Лектин С-типа - C-type lectin

Домен лектина С-типа
PDB 1jzn EBI.jpg
Пентамерная структура лектина яда гремучей змеи, который является лектином, связывающим галактозу.[1] [2]
Идентификаторы
СимволЛектин_С
PfamPF00059
ИнтерПроIPR001304
УМНЫЙCLECT
PROSITEPS50041
SCOP22 мсб / Объем / СУПФАМ
CDDcd00037
Мембранома52

А Лектин С-типа (CLEC) представляет собой тип связывания углеводов белковый домен известный как лектин.[3] Обозначение C-типа связано с их требованиями к кальций для переплета.[4] Белки, содержащие лектиновые домены С-типа, выполняют широкий спектр функций, включая клеточную адгезию, иммунный ответ на патогены и апоптоз.[5][6]

Классификация

Дрикамер и другие. классифицировал лектины C-типа на 7 подгрупп (от I до VII) на основе порядка различных белковые домены в каждом белке.[7] Эта классификация была впоследствии обновлена ​​в 2002 году, в результате чего были выделены семь дополнительных групп (с VIII по XIV).[8] Совсем недавно были добавлены еще три подгруппы (с XV по XVII).[3]

ГруппаимяСвязанные домены
яЛектиканыEGF, Суши, Ig и Link домены
IIАсиалогликопротеин и рецепторы постоянного токаНикто
IIIКоллектиныНикто
IVSelectinsСуши и EGF домены
VНК - сотовый рецепторыНикто
VIЭндоцитарные рецепторы мульти-CTLDДомены FnII и Ricin
VIIРег группаНикто
VIIIХондролектин, ЛайлинНикто
IXТетранектинНикто
ИксПолицистинWSC, REJ, PKD домены
XIАттрактин (ATRN )PSI, EGF и CUB домены
XIIОсновной основной белок эозинофилов (EMBP)Никто
XIIIDGCR2Никто
XIVТромбомодулин, CD93, CD248, CLEC14AEGF домены [9]
XVBimlecНикто
XVISEECSCP и EGF домены
XVIICBCP /Frem1 / QBRICKCSPG повторяет и CalX-бета домены

CLEC включают:

«Лектин-подобные рецепторы NK-клеток» представляют собой очень близкую группу:[10]

Дополнительные белки, содержащие этот домен, включают:

использованная литература

  1. ^ Уокер Дж. Р., Нагар Б., Янг Н. М., Хирама Т., Рини Дж. М. (апрель 2004 г.). «Рентгеновская кристаллическая структура галактозоспецифического лектина С-типа, обладающего новой декамерной четвертичной структурой». Биохимия. 43 (13): 3783–92. Дои:10.1021 / bi035871a. PMID  15049685.
  2. ^ Махла Р.С., Редди М.С., Прасад Д.В., Кумар Х. (сентябрь 2013 г.). «Подслащенные PAMP: роль сахарных комплексов PAMP в врожденном иммунитете и биологии вакцины». Границы иммунологии. 4: 248. Дои:10.3389 / fimmu.2013.00248. ЧВК  3759294. PMID  24032031.
  3. ^ а б Зеленский А.Н., Греди Дж. Э. (декабрь 2005 г.). «Суперсемейство лектин-подобных доменов С-типа». FEBS J. 272 (24): 6179–217. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2005.05031.x. PMID  16336259.
  4. ^ C-тип + лектин в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
  5. ^ Дрикамер К. (октябрь 1999 г.). «Лектин-подобные домены С-типа». Curr. Мнение. Struct. Биол. 9 (5): 585–90. Дои:10.1016 / S0959-440X (99) 00009-3. PMID  10508765.
  6. ^ Камби А., Фигдор С. (май 2009 г.). «Некроз: лектины С-типа чувствуют гибель клеток». Curr. Биол. 19 (9): R375–8. Дои:10.1016 / j.cub.2009.03.032. PMID  19439262. S2CID  17409821.
  7. ^ Дрикамер К. (1993). «Эволюция Са (2 +) - зависимых лектинов животных». Прог. Nucleic Acid Res. Мол. Биол. Прогресс в исследованиях нуклеиновых кислот и молекулярной биологии. 45: 207–32. Дои:10.1016 / S0079-6603 (08) 60870-3. ISBN  978-0-12-540045-9. PMID  8341801.
  8. ^ Дрикамер К., Фадден А.Дж. (2002). «Геномный анализ лектинов С-типа». Biochem. Soc. Symp. 69 (69): 59–72. Дои:10.1042 / bss0690059. PMID  12655774.
  9. ^ Хан, К. А .; McMurray, J. L .; Mohammed, F .; Бикнелл, Р. (2019). «Белки группы 14 лектинового домена С-типа в сосудистой биологии, раке и воспалении». Журнал FEBS. 286 (17): 3299–3332. Дои:10.1111 / фев.14985. ЧВК  6852297. PMID  31287944.
  10. ^ NK + клетки + лектинподобные + рецепторы в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

внешние ссылки