Кателицидин - Cathelicidin

ЛАГЕРЬ
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыЛАГЕРЬ, IPR001894, CAP-18, CAP18, CRAMP, HSD26, ген FALL39, ген LL37, FALL39, LL37, FALL-39, антимикробный пептид кателицидин, кателицидины
Внешние идентификаторыOMIM: 600474 MGI: 108443 ГомолоГен: 110678 Генные карты: ЛАГЕРЬ
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение CAMP
Геномное расположение CAMP
Группа3п21.31Начинать48,223,347 бп[1]
Конец48,225,491 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CAMP 210244 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004345

NM_009921

RefSeq (белок)

NP_004336

NP_034051

Расположение (UCSC)Chr 3: 48.22 - 48.23 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Антимикробные пептиды кателицидина (ЛАГЕРЬ) LL-37 и ОСЕНЬ-39 находятся полипептиды которые в основном хранятся в лизосомы из макрофаги и полиморфноядерные лейкоциты (PMN); у людей ЛАГЕРЬ ген кодирует предшественник пептида CAP-18, который расщепляется на активные формы LL-37 и FALL-39.[4][5]

Кателицидины играют важную роль во врожденной иммунной защите млекопитающих от инвазивной бактериальной инфекции.[6] Пептиды семейства кателицидинов классифицируются как антимикробные пептиды (AMP). Семейство AMP также включает дефенсины. В то время как дефенсины имеют общие структурные особенности, кателицидин-родственные пептиды очень гетерогенны.[6] Члены семейства антимикробных полипептидов кателицидинов характеризуются высококонсервативной областью (доменом кателина) и сильно вариабельным доменом пептида кателицидина.[6]

Пептиды кателицидина были выделены из многих различных видов млекопитающие. Кателицидины первоначально были обнаружены в нейтрофилы, но с тех пор были обнаружены во многих других клетках, включая эпителиальный клетки и макрофаги после активации бактериями, вирусами, грибами или гормоном 1,25-Д, который является гормонально активной формой Витамин Д.[7]

Механизм антимикробного действия

Общее правило механизма, запускающего действие кателицидина, как и других антимикробных пептидов, включает дезинтеграцию (повреждение и прокалывание) клеточных мембран организмов, в отношении которых пептид активен.[8] Кателицидин быстро разрушает липопротеиновые мембраны микробов, окруженных фагосомы после слияния с лизосомы в макрофаги.

Характеристики

Кателицидины имеют размер от 12 до 80 аминокислотных остатков и широкий диапазон структур.[9] Большинство кателицидинов представляют собой линейные пептиды с 23-37 аминокислотными остатками и складываются в амфипатические пептиды. α-спирали. Кроме того, кателицидины также могут быть молекулами небольшого размера (12-18 остатков) с бета-шпилечными структурами, стабилизированными одной или двумя дисульфидными связями. Также присутствуют еще более крупные пептиды кателицидина (39-80 аминокислотных остатков). Эти более крупные кателицидины демонстрируют повторяющиеся пролиновые мотивы формирование протяженных структур полипролинового типа.[6]

Семейство кателицидинов разделяет первичную гомологию последовательностей с цистатин[10] семейство ингибиторов цистеиновых протеиназ, хотя аминокислотные остатки, которые считаются важными для такого ингибирования протеаз, обычно отсутствуют.

Нечеловеческие ортологи

Пептиды кателицидина были обнаружены у людей, обезьян, мышей, крыс, кроликов, морских свинок, панд, свиней, крупного рогатого скота, лягушек, овец, коз, цыплят и лошадей.

В настоящее время идентифицированные пептиды кателицидина включают следующее:[6]

  • Человек: hCAP-18 (расщепляется на LL-37 и FALL-39)
  • Обезьяна-резус: RL-37
  • Мыши: CRAMP-1/2, (антимикробный пептид, связанный с кателицидином)[11]
  • Крысы: rCRAMP
  • Кролики: CAP-18
  • Морская свинка: CAP-11
  • Свиньи: ПР-39, Профенин, ПМАП-23,36,37
  • Крупный рогатый скот: BMAP-27,28,34 (миелоидные противомикробные пептиды крупного рогатого скота); Bac5, Bac7
  • Лягушки: кателицидин-AL (содержится в Амолопс лолоенсис )[12]
  • Куры: четыре кателицидина, фоулицидин 1,2,3 и кателицидин бета-1. [13]
  • Тасманский дьявол: Saha-CATH5 [14]
  • Лососевые: CATH1 и CATH2

