База данных классификации транспортеров - Transporter Classification Database

В База данных классификации транспортеров (или TCDB) является Международный союз биохимии и молекулярной биологии (IUBMB) -утвержденная система классификации для мембранные транспортные белки, в том числе ионные каналы.^[1][2][3]

Классификация

Верхний уровень классификации и несколько примеров белков с известной трехмерной структурой:

1. каналы и поры

1. каналы α-типа

• 1.A.1 Суперсемейство управляемых напряжением ионных каналов
• 1.A.2 Внутренний выпрямитель К⁺ канальная семья
• 1.A.3 Рецептор рианодин-инозитол-1,4,5-трифосфата Ca²⁺ канальная семья
• 1.A.4 Переходный рецепторный потенциал Ca²⁺ канальная семья
• 1.A.5 Семейство катионных каналов полицистина
• 1.A.6 Эпителиальный Na⁺ канальная семья
• 1.A.7 Семейство катионных каналов рецептора АТФ P2X
• 1.A.8 Основное суперсемейство внутренних белков
• 1.A.9 Рецептор нейротрансмиттера, петля Cys, семейство лиганд-зависимых ионных каналов
• 1.A.10 Семейство глутаматных ионных каналов из рецепторы нейротрансмиттеров
• 1.A.11 Семейство канальных транспортеров аммиака
• 1.A.12 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов
• 1.A.13 Семейство эпителиальных хлоридных каналов
• 1.A.14 Семейство передачи генов, усиленных семенниками
• 1.A.15 Неселективное семейство катионов канал-2
• 1.A.16 Семейство формиат-нитритных транспортеров
• 1.A.17 Семейство кальцийзависимых хлоридных каналов
• 1.A.18 Хлоропластная оболочка, образующая анионный канал, семейство Tic110
• 1.A.19 Семейство каналов матрикс-2 вируса гриппа типа А
• 1.A.20 BCL2 / Adenovirus E1B-взаимодействующий белок 3 семейства
• 1.A.21 Семейство bcl-2
• 1.A.22 Механочувствительный ионный канал с большой проводимостью
• 1.A.23 Механочувствительный ионный канал с малой проводимостью
• 1.A.24 Семейство коннексинов, образующих щелевые соединения
• 1.A.25 Семейство иннексинов, образующих щелевые соединения
• 1.A.26 Mg²⁺ семейство транспортеров-E
• 1.A.27 Семья Фосфолемман
• 1.A.28 Семейство транспортеров мочевины
• 1.A.29 Семейство мочевинных / амидных каналов
• 1.A.30 ЧАС⁺- или Na⁺-транслоцирующий бактериальный жгутиковый мотор MotAB / суперсемейство ExbBD-транспортирующий активатор внешней мембраны
• 1.A.31 Семья Аннексин
• 1.A.32 Семейство каналов NB вируса гриппа типа B
• 1.A.33 Белки теплового шока 70, образующие катион-канал
• 1.A.34 Бациллы семейство каналообразующих комплексов типа щелевого соединения
• 1.A.35 Семейство переносчиков ионов металлов CorA
• 1.A.36 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов
• 1.A.37 CD20 Ca²⁺ канальная семья
• 1.A.38 Семейство регуляторов pH Гольджи
• 1.A.39 Семейство каналов CM2 вируса гриппа типа C
• 1.A.40 Семейство Vpu-каналов вируса иммунодефицита человека типа I
• 1.A.41 Птичий реовирус p10 Семейство вропоринов
• 1.A.42 Семейство вирусных белков R ВИЧ
• 1.A.43 Устойчивость к камфоре или семья экспортеров фторида
• 1.A.44 Порообразующий белок кончика хвоста pb2 семейства фага Т5
• 1.A.45 Семейство инъекционных фагов P22
• 1.A.46 Семейство бестрофинов, образующих анионный канал
• 1.A.47 Нуклеотид-чувствительный анион-селективный канал, семейство ICln
• 1.A.48 Анионный канал Семья Твити
• 1.A.49 Коронавирус человека ns12.9 семейство виропоринов
• 1.A.50 Фосфоламбан (Ca²⁺-канал и Ca²⁺-ATPase регулятор) семейство
• 1.A.51 Семейство потенциалзависимых протонных каналов (VPC)
• 1.A.52 Ca²⁺ Релиз-активированный Ca²⁺ (CRAC) Семейство каналов (CRAC-C)
• 1.A.53 Семейство катион-селективных каналов виропорина P7 вируса гепатита C (HCV-P7)
• 1.A.54 Пресенилин ER Ca²⁺ Канал утечки (пресенилин) Семья
• 1.A.55 Са, связанный с синаптическими пузырьками²⁺ Канал, Цветок (Цветок) Семья
• 1.A.56 Семейство медных транспортеров (Ctr)
• 1.A.57 Виропорин, коронавирус SARS человека (SARS-VP)
• 1.A.58 Семейство матричных белков 2 (BM2-C) вируса гриппа типа B
• 1.A.59 Порообразующий пептид вируса болезни бурсальной полости, семейство Pep46 (Pep46)
• 1.A.60 Преобразующий пептид реовируса млекопитающих, семейство Mu-1 (Mu-1)
• 1.A.61 Семейство цепи F (гамма-пептид), образующей канал Nodavirus насекомых
• 1.A.62 Семейство гомотримерных катионных каналов (TRIC)
• 1.A.63 α-спиральный порин внешней мембраны игникокка (семейство I-OMP
• 1.A.64 Семейство плазмолипинов (плазмолипинов)
• 1.A.65 Семейство белков виропорина E (виропорин E) коронавируса
• 1.A.66 Семейство пардаксин (пардаксин)
• 1.A.67 Мембрана Mg²⁺ Семейство транспортеров (MMgT)
• 1.A.68 Семейство малых гидрофобных вирусов виропоринов (V-SH)
• 1.A.69 Семейство каналов рецепторов гетеромерного одоранта (HORC)
• 1.A.70 Молекула против микробов семейства A (MamA)
• 1.A.71 Семейство кислотно-растворимых белков мозга (канал BASP1)
• 1.A.72 Надсемейство Mer
• 1.A.73 Семейство белков лизиса колицина (CLP)
• 1.A.74 Семейство Mitsugumin 23 (MG23)
• 1.A.75 Механический ноцицептор, семейство пьезо (пьезо)
• 1.A.76 Семейство транспортеров магния1 (MagT1)
• 1.A.77 Mg²⁺/ Ca²⁺ Семейство Uniporter (MCU)
• 1.A.78 K⁺-селективный канал в семействе эндосом и лизосом (KEL)
• 1.A.79 Белок захвата холестерина (ChUP) или семейство двухцепочечных РНК
• 1.A.80 Семейство NS4a виропоринов (NS4a)
• 1.A.81 Низкое сродство Ca²⁺ Канал (LACC) Семья
• 1.A.82 Семейство каналов механотрансдукции волосковых клеток (HCMC)
• 1.A.83 Семейство вирусов SV40 Viroporin VP2 (SV40 VP2)
• 1.A.84 Модулятор гомеостаза кальция Ca²⁺ Канал (CALHM-C) Семья
• 1.A.85 Семейство полиовируса 2B Виропорин (2B Виропорин)
• 1.A.86 Семейство вируса папилломы человека типа 16 (HPV16) L2 виропорин (L2 виропорин)
• 1.A.87 Семейство механочувствительных кальциевых каналов (MCA)
• 1.A.88 Семейство грибковых калиевых каналов (F-Kch)
• 1.A.89 Семейство человеческого коронавируса 229E виропорин (229E виропорин)
• 1.A.90 Семейство виропоринов метапневмовируса человека (HMPV) (HMPV-виропорин)
• 1.A.91 Асексуальный белок 3.2, связанный с цитоадгезией, семейства Plasmodium falciparum (Clag3)
• 1.A.92 Семейство реовирусов Viroporin VP10 (RVP10)
• 1.A.93 Семейство неструктурного белка 3 вируса синего языка виропоринов (NS3)
• 1.A.94 Семейство ротавирусных неструктурных гликопротеинов 4 виропоринов (NSP4)
• 1.A.95 Семейство эфемеровирусов виропоринов (EVVP)
• 1.A.96 Семейство виропоринов вируса полиомы человека (PVVP)
• 1.A.97 Семейство виропоринов E5 вируса папилломы человека 16 типа (HPV-E5)
• 1.A.98 Семейство белков P13 Т-лимфотропного вируса 1 человека (HTLV1-P13)
• 1.A.99 Семейство малых мембранных белков E оболочки вируса инфекционного бронхита (IBV-E)
• 1.A.100 Предполагаемый виропорин Rhabdoviridae, семейство U5 (RV-U5)
• 1.A.101 Семейство пероксисомальных порообразующих Pex11 (Pex11)
• 1.A.102 Семейство виропоринов PB1-F2 (PB1-F2) вируса гриппа A
• 1.A.103 Семейство обезьяньих вирусов 5 (вирус парагриппа 5) SH (SV5-SH)
• 1.A.104 Предлагаемый биосинтез жгутиков Na⁺ Канал, Семья FlaH (FlaH)
• 1.A.105 Семейство киназных доменов смешанного происхождения (MLKL)
• 1.A.106 Семейство кальциевых каналов, активируемых нагрузкой кальцием (CLAC)
• 1.A.107 Семейство порообразующих глобинов (глобинов)

