Ациредуктон-диоксигеназа (требуется железо (II)) - Википедия - Acireductone dioxygenase (iron(II)-requiring)

Ациредуктон диоксигеназа [требует железа (II)] (ЕС 1.13.11.54 ) является фермент который катализирует в химическая реакция

1,2-дигидрокси-5- (метилтио) пент-1-ен-3-он + O₂ ${ displaystyle rightleftharpoons}$ 4- (метилтио) -2-оксобутаноат + формиат

Таким образом, два субстраты этого фермента 1,2-дигидрокси-5- (метилтио) пент-1-ен-3-он и кислород, а его два товары находятся 4-метилтио-2-оксобутаноат и форматировать.

Этот фермент принадлежит к семейству оксидоредуктазы, особенно те, которые действуют на одиночных доноров с O₂ как окислитель и включение двух атомов кислорода в субстрат (оксигеназы). Включенный кислород не обязательно должен быть получен из O₂. В систематическое название этого класса ферментов 1,2-дигидрокси-5- (метилтио) пент-1-ен-3-он: оксидоредуктаза кислорода (формиатобразующая). Другие широко используемые имена включают ARD ', 2-гидрокси-3-кето-5-тиометилпент-1-ендиоксигеназа (неоднозначно), ациредуктон-диоксигеназа (неоднозначно), E-2 ', и E-3 диоксигеназа. Этот фермент участвует в метаболизм метионина.

Структурные исследования

По состоянию на конец 2007 г. только один структура было решено для этого класса ферментов, с PDB код доступа 2HJI.

Рекомендации

• Рэй Дж. У., Абелес Р. Х. (1993). «Бактериальный фермент, катализирующий образование окиси углерода». J. Biol. Chem. 268 (29): 21466–9. PMID  8407993.
• Рэй Дж. У., Абелес Р. Х. (1995). «Путь спасения метионина в Klebsiella pneumoniae и печени крыс. Идентификация и характеристика двух новых диоксигеназ». J. Biol. Chem. 270 (7): 3147–53. Дои:10.1074 / jbc.270.7.3147. PMID  7852397.
• Furfine ES, Abeles RH (1988). «Промежуточные продукты в превращении 5'-S-метилтиоаденозина в метионин у Klebsiella pneumoniae». J. Biol. Chem. 263 (20): 9598–606. PMID  2838472.
• Дай Y, Wensink PC, Abeles RH (1999). «Один белок, два фермента». J. Biol. Chem. 274 (3): 1193–5. Дои:10.1074 / jbc.274.3.1193. PMID  9880484.
• Мо Х, Дай Й, Почапский СС, Почапский ТЦ (1999). «Отнесения 1H, 13C и 15N ЯМР для оксида углерода, генерирующего металлофермент из Klebsiella pneumoniae». J. Biomol. ЯМР. 14 (3): 287–8. Дои:10.1023 / А: 1008396624784. PMID  10481280. S2CID  36731035.
• Дай Ю., Почапский ТЦ, Абелес Р.Х. (2001). «Механистические исследования двух диоксигеназ в пути спасения метионина Klebsiella pneumoniae». Биохимия. 40 (21): 6379–87. Дои:10.1021 / bi010110y. PMID  11371200.
• Аль-Мджени Ф., Джу Т, Покапски Т.С., Марони М.Дж. (2002). «Исследование XAS структуры и функции Ni в ациредуктон-диоксигеназе». Биохимия. 41 (21): 6761–9. Дои:10.1021 / bi012209a. PMID  12022880.
• Покапский ТС, Покапский С.С., Джу Т, Мо Х, Аль-Мджени Ф., Марони М.Дж. (2002). «Моделирование и эксперимент дают структуру ациредуктон-диоксигеназы из Klebsiella pneumoniae». Nat. Struct. Биол. 9 (12): 966–72. Дои:10.1038 / nsb863. PMID  12402029. S2CID  38098047.