SLC22A4 - SLC22A4

SLC22A4
Идентификаторы
ПсевдонимыSLC22A4, OCTN1, семейство 22 переносчиков растворенных веществ, член 4, DFNB60
Внешние идентификаторыOMIM: 604190 MGI: 1353479 ГомолоГен: 81701 Генные карты: SLC22A4
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение SLC22A4
Геномное расположение SLC22A4
Группа5q31.1Начните132,294,394 бп[1]
Конец132,344,190 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SLC22A4 205896 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

6583

30805

Ансамбль

ENSG00000197208

ENSMUSG00000020334

UniProt

Q9H015

Q9Z306

RefSeq (мРНК)

NM_003059

NM_019687
NM_001330304

RefSeq (белок)

NP_003050

NP_001317233
NP_062661

Расположение (UCSC)Chr 5: 132.29 - 132.34 МбChr 11: 53.98 - 54.03 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Семейство переносчиков растворенных веществ 22, член 4, также известен как SLC22A4, это человек ген; кодируемый белок известен как эрготионеин транспортер.[5]

Функция

Кодируемый белок представляет собой интегральный белок плазматической мембраны, содержащий 12 трансмембранных сегментов. Первым функциональным обозначением этого белка было OCTN1 («переносчик органических катионов, новый, тип 1»), но эффективность транспорта для органических катионов (например, тетраэтиламмоний ) очень низкий.[6] Транспортная эффективность карнитина также незначительна. Вместо этого белок отвечает за перевозка ионов натрия и эрготионеин, что является антиоксидант, в ячейки.[7] Таким образом, более подходящим функциональным обозначением является ЭТТ («переносчик эрготионеина»).

Взаимодействия

SLC22A4 был показан взаимодействовать с участием ПДЗК1.[8]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197208 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020334 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Ген Entrez: семейство 22 переносчиков растворенного вещества SLC22A4 (переносчик эрготионеина), член 4».
  6. ^ Григат С., Харлфингер С., Пал С., Стрибингер Р., Гольц С., Гертс А., Лазар А., Шёмиг Е., Грюндеманн Д. (июль 2007 г.). «Исследование субстратной специфичности переносчика эрготионеина с метимазолом, герцинином и органическими катионами». Биохимическая фармакология. 74 (2): 309–16. Дои:10.1016 / j.bcp.2007.04.015. PMID  17532304.
  7. ^ Грюндеманн Д., Харлфингер С., Гольц С., Гертс А., Лазар А., Беркельс Р., Юнг Н., Рубберт А., Шёмиг Э. (апрель 2005 г.). «Открытие переносчика эрготионеина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (14): 5256–61. Дои:10.1073 / pnas.0408624102. ЧВК  555966. PMID  15795384.
  8. ^ Gisler SM, Pribanic S, Bacic D, Forrer P, Gantenbein A, Sabourin LA, Tsuji A, Zhao ZS, Manser E, Biber J, Murer H (ноябрь 2003 г.). «PDZK1: I. основной каркас в щеточных краях проксимальных канальцевых клеток». Kidney International. 64 (5): 1733–45. Дои:10.1046 / j.1523-1755.2003.00266.x. PMID  14531806.