1.B. β-бочковые порины и другие белки внешней мембраны

• 1.B.1 Общее бактериальное семейство поринов
• 1.B.2 Хламидийный семейство поринов (CP)
• 1.B.3 Сахарный порин (SP) семья
• 1.B.4 Brucella-Rhizobium порин (BRP) семья
• 1.B.5 Псевдомонады Семейство опрП поринов (ПОП)
• 1.B.6 Семейство поринов OmpA-OmpF (OOP)
• 1.B.7 Семейство Rhodobacter PorCa porin (RPP)
• 1.B.8 Семейство митохондриальных и пластидных поринов (MPP)
• 1.B.9 Семейство белков внешней мембраны FadL (FadL)
• 1.B.10 Семейство нуклеозид-специфичных каналообразующих поринов внешней мембраны (Tsx)
• 1.B.11 Семейство фимбриальных поринов с внешней мембраной (FUP)
• 1.B.12 Автовоз-1 (AT-1) семейство
• 1.B.13 Альгинат экспортный порин (AEP) семья
• 1.B.14 Семейство рецепторов внешней мембраны (OMR)
• 1.B.15 Семейство рафинозных поринов (RafY)
• 1.B.16 Семейство короткоцепочечных амидов и мочевины поринов (SAP)
• 1.B.17 Семейство фактора внешней мембраны (OMF)
• 1.B.18 Семейство вспомогательных белков внешней мембраны (OMA)
• 1.B.19 Семейство глюкозоселективных поринов OprB (OprB)
• 1.B.20 Семейство секреции с двумя партнерами (TPS)
• 1.B.21 Семейство поринов OmpG (OmpG)
• 1.B.22 Семейство секретинов (секретинов) внешней бактериальной мембраны
• 1.B.23 Семейство цианобактериальных поринов (CBP)
• 1.B.24 Микобактериальный порин
• 1.B.25 Семейство поринов внешней мембраны (Opr)
• 1.B.26 Семейство циклодекстринпоринов (CDP)
• 1.B.31 Campylobacter jejuni семья ооринов главной наружной мембраны (MomP)
• 1.B.32 Семейство поринов внешней мембраны фузобактерий (FomP)
• 1.B.33 Семейство поринов, вставленных во внешнюю мембрану (комплекс Bam) (OmpIP)
• 1.B.34 Коринебактериальные порины
• 1.B.35 Семейство олигогалактуронат-специфичных поринов (KdgM)
• 1.B.39 Бактериальный порин, семейство OmpW (OmpW)
• 1.B.42 Семейство экспортных поринов липополисахаридов внешней мембраны (LPS-EP)
• 1.B.43 Семейство Coxiella porin P1 (CPP1)
• 1.B.44 Вероятный белок семейства porphyromonas gingivalis porin (PorT), переносящий белок
• 1.B.49 Семейство поринов Anaplasma P44 (A-P44)
• 1.B.48 Curli-образные транспортеры
• 1.B.54 Интимин / Invasin (Int / Inv) или Автовоз-3 семья
• 1.B.55 Семейство поли-ацетил-D-глюкозаминпоринов (PgaA)
• 1.B.57 Семейство белков большой наружной мембраны Legionella (LM-OMP)
• 1. Семейство поринов B.60 Omp50 (Omp50 Porin)
• 1.B.61 Семейство дельта-протеобактериальных поринов (Delta-porin)
• 1.B.62 Предполагаемое семейство бактериальных поринов (PBP)
• 1.B.66 Предполагаемое семейство бета-стволовых поринов-2 (BBP2)
• 1.B.67 Предполагаемое семейство бета-баррелей поринов-4 (BBP4)
• 1.B.68 Предполагаемое суперсемейство бета-стволовых поринов-5 (BBP5)
• 1.B.70 Семейство наружных мембранных каналов (OMC)
• 1.B.71 Семейство протеобактериальных / веррукомикробных поринов (ПВП)
• 1.B.72 Семейство поринов внешней мембраны протохламидий (PomS / T)
• 1.B.73 Семейство биогенеза / сборки капсул (CBA)
• 1.B.78 DUF3374 семейство связанных с транспортом электронов поринов (ETPorin)

