GDP-манноза 3,5-эпимераза - GDP-mannose 3,5-epimerase

В энзимология, а GDP-манноза 3,5-эпимераза (EC 5.1.3.18 ) является фермент который катализирует то химическая реакция

ВВП-манноза ${ displaystyle rightleftharpoons}$ GDP-L-галактоза + GDP-L-гулоза - обзор первоначальной реакции (обновлено в 2020 году, см. Ниже)

Следовательно, у этого фермента есть один субстрат, ВВП-манноза, и два товары, GDP-L-галактоза и GDP-L-гулоза

Поскольку в реакционной смеси был обнаружен только GDP-L-гулоза (C5-эпимер GDP-D-маннозы), было высказано предположение, что фермент выполняет C5-эпимеризацию перед C3-эпимеризацией. Тем не мение, GDP-D-altrose был недавно обнаружен как продукт реакции, что означает, что могут происходить оба пути реакции: C5-до-C3 и C3-до-C5. Это также означает, что GDP-манноза 3,5-эпимераза имеет три продукта реакции, а именно основной продукт GDP-L-галактоза (C3,5-эпимер) и два побочных продукта GDP-L-гулоза (С5-эпимер) + GDP-D-altrose (С3-эпимер).

GDP-D-манноза ${ displaystyle rightleftharpoons}$ GDP-L-галактоза (C3,5-эпимер) + GDP-L-гулоза (C5-эпимер) + GDP-D-альтроза (C3-эпимер) - обновление обзора реакции в 2020 г.

Этот фермент принадлежит к семейству изомеразы особенно те рацемазы и эпимеразы действующий на углеводы и производные. В систематическое название этого класса ферментов GDP-манноза 3,5-эпимераза. Другие широко используемые имена включают GDP-D-манноза: эпимераза GDP-L-галактозы, гуанозин 5'-дифосфат D-манноза: гуанозин 5'-дифосфат, и L-галактоза эпимераза. Этот фермент участвует в метаболизм аскорбата и альдарата.

Структурные исследования

На конец 2007 г. 4 структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 2C54, 2C59, 2C5A, и 2C5E.

Рекомендации

• Барбер Г.А., Хебда П.А. (1982). «GDP-D-манноза: эпимераза GDP-L-галактозы из Chlorella pyrenoidosa». Методы Энзимол. Методы в энзимологии. 83: 522–5. Дои:10.1016/0076-6879(82)83046-2. ISBN  978-0-12-181983-5. PMID  7098948.
• Hebda PA, Behrman EJ, Barber GA (1979). «Гуанозин 5'-дифосфат D-манноза: гуанозин 5'-дифосфат L-галактоза эпимераза Chlorella pyrenoidosa. Химический синтез гуанозин 5'-дифосфат L-галактозы и дальнейшие исследования фермента и реакции, которую он катализирует». Arch. Biochem. Биофизы. 194 (2): 496–502. Дои:10.1016/0003-9861(79)90644-1. PMID  443816.
• Геваерт О, Ван Овертвельдт С., Бееренс К., Десмет Т. (2019). «Характеристика первой бактериальной и термостабильной GDP-манноза 3,5-эпимеразы». Int. J. Mol. Наука. 20 (14): E3530. Дои:10.3390 / ijms20143530. ЧВК  6678494. PMID  31330931.
• Геваерт О., Ван Овертвельдт С., Да Коста М., Бееренс К., Десмет Т. (2020). «GDP-altrose как новый продукт GDP-манноза 3,5-эпимеразы: пересмотр механизма ее реакции». Int J Biol Macromol. 165 (Pt B): 1862–1868. Дои:10.1016 / j.ijbiomac.2020.10.067. PMID  33075338.