SAP30 - SAP30

SAP30
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2КДП
Идентификаторы
Псевдонимы	SAP30, Sin3A-ассоциированный белок 30
Внешние идентификаторы	OMIM: 603378 MGI: 1929129 ГомолоГен: 2869 Генные карты: SAP30
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 4 (человек)
Конец	173,377,532 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 8 (мышь)
Конец	57,487,860 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность; • связывание ионов металлов; • активность гистондеацетилазы;
Сотовый компонент	• гистондеацетилазный комплекс; • ядро клетки; • нуклеоплазма;
Биологический процесс	• дифференциация клеток скелетных мышц; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • деацетилирование гистонов;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8819
	60406
	ENSG00000164105
	ENSMUSG00000031609
	O75446
	O88574
	NM_003864
	NM_021788
	NP_003855
	NP_068560.1
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Sin3A-ассоциированный белок, 30 кДа, также известен как SAP30, это белок который у человека кодируется SAP30 ген.^[5]

Функция

Гистон ацетилирование играет ключевую роль в регуляции экспрессии эукариотических генов. Ацетилирование и деацетилирование гистонов катализируются многосубъединичными комплексами. Белок, кодируемый этим геном, является компонентом гистоновая деацетилаза комплекс, который включает SIN3A, SAP18, HDAC1, HDAC2, RbAp46, RbAp48 и другие полипептиды. Этот комплекс активен в деацетилировании октамеров коровых гистонов, но неактивен в деацетилировании нуклеосомных гистонов. Псевдоген этого гена расположен на хромосоме 3.^[5]

У млекопитающих есть один паралог SAP30, названный SAP30-like (SAP30L ), который на 70% идентичен последовательностям SAP30.^[6] SAP30 и SAP30L вместе составляют хорошо консервативное семейство белков SAP30. Также SAP30L взаимодействует с несколькими компонентами корепрессорного комплекса Sin3A и вызывает репрессию транскрипции посредством рекрутирования Sin3A и гистоновых деацетилаз.^[7]

Белки семейства SAP30 (белки SAP30) обладают функциональным ядрышковый сигнал локализации, и они способны нацеливать Sin3A на ядрышко.^[7] Белки SAP30 имеют независимый от последовательности контакт с ДНК посредством своего N-концевого цинк-зависимого модуля, а их кислая центральная область вносит вклад во взаимодействия гистонов и нуклеосом. Связывание белков SAP30 с ДНК регулируется ядерными сигнальными липидами, фосфоинозитидами (PI).^[8] Белки SAP30 представляют собой первый пример, в котором ДНК и ИП, по-видимому, находятся во взаимно антагонистических взаимоотношениях в отношении их взаимодействия с цинковый палец белков и, таким образом, иллюстрирует молекулярный механизм того, как эти липиды могут способствовать регуляции генов.^[8]^[9]