1.C Порообразующие токсины (белки и пептиды)

• 1.C.3 α-Гемолизин (αHL) семья
• 1.C.4 Аэролизин семья
• 1.C.5 ε-токсин семья
• 1.C.11 Суперсемейство RTX-токсинов
• 1.C.12 Комплекс мембранной атаки / надсемейство перфоринов
• 1.C.13 Лейкоцидин семья
• 1.C.14 Цитогемолизин (CHL) семья
• 1.C.39 Семейство тиол-активированных холестерин-зависимых цитолизинов
• 1.C.43 Лысенин семья
• 1.C.56 Pseudomonas syringae Семейство катионных каналов HrpZ
• 1.C.57 Клостридиальное семейство цитотоксинов
• 1.C.74 Змеиный цитотоксин (SCT) семья
• 1.C.97 Семейство порообразующих плевротолизинов

1.D Каналы, синтезированные не рибосомами

• 1.D.1. Грамицидин А Канал Семья
• 1.D.2 Каналообразующий Сирингомицин Семья
• 1.D.3 Семейство каналообразующих сирингопептинов
• 1.D.4 Семья, образующая канал Толаасин
• 1.D.5. Аламетицин или Пептаибол Семейство антибиотиков, образующих канал
• 1.D.6 Комплексный поли-3-гидроксибутират Ca²⁺ Канал (cPHB-CC) Семейство
• 1.D.7 Семья Бетиколина
• 1.D.8. Сапонин Семья
• 1.D.9. Полиглутамин Семейство ионных каналов (PG-IC)
• 1.D.10. Керамид -формирование семейства каналов
• 1.D.11. Сурфактин Семья
• 1.D.12 Семья Боверицинов (Beauvericin)
• 1.D.13 Амфипатические пептидные антибиотики с доставкой ДНК (DAPA)
• 1.D.14 Семейство синтетических Leu / Ser амфипатических каналообразующих пептидов (l / S-SCP)
• 1.D.15 Семья даптомицина (даптомицина)
• 1.D.16 Семейство синтетических амфипатических порообразующих гептапептидов (SAPH)
• 1.D.17 Комбинаторно разработанное семейство порообразующих β-листовых пептидов
• 1.D.18 Семейство порообразующих конъюгатов гуанозин-желчная кислота
• 1.D.19 Ca²⁺ Каналообразующий препарат, Дигитоксин Семья
• 1.D.20 Семейство порообразующих полиеновых макролидных антибиотиков / грибковых агентов (PMAA)
• 1.D.21 Семейство липидных нанопор (LipNP)
• 1.D.22 Каротиноидный пигмент, перемещающий протоны, Зеаксантин Семья
• 1.D.23 Семейство порообразующих фениленэтиниленовых противомикробных средств (PEPA)
• 1.D.24 Семейство морских губок из политеонамида B (pTB)
• 1.D.25 Семейство ариламиновых фолдамеров (AAF)
• 1.D.26 Семейство 9'-O-β-D-глюкозидов дигидродегидродикониферилового спирта (DDDC9G)
• 1.D.27 Семейство Thiourea isosteres
• 1.D.28 Семейство липопептаиболов
• 1.D.29 Семейство макроциклических олигохолатов
• 1.D.30 Семейство искусственных гидразид-связанных столбов [5] ареновых каналов (HAPA-C)
• 1.D.31. Амфотерицин B Семья
• 1.D.32 Порообразующие Новицидин Семья
• 1.D.33 Каналообразующий Политеонамид B Семья
• 1.D.34 Каналообразующие олигоэфирные болаамфифилы
• 1.D.35 Порообразующий циклический Липодепсипептид Семья
• 1.D.36. Олигоборнене Семейство ионных каналов
• 1.D.37. Гибикуслид C Семья
• 1.D.38 Семейство циклических пептидных нанотрубок (cPepNT)
• 1.D.39 Семейство контролируемых светом амфифильных молекулярных ионных каналов на основе азобензола (AAM-IC)
• 1.D.40 Семейство липидных тороидальных пор, индуцированных белком
• 1.D.41 Семейство ионофоров спротетонатного типа (спирогексанолид)
• 1.D.42 Семейство трипептидов Phe-Arg-столба [5] ареновых каналов (TPPA-C)
• 1.D.43 Семейство гуанозиндинуклеозидных каналов (TT-GDN-C), адаптированных к триазолам
• 1.D.44 Синтетический ионный канал с редокс-активным семейством ферроцена (ICRF)
• 1.D.45 Семейство мембранных пор сонопорации и электропорации (SEMP)
• 1.D.46 Семейство ДНК-нанопор (DnaNP)
• 1.D.47 Семейство порообразующих синтетических циклических пептидов (PSCP)
• 1.D.48 Порообразующие Сирингомицин E Семья
• 1.D.49 Семейство трансмембранных каротиноидных радикальных каналов (CRC)
• 1.D.50 Семейство переносчиков амфифильных бис-катехол-анионов (AC-AT)
