Стефан Шустер - Stefan Schuster

Стефан Шустер
Профессор Стефан Шустер.JPG
Родившийся (1961-11-07) 7 ноября 1961 г. (59 лет)
Meissen, Германия
НациональностьНемецкий
Альма-матерБерлинский университет имени Гумбольдта
Известенметаболизм, преобразование сигнала, анализ метаболического контроля, эволюционная теория игр
Научная карьера
УчрежденияЙенский университет
ТезисТеоретические исследования взаимосвязи временной иерархии в ферментативных реакционных системах и принципов оптимизации
Академические консультантыРейнхарт Генрих

Стефан Шустер (родился 7 ноября 1961 г. в г. Meissen ) - немецкий биофизик. Он профессор биоинформатика на Йенский университет.

Жизнь

Стефан Шустер учился биофизика на Университет Гумбольдта в Берлине и написал докторскую диссертацию под руководством проф. Рейнхарт Генрих на кафедре теоретической биофизики Университет Гумбольдта, Берлин (Название: "Теоретические исследования взаимосвязи временной иерархии в ферментативных реакционных системах и принципов оптимизации"). В 2003 году получил звание профессора кафедры биоинформатики Университета Фридриха Шиллера в Йене.

Стефан Шустер - один из представителей Йенского центра биоинформатики (JCB).

Стефан Шустер в настоящее время является редактором Эльзевир журнал Биосистемы.

Его младший брат - постановщик Роберт Шустер.

Исследование

В исследование Стефана Шустера охватывает широкий круг тем в области биоинформатики и системная биология. К ним, среди прочего, относятся:

Стефан Шустер внес значительный вклад в развитие анализ элементарного режима[6][7][8]. С тех пор этот метод широко используется для определения метаболические пути и разнообразные приложения в биотехнология например, расчет оптимальный молярный выход. Шустер и его сотрудники использовали этот метод, например, для анализа пенициллин производство[9] и НАД+ метаболизм[10] а также для прогнозирования жизнеспособности кишечная палочка мутанты[11]. Он участвовал в разработке программного обеспечения для анализа метаболических путей.[12].

Применение интенсивного биохимический Интересен вопрос, действительно ли люди и другие высшие животные мог преобразовать жирные кислоты в сахар. Хотя биохимический учебник знание говорит, что это было бы невозможно, in silico анализирует Кристоф Калета, Стефан Шустер и его коллеги показали, что в принципе существует несколько запутанных маршрутов, на которых глюконеогенез из жирных кислот. Это теоретическое прогноз нашел значительное внимание в онлайн статьи[13][14].

Исследования метаболических путей включают: анализ баланса потоков, который используется, например, для объяснения Эффект варбурга[15].

Книга Рейнхарда Генриха и Стефана Шустера »Регулирование сотовых систем"[16] был рассмотрен Атель Корниш-Боуден[17]. Он написал: "Для обычных читателей было бы большим достижением, если бы такие книги, как эта, могли бы помочь опровергнуть идеи шагов, ограничивающих скорость, которые так долго сбивали с толку биохимическую концепцию метаболизма, не позволяя биотехнологии реализовать многие из обещанных целей. когда генная инженерия впервые стала возможной. Для специалистов, уже озабоченных кинетическим поведением мультиферментных систем, это книга, которая им необходима ".