Взаимодействия

SAP30 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164105 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031609 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б «Ген Entrez: SAP30 Sin3A-ассоциированный белок, 30 кДа».
^ Линдфорс К., Виири К.М., Нийттинен М., Хейнонен Т.Ю., Мяки М., Кайнулайнен Х. (декабрь 2003 г.). «TGF-бета индуцирует экспрессию SAP30L, нового ядерного белка». BMC Genomics. 4 (1): 53. Дои:10.1186/1471-2164-4-53. ЧВК 319701. PMID 14680513.
^ ^а ^б Виири К.М., Коркеамаки Х., Кукконен М.К., Ниеминен Л.К., Линдфорс К., Петерсон П., Мяки М., Кайнулайнен Х., Лохи О. (2006). «SAP30L взаимодействует с членами корепрессорного комплекса Sin3A и направляет Sin3A на ядрышко». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (11): 3288–98. Дои:10.1093 / нар / gkl401. ЧВК 1500868. PMID 16820529.
^ ^а ^б Виири К.М., Янис Дж., Сиггерс Т., Хейнонен Т.Ю., Вальякка Дж., Булык М.Л., Мяки М., Лохи О. (январь 2009 г.). «ДНК-связывающая и изгибающая активности SAP30L и SAP30 опосредуются цинк-зависимым модулем и монофосфоинозитидами». Молекулярная и клеточная биология. 29 (2): 342–56. Дои:10.1128 / MCB.01213-08. ЧВК 2612513. PMID 19015240.
^ http://acta.uta.fi/teos.php?id=11179
^ ^а ^б Хуан Н.Э., Линь СН, Лин Ю.С., Ю В.К. (июнь 2003 г.). «Модуляция активности YY1 с помощью SAP30». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 306 (1): 267–75. Дои:10.1016 / s0006-291x (03) 00966-5. PMID 12788099.
^ ^а ^б ^c ^d ^е Чжан Ю., Сунь З. В., Иратни Р., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Хэмпси М., Рейнберг Д. (июнь 1998 г.). «SAP30, новый белок, консервативный для человека и дрожжей, является компонентом гистондеацетилазного комплекса». Молекулярная клетка. 1 (7): 1021–31. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80102-1. PMID 9651585.
^ ^а ^б ^c ^d ^е Чжан Ю., Нг Х. Х., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Берд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD показывает основной комплекс гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Гены и развитие. 13 (15): 1924–35. Дои:10.1101 / гад.13.15.1924. ЧВК 316920. PMID 10444591.
^ Суонсон К.А., Ноепфлер П.С., Хуанг К., Кан Р.С., Коули С.М., Лаэрти С.Д., Эйзенман Р.Н., Радхакришнан И. (август 2004 г.). «Репрессоры HBP1 и Mad1 связывают корепрессорный домен PAH2 Sin3 с противоположными спиральными ориентациями». Структурная и молекулярная биология природы. 11 (8): 738–46. Дои:10.1038 / nsmb798. PMID 15235594. S2CID 44324333.
^ ^а ^б Yochum GS, Ayer DE (июль 2001 г.). «Pf1, новый белок цинкового пальца PHD, который связывает корепрессор TLE с комплексом mSin3A-гистондеацетилаза». Молекулярная и клеточная биология. 21 (13): 4110–8. Дои:10.1128 / MCB.21.13.4110-4118.2001. ЧВК 87072. PMID 11390640.
^ ^а ^б ^c ^d ^е ^ж Кузьмичев А., Чжан Ю., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Рейнберг Д. (февраль 2002 г.). «Роль комплекса Sin3-гистондеацетилаза в регуляции роста кандидатом в супрессор опухоли p33 (ING1)». Молекулярная и клеточная биология. 22 (3): 835–48. Дои:10.1128 / mcb.22.3.835-848.2002. ЧВК 133546. PMID 11784859.
^ ^а ^б Лаэрти CD, Биллин А.Н., Лавинский Р.М., Йочум Г.С., Буш А.С., Сан Дж. М., Маллен Т. М., Дэви Дж. Р., Роуз Д. В., Гласс С. К., Розенфельд М. Г., Эйер Д. Е., Эйзенман Р. Н. (июль 1998 г.). «SAP30, компонент корепрессорного комплекса mSin3, участвующий в N-CoR-опосредованной репрессии специфическими факторами транскрипции». Молекулярная клетка. 2 (1): 33–42. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80111-2. PMID 9702189.
^ Андерхилл С., Кутоб М.С., Йи С.П., Торчиа Дж. (Декабрь 2000 г.). «Новый корепрессорный комплекс ядерного рецептора, N-CoR, содержит компоненты комплекса SWI / SNF млекопитающих и корепрессор KAP-1». Журнал биологической химии. 275 (51): 40463–70. Дои:10.1074 / jbc.M007864200. PMID 11013263.
^ Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE (май 2003 г.). «Идентификация и характеристика трех новых компонентов корепрессорного комплекса mSin3A». Молекулярная и клеточная биология. 23 (10): 3456–67. Дои:10.1128 / mcb.23.10.3456-3467.2003. ЧВК 164750. PMID 12724404.