• 1.D.51 Семейство белковых нанопор (ProNP)
• 1.D.52 Семейство нанопор макроцикла ароматического олигоамида (OmnNP)
• 1.D.53 Семейство альфа, гамма-пептидных нанотрубок (a, gPepNT)
• 1.D.54 Семейство калий-селективных гексил-бензоуреидо-15-краун-5-эфирных ионных каналов (HBEC)
• 1.D.55 Семейство нанопор на основе порфирина (PorNP)
• 1.D.56 Семейство олигомерных нанопор (AibNP) альфа-аминоизобутирата (Aib)
• 1.D.57 Семейство липидных электропор (LEP)
• 1.D.58 Семейство продигиозена, переносящего анион (продигиозен)
• 1.D.59 Семейство переносчиков анионов перенозина (Perenosin)
• 1.D.60 Семейство альфа, гамма-циклических пептидов (AGCP)
• 1.D.61 Семейство анионофорных 2,6-бис (бензимидазол-2-ил) пиридинов (ABBP)
• 1.D.62 Семейство каналообразующих производных бис-триазолилдигуанозина (TDG)
• 1.D.63 Семейство нанопор на основе пептидов (PepNP)
• 1.D.64 Семейство углеродных нанотрубок (CarNT)
• 1.D.65 Семейство порообразующих амфидинолов (амфидинолов)
• 1.D.66 Семейство спиральных макромолекул и нанопор (HmmNP)
• 1.D.67 Семейство спиральных пептидных ионных каналов (CEHP), модифицированных коронным эфиром
• 1.D.68 Семейство порообразующих плейроновых блочных полимеров (PPBP)
• 1.D.69 Семейство конических нанопор (ConNP)
• 1.D.70 Семейство металлических (Au / Ag / Pt / графен) нанопор (MetNP)
• 1.D.71 Семейство синтетических пептидов TP359 (TP359)
• 1.D.72 Семейство триазиновых рецепторов на основе хлорид-носителя (CCTTR)
• 1.D.73 Семейство мезопористых нанопор кремнезема (SilNP)
• 1.D.74 Семейство синтетических жестких п-октифенилстейв-пор (SSROP), чувствительных к стимулам

1.E Холинс

1.F Слияние пузырьков поры

• 1.F.1 Семейство пор слияния синаптосомных пузырьков (SVF-Pore)
• 1.F.2 Семейство октамерных экзоцист (экзоцист)

1.G Вирусный синтез поры

• 1.G.1 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-1 (VMFP1)
• 1.G.2 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-2 (VMFP2)
• 1.G.3 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-3 (VMFP3)
• 1.G.4 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-4 (VMFP4)
• 1.G.5 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-5 (VMFP5)
• 1.G.6 Семейство слитых белков гепаднавируса S (белок HBV-S)
• 1.G.7 Семейство FAST Fusion Protein (R-FAST) реовируса
• 1.G.8 Семейство слитых белков аренавируса (AV-FP)
• 1.G.9 Семейство синцитина (синцитина)
• 1.G.10 Семейство комплексов слияния мембран вируса простого герпеса (HSV-MFC)
• 1.G.11 Семейство протеиновых комплексов входа в клетки поксвируса (PEP-C)
• 1.G.12 Семейство слитого белка gp95 вируса лейкоза птиц (ALV-gp95)
• 1.G.13 Семейство малых трансмембран, связанных с слиянием ортореовирусов (FAST)
• 1.G.14 Семейство гемагглютинин вируса гриппа / слитый порообразующий белок (Influenza-H / FPP)
• 1.G.15 Семейство гликопротеинов GP64 (GP64) основной оболочки вируса ядерного полиэдроза Autographa californica
• 1.G.16 Семейство гибридных пептидов вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) (ВИЧ-FP)
• 1.G.17 Семейство гликопротеинов оболочки вируса лейкемии крупного рогатого скота (BLV-Env)
• 1.G.18 Пептид слияния SARS-CoV в семействе предшественников гликопротеинов Spike (SARS-FP)
• 1.G.19 Семейство ротавирусных комплексов слияния порообразующих мембран (Rotavirus MFC)
• 1.G.20 Семейство гликопротеинов слияния с оболочкой Gc хантавируса (Gc-EFG)
• 1.G.21 Семейство вирусов Эпштейна-Барра (вирус герпеса человека 4) Gp42 (Gp42)
• 1.G.22 Семейство гликопротеинов gO (gO) цитомегаловируса (вируса герпеса человека 5)

1.H Парацеллюлярные каналы

• 1.H.1. Claudin Tight Junction (Claudin1) Семья
• 1.H.2 Семейство беспозвоночных PMP22-Claudin (Claudin2)

