Cob (I) ириновая кислота a, c-диамид аденозилтрансфераза - Cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase

АТФ: корриноид аденозилтрансфераза
Белок MMAB PDB 2idx.png
Митохондриальная Cob (I) ириновая кислота человека a, c-диамид-аденозилтрансфераза, MMAB.[1]
Идентификаторы
Номер ЕС2.5.1.17
Количество CAS37277-84-2
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO
АТФ: корриноид аденозилтрансфераза
PDB 1g5t EBI.jpg
трехмерная структура атр: корриноид-аденозилтрансфераза из сальмонеллы тифимуриум. форма апо-атп
Идентификаторы
СимволCobA_CobO_BtuR
PfamPF02572
Pfam кланCL0023
ИнтерПроIPR003724
SCOP21g64 / Объем / СУПФАМ
Кобаламин аденозилтрансфераза (PduO / EutT)
PDB 1nog EBI.jpg
кристаллическая структура консервативного белка 0546 из ацидофильной термоплазмы
Идентификаторы
СимволCob_adeno_trans
PfamPF01923
ИнтерПроIPR002779
SCOP21 ног / Объем / СУПФАМ

В молекулярной биологии cob (I) ириновая кислота a, c-диамид аденозилтрансфераза (также известный как АТФ: аламин-аденозилтрансфераза cob (I) или АТФ: корриноид-аденозилтрансфераза) EC 2.5.1.17 является фермент который катализирует преобразование кобаламин (витамин B12) в одну из форм его кофермента, аденозилкобаламин (коэнзим B12, AdoCbl).[2][3] Аденозилкобаламин требуется в качестве кофактор для деятельности определенных ферменты. AdoCbl содержит аденозильный фрагмент, связанный с кобальт ион кобаламина через ковалентный Связь Co-C.

АТФ: аламиноаденозилтрансферазы cob (I) подразделяются на три группы: CobA-типа,[4] EutT-типа [5] и PduO-типа.[6] Кажется, что каждый из трех типов ферментов специализируется на определенных AdoCbl-зависимых ферменты или для синтез de novo компании AdoCbl. PduO и EutT дальние родственники, консервированный мотивов, а CobA - эволюционно не связаны и является примером конвергентная эволюция.

Группа CobA включает АТФ: cob (I) аламин аденозилтрансферазы CobA (Сальмонелла тифимуриум ), CobO (Псевдомонады денитрификаторы) и ButR (кишечная палочка). Существует высокая степень последовательность идентичность между этими белки.[7] CobA отвечает за присоединение аденозильной части АТФ к иону кобальта Коррин кольцо, необходимое для превращения кобаламина в аденозилкобаламин.[3][4] PduO превращает кобаламин в AdoCbl для 1,2-пропандиола деградация,[8] в то время как EutT производит AdoCbl для этаноламин утилизация.[9]

Синонимы

Этот фермент также известен как:

  • Кобаламин аденозилтрансфераза
  • АТФ: аламин аденозилтрансфераза cob (I)
  • АТФ: корриноид аденозилтрансфераза

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Schubert HL, Hill CP (декабрь 2006 г.). «Структура АТФ-связанной АТФ человека: кобаламин-аденозилтрансфераза». Биохимия. 45 (51): 15188–96. Дои:10.1021 / bi061396f. ЧВК  2532598. PMID  17176040.
  2. ^ Mera PE, Escalante-Semerena JC (сентябрь 2010 г.). «Множественные роли АТФ: аламиноаденозилтрансферазы cob (I) в превращении B12 в кофермент B12». Appl. Microbiol. Биотехнология. 88 (1): 41–8. Дои:10.1007 / s00253-010-2773-2. ЧВК  3034633. PMID  20677021.
  3. ^ а б Шеппард Д.Е., Пенрод Дж. Т., Бобик Т., Кофоид Э, Рот Дж. Р. (ноябрь 2004 г.). «Доказательства того, что B12-аденозилтрансфераза кодируется в этаноламиновом опероне Salmonella enterica». J. Bacteriol. 186 (22): 7635–44. Дои:10.1128 / JB.186.22.7635-7644.2004. ЧВК  524904. PMID  15516577.
  4. ^ а б Буан Н.Р., Рефельд К., Эскаланте-Семерена Дж.С. (май 2006 г.). «Исследования АТФ типа CobA: Co (I) риноид-аденозилтрансфераза, фермент штамма Go1 Methanosarcina mazei». J. Bacteriol. 188 (10): 3543–50. Дои:10.1128 / JB.188.10.3543-3550.2006. ЧВК  1482872. PMID  16672609.
  5. ^ Buan NR, Suh SJ, Escalante-Semerena JC (сентябрь 2004 г.). «Ген eutT Salmonella enterica кодирует кислородно-лабильный металлсодержащий АТФ: фермент корриноид-аденозилтрансфераза». J. Bacteriol. 186 (17): 5708–14. Дои:10.1128 / JB.186.17.5708-5714.2004. ЧВК  516830. PMID  15317775.
  6. ^ Джонсон С.Л., Печоник Э., Парк С.Д., Хавеманн Г.Д., Лил Н.А., Бобик Т.А. (март 2001 г.). «Функциональная геномная, биохимическая и генетическая характеристика гена Salmonella pduO, гена АТФ: cob (I) аламин аденозилтрансферазы». J. Bacteriol. 183 (5): 1577–84. Дои:10.1128 / JB.183.5.1577-1584.2001. ЧВК  95042. PMID  11160088.
  7. ^ Suh SJ, Escalante-Semerena JC (июль 1993 г.). «Клонирование, секвенирование и сверхэкспрессия cobA, который кодирует АТФ: корриноидную аденозилтрансферазу в Salmonella typhimurium». Ген. 129 (1): 93–7. Дои:10.1016/0378-1119(93)90701-4. PMID  7916712.
  8. ^ Люерс Ф., Сейфрид М., Даниэль Р., Готтшалк Г. (сентябрь 1997 г.). «Превращение глицерина в 1,3-пропандиол с помощью Clostridium pasteurianum: клонирование и экспрессия гена, кодирующего 1,3-пропандиолдегидрогеназу». FEMS Microbiol. Латыш. 154 (2): 337–45. Дои:10.1016 / s0378-1097 (97) 00351-0. PMID  9311132.
  9. ^ Буан Н.Р., Эскаланте-Семерена ЮК (июнь 2006 г.). «Очистка и начальная биохимическая характеристика АТФ: фермент Cob (I) аламин аденозилтрансфераза (EutT) Salmonella enterica». J. Biol. Chem. 281 (25): 16971–7. Дои:10.1074 / jbc.M603069200. PMID  16636051.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR003724
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR002779