CHD1L - CHD1L

CHD1L
Идентификаторы
ПсевдонимыCHD1L, ALC1, CHDL, ДНК-связывающий белок 1 хромодомена геликазы, подобный ДНК-связывающему белку 1 хромодомена геликазы
Внешние идентификаторыOMIM: 613039 MGI: 1915308 ГомолоГен: 11590 Генные карты: CHD1L
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение CHD1L
Геномное расположение CHD1L
Группа1q21.1Начинать147,242,654 бп[1]
Конец147,295,765 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CHD1L 207645 s в формате fs.png

PBB GE CHD1L 212539 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_026539

RefSeq (белок)

NP_080815

Расположение (UCSC)Chr 1: 147.24 - 147,3 МбChr 3: 97,56 - 97,61 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Хромодомен-геликаза-ДНК-связывающий белок 1-подобный (ALC1) является фермент что у людей кодируется CHD1L ген.[5][6] Он участвует в процессах ремоделирования хроматина и релаксации ДНК, необходимых для репликации, репарации и транскрипции ДНК. ALC1 состоит из домена АТФазы и макродомена. На основании гомологии внутри АТФазного домена ALC1 принадлежит семейству Snf2.[7]

Функция

В развитии

CHD1L, ДНК геликаза, обладает ремоделирование хроматина активность и взаимодействует с PARP1 / PARylation в регуляции плюрипотентности во время развивающий перепрограммирование. Макродомен CHD1L взаимодействует с фрагментом PAR PARylated-PARP1 для облегчения репрограммирования на ранней стадии и плюрипотентность в стволовых клетках.[8] Похоже, что экспрессия CHD1L жизненно важна для ранних событий в эмбриональное развитие. [9]

В ремонте ДНК

Чтобы разрешить критический клеточный процесс репарации ДНК, хроматин должен быть реконструирован в местах повреждения. CHD1L (ALC1) а ремоделирование хроматина белок, очень рано действует в репарации ДНК. Релаксация хроматина происходит быстро в месте повреждения ДНК.[10] Инициатором этого процесса является PARP1 белок, который начинает появляться при повреждении ДНК менее чем за секунду, с половиной максимального накопления в течение 1,6 секунды после повреждения.[11] Затем ремоделирующий хроматин CHD1L (ALC1) быстро прикрепляется к продукту PARP1 и завершает прибытие к повреждению ДНК в течение 10 секунд после повреждения.[10] Примерно половина максимальной релаксации хроматина из-за действия CHD1L (ALC1) происходит через 10 секунд.[10] Затем это позволяет задействовать фермент репарации ДНК. MRE11, чтобы начать восстановление ДНК, в течение 13 секунд.[11] MRE11 участвует в гомологичный рекомбинационный ремонт. CHD1L (ALC1) также требуется для ремонта УФ -поврежденный хроматин через эксцизионная репарация нуклеотидов.[12]

Связанные генные проблемы

С Синдром делеции 1q21.1 происходит нарушение, которое приводит к увеличению разрывов ДНК. Роль CHD1L аналогична роли геликаза с Синдром Вернера[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131778 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028089 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Мао М, Фу Джи, Ву Дж.С., Чжан К.Х., Чжоу Дж., Кан LX, Хуан К.Х., Хе К.Л., Гу Б.В., Хан З.Г., Шен Й, Гу Дж, Юй Ю, Сюй Ш, Ван YX, Чен С.Дж., Чен З. (Июль 1998 г.). «Идентификация генов, экспрессируемых в человеческих CD34 (+) гематопоэтических стволовых / клетках-предшественниках, с помощью тегов экспрессируемой последовательности и эффективного клонирования кДНК полной длины». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (14): 8175–80. Дои:10.1073 / пнас.95.14.8175. ЧВК  20949. PMID  9653160.
  6. ^ «Ген Entrez: ДНК-связывающий белок 1-подобный хромодомена геликазы CHD1L».
  7. ^ Флаус А., Мартин Д.М., Бартон Г.Дж., Оуэн-Хьюз Т. (31 мая 2006 г.). «Идентификация нескольких различных подсемейств Snf2 с консервативными структурными мотивами». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (10): 2887–905. Дои:10.1093 / нар / gkl295. ЧВК  1474054. PMID  16738128.
  8. ^ Цзян Б.Х., Чен В.Й., Ли Х.Й., Цзянь И, Чанг В.С., Се ПК, Ву П, Чен Ц.Й., Сон Х.Й., Цзянь С.С., Сун Ю.Дж., Чиу С.Х. "CHD1L регулируемая PARP1-управляемая плюрипотентность и ремоделирование хроматина во время раннего репрограммирования клеток". Стволовые клетки. 33 (10): 2961–72. Дои:10.1002 / шток.2116. ЧВК  4832376. PMID  26201266.
  9. ^ Снайдер А.С., Леонг Д., Ван Ц.Т., Высоцка Дж., Яо М.В., Скотт М.П. (февраль 2013 г.). «Фактор ремоделирования хроматина Chd1l необходим преимплантационному эмбриону». Биология Открыть. 2 (2): 121–31. Дои:10.1242 / bio.20122949. ЧВК  3575647. PMID  23429299.
  10. ^ а б c Sellou H, Lebeaupin T, Chapuis C, Smith R, Hegele A, Singh HR, Kozlowski M, Bultmann S, Ladurner AG, Timinszky G, Huet S (декабрь 2016 г.). «Поли (АДФ-рибоза) -зависимый ремоделер хроматина Alc1 индуцирует локальную релаксацию хроматина при повреждении ДНК». Молекулярная биология клетки. 27 (24): 3791–3799. Дои:10.1091 / mbc.E16-05-0269. ЧВК  5170603. PMID  27733626.
  11. ^ а б Haince JF, McDonald D, Rodrigue A, Déry U, Masson JY, Hendzel MJ, Poirier GG (январь 2008 г.). «PARP1-зависимая кинетика рекрутирования белков MRE11 и NBS1 на множественные участки повреждения ДНК». Журнал биологической химии. 283 (2): 1197–208. Дои:10.1074 / jbc.M706734200. PMID  18025084.
  12. ^ Pines A, Vrouwe MG, Marteijn JA, Typas D, Luijsterburg MS, Cansoy M, Hensbergen P, Deelder A, de Groot A, Matsumoto S, Sugasawa K, Thoma N, Vermeulen W., Vrieling H, Mullenders L (октябрь 2012 г.). «PARP1 способствует эксцизионной репарации нуклеотидов посредством стабилизации DDB2 и привлечения ALC1». Журнал клеточной биологии. 199 (2): 235–49. Дои:10.1083 / jcb.201112132. ЧВК  3471223. PMID  23045548.
  13. ^ Гарвард C (2011). «Понимание влияния варианта 1q21.1 количества копий». Журнал редких заболеваний Orphanet. 6: 54. Дои:10.1186/1750-1172-6-54. ЧВК  3180300. PMID  21824431.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение