CACNA1H - CACNA1H

CACNA1H
Идентификаторы
ПсевдонимыCACNA1H, CACNA1HB, Cav3.2, ECA6, EIG6, субъединица потенциал-зависимого канала кальция альфа1 H, HALD4
Внешние идентификаторыOMIM: 607904 MGI: 1928842 ГомолоГен: 56913 Генные карты: CACNA1H
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение CACNA1H
Геномное расположение CACNA1H
Группа16p13.3Начинать1,153,106 бп[1]
Конец1,221,771 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CACNA1H 205845 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001005407
NM_021098

NM_001163691
NM_021415

RefSeq (белок)

NP_001005407
NP_066921

н / д

Расположение (UCSC)Chr 16: 1.15 - 1.22 МбChr 17: 25.37 - 25.43 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Кальциевый канал, зависимый от напряжения, Т-тип, альфа-1H-субъединица, также известный как CACNA1H, это белок который у человека кодируется CACNA1H ген.[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует Саv3.2, член Т-типа α1 субъединицы семейства, белок в потенциал-зависимый кальциевый канал сложный. Кальциевые каналы опосредуют приток ионов кальция в клетку при поляризации мембраны и состоят из комплекса α1, α2субъединицы δ, β и γ в соотношении 1: 1: 1: 1. Α1 субъединица имеет 24 трансмембранных сегмента и образует поры, через которые ионы проходят в клетку. Есть несколько изоформы каждого из белков в комплексе, либо кодируемых разными генами, либо в результате альтернативное сращивание стенограмм. Альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие различные изоформы, были охарактеризованы для гена, описанного здесь.[5]

Клиническое значение

Исследования показывают, что определенные мутации в этом гене приводят к абсансная эпилепсия в детстве (CAE).[8] Варианты Cav3.2 с повышенной активностью каналов способствуют восприимчивости к идиопатическая генерализованная эпилепсия (ИГЭ), но сами по себе недостаточны, чтобы вызвать эпилепсию.[9] В базе данных SFARIgene перечислены CACNA1H с аутизм оценка 2,1, что указывает на причинно-следственную связь кандидата с аутизм.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196557 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024112 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: кальциевый канал CACNA1H, потенциалозависимый, Т-тип, альфа-1H-субъединица».
  6. ^ Криббс Л.Л., Ли Дж. Х., Ян Дж., Сатин Дж., Чжан Й., Дауд А., Барклай Дж., Уильямсон М. П., Фокс М., Риз М., Перес-Рейес Е. (июль 1998 г.). «Клонирование и характеристика альфа1Н из сердца человека, члена семейства генов Са2 + канала Т-типа». Circ. Res. 83 (1): 103–9. Дои:10.1161 / 01.res.83.1.103. PMID  9670923.
  7. ^ Каттералл В.А., Перес-Рейес Э., Снатч Т.П., Стриссниг Дж. (Декабрь 2005 г.). "Международный союз фармакологии. XLVIII. Номенклатура и взаимосвязь структура-функция потенциалзависимых кальциевых каналов". Pharmacol. Rev. 57 (4): 411–25. Дои:10.1124 / пр.57.4.5. PMID  16382099. S2CID  10386627.
  8. ^ Chen Y, Lu J, Pan H, Zhang Y, Wu H, Xu K, Liu X, Jiang Y, Bao X, Yao Z, Ding K, Lo WH, Qiang B, Chan P, Shen Y, Wu X (август 2003 г.) ). «Связь между генетической изменчивостью CACNA1H и абсансной эпилепсией у детей». Анна. Neurol. 54 (2): 239–43. Дои:10.1002 / ana.10607. PMID  12891677. S2CID  33233159.
  9. ^ Херон С.Е., Хосравани Х., Варела Д., Бладен С., Уильямс Т.С., Ньюман М.Р., Шеффер И.Е., Беркович С.Ф., Малли Дж.С., Зампони Г.В. (декабрь 2007 г.). «Расширенный спектр идиопатических генерализованных эпилепсий, связанных с функциональными вариантами CACNA1H». Анна. Neurol. 62 (6): 560–8. Дои:10.1002 / ana.21169. HDL:1880/106734. PMID  17696120. S2CID  33737531.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.