Клиническое значение

Пациенты с розацеа имеют повышенные уровни кателицидина и повышенные уровни триптические ферменты рогового слоя (SCTE). Кателицидин расщепляется на антимикробный пептид. LL-37 обоими калликрейн 5 и калликрейн 7 сериновые протеазы. Предполагается, что чрезмерное производство LL-37 является причиной всех подтипов Розацеа.[15] В прошлом для лечения розацеа использовались антибиотики, но антибиотики могут работать только потому, что они ингибируют некоторые SCTE.[16]

Более высокие уровни в плазме антимикробного белка кателицидина человека (hCAP18 ) значительно снижают риск смерти от инфекции в диализ пациенты. Пациенты с высоким уровнем этого белка в 3,7 раза чаще выживали после диализа почек в течение года без смертельной инфекции.[17] Производство кателицидина повышается за счет Витамин Д.[18][19]

СААП-148 (а sсинтетический апротивомикробные и анитбиофильм пeptide) представляет собой модифицированную версию LL-37, которая обладает повышенной антимикробной активностью по сравнению с LL-37. В частности, SAAP-148 более эффективно убивал бактерии в физиологических условиях.[20]

Считается, что LL-37 играет роль в псориаз патогенез (наряду с другими антимикробными пептидами). При псориазе поврежден кератиноциты высвобождают LL-37, который образует комплексы с самогенетическим материалом (ДНК или РНК) из других клеток. Эти комплексы стимулируют дендритные клетки (тип антигенпрезентирующей клетки), которые затем высвобождают интерферон α и β, который способствует дифференцировке Т-клеток и продолжающемуся воспалению.[21] LL-37 также оказался распространенным аутоантигеном при псориазе; Т-клетки, специфичные для LL-37, были обнаружены в крови и коже у двух третей пациентов с псориазом средней и тяжелой степени.[21]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164047 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Энтрез Ген: антимикробный пептид кателицидина CAMP».
  5. ^ Запись UniProt: P49913 Проверено 29 ноября 2019 г.
  6. ^ а б c d е Занетти М (январь 2004 г.). «Кателицидины, многофункциональные пептиды врожденного иммунитета». Журнал биологии лейкоцитов. 75 (1): 39–48. Дои:10.1189 / jlb.0403147. PMID  12960280. S2CID  14902156.
  7. ^ Лю П.Т., Стенгер С., Ли Х., Венцель Л., Тан Б.Х., Круцик С.Р., Очоа М.Т., Шаубер Дж., Ву К., Мейнкен С., Камен Д.Л., Вагнер М., Балс Р., Штайнмайер А., Цюгель Ю., Галло Р.Л., Айзенберг Д. , Хьюисон М., Холлис Б.В., Адамс Дж. С., Блум Б. Р., Модлин Р. Л. (март 2006 г.). «Запуск Toll-подобного рецептора опосредованного витамином D антимикробного ответа человека». Наука. 311 (5768): 1770–3. Bibcode:2006Научный ... 311.1770L. Дои:10.1126 / science.1123933. PMID  16497887. S2CID  52869005.
  8. ^ Костючук Е.М., Лисовский П., Ярчак Ю., Стшалковская Н., Ювик А., Горбаньчук Ю., Кшижевский Ю., Звежовский Л., Багницка Е. (декабрь 2012 г.). «Кателицидины: семейство антимикробных пептидов. Обзор». Отчеты по молекулярной биологии. 39 (12): 10957–70. Дои:10.1007 / s11033-012-1997-х. ЧВК  3487008. PMID  23065264.
  9. ^ Дженнаро Р., Занетти М. (2000). «Структурные особенности и биологическая активность антимикробных пептидов на основе кателицидина». Биополимеры. 55 (1): 31–49. Дои:10.1002 / 1097-0282 (2000) 55: 1 <31 :: AID-BIP40> 3.0.CO; 2-9. PMID  10931440.
  10. ^ Зайоу М., Низет В., Галло Р.Л. (май 2003 г.). «Антимикробные и протеазо-ингибирующие функции пропоследовательности человеческого кателицидина (hCAP18 / LL-37)». Журнал следственной дерматологии. 120 (5): 810–6. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2003.12132.x. PMID  12713586.