дальнейшее чтение

Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN (март 1995 г.). «Репрессия транскрипции Mad-Max опосредована образованием тройного комплекса с гомологами дрожжевого репрессора Sin3 млекопитающих». Ячейка. 80 (5): 767–76. Дои:10.1016/0092-8674(95)90355-0. PMID 7889570. S2CID 8749951.
Чжан Ю., Иратни Р., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Рейнберг Д. (май 1997 г.). «Гистоновые деацетилазы и SAP18, новый полипептид, являются компонентами комплекса Sin3 человека». Ячейка. 89 (3): 357–64. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80216-0. PMID 9150135.
Чжан Ю., Сунь З. В., Иратни Р., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Хэмпси М., Рейнберг Д. (июнь 1998 г.). «SAP30, новый белок, консервативный для человека и дрожжей, является компонентом гистондеацетилазного комплекса». Молекулярная клетка. 1 (7): 1021–31. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80102-1. PMID 9651585.
Лаэрти CD, Биллин А.Н., Лавинский Р.М., Йочум Г.С., Буш А.С., Сан Дж. М., Маллен Т. М., Дэви Дж. Р., Роуз Д. В., Гласс С. К., Розенфельд М. Г., Эйер Д. Е., Эйзенман Р. Н. (июль 1998 г.). «SAP30, компонент корепрессорного комплекса mSin3, участвующий в N-CoR-опосредованной репрессии специфическими факторами транскрипции». Молекулярная клетка. 2 (1): 33–42. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80111-2. PMID 9702189.
Чжан Ю., Лерой Г., Силиг Х.П., Лейн В.С., Рейнберг Д. (октябрь 1998 г.). «Специфический для дерматомиозита аутоантиген Mi2 является компонентом комплекса, содержащего гистондеацетилазу и активность ремоделирования нуклеосом». Ячейка. 95 (2): 279–89. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81758-4. PMID 9790534. S2CID 18786866.
Тонг Дж. К., Хассиг Калифорния, Шницлер Г. Р., Кингстон Р. Э., Шрайбер С. Л. (октябрь 1998 г.). «Деацетилирование хроматина АТФ-зависимым комплексом ремоделирования нуклеосом». Природа. 395 (6705): 917–21. Дои:10.1038/27699. PMID 9804427. S2CID 4355885.
Се Дж. Дж., Чжоу С., Чен Л., Янг Д. Б., Хейворд С. Д. (январь 1999 г.). «CIR, корепрессор, связывающий фактор связывания ДНК CBF1 с комплексом гистондеацетилазы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (1): 23–8. Дои:10.1073 / pnas.96.1.23. ЧВК 15086. PMID 9874765.
Бутелл Дж. М., Томас П., Нил Дж. У., Вестон В. Дж., Дуче Дж., Харпер П. С., Джонс А. Л. (сентябрь 1999 г.). «Аберрантные взаимодействия белков-репрессоров транскрипции с продуктом гена болезни Хантингтона, хантингтином». Молекулярная генетика человека. 8 (9): 1647–55. Дои:10.1093 / hmg / 8.9.1647. PMID 10441327.
Чжан Ю., Нг Х. Х., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Берд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD показывает основной комплекс гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Гены и развитие. 13 (15): 1924–35. Дои:10.1101 / гад.13.15.1924. ЧВК 316920. PMID 10444591.
Критивас А., Янг Д. Б., Ляо Дж., Грин Д., Хейворд С. Д. (октябрь 2000 г.). «Человеческий герпесвирус 8 LANA взаимодействует с белками корепрессорного комплекса mSin3 и отрицательно регулирует экспрессию гена вируса Эпштейна-Барра в дважды инфицированных клетках PEL». Журнал вирусологии. 74 (20): 9637–45. Дои:10.1128 / JVI.74.20.9637-9645.2000. ЧВК 112396. PMID 11000236.
