CLIC4 - CLIC4

CLIC4
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2AHE, 2D2Z, 3OQS
Идентификаторы
Псевдонимы	CLIC4, CLIC4L, H1, MTCLIC, huH1, p64H1, хлоридный внутриклеточный канал 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 606536 MGI: 1352754 ГомолоГен: 8490 Генные карты: CLIC4
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	24,844,321 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 4 (мышь)
Конец	135,272,814 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность потенциалзависимого ионного канала; • GO: 0001948 связывание с белками; • активность глутатионтрансферазы; • активность хлоридного канала;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • неотъемлемый компонент мембраны; • цитозоль; • центросома; • мембрана; • межклеточное соединение; • ядерная матрица; • цитоскелет микротрубочек; • клеточная мембрана; • апикальная часть клетки; • внутриклеточный; • комплекс хлоридных каналов; • центр организации микротрубочек; • микроворсинки; • поверхность клетки; • соединение клеток; • середина тела; • митохондрия; • актиновый цитоскелет; • перинуклеарная область цитоплазмы; • внеклеточная экзосома; • цитоскелет; • мембрана цитоплазматических везикул; • цитоплазматический пузырек; • ядро клетки;
Биологический процесс	• клеточный ответ на ион кальция; • дифференциация клеток; • рост многоклеточного организма; • регуляция трансмембранного транспорта ионов; • морфогенез эндотелиальных клеток; • ионный транспорт; • дифференцировка кератиноцитов; • вакуолярное закисление; • отрицательное регулирование миграции клеток; • оплодотворение; • установление или поддержание полярности апикальных / базальных клеток; • перенос хлоридов; • морфогенез ветвления эпителиальной трубки; • морфогенез сосудистой сети сетчатки глаза камерного типа; • регуляция организации цитоскелета; • ангиогенез; • метаболический процесс глутатиона; • трансмембранный транспорт хлоридов; • транспорт; • трансмембранный перенос ионов;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	25932
	29876
	ENSG00000169504
	ENSMUSG00000037242
	Q9Y696
	Q9QYB1
	NM_013943
	NM_013885
	NP_039234
	NP_038913
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Хлорид внутриклеточный канал 4, также известен как CLIC4, является эукариотическим ген.^[5]

Хлоридные каналы представляют собой разнообразную группу белков, которые регулируют фундаментальные клеточные процессы, включая стабилизацию потенциала клеточной мембраны, трансэпителиальный транспорт, поддержание внутриклеточный pH, и регулирование объема клеток. Белок хлоридного внутриклеточного канала 4 (CLIC4), кодируемый геном CLIC4, является членом семейства p64; ген экспрессируется во многих тканях и демонстрирует внутриклеточный везикулярный паттерн в ПАНК-1 клетки (раковые клетки поджелудочной железы).^[5]

Связующие партнеры

CLIC4 связывается с динамин I, α-тубулин, β-актин, креатинкиназа и две изоформы 14-3-3.^[6]

Смотрите также

Хлоридный канал

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169504 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037242 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б «Энтрез Ген: внутриклеточный канал 4 хлорида CLIC4».
^ Сугинта В., Карулиас Н., Эйткен А., Эшли Р. Х. (октябрь 2001 г.). «Хлоридный белок внутриклеточного канала CLIC4 (p64H1) связывается непосредственно с динамином I мозга в комплексе, содержащем актин, тубулин и изоформы 14-3-3». Biochem. J. 359 (Pt1): 55–64. Дои:10.1042/0264-6021:3590055. ЧВК 1222121. PMID 11563969.

