Sphingomonadaceae - Википедия - Sphingomonadaceae

Sphingomonadaceae
Культура
А культура из Sphingomonas phyllosphaerae
Научная классификация е
Домен:Бактерии
Тип:Протеобактерии
Учебный класс:Alphaproteobacteria
Заказ:Sphingomonadales
Семья:Sphingomonadaceae
Косако и другие. 2000
Роды[1]

Sphingomonadaceae площадь грамотрицательные бактерии l семья Alphaproteobacteria. Важная особенность - наличие сфинголипиды (в основном 2'гидроксимиристол дигидросфингозин-1-глюкуроновая кислота, «SGL-1») во внешней мембране клеточной стенки.[2][3] Клетки имеют яйцевидную или палочковидную форму. Другие тоже плеоморфный, т.е. клетки меняют форму со временем. Некоторые виды из семейства Sphingomonadaceae являются доминирующими компонентами биопленок.[4][5][6]

Подразделение

Всего восемнадцать родов Sphingomonadaceae: Aestuariisphingobium, Allosphingosinicella, Aquisediminimonas, Бластомонады, Чакрабартия, Гефестия, Новосфингопиксис, парабластомонас, парасфингопиксис, ризорабдус, ризорапис, Сфингобиум, Сфингомикробий, Сфингомонады, Сфингопиксис, Sphingorhabdus, Sphingosinithalassobacter и Stakelama.[7]

Энергетический ресурс

Хотя большинство видов семейства Sphingomonadaceae являются гетеротрофными,[8] некоторые фототрофный.

Функция

Известно, что некоторые виды Sphingomonadaceae разлагают некоторые ароматические соединения. Это делает бактерии интересными для восстановление окружающей среды.[9]

Разнообразная метаболическая способность родов в пределах Sphingomonadaceae семья, например Сфингобиум, Новосфингобиум, и Сфингопиксис позволяют этим родам адаптироваться и быть многочисленными в присутствии Бисфенол А. Сообщество микробов с многочисленными Sphingomonadaceae члены могут деградировать Бисфенол А с постоянной скоростью.[10]

Род Sphingomonas Sphingomonadaceae способен производить сфинганов, своего рода экзополисахариды с определенными вязкость. Это свойство сфинганов делает его полезным во многих отраслях промышленности, включая пищевую и фармацевтическую.[11][8]

В Zymomonas рода Sphingomonadaceae являются факультативно анаэробными, этанологенными и ферментативными.[12] Zymomonas mobilis оказались более эффективными в переваривании глюкозы и производстве этанола по сравнению с Saccharomyces cerevisiae,[13] вид дрожжей, который используется в ферментационной и пищевой промышленности.[14] Хотя такие характеристики, как высокая скорость ферментации этанола, высокая толерантность к этанолу и широкая толерантность к pH, делают Zymomonas ферментативным агентом в некоторых отраслях промышленности,[15][12] он также может вызвать порчу пива и сидра.[15] Производство Сероводород и Ацетальдегид Zymomonas увеличивают мутность и могут вызывать у пива неприятный запах.[15][16]

Распределение

Бактерии семейства Sphingomonadaceae распространены в различных средах, таких как вода,[5] почва,[17][18] осадок.[8][19]

Взаимодействие с человеком и растениями

Некоторые члены семейства Sphingomonadaceae обычно существуют в среде, подвергшейся воздействию человека, включая системы питьевой воды,[20][5] больничная и бытовая водопроводная вода,[21] и медицинские приборы.[22][23][24]

Известно, что большинство видов семейства Sphingomonadaceae не вредны для человека или растений.[8] Некоторые виды могут защитить растения от болезнетворных патогенов, таких как Thielaviopsis basicola, и Rhizoctonia solani AG2-2IIIB.[8][18][17][25]

В Сфингомонады и Сфингобиум роды, как правило, имеют более высокие устойчивость к антибиотикам по сравнению с тремя другими родами семейства Sphingomonadaceae: Новосфингобиум, Сфингопиксис, и Бластомонады.[5] 