Андерхилл С., Кутоб М.С., Йи С.П., Торчиа Дж. (Декабрь 2000 г.). «Новый корепрессорный комплекс ядерного рецептора, N-CoR, содержит компоненты комплекса SWI / SNF млекопитающих и корепрессор KAP-1». Журнал биологической химии. 275 (51): 40463–70. Дои:10.1074 / jbc.M007864200. PMID 11013263.
Хамфри Г.В., Ван Й., Руссанова В.Р., Хираи Т., Цинь Дж., Накатани И., Ховард Б.Х. (март 2001 г.). «Стабильные гистоновые деацетилазные комплексы, отличающиеся наличием белков домена SANT CoREST / kiaa0071 и Mta-L1». Журнал биологической химии. 276 (9): 6817–24. Дои:10.1074 / jbc.M007372200. PMID 11102443.
Сковира Д., Зеремский М., Незнанов Н., Ли М., Чой Й, Уэсуги М., Хаузер К.А., Гу В., Гудков А.В., Цинь Дж. (Март 2001 г.). «Дифференциальная ассоциация продуктов альтернативных транскриптов кандидата опухолевых супрессоров ING1 с транскрипционным корепрессорным комплексом mSin3 / HDAC1». Журнал биологической химии. 276 (12): 8734–9. Дои:10.1074 / jbc.M007664200. PMID 11118440.
Yochum GS, Ayer DE (июль 2001 г.). «Pf1, новый белок цинкового пальца PHD, который связывает корепрессор TLE с комплексом mSin3A-гистондеацетилаза». Молекулярная и клеточная биология. 21 (13): 4110–8. Дои:10.1128 / MCB.21.13.4110-4118.2001. ЧВК 87072. PMID 11390640.
Кузьмичев А., Чжан Ю., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Рейнберг Д. (февраль 2002 г.). «Роль комплекса Sin3-гистондеацетилаза в регуляции роста кандидатом в супрессор опухоли p33 (ING1)». Молекулярная и клеточная биология. 22 (3): 835–48. Дои:10.1128 / MCB.22.3.835-848.2002. ЧВК 133546. PMID 11784859.
Сайто М., Исикава Ф. (сентябрь 2002 г.). «MCpG-связывающий домен MBD3 человека не связывается с mCpG, но взаимодействует с компонентами NuRD / Mi2 HDAC1 и MTA2». Журнал биологической химии. 277 (38): 35434–9. Дои:10.1074 / jbc.M203455200. PMID 12124384.
Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W (апрель 2003 г.). «Деацетилаза Sin3 человека и связанная с тритораксом Set1 / Ash2 гистон H3-K4 метилтрансфераза селективно связаны вместе фактором пролиферации клеток HCF-1». Гены и развитие. 17 (7): 896–911. Дои:10.1101 / gad.252103. ЧВК 196026. PMID 12670868.
Хуан Н.Э., Линь СН, Лин Ю.С., Ю В.К. (июнь 2003 г.). «Модуляция активности YY1 с помощью SAP30». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 306 (1): 267–75. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00966-5. PMID 12788099.
Сирони Э., Черри А., Томазини Д., Сирчия С. М., Порта G, Росселла Ф., Грати Ф. Р., Симони Дж. (Апрель 2004 г.). «Потеря гетерозиготности по хромосоме 4q32-35 в спорадических базальноклеточных карциномах: доказательства участия генов p33ING2 / ING1L и SAP30». Журнал кожной патологии. 31 (4): 318–22. Дои:10.1111 / j.0303-6987.2004.0187.x. PMID 15005689. S2CID 2520678.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164105 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031609 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] а ^б «Ген Entrez: SAP30 Sin3A-ассоциированный белок, 30 кДа».

