Аминоксидаза (медьсодержащая) - Википедия - Amine oxidase (copper-containing)
| Аминоксидаза меди, ферментный домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура медьсодержащей бензиламиноксидазы из Hansenula polymorpha.[1] | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Cu_amine_oxid | ||||||||
| Pfam | PF01179 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR015798 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00895 | ||||||||
| SCOP2 | 1oac / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| Мембранома | 252 | ||||||||
| |||||||||
| N-концевой домен аминоксидазы меди | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура e. Аминоксидаза coli, анаэробно восстановленная бета-фенилэтиламином | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Cu_amine_oxidN1 | ||||||||
| Pfam | PF07833 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR012854 | ||||||||
| SCOP2 | 1 гп / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
| Аминоксидаза меди, домен N2 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура эукариотической (проростки гороха) медьсодержащей аминоксидазы с разрешением 2.2a | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Cu_amine_oxidN2 | ||||||||
| Pfam | PF02727 | ||||||||
| Pfam клан | CL0047 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR015800 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00895 | ||||||||
| SCOP2 | 1oac / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
| Аминоксидаза меди, домен N3 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура аминоксидазы hansenula polymorpha в комплексе с xe до 1,6 ангстрем | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Cu_amine_oxidN3 | ||||||||
| Pfam | PF02728 | ||||||||
| Pfam клан | CL0047 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR015802 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00895 | ||||||||
| SCOP2 | 1oac / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
Аминоксидаза (медьсодержащая) (AOC) (ЕС 1.4.3.21 и ЕС 1.4.3.22; раньше ЕС 1.4.3.6 ) - это семья аминоксидаза ферменты который включает как первично-аминоксидаза и диаминоксидаза; эти ферменты катализируют окисление широкого спектра биогенных аминов, включая многие нейротрансмиттеры, гистамин и ксенобиотические амины. Они действуют как гомодимер с дисульфидной связью. Они катализируют окисление первичных аминов до альдегидов с последующим высвобождением аммиака и перекиси водорода, для чего требуется один ион меди на субъединицу и топахинон в качестве кофактора:[2]
- RCH2NH2 + H2О + О2 RCHO + NH3 + H2О2
3 субстраты этого фермента первичные амины (RCH2NH2), ЧАС2О, и О2, а его 3 товары находятся RCHO, NH3, и ЧАС2О2.
Медьсодержащие аминоксидазы обнаружены у бактерий, грибов, растений и животных. У прокариот фермент позволяет использовать различные аминные субстраты в качестве источников углерода и азота.[3][4]
Этот фермент принадлежит к оксидоредуктазы особенно те, которые действуют на группу доноров CH-NH2 с кислородом в качестве акцептора. В систематическое название этого класса ферментов амин: оксидоредуктаза кислорода (дезаминирующая) (медьсодержащая). Этот фермент участвует в 8 метаболические пути: цикл мочевины и метаболизм аминогрупп, метаболизм глицина, серина и треонина, метаболизм гистидина, метаболизм тирозина, метаболизм фенилаланина, метаболизм триптофана, метаболизм бета-аланина, и биосинтез алкалоидов ii. Имеет 2 кофакторы: медь, и PQQ.
Структура
Трехмерная структура аминоксидазы меди была определена с помощью Рентгеновская кристаллография.[1]Аминоксидазы меди представляют собой гомодимеры грибовидной формы с массой 70-95 кДа, каждый мономер содержит ион меди и ковалентно связанный окислительно-восстановительный кофактор, топахинон (TPQ). TPQ образуется в результате посттрансляционной модификации консервативного остатка тирозина. Ион меди координирован с тремя остатки гистидина и две молекулы воды в форме искаженной квадратной пирамиды, которые выполняют двойную функцию в катализе и биогенезе TPQ. Каталитический домен является самым большим из 3-4 доменов, обнаруженных в аминоксидазах меди, и состоит из бета-сэндвича из 18 нитей на двух листах. Активный сайт скрыт и требует изменения конформации, чтобы обеспечить доступ к субстрату.
N-концевые домены N2 и N3 имеют общую структурную складку, ее ядро состоит из альфа-бета (4), где спираль упакована против свернутых в спираль антипараллельных бета-листов. Дополнительный домен находится на N-конце некоторых аминоксидаз меди, а также в родственных белки Такие как клеточная стенка гидролаза и N-ацетилмурамоил-L-аланин амидаза. Этот домен состоит из пятицепочечного антипараллельного бета-лист скрученный вокруг альфы спираль.[5][6]
Функция
У эукариот они выполняют более широкий спектр функций, включая дифференцировку и рост клеток, заживление ран, детоксикацию и передачу клеточных сигналов;[7] один фермент AOC (AOC3 ) функционирует как белок сосудистой адгезии (VAP-1) в некоторых тканях млекопитающих.[1]
Белки человека, содержащие этот домен
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c PDB: 3LOY; Чанг С.М., Клема В.Дж., Джонсон Б.Дж., Муре М., Клинман Дж. П., Уилмот К.М. (март 2010 г.). «Кинетический и структурный анализ субстратной специфичности двух аминоксидаз меди из Hansenula polymorpha». Биохимия. 49 (11): 2540–50. Дои:10.1021 / bi901933d. ЧВК 2851405. PMID 20155950.