1.I Мембранные каналы

• 1.I.1 Ядерный поровый комплекс семья, в том числе кариоферины
• 1.I.2 Завод плазмодесматы семья

2. Электрохимические транспортеры, управляемые потенциалом

2.А носильщики (унипортеры, сторонники, антипортеры )

• 2.A.1 Суперсемейство Major Facilitator (MFS), см. Также Лактозопермеаза, Фосфат пермеаза и Транспортер глюкозы
• 2.A.2 Гликозид-пентозид-гексуронид (GPH): семейство катионов-симпортеров
• 2.A.3 Семейство аминокислот, полиаминов и органических соединений (APC)
• 2.A.4 Помощник по диффузии катионов (CDF) Семья
• 2.A.5 Цинк (Zn²⁺) -Железо (Fe²⁺) Пермеаза Семья
• 2.A.6 Надсемейство деление резистентность-нодуляция-деление, смотрите также Мембранный белок, экспортирующий белок SecDF
• 2.A.7. Транспортер наркотиков / метаболитов (DMT) Надсемейство
• 2.A.8 Глюконат: H⁺ Семейство Symporter (GntP)
• 2.A.9 Семейство мембранных протеиновых инсертаз (YidC / Alb3 / Oxa1)
• 2.A.10 Семейство переносчиков 2-кето-3-дезоксиглюконата (KdgT)
• 2.A.11 Цитрат-Mg²⁺:ЧАС⁺ (CitM) Цитрат-Ca²⁺:ЧАС⁺ (CitH) Семья сторонников (CitMHS)
• 2.A.12 ATP: Семейство ADP Antiporter
• 2.A.13 Семейство поглощения C4-дикарбоксилата (Dcu)
• 2.A.14 Семейство лактат-пермеаз
• 2.A.15 Семейство переносчиков бетаина / карнитина / холина (BCCT)
• 2.A.16 Устойчивость к теллуриту / переносчик дикарбоксилата Семья
• 2.A.17 Семейство протон-зависимых переносчиков олигопептидов
• 2.A.18 Семейство аминокислот / ауксинпермеаз (AAAP)
• 2.A.19 Ca²⁺: Семейство катионных антипортеров (CaCA)
• 2.A.20 Семейство переносчиков неорганического фосфата (PiT)
• 2.A.21 Растворенное вещество: семейство натриевых симпортеров
• 2.A.22. Нейротрансмиттер: натриевый симпортер Семья
• 2.A.23 Дикарбоксилат / аминокислота: катион (Na⁺ или H⁺Семейство Symporter (DAACS)
• 2.A.24 Семейство переносчиков 2-гидроксикарбоксилата (2-HCT)
• 2.A.25 Аланин или глицин: симпортер катионов (AGCS) Семейство
• 2.A.26 Семейство аминокислот с разветвленной цепью: симпортер катионов (LIVCS)
• 2.A.27 Глутамат: Na⁺ Семейство Symporter (ESS)
• 2.A.28 Желчная кислота: Na⁺ Symporter Семья
• 2.A.29 Митохондриальный носитель Семья
• 2.A.30 Катионно-хлоридный котранспортер (CCC) Семья
• 2.A.31 Семейство анионообменников
• 2.A.32 Семейство транспортеров кремния (сидячих)
• 2.A.33 NhaA Na⁺:ЧАС⁺ Антипортер (NhaA) Семья
• 2.A.34 NhaB Na⁺:ЧАС⁺ Семья Antiporter (NhaB)
• 2.A.35 NhaC Na⁺:ЧАС⁺ Семейство Antiporter (NhaC)
• 2.A.36 Моновалентный катион: протон-антипортер-1 (CPA1) Семья
• 2.A.37 Моновалентный катион: протон-антипортер-2 (CPA2) Семья
• 2.A.38 K⁺ Транспортер (Trk) Семья
• 2.A.39 Нуклеооснование: катионный симпортер-1 (NCS1) Семья
• 2.A.40 Нуклеарное основание: Cation Symporter-2 (NCS2) Семья
• 2.A.41 Семейство концентрирующих переносчиков нуклеозидов (CNT)
• 2.A.42 Семейство пермеаз гидрокси / ароматических аминокислот (HAAAP)
• 2.A.43 Семейство лизосомальных переносчиков цистина (LCT)
• 2.A.45 Семейство выходов арсенит-антимонита
• 2.A.46 Бензоат: H⁺ Symporter (BenE) Семья
• 2.A.47 Двухвалентный анион: Na⁺ Symporter (DASS) Семья
• 2.A.48 Семейство сокращенных переносчиков фолиевой кислоты (RFC)
• 2.A.49 Хлорид-носитель / канал (ClC) Семья
• 2.A.50 Семейство поглощения глицерина (GUP)
• 2.A.51 Семейство переносчиков хромат-ионов (CHR)
• 2.A.52 Ni²⁺-Co²⁺ Семейство транспортеров (NiCoT)
• 2.A.53 Сульфат пермеаза (SulP) Семья
• 2.A.54 Семейство митохондриальных трикарбоксилатных переносчиков (МТС)
• 2.A.55 Металлический ион (Mn²⁺-iron) Транспортер (Nramp) Семья
• 2.A.56 Семейство трехсторонних АТФ-независимых периплазматических транспортеров (TRAP-T)
• 2.A.57 Семейство равновесных переносчиков нуклеозидов (ЛОР)
• 2.A.58 Фосфат: Na⁺ Семейство Symporter (PNaS)
• 2.A.59 Семейство Arsenical Resistance-3 (ACR3)
• 2.A.60 Транспортер органо-анионов (ОАТ) Семья
• 2.A.61 Семейство C (DcuC) с захватом C4-дикарбоксилата
• 2.A.62 NhaD Na⁺:ЧАС⁺ Семья Antiporter (NhaD)
