вирусов этого рода. Всего насчитывается 97 видов.^[1] и 20 серогрупп.

Название Ортобунявирус происходит от Буньямвера, Уганда,^[3] где оригинал типовой вид Ортобуньявирус Буньямвера был впервые обнаружен,^[4] вместе с префиксом Ортопеды (ορϑοϛ), что означает «прямой».^[5]

В типовой вид является Ортобуньявирус Буньямвера.

Эпидемиология

Наиболее разнообразен род по Африка, Австралия и Океания, но встречается почти во всем мире. Самый ортобуньявирус разновидность передаются комары и вызывают болезни крупный рогатый скот.^{[нужна цитата ]} В Вирус калифорнийского энцефалита, то Вирус Ла Кросса и Вирус Джеймстаунского каньона находятся североамериканский виды, которые вызывают энцефалит в людях.

Вирусология

Геном Вирус Буньямвера рода Ортосбуниавирус^[3]

• Типовой вид Ортобуньявирус Буньямвера.^[6]
• Вирус имеет сферическую форму, диаметр от 80 до 120 нм, и состоит из трех одноцепочечных молекул РНК с отрицательным смыслом, инкапсулированных в рибонуклеокапсид.^[7]
• Три РНК обозначены как S, M и L (для малых, средних и больших) и имеют длину около 1 килобаз, 4,5 и 6,9 килобайт.^[8][7][9]
• S-РНК кодирует белок нуклеокапсида (белок N) и неструктурный белок (белок NS).^[10]
• М РНК кодирует полипротеин, который расщепляется протеазой хозяина на белки Gn, NSm и Gc.^[7]
• L-РНК кодирует вирусную РНК-зависимую РНК-полимеразу или L-белок.^[11]

Жизненный цикл

Векторы

Первичные переносчики ортобуньявирусов: гематофаг насекомые Culicidae семья, в том числе представители ряда родов комаров (в том числе Aedes, Coquillettidia, Culex, Кулисета, и Анофелес ) и мокрецов (таких как Куликоидес параенсис ).^[12][9] Хотя также возможна передача клещами и постельными клопами. Предпочтение вирусных векторов обычно строгое, только один или очень небольшое количество векторов передают конкретный вирус в регионе, даже если несколько вирусов и векторов перекрываются.^[13] Организмы, относящиеся к предпочтительному переносчику, могут переносить вирус, но не могут передавать его компетентно.^[9]

Членистоногие-переносчики заражаются вирусом, питаясь кровью инфицированного хозяина. У комаров репликация ортобуньявирусов усиливается за счет иммуномодуляции, которая возникает в результате переваривания белков крови, производящих ГАМК и активация ГАМКергической передачи сигналов.^[14] Инфекция передается новому хозяину через вирусные частицы в слюне переносчиков.^[14] Ортобунявирусная инфекция в членистоногие клетки до конца не изучены, но обычно не являются цитопатологическими и вредные эффекты минимальны.^[15][13] Зараженные комары могут улучшить физическую форму.^[13] Трансорвариальная передача наблюдалась среди москитов, инфицированных ортобуньявирусами калифорнийской серогруппы.^[9] Подобно комарам, кровью питаются только самки куликоидных мошек; они предпочитают кормление в помещении, особенно во время дождя.^[9]

Хосты Sylvatic Cycle

в сливатический цикл, вирусы передаются между млекопитающими-хозяевами посредством членистоногих векторов. В качестве хозяев или резервуаров ортобуньявирусов был идентифицирован широкий круг млекопитающих, включая приматов, ленивцев, диких и домашних птиц, мартышек, грызунов и крупных млекопитающих, таких как олени, лоси и лоси.^[12][9]

Инфекционное заболевание

Заражение начинается с укуса инфицированного компетентного переносчика. Проникновение вируса происходит посредством рецептор-опосредованного (клатрин-зависимого) эндоцитоза, но рецепторы неизвестны.^[15] Несмотря на то что, Гепаран сульфат и DC-SIGN (CD209 или Дендритная клетка -специфическая молекула внутриклеточной адгезии -3-захватывающий неинтегрин) были идентифицированы как компоненты проникновения вируса в некоторых ортобуньявирусах.^[13][15] Гетеродимеры Gn / Gc на вирусной поверхности ответственны за распознавание клеток-мишеней^[16], с Gc считается первичным белком прикрепления, хотя Gn был предложен как белок прикрепления для LACV в клетках членистоногих.^[13] Подкисление эндосомы запускает конформационные изменения в пептиде слияния Gc, освобождая рибонуклеарный белок (RNP), когда он высвобождается в цитоплазму.^[16]

