Анализ трех таксонов - Three-taxon analysis

Анализ трех таксонов (или же TTS, трехпозиционный анализ, 3ia) это кладистический на основе метода филогенетической реконструкции. Представлено Нельсоном и Платником (1991)[1] для реконструкции филогении организмов этот метод также может быть применен к биогеографические районы. Он пытается реконструировать сложные филогенетические деревья, разбивая проблему на более простые части. Вместо того, чтобы пытаться определить взаимосвязь всех таксонов X сразу, он рассматривает 3 таксона одновременно. Относительно легко составить отчеты о трех таксонах (3is); то есть утверждения формы «А и В более тесно связаны друг с другом, чем с С».[2] После рассмотрения каждой группы из трех таксонов метод строит дерево, которое согласуется с максимально возможным количеством утверждений из трех пунктов.[2]

С теоретической точки зрения метод имеет три основные проблемы: (1) эволюция характера априори считается необратимой; (2) 3is, которые не являются логически независимыми, рассматриваются как если бы они были; (3) 3is, которые рассматриваются как независимые опоры для данного дерева, могут быть взаимоисключающими на этом дереве. [3]

Компьютерная программа, реализующая анализ трех таксонов, называется LisBeth.[4] (для систематических и биогеографических исследований). Лизбет была освобождена на свободе.[5] Недавнее исследование, основанное на моделировании, показало, что анализ трех таксонов дает хорошую мощность и промежуточный уровень ошибок между экономичностью с упорядоченными состояниями и экономией с неупорядоченными состояниями.[6]

Анализ трех таксонов (3ia). Изменено с рисунка 1 из этой статьи: Grand A, Corvez A, Duque Velez LM, Laurin M. 2013.
Филогенетический вывод с использованием дискретных символов: выполнение упорядоченной и неупорядоченной экономичности и трехпозиционных утверждений. Biol J Linn Soc. 110 (4): 914–930.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Nelson, G .; Платник, Н. И. (1991). "Утверждения о трех таксонах: более точное использование экономичности?". Кладистика. 7 (4): 351. Дои:10.1111 / j.1096-0031.1991.tb00044.x.
  2. ^ а б Zaragueta-Bagils, R .; Бурдон, Э. (2007). «Трехэлементный анализ: иерархическое представление и обработка отсутствующих и неприменимых данных». Comptes Rendus Palevol. 6 (6–7): 527. Дои:10.1016 / j.crpv.2007.09.013.
  3. ^ De Laet, J .; Смец, Э. (1998). «О трехтаксонном подходе к анализу экономичности». Кладистика. 14 (4): 363–381.
  4. ^ Bagils, R. Z. E .; Ung, V .; Grand, A. S .; Винь-Леббе, Р. Г .; Cao, N. L .; Дюкасс, Дж. (2012). «ЛисБет: Новая кладистика для филогенетики и биогеографии». Comptes Rendus Palevol. 11 (8): 563. Дои:10.1016 / j.crpv.2012.07.002.
  5. ^ «Пакет Лизбет».
  6. ^ Гранд, Анаис; Корвес, Адель; Дуке Велес, Лина Мария; Лорен, Мишель (2013). «Филогенетический вывод с использованием дискретных символов: выполнение упорядоченной и неупорядоченной экономичности и трехпозиционных утверждений». Биологический журнал Линнеевского общества. 110 (4): 914–930. Дои:10.1111 / bij.12159.