• 2.A.63 Моновалентный катион (K⁺ или Na⁺): Семейство протонных антипортеров (CPA3)
• 2.A.64 Семья близнецов аргинина (Tat)
• 2.A.65 Семейство переносчиков билирубина (BRT)
• 2.A.66 Суперсемейство мультилекарственных / олигосахаридиллипидных / полисахаридных (MOP) флиппаз
• 2.A.67 Семейство переносчиков олигопептидов (OPT)
• 2.A.68 Семейство p-аминобензоилглутаматных переносчиков (AbgT)
• 2.A.69 Семейство ауксиновых переносчиков оттока (AEC)
• 2.A.70 Малонат: Na⁺ Symporter (MSS) Семья
• 2.A.71 Семейство переносчиков фолата-биоптерина (FBT)
• 2.A.72 К⁺ Семейство Uptake Permease (KUP)
• 2.A.73 Семейство поглощения короткоцепочечных жирных кислот (AtoE)
• 2.A.74 Семейство мультилекарственных эндосомальных транспортеров (МЭТ) 4 TMS
• 2.A.75 Семейство экспортеров L-лизина (LysE)
• 2.A.76 Устойчивость к семейству гомосерин / треонин (RhtB)
• 2.A.77 Семейство устойчивости к кадмию (CadD)
• 2.A.78 Семейство экспортеров аминокислот с разветвленной цепью (LIV-E)
• 2.A.79 Семейство экспортеров треонина / серина (ThrE)
• 2.A.80 Семейство транспортеров трикарбоксилата (TTT)
• 2.A.81 Семейство аспартатов: аланиновых обменников (AAEx)
• 2.A.82 Семейство переносчиков органических растворенных веществ (OST)
• 2.A.83 Na⁺-зависимое семейство транспортеров бикарбоната (SBT)
• 2.A.84 Семейство экспортеров мальтозы из хлоропластов (MEX)
• 2.A.85 Семейство экспортеров ароматических кислот (ArAE)
• 2.A.86 Семейство экспортеров Autoinducer-2 (AI-2E) (ранее семейство PerM, TC № 9.B.22)
• 2.A.87 Семейство прокариотических транспортеров рибофлавина (P-RFT)
• 2.A.88 Семейство транспортеров захвата витаминов (VUT или ECF)
• 2.A.89 Семейство вакуумных транспортеров железа (VIT)
• 2.A.90 Рецептор / переносчик витамина А (STRA6) Семья
• 2.A.91 Комплекс импорта митохондриальной тРНК (M-RIC) (Ранее 9.C.8)
• 2.A.92 Семейство холиновых транспортеров (CTL)
• 2.A.94 Семейство фосфатпермеазы (Pho1)
• 2.A.95 Семейство переносчиков нейтральных аминокислот 6TMS (NAAT)
• 2.A.96 Семейство транспортеров захвата ацетата (AceTr)
• 2.A.97 Внутренняя мембрана митохондрий K⁺/ЧАС⁺ и Ca²⁺/ЧАС⁺ Семейство обменников (LetM1)
• 2.A.98 Семья предполагаемых экспортеров сульфатов (PSE)
• 2.A.99 6TMS Ni²⁺ захватывающий транспортер (HupE-UreJ) Семья
• 2.A.100 Семья Ферропортин (Fpn)
• 2.A.101 Семейство Malonate Uptake (MatC) (ранее UIT1)
• 2.A.102 Семейство пермеаз захвата 4-толуолсульфоната (TSUP)
• 2.A.103 Семейство экспортеров бактериальных прекурсоров муреина (MPE)
• 2.A.104 Семейство экспортеров L-аланина (AlaE)
• 2.A.105 Семейство митохондриальных переносчиков пирувата (MPC)
• 2.A.106 Ca²⁺:ЧАС⁺ Семейство антипортеров-2 (CaCA2)
• 2.A.107 MntP Mn²⁺ Семья экспортеров (MntP)
• 2.A.108 Семейство транспортеров железа / свинца (ILT)
• 2.A.109 Семейство резистентных к ионам теллура (TerC)
• 2.A.110 Heme Transporter, семейство гем-зависимых генных белков (HRG)
• 2.A.111 The Na⁺/ЧАС⁺ Семейство Antiporter-E (NhaE)
• 2.A.112 Семейство антигенов группы крови KX (KXA)
• 2.A.113 Семейство транспортеров никеля / кобальта (NicO)
• 2.A.114. Предполагаемое семейство CstA (CstA), предполагающего переносчиков углерода из-за углеродного голодания.
• 2.A.115 Семья экспортеров новобиоцина (NbcE)
• 2.A.116 Семейство пептидогликолипидных белков (GAP)
• 2.A.117 Семейство экспортеров хлоргексадина (CHX)
• 2.A.118 Семейство основных аминокислотных антипортеров (ArcD)
• 2.A.119 Семья экспортеров органо-мышьяка (ArsP)
• 2.A.120 Семейство предполагаемых аминокислотных пермеаз (PAAP)
• 2.A.121 Семейство транспортеров сульфатов (CysZ)
• 2.A.122 Семейство холиноподобных вспомогательных белков LrgB / CidB (LrgB / CidB)
• 2.A.123 Сладкое; PQ-петля; Слюна; Семья MtN3 (Sweet)
• 2.A.124 Семейство экспортеров лизина (LysO)
• 2.A.125 Семейство эукариотических транспортеров рибофлавина (E-RFT)
• 2.A.126 Семейство экспортеров жирных кислот (FAX)
• 2.A.127 Семейство энтеробактериальных переносчиков кардиолипина (CLT)