дальнейшее чтение

Берриман М, Бретчер А (2000). «Идентификация нового члена семейства генов внутриклеточных каналов хлоридов (CLIC5), который ассоциируется с актиновым цитоскелетом микроворсинок плаценты». Мол. Биол. Ячейка. 11 (5): 1509–21. Дои:10.1091 / mbc.11.5.1509. ЧВК 14863. PMID 10793131.
Берриман М.А., Голденринг-младший (2004). «CLIC4 обогащен на стыках клеток и клеток и колокализуется с AKAP350 в центросоме и среднем теле культивируемых клеток млекопитающих». Cell Motil. Цитоскелет. 56 (3): 159–72. Дои:10,1002 / см. 10141. PMID 14569596.
Бохман С., Мацумото Т., Сух К. и др. (2006). «Протеомный анализ дифференцировки эндотелиальных клеток, индуцированной сосудистым эндотелиальным фактором роста, показывает роль хлоридного внутриклеточного канала 4 (CLIC4) в морфогенезе канальцев». J. Biol. Chem. 280 (51): 42397–404. Дои:10.1074 / jbc.M506724200. PMID 16239224.
Chuang JZ, Milner TA, Zhu M, Sung CH (1999). «Внутриклеточный хлоридный канал p64H1 29 кДа связан с большими везикулами с плотным ядром в нейронах гиппокампа крыс». J. Neurosci. 19 (8): 2919–28. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.19-08-02919.1999. PMID 10191309.
Дункан Р. Р., Вествуд П. К., Бойд А., Эшли Р. Х. (1997). "P64H1 головного мозга крысы, экспрессия нового члена семейства белков хлоридных каналов p64 в эндоплазматическом ретикулуме". J. Biol. Chem. 272 (38): 23880–6. Дои:10.1074 / jbc.272.38.23880. PMID 9295337.
Эдвардс JC (1999). "Роман, связанный с p64 Cl⁻ канал: субклеточное распределение и экспрессия, специфичная для сегментов нефрона ». Am. J. Physiol. 276 (3, часть 2): F398–408. Дои:10.1152 / ajprenal.1999.276.3.F398. PMID 10070163.
Цянь З., Окухара Д., Абэ М.К., Роснер М.Р. (1999). «Молекулярное клонирование и характеристика внутриклеточного хлоридного канала, связанного с митоген-активированной протеинкиназой». J. Biol. Chem. 274 (3): 1621–7. Дои:10.1074 / jbc.274.3.1621. PMID 9880541.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Рённов-Ессен Л., Вилладсен Р., Эдвардс Дж. К., Петерсен О. В. (2002). «Дифференциальная экспрессия гена хлоридного внутриклеточного канала, CLIC4, в трансформации фактора роста-β1-опосредованного превращения фибробластов в миофибробласты». Am. Дж. Патол. 161 (2): 471–80. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 64203-4. ЧВК 1850723. PMID 12163372.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514.
Shiio Y, Suh KS, Lee H и др. (2006). «Количественный протеомный анализ myc-индуцированного апоптоза: прямая роль Myc-индукции митохондриального хлорид-ионного канала, mtCLIC / CLIC4». J. Biol. Chem. 281 (5): 2750–6. Дои:10.1074 / jbc.M509349200. PMID 16316993.
Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК 1083732. PMID 11256614.
Сингх Х., Эшли Р.Х. (2007). «CLIC4 (p64H1) и его предполагаемый трансмембранный домен образуют плохо селективные ионные каналы, регулируемые окислительно-восстановительными механизмами». Мол. Membr. Биол. 24 (1): 41–52. Дои:10.1080/09687860600927907. PMID 17453412.
Сингх Х., кузен М.А., Эшли Р.Х. (2007). «Функциональное восстановление« хлоридных внутриклеточных каналов »млекопитающих CLIC1, CLIC4 и CLIC5 обнаруживает дифференциальную регуляцию актином цитоскелета». FEBS J. 274 (24): 6306–6316. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2007.06145.x. PMID 18028448.
Сингх Х (2010). «Два десятилетия с диморфными хлоридными внутриклеточными каналами (CLIC)». Письма FEBS. 584 (10): 2112–21. Дои:10.1016 / j.febslet.2010.03.013. PMID 20226783.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Сугинта В., Карулиас Н., Эйткен А., Эшли Р. Х. (2003). «Хлоридный белок внутриклеточного канала CLIC4 (p64H1) связывается непосредственно с динамином I мозга в комплексе, содержащем актин, тубулин и изоформы 14-3-3». Biochem. J. 359 (Pt 1): 55–64. Дои:10.1042/0264-6021:3590055. ЧВК 1222121. PMID 11563969.
Валенсуэла С.М., Мартин Д.К., Пор С.Б. и др. (1997). «Молекулярное клонирование и экспрессия хлорид-ионного канала ядер клеток». J. Biol. Chem. 272 (19): 12575–82. Дои:10.1074 / jbc.272.19.12575. PMID 9139710.
Вик М., Бюргер С., Брюссельбах С. и др. (1994). «Идентификация сывороточно-индуцибельных генов: различные паттерны регуляции генов во время G0 -> S и G1 -> S прогрессии». J. Cell Sci. 107 (1): 227–39. PMID 8175911.
Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.

внешние ссылки

CLIC4 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Человек CLIC4 расположение генома и CLIC4 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья о ген на хромосома человека 1 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169504 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037242 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] а ^б «Энтрез Ген: внутриклеточный канал 4 хлорида CLIC4».

[pmid11563969-6] Сугинта В., Карулиас Н., Эйткен А., Эшли Р. Х. (октябрь 2001 г.). «Хлоридный белок внутриклеточного канала CLIC4 (p64H1) связывается непосредственно с динамином I мозга в комплексе, содержащем актин, тубулин и изоформы 14-3-3». Biochem. J. 359 (Pt1): 55–64. Дои:10.1042/0264-6021:3590055. ЧВК 1222121. PMID 11563969.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]