- ^ Конвери М.А., Филлипс С.Е., Макферсон М.Дж., Ядав К.Д., Ноулз П.Ф., Парсонс М.Р., Уилмот С.М., Блейкли В., Корнер А.С. (1995). «Кристаллическая структура хинофермента: аминоксидаза меди Escherichia coli при разрешении 2 A». Структура. 3 (11): 1171–1184. Дои:10.1016 / s0969-2126 (01) 00253-2. PMID 8591028.
- ^ Мюррей Дж. М., Конвери М. А., Филлипс С. Е., Макферсон М. Дж., Ноулз П. Ф., Парсонс М. Р., Уилмот С. М., Блейкли В., Корнер А. С., Альтон Г., Палсик М. М. (1997). «Каталитический механизм аминооксидазы хинофермента из Escherichia coli: изучение восстановительной полуреакции». Биохимия. 36 (7): 1608–1620. Дои:10.1021 / bi962205j. PMID 9048544.
- ^ Танизава К., Гусс Дж. М., Фриман Х. С., Ямагути Х., Уилс М.С., Дули Д.М., Мацунами Х., Макинтайр В.С., Руджеро С.Э. (1997). «Кристаллические структуры медьсодержащей аминоксидазы из Arthrobacter globiformis в холо- и апо-формах: последствия для биогенеза топахинона». Биохимия. 36 (51): 16116–16133. Дои:10.1021 / bi971797i. PMID 9405045.
- ^ Парсонс М.Р., Конвери М.А., Уилмот К.М., Ядав К.Д., Блейкли В., Корнер А.С., Филлипс С.Е., Макферсон М.Дж., Ноулз П.Ф. (ноябрь 1995 г.). «Кристаллическая структура хинофермента: аминоксидаза меди Escherichia coli при разрешении 2 A». Структура. 3 (11): 1171–84. Дои:10.1016 / s0969-2126 (01) 00253-2. PMID 8591028.
- ^ Уилмот С.М., Хайду Дж., Макферсон М.Дж., Ноулз П.Ф., Филипс С.Е. (ноябрь 1999 г.). «Визуализация дикислорода, связанного с медью во время ферментативного катализа». Наука. 286 (5445): 1724–8. Дои:10.1126 / science.286.5445.1724. PMID 10576737.
- ^ Гусс Дж. М., Фриман Х. С., Кумар В., Уилс М. С., Дули Д. М., Харви И., Макгирл М. А., Зубак В. М. (1996). «Кристаллическая структура эукариотической (проростки гороха) медьсодержащей аминоксидазы при разрешении 2,2 A». Структура. 4 (8): 943–955. Дои:10.1016 / s0969-2126 (96) 00101-3. PMID 8805580.
дальнейшее чтение
- Амеяма М., Хаяси М., Мацусита К., Синагава Э., Адачи О. (1984). «Микробиологическое производство пирролохинолинхинона». Agric. Биол. Chem. 48 (2): 561–565. Дои:10.1271 / bbb1961.48.561.
- Августинссон КБ, Олссон Б (1959). «Эстеразы в молоке и плазме крови свиней. I. Исследования субстратной специфичности и электрофореза». Biochem. J. 71 (3): 477–84. Дои:10.1042 / bj0710477. ЧВК 1196820. PMID 13638253.
- Бойер П.Д., Ларди Х. и Мирбек К. (ред.), Ферменты, 2-е изд., Т. 8, Academic Press, Нью-Йорк, 1963, стр. 337-351.
- Буффони Ф, Блашко Х (1964). «Бензиламиноксидаза и гистаминаза: очистка и кристаллизация фермента из плазмы свиней». Труды Королевского общества B. 161 (983): 153–67. Bibcode:1964RSPSB.161..153B. Дои:10.1098 / rspb.1964.0086. PMID 14224405. S2CID 43432156.
- Хейвуд GW, Большой PJ (1981). «Микробное окисление аминов. Распределение, очистка и свойства двух первичных аминооксидаз из дрожжей Candida boidinii, выращенных на аминах в качестве единственного источника азота». Biochem. J. 199 (1): 187–201. Дои:10.1042 / bj1990187. ЧВК 1163349. PMID 7337701.
- МакИвен CM младший (1965). «Моноаминоксидаза плазмы человека. 1. Очистка и идентификация». J. Biol. Chem. 240 (5): 2003–10. PMID 5888801.
- Мондови Б., Коста МТ, Агро АФ, Ротилио Дж. (1967). «Пиридоксальфосфат как простетическая группа диаминоксидазы почек свиней». Arch. Biochem. Биофизы. 119 (1): 373–81. Дои:10.1016/0003-9861(67)90468-7. PMID 4964016.
- Ямада Х, Адачи О, Огата К. (1965). «Аминоксидазы микроорганизмов. Часть II. Очистка и кристаллизация аминоксидазы Aspergillus niger». Agric. Биол. Chem. 29: 649–654. Дои:10.1271 / bbb1961.29.649.
- Ямада Х, Адачи О, Огата К. (1965). «Аминоксидазы микроорганизмов. Часть III. Свойства аминоксидазы Aspergillus niger». Agric. Биол. Chem. 29: 864–869. Дои:10.1271 / bbb1961.29.864.
- Ямада Х, Адачи О, Огата К. (1965). «Аминоксидазы микроорганизмов. Часть IV. Другие свойства аминоксидазы Aspergillus niger». Agric. Биол. Chem. 29: 912–917. Дои:10.1271 / bbb1961.29.912.
- Бойер П.Д., Ларди Х. и Мирбек К. (ред.), Ферменты, 2-е изд., Т. 8, Academic Press, Нью-Йорк, 1963, стр. 313-335.
