Sulfobacillus thermosulfidooxidans - Sulfobacillus thermosulfidooxidans

Sulfobacillus thermosulfidooxidans
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Фирмикуты
Учебный класс:
Incertae sedis
Род:
Сульфобациллы
Разновидность:
S. thermosulfidooxidans
Биномиальное имя
Sulfobacillus thermosulfidooxidans
Головачева и Каравайко 1991[1]

Sulfobacillus thermosulfidooxidans это разновидность из бактерии из род Сульфобациллы. Это ацидофильный, миксотрофный умеренно теплолюбивый, Грамположительный, спорулирующий факультативный анаэроб. Как следует из названия, он способен окисляющий сера.[2][3][4]

Таксономия

S. thermosulfidooxidans, а также род Сульфобациллы, были впервые описаны в 1978 г. на основе изолятов из Казахстан.[5][1] S. thermosulfidooxidans это типовой вид рода.[1] Таксономическое положение этого рода неопределенное,[3][1] вероятно, относится к роду Thermaerobacter и, возможно, представляет собой глубокую ветвь Фирмикуты или отдельный филюм.[3][6]

Распространение и экология

S. thermosulfidooxidans широко распространен как в натуральном, так и в искусственном кислый среды, в том числе горячие источники и кислотный дренаж шахты. Штаммы были изолированы от множества мест, включая Китай,[7] Чили,[4] Казахстан,[5] Калифорния,[2] и Замбия.[7] По сравнению с другими бактериями, часто встречающимися в аналогичной среде, Сульфобациллы виды обычно присутствуют в относительно низкой численности.[2][7]

Рост и метаболизм

S. thermosulfidooxidans является ацидофильный и умеренно теплолюбивый; в то время как разные штаммы немного отличаются pH и оптимальные температуры роста, все предпочитают среду около pH 2,0 с оптимальной температурой роста от 45 ° C до 55 ° C.[5][8][3][4] S. thermosulfidooxidans является утюг - и сера -окислитель, способный окислять элементарную серу, тетратионат, и сульфиды.[2]

Геном

В геномы из нескольких S. thermosulfidooxidans штаммы были секвенированы, демонстрируя размер генома 3,2-3,9 мегабазы, с Содержимое GC 48-49%[4][2][3][7] и ряд биоинформатически определенный гены, кодирующие белок в диапазоне от около 3200[3] до максимума около 3900.[2] Все секвенированные геномы содержат большое количество гены связана с сера окисление; например, гены, кодирующие редуктаза сероксигеназы (SOR) и гетеродисульфидредуктаза -подобно ферменты.[2][3][7] Генетическая основа способности этого вида к окислению железа менее ясна, но, вероятно, связана с сульфоцианин белок.[2][3][7] В геноме также содержится большое количество транспортные белки, в том числе специализированные для ион металла излияние, и несколько CRISPR / Cas системы.[3] Есть свидетельства горизонтальный перенос генов как значительный вклад в S. thermosulfidooxidans эволюция, включая неожиданную связь между геном SOR и аналогичными генами, обнаруженными только в археи.[2][3][7]

Рекомендации

  1. ^ а б c d «Род Sulfobacillus». Список прокариотических имен, стоящих в номенклатуре. Получено 18 ноября 2018.
  2. ^ а б c d е ж грамм час я Правосудие, Николай Б; Норман, Андерс; Браун, Кристофер Т; Сингх, Андреа; Томас, Брайан С; Банфилд, Джиллиан Ф (2014). «Сравнение экологических геномов и геномов изолята Sulfobacillus показывает различный метаболизм углерода, серы, азота и водорода». BMC Genomics. 15 (1): 1107. Дои:10.1186/1471-2164-15-1107. ЧВК  4378227. PMID  25511286.
  3. ^ а б c d е ж грамм час я j Го, Сюэ; Инь, Хуацюнь; Лян, Или; Ху, Ци; Чжоу, Сишу; Сяо, Юньхуа; Ма, Лиюань; Чжан, Сиань; Цю, Гуаньчжоу; Лю, Сюэдуань; Мормиле, Мелани Р. (18 июня 2014 г.). «Сравнительный анализ генома показывает метаболическую универсальность и адаптацию к окружающей среде штамма ST Sulfobacillus thermosulfidooxidans». PLoS ONE. 9 (6): e99417. Дои:10.1371 / journal.pone.0099417. ЧВК  4062416. PMID  24940621.
  4. ^ а б c d Travisany, D .; Di Genova, A .; Sepulveda, A .; Bobadilla-Fazzini, R.A .; Parada, P .; Маасс, А. (26 октября 2012 г.). «Проект последовательности генома штамма Sulfobacillus thermosulfidooxidans Cutipay, местной бактерии, выделенной из природных экстремальных горнодобывающих сред в северном Чили». Журнал бактериологии. 194 (22): 6327–6328. Дои:10.1128 / JB.01622-12. ЧВК  3486405. PMID  23105067.
  5. ^ а б c Головачева, РС; Караванько, Г.И. (1978). «[Sulfobacillus, новый род термофильных спорообразующих бактерий]». Микробиология. 47 (5): 815–22. PMID  101742.
  6. ^ Людвиг, Вольфганг; Шлейфер, Карл-Хайнц; Уитмен, Уильям Б. (2001). «Пересмотренная дорожная карта к типу Firmicutes». В Вос, Пол; Гаррити, Джордж; Джонс, Дороти; Krieg, Noel R .; Людвиг, Вольфганг; Рейни, Фред А .; Шлейфер, Карл-Хайнц; Уитмен, Уильям Б. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том 3: The Firmicutes (2-е изд.). Springer. ISBN  978-0-387-95041-9.
  7. ^ а б c d е ж грамм Чжан, Сиань; Лю, Сюэдуань; Лян, Или; Го, Сюэ; Сяо, Юньхуа; Ма, Лиюань; Мяо, Бо; Лю, Хунвэй; Пэн, Делян; Хуанг, Венкун; Чжан, Югуан; Инь, Хуацюнь; Дрейк, Гарольд Л. (1 апреля 2017 г.). «Адаптивная эволюция экстремальных ацидофилов Sulfobacillus thermosulfidooxidans, потенциально обусловленная горизонтальным переносом генов и потерей генов». Прикладная и экологическая микробиология. 83 (7). Дои:10.1128 / AEM.03098-16. ЧВК  5359484. PMID  28115381.
  8. ^ Богданова Т.И. (1 мая 2006 г.). «Sulfobacillus thermotolerans sp. Nov., Термотолерантная хемолитотрофная бактерия». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 56 (5): 1039–1042. Дои:10.1099 / ijs.0.64106-0. PMID  16627651.