Рекомендации

  1. ^ Pfeiffer, T .; Шустер, С. (2005). «Теоретико-игровые подходы к изучению эволюции биохимических систем». Тенденции в биохимических науках. 30 (1): 20–25. Дои:10.1016 / j.tibs.2004.11.006. PMID  15653322.
  2. ^ Шустер, С. (1996). «Контрольный анализ в терминах обобщенных переменных, характеризующих метаболические системы». Журнал теоретической биологии. 182 (3): 259–268. Дои:10.1006 / jtbi.1996.0163.
  3. ^ Schuster, S .; Marhl, M .; Хёфер, Т. (2002). «Моделирование простых и сложных колебаний кальция: от одноклеточных ответов до межклеточной передачи сигналов». Европейский журнал биохимии. 269 (5): 1333–1355. Дои:10.1046 / j.0014-2956.2001.02720.x.
  4. ^ Bodenstein, C .; Heiland, I .; Шустер, С. (2012). «Температурная компенсация и вовлечение в циркадные ритмы». Физическая биология. 9 (3): 036011. Дои:10.1088/1478-3975/9/3/036011. ISSN  1478-3967.
  5. ^ Schuster, S .; de Figueiredo, L.F .; Schroeter, A .; Калета, К. (2011). «Сочетание анализа метаболических путей с эволюционной теорией игр. Объяснение возникновения низкоэффективных путей с помощью аналитического подхода к оптимизации». Биосистемы. 105 (2): 147–153. Дои:10.1016 / j.biosystems.2011.05.007.
  6. ^ Schuster, S .; Hilgetag, C .; Woods, J.H .; Фелл, Д.А. (2002). «Пути реакций в биохимических реакционных системах: алгебраические свойства, проверенная процедура расчета и пример из метаболизма нуклеотидов». Журнал математической биологии. 45 (2): 153–181. Дои:10.1007 / s002850200143. ISSN  0303-6812.
  7. ^ Шустер, S; Дандекар, Т; Фелл, Д.А. (1999). «Обнаружение режимов элементарного потока в биохимических сетях: многообещающий инструмент для анализа путей и метаболической инженерии». Тенденции в биотехнологии. 17 (2): 53–60. Дои:10.1016 / S0167-7799 (98) 01290-6.
  8. ^ Schuster, S .; Fell, D.A .; Дандекар, Т. (2000). «Общее определение метаболических путей, полезных для систематической организации и анализа сложных метаболических сетей». Природа Биотехнологии. 18 (3): 326–332. Дои:10.1038/73786. ISSN  1087-0156. PMID  10700151.
  9. ^ Prauße, M.T.E .; Schäuble, S .; Guthke, R .; Шустер, С. (2016). «Расчет различных путей синтеза пенициллина и их молярных выходов». Биотехнологии и биоинженерия. 113 (1): 173–181. Дои:10.1002 / бит. 25694. PMID  26134880.
  10. ^ de Figueiredo, L.F .; Gossmann, T.I .; Ziegler, M .; Шустер, С. (2011). «Анализ пути метаболизма НАД +» (PDF). Биохимический журнал. 439 (2): 341–348. Дои:10.1042 / BJ20110320. ISSN  0264-6021. PMID  21729004.
  11. ^ Stelling, J .; Klamt, S .; Bettenbrock, K .; Schuster, S .; Жиль, Э. (2002). «Структура метаболической сети определяет ключевые аспекты функциональности и регулирования». Природа. 420 (6912): 190–193. Дои:10.1038 / природа01166. ISSN  0028-0836. PMID  12432396.
  12. ^ Камп, А. фон; Шустер, С. (2006). «Metatool 5.0: быстрый и гибкий анализ элементарных режимов». Биоинформатика. 22 (15): 1930–1931. Дои:10.1093 / биоинформатика / btl267. ISSN  1367-4803. PMID  16731697.
  13. ^ Информацияdienst Wissenschaft
  14. ^ Ärztezeitung 2011
  15. ^ Schuster, S .; Boley, D .; Moller, P .; Старк, H .; Калета, К. (2015). «Математические модели для объяснения эффекта Варбурга: обзор, посвященный производству АТФ и биомассы». Сделки Биохимического Общества. 43 (6): 1187–1194. Дои:10.1042 / BST20150153. ISSN  0300-5127. PMID  26614659.
  16. ^ Heinrich, R .; Шустер, С. (1996). Регулирование сотовых систем. Бостон, Массачусетс: Springer США. ISBN  9781461311614. OCLC  840281317.
  17. ^ Корниш-Боуден, А. (1998). "Регулирование сотовых систем, Рейнхарт Генрих и Стефан Шустер, Чепмен и Холл, Нью-Йорк, 1996. 372 стр". Вестник математической биологии. 59 (5): 1027–1028. Дои:10.1016 / S0092-8240 (97) 00050-5.

внешняя ссылка