2.B Нерибосомно синтезированные портеры

• 2.B.1. Валиномицин Семья Перевозчиков
• 2.B.2. Моненсин Семья
• 2.B.3. Нигерицин Семья
• 2.B.4. Макротетролид Семья антибиотиков (МА)
• 2.B.5 Семейство макроциклических полиэфиров (MP)
• 2.B.6. Иономицин Семья
• 2.B.7 Семейство трансмембранной α-спиральной транслокации фосфолипидов (TMP-PLT)
• 2.B.8. Бафиломицин Семья A1 (бафиломицин)
• 2.B.9. Проникающий в клетки пептид (CPP) Функциональное семейство
• 2.B.10 Синтетический CPP, Транспортный Семья
• 2.B.11. Кальцимицин или A23187 Семейство ионофоров-носителей
• 2.B.12. Салиномицин Семья
• 2.B.13 Семейство тетрапирролических макроциклических анионных антипортеров (TPMC-AA)
• 2.B.14 Семейство ласалоцидов A или X-537A Ionophore (Lasalocid)
• 2.B.15 Семейство хлорид-носителей на основе трис-тиомочевины (TTT-CC)
• 2.B.16 Семейство сложных анионных носителей, содержащих галогеновые связи (HCAC)
• 2.B.17 Производное изофталаминда H⁺: Cl⁻ Семейство ко-транспортеров (IDC)
• 2.B.18 Производное пиридин-2,6-дикарбоксамина (PDCA) H +: Cl⁻ Семья совместного транспортера
• 2.B.19 Семейство производных пиррола (C4P) Calix (4)
• 2.B.20 Семейство продигиозина (продигиозина) хлорида / бикарбонатного обменника
• 2.B.21 Семейство производных анионов орто-фенилендиамин-бис-мочевины (oPDA-U)
• 2.B.22 Семейство транспортеров анионов, функционализированных имидазолием (IAT)
• 2.B.23. Гомотетрамерный трансмембранный цинк.²⁺/ Co²⁺: Proton Synthetic Antiporter, семейство рокеров (рокеров)
• 2.B.24 Семейство 2,6-бис (бензимидазол-2-ил) пиридин-анион-носитель (BBP-AC)
• 2.B.25 Семейство пептид-опосредованных липидных триггеров (PLFF)
• 2.B.26 Семейство бис (имидазолил) -функционализированных бис (холоил) конъюгатов (BIBCC)
• 2.B.27 Семейство транспортеров трис-мочевины-аниона
• 2.B.29 Анионофорный морской алкалоид Тамбджамин Семья

2.C Блоки питания с ионным градиентом

• 2.C.1 Семейство дополнительных белков TonB-ExbB-ExbD / TolA-TolQ-TolR (TonB) для активации активного транспорта, опосредованного рецепторами внешней мембраны (OMR)

3. Первичные активные транспортеры

3.А. Транспортеры, управляемые гидролизом P-P-связи

• 3.A.1 Автовозы ABC включая BtuCD, переносчик захвата молибдата, Регулятор трансмембранной проводимости при муковисцидозе и другие
• 3.A.2 Буква H⁺- или Na⁺-переносящий АТФаза F-типа, АТФаза V-типа и суперсемейство АТФазы А-типа
• 3.A.3 АТФаза P-типа Надсемейство
• 3.A.4 Истечение арсенит-антимонита семья
• 3.A.5 Общий секреторный путь (Сек) Translocon (препротеинтранслоказа SecY)
• 3.A.6 Семейство секреторных путей типа III (связанных с вирулентностью) (IIISP)
• 3.A.7 Семейство секреторных путей (IVSP) типа IV (конъюгальный перенос ДНК-белок или VirB)
• 3.A.8 Семейство митохондриальных протеинтранслоказ (MPT)
• 3.A.9 Семейство транслоказ белков оболочки хлоропластов (CEPT или Tic-Toc)
• 3.A.10 ЧАС⁺, Na⁺-транслоцирующая пирофосфатаза семья
• 3.A.11 Семейство транспортеров трансформации ДНК, связанных с компетентностью бактерий (ДНК-Т)
• 3.A.12 Семейство транслокаторов ДНК перегородки (S-ДНК-T)
• 3.A.13 Семейство экспортеров нитчатых фагов (FPhE)
• 3.A.14 Семейство фимбрилина / экспортеров белка (FPE)
• 3.A.15 Семейство главных терминальных ветвей (MTB), секретирующих белок внешней мембраны
• 3.A.16 Семейство эндоплазматических ретикулярных ретротранслоконов (ER-RT)
• 3.A.17 Семейство инъектисомов Фага Т7 (T7 Injectisome)
• 3.A.18 Семейство ядерных экспортеров мРНК (мРНК-E)
• 3.A.19 Семейство комплексов распознавания / вставки TMS (TRC)
• 3.A.20 Семейство импортеров пероксисомального белка (ИПП)
• 3.A.21 Семейство комплексов биогенеза / встраивания белков с заякоренной хвостом мембраны (TAMP-B)
• 3.A.22 Семейство экспортных комплексов ядерной мРНК TREX / TAP, связанных с транскрипцией (TREX)
• 3.A.23 Семейство симбиоза / секреторного пути вирулентности (VISP) типа VI
• 3.A.24 Тип VII или семейство систем секреции белка ESX (T7SS)
• 3.A.25 Семейство ERAD-подобных машин для симбионтов (SELMA)
• 3.A.26 Семейство Plasmodium Translocon экспортируемых белков (PTEX)

3.B Транспортеры, управляемые декарбоксилированием

• 3.B.1 Na⁺-транспортное семейство декарбоксилазы карбоновых кислот (NaT-DC)

3.C Транспортёры с переносом метилового эфира

• 3.C.1 Na⁺ Транспортировка метилтетрагидрометаноптерина: семейство метилтрансферазы коэнзима М (NaT-MMM)

3.D. Транспортеры с окислительным восстановлением

В их состав входит ряд трансмембранных цитохром b -подобные белки, включая коэнзим Q - цитохром с редуктаза (цитохром bc1); комплекс цитохрома b6f; формиатдегидрогеназа, респираторная нитратредуктаза; сукцинат - кофермент Q редуктаза (фумаратредуктаза); и сукцинатдегидрогеназа. Увидеть электронная транспортная цепь.

