TPCN1 - TPCN1

TPCN1
Идентификаторы
Псевдонимы	TPCN1, TPC1, двухпористый сегментный канал 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 609666 MGI: 2182472 ГомолоГен: 9905 Генные карты: TPCN1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 12 (человек)
Конец	113,298,585 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 5 (мышь)
Конец	120,588,673 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность кальциевых каналов; • активность потенциалзависимого ионного канала; • активность ионного канала; • GO: 0001948 связывание с белками; • идентичное связывание с белками; • Активность канала высвобождения кальция, чувствительного к NAADP; • активность потенциалзависимых кальциевых каналов; • активность активированного кальцием катионного канала;
Сотовый компонент	• неотъемлемый компонент мембраны; • эндосома; • мембрана; • клеточная мембрана; • лизосомальная мембрана; • лизосома; • эндосомная мембрана; • Комплекс CatSper;
Биологический процесс	• деполяризация мембраны во время потенциала действия; • положительное регулирование аутофагии; • регуляция трансмембранного транспорта ионов; • ионный транспорт; • трансмембранный перенос ионов; • трансмембранный транспорт ионов кальция; • транспорт ионов кальция; • трансмембранный транспорт; • высвобождение секвестрированного иона кальция в цитозоль; • подвижность жгутиковых сперматозоидов;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	53373
	252972
	ENSG00000186815
	ENSMUSG00000032741
	Q9ULQ1
	Q9EQJ0
	NM_001143819; NM_001301214; NM_017901; NM_001351346; NM_001351347
	NM_145853
	NP_001137291; NP_001288143; NP_060371; NP_001338275; NP_001338276
	NP_665852
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Канал с двумя сегментами пор 1 (TPC1) принадлежит человеку. белок закодировано TPCN1 ген.^[5] Белок, кодируемый этим геном, представляет собой ионный канал. В отличие от других кальций и натриевые каналы которые имеют четыре гомологичных домена, каждый из которых содержит 6 трансмембранных сегментов (от S1 до S6), TPCN1 содержит только два домена (каждый из которых содержит сегменты от S1 до S6).^[6]^[7]^[8]

Структура

Структура TPC1 ортолог из Arabidopsis thaliana была решена двумя лабораториями.^[9]^[10] Структуры решены с использованием Рентгеновская кристаллография и содержал складку потенциалзависимый ионный канал и EF руки. Только один домен датчика напряжения, по-видимому, отвечает за измерение напряжения.

Филовирусные инфекции

Эксперименты с генетическим нокаутом и фармакологическим ингибированием демонстрируют, что Двухпоровые каналы, TPC1 и TPC2, необходимы для заражения филовирусами Эбола и Марбург у мышей.^[11]

Смотрите также

Двухпористый канал

дальнейшее чтение

Ишибаши К., Сузуки М., Имаи М. (апрель 2000 г.). «Молекулярное клонирование новой формы (двухповторного) белка, связанного с потенциал-зависимыми натриевыми и кальциевыми каналами». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 270 (2): 370–6. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2435. PMID 10753632.
Хиросава М., Нагасе Т., Исикава К., Кикуно Р., Номура Н., Охара О. (октябрь 1999 г.). «Характеристика клонов кДНК, выбранных с помощью анализа GeneMark из фракционированных по размеру библиотек кДНК головного мозга человека». ДНК исследования. 6 (5): 329–36. Дои:10.1093 / днарес / 6.5.329. PMID 10574461.
Clapham DE, Garbers DL (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. L. Номенклатура и взаимосвязь структур-функций CatSper и двухпоровых каналов». Фармакологические обзоры. 57 (4): 451–4. Дои:10.1124 / пр.57.4.7. PMID 16382101. S2CID 35096827.
Calcraft PJ, Ruas M, Pan Z, Cheng X, Arredouani A, Hao X, Tang J, Rietdorf K, Teboul L, Chuang KT, Lin P, Xiao R, Wang C, Zhu Y, Lin Y, Wyatt CN, Parrington J , Ма Дж., Эванс А.М., Галионе А., Чжу М.Х. (май 2009 г.). «NAADP мобилизует кальций из кислых органелл через двухпоровые каналы». Природа. 459 (7246): 596–600. Дои:10.1038 / природа08030. ЧВК 2761823. PMID 19387438.
Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (июнь 2002 г.). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК исследования. 9 (3): 99–106. CiteSeerX 10.1.1.500.923. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID 12168954.

внешняя ссылка

TPCN1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000186815 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032741 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] "Entrez Gene: канал 1 с двумя поровыми сегментами".

[pmid10574461-6] Хиросава М., Нагасе Т., Исикава К., Кикуно Р., Номура Н., Охара О. (октябрь 1999 г.). «Характеристика клонов кДНК, выбранных с помощью анализа GeneMark из фракционированных по размеру библиотек кДНК головного мозга человека». ДНК исследования. 6 (5): 329–36. Дои:10.1093 / днарес / 6.5.329. PMID 10574461.

[pmid10753632-7] Ишибаши К., Сузуки М., Имаи М. (апрель 2000 г.). «Молекулярное клонирование новой формы (двухповторного) белка, связанного с потенциал-зависимыми натриевыми и кальциевыми каналами». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 270 (2): 370–6. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2435. PMID 10753632.

[pmid16382101-8] Clapham DE, Garbers DL (декабрь 2005 г.). "Международный союз фармакологии. L. Номенклатура и взаимосвязь структур-функций CatSper и двухпоровых каналов". Фармакологические обзоры. 57 (4): 451–4. Дои:10.1124 / пр.57.4.7. PMID 16382101. S2CID 35096827.

[9] Го Дж, Цзэн В., Чен Кью, Ли С., Чен Л., Ян И, Цан С., Рен Д., Цзян Ю. (март 2016 г.). «Структура потенциалозависимого двухпорового канала TPC1 из Arabidopsis thaliana». Природа. 531 (7593): 196–201. Дои:10.1038 / природа16446. ЧВК 4841471. PMID 26689363.

[10] Кинцер А.Ф., Страуд Р.М. (март 2016 г.). «Структура, ингибирование и регуляция двухпорового канала TPC1 из Arabidopsis thaliana». Природа. 531 (7593): 258–62. Дои:10.1038 / природа17194. ЧВК 4863712. PMID 26961658.

[11] Сакурай Ю., Колокольцов А.А., Чен С.К., Тидвелл М.В., Баута В.Е., Клугбауэр Н., Гримм К., Уол-Шотт С., Биль М., Дэйви Р.А. (февраль 2015 г.). «Вирус Эбола. Двухпоровые каналы контролируют проникновение вируса Эбола в клетки-хозяева и являются мишенями для лечения болезней». Наука. 347 (6225): 995–8. Дои:10.1126 / science.1258758. ЧВК 4550587. PMID 25722412.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]