  11. ^ Галло Р.Л., Ким К.Дж., Бернфилд М., Козак К.А., Занетти М., Мерлуцци Л., Дженнаро Р. (май 1997 г.). «Идентификация CRAMP, антимикробного пептида, связанного с кателином, экспрессируемого в эмбриональной и взрослой мыши». Журнал биологической химии. 272 (20): 13088–93. Дои:10.1074 / jbc.272.20.13088. PMID  9148921.
  12. ^ Хао Х, Ян Х, Вэй Л., Ян С., Чжу В., Ма Д., Ю Х, Лай Р. (август 2012 г.). «Кателицидин амфибий заполняет эволюционный пробел кателицидина у позвоночных». Аминокислоты. 43 (2): 677–85. Дои:10.1007 / s00726-011-1116-7. PMID  22009138. S2CID  2794908.
  13. ^ Achanta M, Sunkara LT, Dai G, Bommineni YR, Jiang W., Zhang G (май 2012 г.). «Тканевая экспрессия и регуляция развития антимикробных пептидов куриного кателицидина». Журнал зоотехники и биотехнологии. 3 (1): 15. Дои:10.1186/2049-1891-3-15. ЧВК  3436658. PMID  22958518.
  14. ^ Peel E, Cheng Y, Djordjevic JT, Fox S, Sorrell TC, Belov K (октябрь 2016 г.). "Кателицидины у тасманского дьявола (Sarcophilus harrisii)". Научные отчеты. 6: 35019. Bibcode:2016НатСР ... 635019П. Дои:10.1038 / srep35019. ЧВК  5057115. PMID  27725697.
  15. ^ Рейнхольц М., Ружичка Т., Шаубер Дж. (Май 2012 г.). «Кателицидин LL-37: антимикробный пептид, играющий роль в воспалительных заболеваниях кожи». Анналы дерматологии. 24 (2): 126–35. Дои:10.5021 / ad.2012.24.2.126. ЧВК  3346901. PMID  22577261.
  16. ^ Ямасаки К., Ди Нардо А., Бардан А., Мураками М., Отаке Т., Кода А., Доршнер Р. А., Боннар С., Декарг П., Овнанян А., Морхен В. Б., Галло Р. Л. (август 2007 г.). «Повышенная активность сериновой протеазы и кателицидина способствует воспалению кожи при розацеа». Природа Медицина. 13 (8): 975–80. Дои:10,1038 / нм 1616. PMID  17676051. S2CID  23470611.
  17. ^ Гомбарт А.Ф., Бхан И., Боррегаард Н., Тамез Х., Камарго, Калифорния, Кёффлер Х.П., Тадхани Р. (февраль 2009 г.). «Низкий уровень в плазме антимикробного пептида кателицидина (hCAP18) предсказывает повышение смертности от инфекционных заболеваний у пациентов, находящихся на гемодиализе». Клинические инфекционные болезни. 48 (4): 418–24. Дои:10.1086/596314. ЧВК  6944311. PMID  19133797.
  18. ^ Заслов М (январь 2002 г.). «Антимикробные пептиды многоклеточных организмов». Природа. 415 (6870): 389–95. Bibcode:2002Натурал.415..389Z. Дои:10.1038 / 415389a. PMID  11807545. S2CID  205028607.
  19. ^ Камен Д.Л., Тангприча В. (май 2010 г.). «Витамин D и молекулярное воздействие на иммунную систему: модуляция врожденного и аутоиммунного». Журнал молекулярной медицины. 88 (5): 441–50. Дои:10.1007 / s00109-010-0590-9. ЧВК  2861286. PMID  20119827.
  20. ^ Брейдж, Анна де; Риол, Мартин; Cordfunke, Robert A .; Маланович, Нермина; Бур, Леони де; Конинг, Роман I .; Равенсберген, Элизабет; Франкен, Марникс; Хейде, Тобиас ван дер (10.01.2018). «Антимикробный пептид SAAP-148 борется с устойчивыми к лекарствам бактериями и биопленками». Научная трансляционная медицина. 10 (423): eaan4044. Дои:10.1126 / scitranslmed.aan4044. ISSN  1946-6234. PMID  29321257.
  21. ^ а б Рендон, Адриана; Schäkel, Knut (23 марта 2019 г.). «Патогенез и лечение псориаза». Международный журнал молекулярных наук. 20 (6): 1475. Дои:10.3390 / ijms20061475. ЧВК  6471628. PMID  30909615.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P49913 (Человеческий кателицидин) в PDBe-KB.