• 3.D.1 H⁺ или Na⁺-транслокация НАДН-дегидрогеназа («комплекс I») семья
• 3.D.2 Семейство протон-транслоцирующих трансгидрогеназ (ПТГ)
• 3.D.3 Хинол, переносящий протоны: цитохром с редуктаза ) Надсемейство
• 3.D.4 Цитохромоксидаза, переносящая протоны (COX) Надсемейство
• 3.D.5 На⁺-транслоцирующий НАДН: семейство хинондегидрогеназ (Na-NDH или NQR)
• 3.D.6 Предполагаемый ион (H⁺ или Na⁺) -транслоцирующий NADH: семейство ферредоксиноксидоредуктазы (NFO или RNF)
• 3.D.7 H₂: Семейство гетеродисульфид оксидоредуктазы (HHO)
• 3.D.8 На⁺- или H⁺- Перекачивание семейства формилметанофурандегидрогеназ (FMF-DH)
• 3.D.9 H⁺-транслоцирующая F420H2-дегидрогеназа (F420H2DH) Семейство
• 3.D.10 Семейство прокариотических сукцинатдегидрогеназ (SDH)

3.E. Светопоглощающие транспортеры

• Бактериородопсин -подобные белки, включая родопсин (смотрите также опсин )
• Бактериальный фотосинтетические реакционные центры и фотосистемы I и II
• Легкоуборочные комплексы от бактерии и хлоропласты

4. Групповые транслокаторы

4.А групповые транслокаторы, управляемые фосфопереносом

• 4.A.1 Семейство PTS глюкоза-глюкозид (Glc)
• 4.A.2 Семейство PTS фруктоза-маннит (Fru)
• 4.A.3 Семейство PTS лактоза-N, N'-диацетилхитобиоза-β-глюкозид (Lac)
• 4.A.4 Семейство PTS Glucitol (кишечник)
• 4.A.5 Семейство PTS Galactitol (Gat)
• 4.A.6 Семейство PTS манноза-фруктоза-сорбоза (мужчина)
• 4.A.7 Семейство PTS L-аскорбата (L-Asc)

4.B Переносчики захвата никотинамид-рибонуклеозида

• 4.B.1 Семейство пермеаз захвата никотинамид рибонуклеозидов (NR) (PnuC)

4.C Транспортеры, связанные с ацил-КоА-лигазой

• 4.C.1 Предлагаемое семейство переносчиков жирных кислот (FAT)
• 4.C.2 Семейство карнитин-O-ацилтрансферазы (CrAT)
• 4.C.3 Семейство ацил-КоА-тиоэстеразы (AcoT)

4.D полисахарид-синтаза / экспортеры

• 4.D.1 Семейство предполагаемой векторной гликозильной полимеризации (VGP)
• 4.D.2 Семейство гликозилтрансферазы 2 (GT2)
• 4.D.3 Семейство гликан-глюкозилтрансфераз (OpgH)

4.E. Групповые транслокаторы, катализируемые вакуолярными полифосфат-полимеразой

• 4.E.1 Семейство вакуолярных (ацидокальцисом) полифосфат-полимераз (V-PPP)

5. Транспортные носители электронов

5. Трансмембранные переносчики 2-х электронов

• 5.A.1 Семейство оксидоредуктазы D с дисульфидной связью (DsbD)
• 5.A.2 Семейство оксидоредуктазы B с дисульфидной связью (DsbB)
• 5.A.3 Семейство прокариотических молибдоптерин-содержащих оксидоредуктаз (PMO)

5.B Трансмембранные переносчики 1-электрона

• 5.B.1 Семейство НАДФН-оксидазы фагоцитов (gp91phox)
• 5.B.2 Семейство эукариотических цитохромов b561 (Cytb561)
• 5.B.3 Семейство Geobacter Nanowire Electron Transfer (G-NET)
• 5.B.4 Семейство суперкомплексов фотосистемы I растений (PSI)
• 5.B.5 Семейство внеклеточных оксидоредуктаз металлов (EMOR)
• 5.B.6 Семейство трансмембранных эпителиальных антигенов протеин-3 железоредуктазы (STEAP)
• 5.B.7 Семья ЕдЗ (ЕдЗ)
• 5.B.8 Семейство порин / цитохромных комплексов транс-наружной мембраны для переноса электронов (ET-PCC)
• 5.B.9 Семейство порин-цитохром c (Cyc2)

8. Дополнительные факторы, связанные с транспортировкой.

8.A Вспомогательные транспортные белки

8.B Белковые / пептидные токсины, синтезированные рибосомами, нацелены на каналы и носителей

8.C Нерибосомно синтезированные токсины, нацеленные на каналы и носителей

9. Не полностью охарактеризованные транспортные системы.

9.A Признанные переносчики неизвестного биохимического механизма

9.B Предполагаемые транспортные белки

9.C Функционально охарактеризованные транспортеры без идентифицированных последовательностей

использованная литература

внешние ссылки

• База данных классификации транспортеров
• Список на qmul.ac.uk
• Saier MH, Tran CV, Barabote RD (январь 2006 г.). «TCDB: База данных классификации транспортеров для анализа и информации о мембранных транспортных белках». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D181–6. Дои:10.1093 / nar / gkj001. ЧВК  1334385. PMID  16381841.
• Буш В., Сайер М. Х. (2002). «Система классификации транспортеров (ТК), 2002». Крит. Rev. Biochem. Мол. Биол. 37 (5): 287–337. Дои:10.1080/10409230290771528. PMID  12449427. S2CID  10558982.
• Классификация переносчиков человека в фармакологии