TOP2B - TOP2B

TOP2B
4j3ncartoon.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTOP2B, TOPIIB, top2beta, топоизомераза (ДНК) II бета, ДНК топоизомераза II бета
Внешние идентификаторыOMIM: 126431 MGI: 98791 ГомолоГен: 134711 Генные карты: TOP2B
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение TOP2B
Геномное расположение TOP2B
Группа3п24.2Начинать25,597,905 бп[1]
Конец25,664,907 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TOP2B 211987 на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001068
NM_001330700

NM_009409

RefSeq (белок)

NP_001059
NP_001317629

NP_033435

Расположение (UCSC)Chr 3: 25,6 - 25,66 МбChr 14: 16.37 - 16.44 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ДНК-топоизомераза 2-бета является фермент что у людей кодируется TOP2B ген.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует ДНК топоизомераза, фермент, который контролирует и изменяет топологическое состояние ДНК во время транскрипции. Этот ядерный фермент участвует в таких процессах, как конденсация хромосом, разделение хроматид и снятие торсионного стресса, возникающего во время транскрипции и репликации ДНК. Он катализирует временное разрушение и повторное соединение двух цепей дуплексной ДНК, что позволяет цепям проходить друг через друга, изменяя таким образом топологию ДНК. Две формы этого фермента существуют как вероятные продукты дупликации гена. Ген, кодирующий эту форму, бета, локализован на хромосоме 3, а альфа-форма - на хромосоме 17. Ген, кодирующий этот фермент, действует как мишень для нескольких противоопухолевых агентов, например митоксантрон, и различные мутации в этом гене были связаны с развитием лекарственной устойчивости. Снижение активности этого фермента также может играть роль в атаксия-телеангиэктазия. Альтернативная сварка этого гена приводит к двум вариантам транскрипта; однако второй вариант еще полностью не описан.[7]

Нейронная активность

Во время нового учусь опыт, набор гены быстро выражается в мозг. Это побудило экспрессия гена считается важным для обработки изучаемой информации. Такие гены обозначаются как немедленные ранние гены (IEG). Активность TOP2B важна для выражения IEG в процессе обучения мышей, который называется ассоциативной памятью страха.[8] Такой опыт обучения, по-видимому, быстро запускает TOP2B, чтобы вызвать двухцепочечные разрывы в промоторная ДНК генов ИЭГ, которые функционируют в нейропластичность. Ремонт этих индуцированных разрывов связано с Деметилирование ДНК промоторов генов IEG, обеспечивающих немедленную экспрессию этих генов IEG.[8]

Взаимодействия TOP2B и ДНК также регулируют транскрипция генов которые важны для развития. К ним относятся гены, кодирующие управление аксоном факторы и клеточная адгезия молекулы. В частности, TOP2B требуется для пластинка -конкретное нацеливание ганглиозная клетка сетчатки аксоны и дендриты в данио.[9]

Взаимодействия

TOP2B был показан взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000077097 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017485 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Тан К.Б., Дорман Т.Э., Фоллс К.М., Чунг Т.Д., Мирабелли С.К., Крук С.Т., Мао Дж. (Январь 1992 г.). «Гены топоизомеразы II альфа и топоизомеразы II бета: характеристика и картирование хромосом 17 и 3 человека, соответственно». Исследования рака. 52 (1): 231–4. PMID  1309226.
  6. ^ Дженкинс Дж. Р., Эйтон П., Джонс Т., Дэвис С. Л., Симмонс Д. Л., Харрис А. Л., Шир Д., Hickson ID (ноябрь 1992 г.). «Выделение клонов кДНК, кодирующих бета-изофермент топоизомеразы II ДНК человека, и локализация гена на хромосоме 3p24». Исследования нуклеиновых кислот. 20 (21): 5587–92. Дои:10.1093 / nar / 20.21.5587. ЧВК  334390. PMID  1333583.
  7. ^ «Ген Entrez: TOP2B топоизомераза (ДНК) II бета 180 кДа».
  8. ^ а б Ли, Сян; Маршалл, Пол Р .; Leighton, Laura J .; Zajaczkowski, Esmi L .; Ван, Цзыци; Madugalle, Sachithrani U .; Инь, Цзяюй; Бреди, Тимоти У .; Вэй, Вэй (2019). «Связанный с репарацией ДНК белок Gadd45γ регулирует временное кодирование немедленной ранней экспрессии генов в прелимбической префронтальной коре и необходим для консолидации ассоциативной памяти о страхе». Журнал неврологии. 39 (6): 970–983. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.2024-18.2018. ЧВК  6363930. PMID  30545945. (Ошибка:PMID  30545945 )
  9. ^ Невин, Л. М .; Xiao, T .; Staub, W .; Байер, Х. (2011). «Топоизомераза II необходима для ламино-специфического нацеливания на аксоны и дендриты ганглиозных клеток сетчатки». Разработка. 138 (12): 2457–2465. Дои:10.1242 / dev.060335. ЧВК  3100707. PMID  21610027.
  10. ^ Китагава Х, Фудзики Р., Йошимура К., Мезаки И, Уэмацу Й, Мацуи Д., Огава С., Унно К., Окубо М, Токита А, Накагава Т, Ито Т, Ишими И, Нагасава Х, Мацумото Т, Янагисава Дж, Като С. (Июнь 2003 г.). «УТВЕРЖДЕНО: комплекс WINAC, модифицирующий хроматин, нацеливается на ядерный рецептор на промоторы и нарушается при синдроме Вильямса». Клетка. 113 (7): 905–17. Дои:10.1016 / s0092-8674 (03) 00436-7. PMID  12837248.
  11. ^ а б Цай С.К., Валков Н., Ян В.М., Гамп Дж., Салливан Д., Сето Э. (ноябрь 2000 г.). «Гистоновая деацетилаза напрямую взаимодействует с ДНК-топоизомеразой II». Природа Генетика. 26 (3): 349–53. Дои:10.1038/81671. PMID  11062478. S2CID  19301396.
  12. ^ Johnson CA, Padget K, Austin CA, Turner BM (февраль 2001 г.). «Активность деацетилазы связана с топоизомеразой II и необходима для апоптоза, вызванного этопозидом». Журнал биологической химии. 276 (7): 4539–42. Дои:10.1074 / jbc.C000824200. PMID  11136718.
  13. ^ Коуэлл И.Г., Окороков А.Л., Каттс С.А., Пэджет К., Белл М., Милнер Дж., Остин, Калифорния (февраль 2000 г.). «Человеческие топоизомеразы IIα и IIβ взаимодействуют с С-концевой областью р53». Экспериментальные исследования клеток. 255 (1): 86–94. Дои:10.1006 / excr.1999.4772. PMID  10666337.
  14. ^ Мао Ю., Десаи С.Д., Лю Л.Ф. (август 2000 г.). «Конъюгация SUMO-1 с изоферментами топоизомеразы II ДНК человека». Журнал биологической химии. 275 (34): 26066–73. Дои:10.1074 / jbc.M001831200. PMID  10862613.
  15. ^ Накано Х., Ямадзаки Т., Миятаке С., Нодзаки Н., Кикучи А., Сайто Т. (март 1996 г.). «Специфическое взаимодействие топоизомеразы IIβ и CD3ε цепи рецепторного комплекса Т-клеток». Журнал биологической химии. 271 (11): 6483–9. Дои:10.1074 / jbc.271.11.6483. PMID  8626450.

дальнейшее чтение