Рекомендации

  1. ^ "Sphingomonadaceae". Таксономия NCBI. Bethesda, MD: Национальный центр биотехнологической информации.. Получено 13 мая 2019.
  2. ^ Гаррити GM, Бреннер DJ, Krieg NR, Staley JR, ред. (2005). Руководство Берджи по систематической бактериологии. Два Proteobacteria, Часть C: Альфа-, Бета-, Дельта- и Эпсилонпротеобактерии. Нью-Йорк, Нью-Йорк: Springer. ISBN  978-0-387-24145-6.
  3. ^ Икуширо Х., Ислам ММ, Тодзё Х., Хаяши Х. (август 2007 г.). «Молекулярная характеристика мембран-ассоциированных растворимых серин-пальмитоилтрансфераз из Sphingobacterium multivorum и Bdellovibrio stolpii». Журнал бактериологии. 189 (15): 5749–61. Дои:10.1128 / JB.00194-07. ЧВК  1951810. PMID  17557831.
  4. ^ de Vries HJ, Beyer F, Jarzembowska M, Lipińska J, van den Brink P, Zwijnenburg A, et al. (2019-01-25). «Sphingomonadaceae из загрязненных мембран». Биопленки и микробиомы NPJ. 5 (1): 6. Дои:10.1038 / s41522-018-0074-1. ЧВК  6347639. PMID  30701078.
  5. ^ а б c d Ваз-Морейра I, Нунес О.К., Манайя К.М. (август 2011 г.). «Разнообразие и паттерны устойчивости к антибиотикам изолятов Sphingomonadaceae из питьевой воды». Прикладная и экологическая микробиология. 77 (16): 5697–706. Дои:10.1128 / AEM.00579-11. ЧВК  3165245. PMID  21705522.
  6. ^ Ли Л., Чон И, Ли Ш., Рю Х, Санто-Доминго Дж. В., Со И (июль 2019 г.). «Динамика физико-химической и общинной структуры биопленок под влиянием органического вещества водорослей и гуминовых веществ». Водные исследования. 158: 136–145. Дои:10.1016 / j.watres.2019.04.014. ЧВК  6563348. PMID  31026675.
  7. ^ «LPSN - Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре».
  8. ^ а б c d е Глэзер С.П., Кемпфер П. (2014). «Семья Sphingomonadaceae». В Rosenberg E, DeLong EF, Lory S, Stackebrandt E (ред.). Прокариоты. Прокариоты: Alphaproteobacteria и Betaproteobacteria. Берлин, Гейдельберг: Springer. С. 641–707. Дои:10.1007/978-3-642-30197-1_302. ISBN  978-3-642-30197-1.
  9. ^ Balkwill DL, Fredrickson JK, Romine MR (12 октября 2006 г.). «Сфингомонады и родственные им роды». Прокариоты, Справочник по биологии бактерий. Том 7: Протеобактерии: подклассы Delta и Epsilon. Глубоко укоренившиеся бактерии. ISBN  978-0-387-33493-6.
  10. ^ Oh S, Choi D (апрель 2019). «Сообщество микробов усиливает биодеградацию бисфенола А посредством отбора Sphingomonadaceae». Микробная экология. 77 (3): 631–639. Дои:10.1007 / s00248-018-1263-4. PMID  30251120. S2CID  52811122.
  11. ^ Ли Х, Цзяо Х, Сунь И, Сунь С, Фэн З, Чжоу В, Чжу Х (ноябрь 2016 г.). «Приготовление и характеристика нового сфингана WL из морских Sphingomonas sp. WG». Научные отчеты. 6 (1): 37899. Bibcode:2016НатСР ... 637899Л. Дои:10.1038 / srep37899. ЧВК  5121650. PMID  27883073.
  12. ^ а б Ян С., Фей К., Чжан И, Контрерас Л. М., Уттуркар С. М., Браун С. Д. и др. (Ноябрь 2016 г.). «Zymomonas mobilis как модельная система для производства биотоплива и биохимических продуктов». Микробная биотехнология. 9 (6): 699–717. Дои:10.1111/1751-7915.12408. ЧВК  5072187. PMID  27629544.
  13. ^ Конвей Т. (сентябрь 1992 г.). «Путь Энтнера-Дудорова: история, физиология и молекулярная биология». Обзор микробиологии FEMS. 9 (1): 1–27. Дои:10.1111 / j.1574-6968.1992.tb05822.x. PMID  1389313.
  14. ^ Перес-Торрадо Р., Керол А (2016). «Оппортунистические штаммы Saccharomyces cerevisiae: потенциальный риск, продаваемый в пищевых продуктах». Границы микробиологии. 6: 1522. Дои:10.3389 / fmicb.2015.01522. ЧВК  4705302. PMID  26779173.
