Штрих-код системы данных о жизни - Barcode of Life Data System

В Штрих-код системы данных о жизни (широко известный как СМЕЛЫЙ или же BOLDSystems) - это веб-платформа, специально посвященная Штрих-кодирование ДНК.[1][2] Это облачная платформа для хранения и анализа данных, разработанная Центром геномики биоразнообразия в Канаде. Он состоит из четырех основных модулей, портала данных, образовательного портала, реестра BIN (предполагаемых видов) и инструментария для сбора и анализа данных, который обеспечивает онлайн-платформу для анализа Последовательности ДНК.[2] С момента запуска в 2005 году BOLD был расширен, чтобы обеспечить ряд функций, включая организацию данных, проверку, визуализацию и публикацию. Самая последняя версия системы, версия 4, запущенная в 2017 году, содержит ряд улучшений, поддерживающих сбор и анализ данных, но также включает новые функции, улучшающие распространение, цитирование и аннотации данных.[3] До 16 ноября 2020 года BOLD уже содержал последовательности штрих-кодов для 318105 формально описанных видов животных, растений, грибов, простейших (около 8,9 миллиона экземпляров).[4]

СМЕЛЫЙ свободно доступен любому исследователю, интересующемуся Штрих-кодирование ДНК. Предоставляя специализированные услуги, он помогает публиковать записи, соответствующие стандартам, необходимым для получения прибыли. Штрих-код обозначение в международных базах данных нуклеотидных последовательностей. Благодаря веб-доставке и гибкой модели безопасности данных, он также имеет хорошие возможности для поддержки проектов, в которых участвуют широкие исследовательские альянсы.[3]

Выпуск данных BOLD в основном исходил от проекта БАРКОД 500K выполнялась Консорциумом International Barcode of Life (iBOL) с 2010 по 2015 год. Его цель заключалась в сборе данных записей штрих-кода ДНК для 5M образцов, представляющих 500K видов. Весь сбор образцов, определение последовательностей, сортировка информации вносятся большим количеством ученых, сотрудников и организаций из разных стран мира. Накопление данных увеличивает точность идентификации штрих-кода ДНК и облегчает получение штрих-кода жизни.

Рекомендации

  1. ^ Ратнасингхам, Судживан; Хеберт, Пол Д. Н. (2013). «Реестр на основе ДНК для всех видов животных: система номеров индекса штрих-кода (BIN)». PLoS ONE. 8 (7): e66213. Дои:10.1371 / journal.pone.0066213. ISSN  1932-6203.
  2. ^ а б РАТНАСИНГЕМ, СУДЖЕЕВАН; ХЕБЕРТ, ПОЛ Д. Н. (24 января 2007 г.). «СТАРТОВЫЕ КОДЫ: жирный: Система данных о штрих-кодах жизни (http://www.barcodinglife.org)». Заметки о молекулярной экологии. 7 (3): 355–364. Дои:10.1111 / j.1471-8286.2007.01678.x. ISSN  1471-8278.
  3. ^ а б "Руководство по печати BOLD для BOLD v4". www.boldsystems.org. Получено 2020-11-16.
  4. ^ «Царства жизни со штрих-кодами | БОЛДСИСТЕМЫ». www.boldsystems.org. Получено 2020-11-16.

внешняя ссылка