После высвобождения в цитоплазму первичная транскрипция начинается с того, что эндонуклеазный домен на L-белке участвует в процессе, известном как «захват крышки».^[13][16] Во время захвата кэпа 10-18 нуклеотидов 5'-7-метилгуанилатных праймеров отщепляются от мРНК хозяина и прикрепляются к 5'-концу вирусных РНК.^[9] Как и все РНК-вирусы с отрицательным смыслом, ортобуньявирусы требуют непрерывной параллельной трансляции клеткой-хозяином для получения полноразмерных вирусных мРНК, следовательно, на 3'-конце мРНК ортобуньявируса отсутствует полиаденилирование.^[9] Примечательно, что у них также отсутствует сигнал полиаденилирования; вместо этого считается, что 3'-концы образуют структуру стержень-петля.^[9][13] Антигеномы (полная длина положительный-смысловые РНК), используемые в качестве матриц для репликации вирусного генома, продуцируются L-белком RdRp без необходимости использования праймеров.^[9] Как геномы с отрицательным смыслом, так и антигеномы с положительным смыслом связаны с N белками (образующими RNP) на всех этапах цикла репликации.^[17] Таким образом, N и L - это минимальные белки, необходимые для транскрипции и репликации.^[16][13]

Сегмент генома М кодирует полипротеин Gn-NSm-Gc на единственной открытой рамке считывания (ORF), кото-рый котрансляционно расщепляется внутренними сигнальными пептидами и сигнальной пептидазой хозяина.^[16][9] Свободные гликопротеины Gc и Gn вставляются в мембрану эндоплазматического ретикулума и образуют гетеродимеры. Сигнал удержания Гольджи на Gn позволяет транспортировать гетеродимеры к аппарату Гольджи, где происходит гликозилирование. Присутствие вирусных гликопротеинов модифицирует мембрану Гольджи, позволяя отрастать РНП в производную Гольджи трубчатую вирусную фабрику (вироплазма ).^[15][9] Ортобуйнавирусы, как сегментированные вирусы, требуют точной упаковки одного из трех геномных сегментов в конечный вирион для образования зрелой инфекционной частицы. Кажется, что упаковка направляется сигналами, полностью содержащимися в последовательностях UTR.^[13] Упакованные геномы приобретают липидную мембрану по мере того, как попадают в вирусные фабрики, затем транспортируются к плазматической мембране клетки-хозяина и высвобождаются посредством экзоцитоза. Последняя модификация гилкопротеина после высвобождения дает зрелую инфекционную частицу.^[13]

Эволюция

Ортобунявирусы частично эволюционируют с помощью ключевого механизма, известного как геномная реассортация, который также имеет место в других сегментированных вирусах. Когда вирусы одной и той же группы одновременно инфицируют клетку-хозяина, могут образовываться смеси и новые комбинации сегментов S, M и L, увеличивая разнообразие. Наиболее частые события перераспределения связаны с сегментами L и S.^[18]

Таксономия

Разновидность

Таксономия остается несколько гибкой, поскольку секвенировано относительно небольшое количество вирусных геномов этого рода. Было показано, что некоторые из перечисленных вирусов являются рекомбинантами других вирусов и могут быть переклассифицированы. В роду 88 видов:^[1]

Организовано по серогруппам

На основании результатов ингибирования перекрестной гемагглютинации и нейтрализации антител были определены 18 серогрупп. Другой - Виемия - с тех пор был признан. Некоторые вирусы еще не отнесены к одной из серогрупп. Серогруппа Симбу является самой крупной и насчитывает не менее 25 членов. Серогруппа группы C состоит как минимум из 13 человек. Важные с медицинской точки зрения вирусы принадлежат к серогруппам Bwamba, Bunyamwera, California, Group C и Simbu.

Рекомендации

внешняя ссылка

• Отчет ICTV: Peribunyaviridae
• Viralzone: Ортобунявирус