  15. ^ а б c Янасэ Х (01.01.2014). «Зимомонас». В Batt CA, Tortorello ML (ред.). Энциклопедия пищевой микробиологии. Энциклопедия пищевой микробиологии (второе издание). Оксфорд: Academic Press. С. 856–863. Дои:10.1016 / b978-0-12-384730-0.00365-7. ISBN  978-0-12-384733-1.
  16. ^ Харрисон Массачусетс (01.01.2009). «Пиво / Пивоварение». В Schaechter M (ред.). Энциклопедия микробиологии (Третье изд.). Оксфорд: Academic Press. С. 23–33. Дои:10.1016 / b978-012373944-5.00117-6. ISBN  978-0-12-373944-5. Отсутствует или пусто | название = (помощь)
  17. ^ а б Киселкова М., Альмарио Дж., Копецки Дж., Сагова-Маречкова М., Хаурат Дж., Мюллер Д. и др. (Август 2014 г.). «Оценка ризобактериальных показателей подавления черной корневой гнили табака на фермерских полях». Отчеты по экологической микробиологии. 6 (4): 346–53. Дои:10.1111/1758-2229.12131. PMID  24992533.
  18. ^ а б Гомес Экспосито Р., де Брюйн И., Постма Дж., Рааймейкерс Дж. М. (18 декабря 2017 г.). «Текущее понимание роли ризосферных бактерий в почвах, подавляющих болезни». Границы микробиологии. 8: 2529. Дои:10.3389 / fmicb.2017.02529. ЧВК  5741648. PMID  29326674.
  19. ^ Jin L, Ko SR, Jin CZ, Jin FJ, Li T, Ahn CY, Oh HM, Lee HG (01.08.2019). «Описание новых членов семейства Sphingomonadaceae: Aquisediminimonas profunda gen. Nov., Sp. Nov. И Aquisediminimonas sediminicola sp. Nov., Выделенных из пресноводных отложений». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 69 (8): 2179–2186. Дои:10.1099 / ijsem.0.003347. PMID  31204973.
  20. ^ Ли Д., Ли З, Ю Дж, Цао Н, Лю Р., Ян М. (ноябрь 2010 г.). «Характеристика структуры бактериального сообщества в системе распределения питьевой воды во время появления красной воды». Прикладная и экологическая микробиология. 76 (21): 7171–80. Дои:10.1128 / AEM.00832-10. ЧВК  2976220. PMID  20851995.
  21. ^ Нарцисо-да-Роша К., Ваз-Морейра I, Манайя К.М. (январь 2014 г.). «Генотипическое разнообразие и устойчивость к антибиотикам у Sphingomonadaceae, выделенных из больничной водопроводной воды». Наука об окружающей среде в целом. 466-467: 127–35. Bibcode:2014ScTEn.466..127N. Дои:10.1016 / j.scitotenv.2013.06.109. PMID  23892027.
  22. ^ Сото-Хирон MJ, Rodriguez-R LM, Luo C, Elk M, Ryu H, Hoelle J и др. (Май 2016). Бессер Т.Э. (ред.). «Биопленка на больничных душевых шлангах: характеристика и значение для нозокомиальных инфекций». Прикладная и экологическая микробиология. 82 (9): 2872–2883. Дои:10.1128 / AEM.03529-15. ЧВК  4836434. PMID  26969701.
  23. ^ Поза М., Гайосо С., Гомес М.Дж., Румбо-Феал С., Томас М., Аранда Дж. И др. (2012-08-29). «Изучение бактериального разнообразия в больницах с помощью пиросеквенирования титана GS-FLX». PLOS ONE. 7 (8): e44105. Bibcode:2012PLoSO ... 744105P. Дои:10.1371 / journal.pone.0044105. ЧВК  3430676. PMID  22952889.
  24. ^ Мерик М., Вилке А., Колайли Ф., Явуз С., Вахабоглу Х. (март 2009 г.). «Водная эпидемия Sphingomonas paucimobilis в отделении интенсивной терапии». Журнал инфекции. 58 (3): 253–5. Дои:10.1016 / j.jinf.2009.01.007. PMID  19232740.
  25. ^ Chapelle E, Mendes R, Bakker PA, Raaijmakers JM (январь 2016 г.). «Грибковая инвазия в микробиом ризосферы». Журнал ISME. 10 (1): 265–8. Дои:10.1038 / ismej.2015.82. ЧВК  4681858. PMID  26023875.