CDH4 - CDH4

CDH4
Идентификаторы
Псевдонимы	CDH4, CAD4, R-CAD, RCAD, кадгерин 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 603006 MGI: 99218 ГомолоГен: 48044 Генные карты: CDH4
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 20 (человек)
Конец	61,940,617 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	179,899,373 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ионов кальция; • связывание ионов металлов; • связывание с белками цитоскелета; • активность гомодимеризации белков; • связывание кадгерина;
Сотовый компонент	• неотъемлемый компонент мембраны; • клеточная мембрана; • неотъемлемый компонент плазматической мембраны; • мембрана; • поверхность клетки; • катениновый комплекс;
Биологический процесс	• гетерофильная клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны; • клеточная адгезия; • положительная регуляция удлинения аксонов; • организация стыковки приверженцев; • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны; • управление аксоном; • сборка ячейки-ячейки; • кальций-зависимая клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны; • межклеточная адгезия, опосредованная кадгерином; • межклеточная адгезия; • клеточный морфогенез;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1002
	12561
	ENSG00000280641; ENSG00000179242
	ENSMUSG00000000305
	P55283
	P39038
	NM_001794; NM_001252338; NM_001252339
	NM_009867; NM_001316723
	NP_001239267; NP_001239268; NP_001785
	NP_001303652; NP_033997
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Кадгерин-4 это белок что у людей кодируется CDH4 ген.^[5]^[6]^[7]

Этот ген представляет собой классический кадгерин из суперсемейства кадгеринов. Кодируемый белок представляет собой кальций-зависимый гликопротеин клеточно-клеточной адгезии, состоящий из пяти внеклеточных повторов кадгерина, трансмембранного участка и высококонсервативного цитоплазматического хвоста. Основываясь на исследованиях на курице и мышах, считается, что этот кадгерин играет важную роль во время сегментации мозга и разрастания нейронов. Кроме того, показана роль в развитии почек и мышц. Особый интерес представляют исследования, показывающие стабильные цис-гетеродимеры кадгеринов 2 и 4 в линиях котрансфицированных клеток. Ранее считалось, что они взаимодействуют исключительно гомофильным образом, это первое свидетельство гетеродимеризации кадгерина.^[7]

Взаимодействия

Кадгерин-4 был показан взаимодействовать с:

PTPmu^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ENSG00000179242 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000280641, ENSG00000179242 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000305 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Чалмерс И.Дж., Хофлер Х., Аткинсон М.Дж. (июнь 1999 г.). «Картирование кластера генов кадгерина в области хромосомы 5, подверженной частой аллельной потере при карциноме». Геномика. 57 (1): 160–3. Дои:10.1006 / geno.1998.5717. PMID 10191097.
^ Коулс П., Ванхалст К., ван Рой Ф. (октябрь 1999 г.). «Отнесение кадгерина-4 (R-кадгерин, CDH4) к полосе хромосомы человека 20q13.3». Cytogenet Cell Genet. 86 (1): 26–7. Дои:10.1159/000015423. PMID 10516427. S2CID 27578498.
^ ^а ^б «Ген Энтреза: CDH4 кадгерин 4, тип 1, R-кадгерин (сетчатка)».
^ Brady-Kalnay SM, Mourton T., Nixon JP, Pietz GE, Kinch M, Chen H, et al. (1998). «Динамическое взаимодействие PTPmu с множеством кадгеринов in vivo». J Cell Biol. 141 (1): 287–96. Дои:10.1083 / jcb.141.1.287. ЧВК 2132733. PMID 9531566.

дальнейшее чтение

Тальярини Ф (1977). «[Отношения между социальной защитой и криминологическими тенденциями с 1930-х годов до наших дней]». Quaderni di Criminologia Clinica. 18 (3): 289–352. PMID 798233.
Сузуки С., Сано К., Танихара Х (1991). «Разнообразие семейства кадгеринов: данные о восьми новых кадгеринах в нервной ткани». Cell Regul. 2 (4): 261–70. Дои:10.1091 / mbc.2.4.261. ЧВК 361775. PMID 2059658.
Танихара Х., Сано К., Хеймарк Р.Л. и др. (1995). «Клонирование пяти человеческих кадгеринов проясняет характерные особенности внеклеточного домена кадгерина и предоставляет дополнительные доказательства двух структурно различных типов кадгерина». Сотовые клеи. Сообщество. 2 (1): 15–26. Дои:10.3109/15419069409014199. PMID 7982033.
Шан В.С., Танака Х., Филлипс Г.Р. и др. (2000). «Функциональные цис-гетеродимеры N- и R-кадгеринов». J. Cell Biol. 148 (3): 579–90. Дои:10.1083 / jcb.148.3.579. ЧВК 2174798. PMID 10662782.
Леканда Ф., Ченг С.Л., Шин С.С. и др. (2000). «Дифференциальная регуляция кадгеринов дексаметазоном в клетках остеобластов человека». J. Cell. Биохим. 77 (3): 499–506. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (20000601) 77: 3 <499 :: AID-JCB14> 3.0.CO; 2-0. PMID 10760957.
Китагава М., Натори М., Мурасе С. и др. (2000). «Мутационный анализ кадгерина-4 выявляет аминокислотные остатки EC1, важные для структуры и функции». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 271 (2): 358–63. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2636. PMID 10799302.
Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Джонсон Э., Тайзен С.С., Джонсон К.Р., Уилок М.Дж. (2004). «R-кадгерин влияет на подвижность клеток через GTPases семейства Rho». J. Biol. Chem. 279 (30): 31041–9. Дои:10.1074 / jbc.M400024200. PMID 15143071.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Миотто Э., Саббиони С., Веронезе А. и др. (2005). «Частое аберрантное метилирование промотора гена CDH4 при колоректальном раке и раке желудка человека». Рак Res. 64 (22): 8156–9. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-3000. PMID 15548679.
Маэда М., Джонсон Э., Мандал С.Х. и др. (2006). «Экспрессия несоответствующих кадгеринов эпителиальными опухолевыми клетками способствует эндоцитозу и деградации E-кадгерина через конкуренцию за p120 (ctn)». Онкоген. 25 (33): 4595–604. Дои:10.1038 / sj.onc.1209396. PMID 16786001.

внешняя ссылка

CDH4 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
CDH4 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.

Эта статья о ген на хромосома человека 20 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000179242 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000280641, ENSG00000179242 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000305 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10191097-5] Чалмерс И.Дж., Хофлер Х., Аткинсон М.Дж. (июнь 1999 г.). «Картирование кластера генов кадгерина в области хромосомы 5, подверженной частой аллельной потере при карциноме». Геномика. 57 (1): 160–3. Дои:10.1006 / geno.1998.5717. PMID 10191097.

[pmid10516427-6] Коулс П., Ванхалст К., ван Рой Ф. (октябрь 1999 г.). «Отнесение кадгерина-4 (R-кадгерин, CDH4) к полосе хромосомы человека 20q13.3». Cytogenet Cell Genet. 86 (1): 26–7. Дои:10.1159/000015423. PMID 10516427. S2CID 27578498.

[entrez-7] а ^б «Ген Энтреза: CDH4 кадгерин 4, тип 1, R-кадгерин (сетчатка)».

[pmid9531566-8] Brady-Kalnay SM, Mourton T., Nixon JP, Pietz GE, Kinch M, Chen H, et al. (1998). «Динамическое взаимодействие PTPmu с множеством кадгеринов in vivo». J Cell Biol. 141 (1): 287–96. Дои:10.1083 / jcb.141.1.287. ЧВК 2132733. PMID 9531566.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]