[pmid14680513-6] Линдфорс К., Виири К.М., Нийттинен М., Хейнонен Т.Ю., Мяки М., Кайнулайнен Х. (декабрь 2003 г.). «TGF-бета индуцирует экспрессию SAP30L, нового ядерного белка». BMC Genomics. 4 (1): 53. Дои:10.1186/1471-2164-4-53. ЧВК 319701. PMID 14680513.

[pmid16820529-7] а ^б Виири К.М., Коркеамаки Х., Кукконен М.К., Ниеминен Л.К., Линдфорс К., Петерсон П., Мяки М., Кайнулайнен Х., Лохи О. (2006). «SAP30L взаимодействует с членами корепрессорного комплекса Sin3A и направляет Sin3A на ядрышко». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (11): 3288–98. Дои:10.1093 / нар / gkl401. ЧВК 1500868. PMID 16820529.

[pmid19015240-8] а ^б Виири К.М., Янис Дж., Сиггерс Т., Хейнонен Т.Ю., Вальякка Дж., Булык М.Л., Мяки М., Лохи О. (январь 2009 г.). «ДНК-связывающая и изгибающая активности SAP30L и SAP30 опосредуются цинк-зависимым модулем и монофосфоинозитидами». Молекулярная и клеточная биология. 29 (2): 342–56. Дои:10.1128 / MCB.01213-08. ЧВК 2612513. PMID 19015240.

[9] ttp://acta.uta.fi/teos.php?id=11179

[pmid12788099-10] а ^б Хуан Н.Э., Линь СН, Лин Ю.С., Ю В.К. (июнь 2003 г.). «Модуляция активности YY1 с помощью SAP30». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 306 (1): 267–75. Дои:10.1016 / s0006-291x (03) 00966-5. PMID 12788099.

[pmid9651585-11] а ^б ^c ^d ^е Чжан Ю., Сунь З. В., Иратни Р., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Хэмпси М., Рейнберг Д. (июнь 1998 г.). «SAP30, новый белок, консервативный для человека и дрожжей, является компонентом гистондеацетилазного комплекса». Молекулярная клетка. 1 (7): 1021–31. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80102-1. PMID 9651585.

[pmid10444591-12] а ^б ^c ^d ^е Чжан Ю., Нг Х. Х., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Берд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD показывает основной комплекс гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Гены и развитие. 13 (15): 1924–35. Дои:10.1101 / гад.13.15.1924. ЧВК 316920. PMID 10444591.

[pmid15235594-13] Суонсон К.А., Ноепфлер П.С., Хуанг К., Кан Р.С., Коули С.М., Лаэрти С.Д., Эйзенман Р.Н., Радхакришнан И. (август 2004 г.). «Репрессоры HBP1 и Mad1 связывают корепрессорный домен PAH2 Sin3 с противоположными спиральными ориентациями». Структурная и молекулярная биология природы. 11 (8): 738–46. Дои:10.1038 / nsmb798. PMID 15235594. S2CID 44324333.

[pmid11390640-14] а ^б Yochum GS, Ayer DE (июль 2001 г.). «Pf1, новый белок цинкового пальца PHD, который связывает корепрессор TLE с комплексом mSin3A-гистондеацетилаза». Молекулярная и клеточная биология. 21 (13): 4110–8. Дои:10.1128 / MCB.21.13.4110-4118.2001. ЧВК 87072. PMID 11390640.

[pmid11784859-15] а ^б ^c ^d ^е ^ж Кузьмичев А., Чжан Ю., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Рейнберг Д. (февраль 2002 г.). «Роль комплекса Sin3-гистондеацетилаза в регуляции роста кандидатом в супрессор опухоли p33 (ING1)». Молекулярная и клеточная биология. 22 (3): 835–48. Дои:10.1128 / mcb.22.3.835-848.2002. ЧВК 133546. PMID 11784859.

[pmid9702189-16] а ^б Лаэрти CD, Биллин А.Н., Лавинский Р.М., Йочум Г.С., Буш А.С., Сан Дж. М., Маллен Т. М., Дэви Дж. Р., Роуз Д. В., Гласс С. К., Розенфельд М. Г., Эйер Д. Е., Эйзенман Р. Н. (июль 1998 г.). «SAP30, компонент корепрессорного комплекса mSin3, участвующий в N-CoR-опосредованной репрессии специфическими факторами транскрипции». Молекулярная клетка. 2 (1): 33–42. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80111-2. PMID 9702189.

[pmid11013263-17] Андерхилл С., Кутоб М.С., Йи С.П., Торчиа Дж. (Декабрь 2000 г.). «Новый корепрессорный комплекс ядерного рецептора, N-CoR, содержит компоненты комплекса SWI / SNF млекопитающих и корепрессор KAP-1». Журнал биологической химии. 275 (51): 40463–70. Дои:10.1074 / jbc.M007864200. PMID 11013263.

[pmid12724404-18] Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE (май 2003 г.). «Идентификация и характеристика трех новых компонентов корепрессорного комплекса mSin3A». Молекулярная и клеточная биология. 23 (10): 3456–67. Дои:10.1128 / mcb.23.10.3456-3467.2003. ЧВК 164750. PMID 12724404.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]