дальнейшее чтение

  • Сюан В., Ламхонва А.М., Librach C, Ярви К., Тейн I (июнь 2003 г.). «Характеристика семейства переносчиков органических катионов / карнитина в сперме человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 306 (1): 121–8. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00930-6. PMID  12788076.
  • Ямада Р., Токухиро С., Чанг X, Ямамото К. (сентябрь 2004 г.). «SLC22A4 и RUNX1: идентификация чувствительных к RA генов». Журнал молекулярной медицины. 82 (9): 558–64. Дои:10.1007 / s00109-004-0547-у. PMID  15184985. S2CID  9156168.
  • Silverberg MS (июнь 2006 г.). «OCTNs: пожалуйста, встанет ли настоящий ген IBD5?». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 12 (23): 3678–81. Дои:10.3748 / wjg.v12.i23.3678. ЧВК  4087460. PMID  16773684.
  • Тамай И., Ябуучи Х., Незу Дж., Сай И, Оку А., Симанэ М., Цудзи А. (декабрь 1997 г.). «Клонирование и характеристика нового pH-зависимого переносчика органических катионов человека, OCTN1». Письма FEBS. 419 (1): 107–11. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 01441-5. PMID  9426230. S2CID  35546307.
  • Meyer-Wentrup F, Karbach U, Gorboulev V, Arndt P, Koepsell H (июль 1998 г.). «Мембранная локализация электрогенного переносчика катионов rOCT1 в печени крысы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 248 (3): 673–8. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9034. PMID  9703985.
  • Ураками Ю., Окуда М., Масуда С., Сайто Х., Инуи К.И. (ноябрь 1998 г.). «Функциональные характеристики и мембранная локализация мультиспецифических переносчиков органических катионов крыс, OCT1 и OCT2, опосредующих канальцевую секрецию катионных препаратов». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии. 287 (2): 800–5. PMID  9808712.
  • Ябуучи Х., Тамай И, Незу Дж., Сакамото К., Оку А., Симанэ М., Сай Й., Цудзи А. (май 1999 г.). «Новый мембранный переносчик OCTN1 обеспечивает мультиспецифический, двунаправленный и pH-зависимый транспорт органических катионов». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии. 289 (2): 768–73. PMID  10215651.
  • Алкорн Дж., Лу Х, Москва Дж. А., Макнамара П. Дж. (Ноябрь 2002 г.). «Экспрессия гена-транспортера в лактирующих и нелактирующих эпителиальных клетках молочной железы человека с использованием полимеразной цепной реакции обратной транскрипции в реальном времени». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии. 303 (2): 487–96. Дои:10.1124 / jpet.102.038315. PMID  12388627. S2CID  16195525.
  • Сайто С., Иида А., Секин А., Огава С., Каваути С., Хигучи С., Накамура И. (2003). «Каталог 238 вариаций среди шести человеческих генов, кодирующих растворенные носители (hSLC) в популяции Японии». Журнал генетики человека. 47 (11): 576–84. Дои:10.1007 / с100380200088. PMID  12436193.
  • Эрали С.А., Гамильтон Б.А., Нигам С.К. (январь 2003 г.). «Органические переносчики анионов и катионов встречаются парами схожих и одинаково экспрессируемых генов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 300 (2): 333–42. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02853-X. PMID  12504088.
  • Гислер С.М., Прибанич С., Бачич Д., Форрер П., Гантенбейн А., Сабурин Л.А., Цуджи А., Чжао З.С., Мансер Е., Бибер Дж., Мурер Х. (ноябрь 2003 г.). «PDZK1: I. основной каркас в щеточных краях проксимальных канальцевых клеток». Kidney International. 64 (5): 1733–45. Дои:10.1046 / j.1523-1755.2003.00266.x. PMID  14531806.
  • Tokuhiro S, Yamada R, Chang X, Suzuki A, Kochi Y, Sawada T, Suzuki M, Nagasaki M, Ohtsuki M, Ono M, Furukawa H, Nagashima M, Yoshino S, Mabuchi A, Sekine A, Saito S, Takahashi A , Цунода Т., Накамура Ю., Ямамото К. (декабрь 2003 г.). «Интронный SNP в сайте связывания RUNX1 SLC22A4, кодирующий переносчик органических катионов, связан с ревматоидным артритом». Природа Генетика. 35 (4): 341–8. Дои:10,1038 / ng1267. PMID  14608356. S2CID  21564858.
  • Пелтекова В.Д., Винтл Р.Ф., Рубин Л.А., Амос К.И., Хуанг К., Гу Х, Ньюман Б., Ван Ойн М., Сескон Д., Гринберг Г., Гриффитс А.М., Сент-Джордж-Хислоп PH, Симинович К.А. (май 2004 г.). «Функциональные варианты генов переносчиков катионов OCTN связаны с болезнью Крона». Природа Генетика. 36 (5): 471–5. Дои:10,1038 / ng1339. PMID  15107849.
  • Кавасаки И, Като И, Сай И, Цудзи А. (декабрь 2004 г.). «Функциональная характеристика однонуклеотидных полиморфизмов человеческого переносчика катионов OCTN1 в популяции Японии». Журнал фармацевтических наук. 93 (12): 2920–6. Дои:10.1002 / jps.20190. PMID  15459889.
  • Ньюман Б., Гу X, Винтл Р., Сескон Д., Язданпанах М., Лю X, Пелтекова В., Ван Ойне М., Амос К. И., Симинович К. А. (февраль 2005 г.). «Гаплотип риска в кластере генов 22A4 / 22A5 семейства Solute Carrier влияет на фенотипическое выражение болезни Крона». Гастроэнтерология. 128 (2): 260–9. Дои:10.1053 / j.gastro.2004.11.056. PMID  15685536.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.