FYVE домен - FYVE domain
| FYVE цинковый палец | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | FYVE | ||||||||
| Pfam | PF01363 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000306 | ||||||||
| PROSITE | PDOC50178 | ||||||||
| SCOP2 | 1vfy / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| OPM суперсемейство | 59 | ||||||||
| Белок OPM | 1vfy | ||||||||
| CDD | cd00065 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии FYVE домен цинковых пальцев назван в честь четырех богатых цистеином белки: Fab 1 (дрожжевой ортолог PIKfyve ), YOTB, Vac 1 (транспортный белок везикул) и EEA1, в котором он был найден. Связывание доменов FYVE Фосфатидилинозитол 3-фосфат,[2] в зависимости от координации иона металла и основных аминокислот. Домен FYVE встраивается в клеточные мембраны в зависимости от pH.[3] Домен FYVE связан с сортировкой вакуолярных белков и функцией эндосом.[4]
Структура
Домен FYVE состоит из двух небольших бета шпильки (или цинковые суставы), за которыми следует альфа-спираль.[5] Палец FYVE связывает двоих цинк ионы. Палец FYVE имеет восемь потенциальных цинк-координирующих положений цистеина и характеризуется наличием основных аминокислот вокруг цистеина. Многие члены этого семейства также включают два гистидина в мотив последовательности:
Палец FYVE конструктивно похож на RING домен и Палец PHD.
Примеры
Ниже приводится список белков человека, содержащих этот домен:
- ANKFY1, EEA1, FGD1, FGD2, FGD3, FGD4, FGD5, FGD6, FYCO1, HGS, MTMR3, MTMR4, ПИКФЫВЕ, ПЛЕХФ1, ПЛЕХФ2
- RUFY1, RUFY2, WDF3, WDFY1, WDFY2, WDFY3, ZFYVE1, ZFYVE16, ZFYVE19, ZFYVE20, ZFYVE21, ZFYVE26, ZFYVE27, ZFYVE28, ZFYVE9
Рекомендации
- ^ Дюма Дж. Дж., Меритью Э., Судхаршан Э. и др. (Ноябрь 2001 г.). «Многовалентное нацеливание на эндосомы с помощью гомодимерного EEA1». Мол. Клетка. 8 (5): 947–58. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00385-9. PMID 11741531.
- ^ Голлье Дж. М., Симонсен А., Д'Арриго А., Бремнес Б., Стенмарк Н., Осланд Р. (июль 1998 г.). «Пальцы FYVE связывают PtdIns (3) P». Природа. 394 (6692): 432–3. Дои:10.1038/28767. PMID 9697764. S2CID 4385768.
- ^ He J, Vora M, Haney RM и др. (Сентябрь 2009 г.). «Внедрение домена FYVE в мембрану регулируется pH». Белки. 76 (4): 852–60. Дои:10.1002 / prot.22392. ЧВК 2909462. PMID 19296456.
- ^ Ливерс SJ, Vanhaesebroeck B, Waterfield MD (апрель 1999 г.). «Передача сигналов через фосфоинозитид-3-киназы: липиды в центре внимания». Curr. Мнение. Cell Biol. 11 (2): 219–25. Дои:10.1016 / S0955-0674 (99) 80029-5. PMID 10209156.
- ^ Мисра С., Херли Дж. Х. (май 1999 г.). «Кристаллическая структура фосфатидилинозитол-3-фосфат-специфичного мембранно-целевого мотива, домена FYVE Vps27p». Клетка. 97 (5): 657–66. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80776-X. PMID 10367894. S2CID 15448444.
дальнейшее чтение
- Стенмарк Х., Осланд Р., То Б. Х., Д'Арриго А. (сентябрь 1996 г.). «Эндосомная локализация аутоантигена EEA1 опосредована цинк-связывающим пальцем FYVE». J. Biol. Chem. 271 (39): 24048–54. Дои:10.1074 / jbc.271.39.24048. PMID 8798641.
- Стенмарк Х., Осланд Р. (декабрь 1999 г.). «Белки FYVE-finger - эффекторы липида инозита». J. Cell Sci. 112 (Pt 23): 4175–83. PMID 10564636.