Функция Гомперца - Gompertz function
В Кривая Гомперца или Функция Гомперца это тип математическая модель для Временные ряды, названный в честь Бенджамин Гомпертц (1779–1865). Это сигмовидная функция который описывает рост как самый медленный в начале и в конце заданного периода времени. Правая или будущая стоимость асимптота функции приближается к кривой гораздо более постепенно, чем к левой асимптоте или асимптоте с меньшими значениями. Это в отличие от простая логистическая функция в котором обе асимптоты подходят кривой симметрично. Это частный случай обобщенная логистическая функция. Изначально функция была разработана для описания человеческой смертности, но с тех пор была изменена для применения в биологии с точки зрения детализации популяций.
История
Бенджамин Гомпертц (1779–1865) был актуарием в Лондоне, получившим частное образование.[1] Он был избран членом Королевское общество в 1819 году. Впервые функция была представлена в его статье от 16 июня 1825 года внизу страницы 518.[2] Функция Гомпертца сократила значительный набор данных в таблицах дожития до одной функции. Он основан на предположении, что уровень смертности экспоненциально снижается с возрастом человека. Результирующая функция Гомпертца предназначена для количества людей, живущих в данном возрасте, в зависимости от возраста.
Ранее работы по построению функциональных моделей смертности проводились французским математиком. Абрахам де Муавр (1667–1754) в 1750-е гг.[3][4] Однако Муавр предположил, что уровень смертности постоянный. Расширение работы Гомперца было предложено английским актуарием и математиком. Уильям Мэтью Макехэм (1826–1891) в 1860 году, который добавил постоянный фоновый уровень смертности к экспоненциально убывающему показателю Гомпертца.[5]
Формула
- а асимптота, так как
- б задает смещение по Икс-axis (переводит график влево или вправо). Когда б = log (2), f (0) = a / 2, также называемая средней точкой.
- c задает скорость роста (у масштабирование)
- е является Число Эйлера (е = 2.71828...)
Характеристики
Точка на полпути находится путем решения для т.
Вывод
Функциональная кривая может быть получена из Закон смертности Гомперца, в котором указывается, что уровень абсолютной смертности (распада) экспоненциально падает с текущим размером. Математически,
куда
- скорость роста
- k - произвольная постоянная.
Пример использования
Примеры использования кривых Гомперца включают:
- Мобильный телефон поглощение, когда затраты были изначально высокими (поэтому поглощение было медленным), затем последовал период быстрого роста, за которым следовало замедление поглощения по мере достижения насыщения[6]
- Население в замкнутом пространстве, поскольку рождаемость сначала увеличивается, а затем замедляется по мере достижения пределов ресурсов[7]
- Моделирование роста опухолей[8]
- Моделирование влияния на рынок в финансах[9] и динамика агрегированных субнациональных кредитов.[10]
- Детализация роста популяции хищных животных с учетом отношений хищник-жертва
- Моделирование бактериальных клеток в популяции
- Изучение распространения болезни
Приложения
Кривая Гомперца
Биология популяций особенно озабочена функцией Гомперца. Эта функция особенно полезна при описании быстрого роста определенной популяции организмов, а также для учета возможной горизонтальной асимптоты, когда грузоподъемность определяется (плато клеток / численность популяции).
Это моделируется следующим образом:
куда:
- время пришло
- N0 начальное количество ячеек
- Nя число клеток плато / популяции
- b - начальная скорость роста опухоли
Эта функция учета количества клеток плато позволяет точно имитировать реальную динамика населения. Функция также соблюдает сигмовидная функция, который является наиболее распространенным условием детализации роста населения. Кроме того, функция использует начальную скорость роста, которая обычно наблюдается в популяциях бактериальных и раковых клеток, которые подвергаются этап журнала и быстро расти в численности. Несмотря на свою популярность, функцию начальной скорости роста опухоли трудно предопределить, учитывая различные микрокосмы, существующие у пациента, или различные факторы окружающей среды в случае популяционной биологии. У онкологических больных такие факторы, как возраст, диета, этническая принадлежность, генетические предрасположенности, метаболизм, образ жизни и происхождение метастаз играют роль в определении скорости роста опухоли. Ожидается, что несущая способность также изменится в зависимости от этих факторов, поэтому описать такие явления сложно.
Метаболическая кривая
Метаболическая функция особенно связана с учетом скорости метаболизма в организме. Эта функция может применяться для мониторинга опухолевых клеток; Скорость метаболизма является динамичной и очень гибкой, что позволяет более точно определять рост рака. Метаболическая кривая учитывает энергию, которую организм обеспечивает для поддержания и создания тканей. Эта энергия может рассматриваться как метаболизм и следует определенному образцу клеточного деления. Энергосбережение может использоваться для моделирования такого роста, независимо от массы и времени развития. Все таксоны имеют схожую модель роста, и в результате эта модель рассматривает деление клеток как основу развития опухоли.
- B = энергия, которую организм использует в состоянии покоя
- NC = количество клеток в данном организме
- BC= скорость метаболизма отдельной клетки
- NCBC= энергия, необходимая для поддержания существующего ткань
- EC= энергия, необходимая для создания новой ткани из отдельной клетки
Различие между энергией, используемой в состоянии покоя, и скоростью метаболизма, позволяет модели более точно определять скорость роста. Энергия покоя ниже, чем энергия, используемая для поддержания ткани, и вместе представляет собой энергию, необходимую для поддержания существующей ткани. Использование этих двух факторов, наряду с энергией, необходимой для создания новой ткани, всесторонне отображает скорость роста и, более того, приводит к точному представлению фаза задержки.
Рост опухолей
В 1960-е годы А.К. Laird[11] впервые успешно использовали кривую Гомперца для аппроксимации данных роста опухолей. Фактически опухоли - это клеточные популяции, растущие в замкнутом пространстве, где доступность питательных веществ ограничена. Обозначая размер опухоли как X (t), полезно записать кривую Гомперца следующим образом:
куда:
- X (0) - размер опухоли на момент начала наблюдения;
- K - несущая способность, то есть максимальный размер, которого можно достичь с помощью доступных питательных веществ. На самом деле это:
независимо от X (0)> 0. Обратите внимание, что при отсутствии терапии и т. Д. Обычно это X (0)
- α - константа, связанная с пролиферативной способностью клеток.
- log () относится к натуральный журнал.
Легко убедиться, что динамика X (t) определяется дифференциальным уравнением Гомперца:
т.е. имеет форму в разбивке:
F (X) представляет собой мгновенную скорость пролиферации клеточной популяции, чей убывающий характер связан с конкуренцией за питательные вещества из-за увеличения клеточной популяции, аналогично скорости логистического роста. Однако есть принципиальная разница: в логистическом случае скорость распространения для небольшой клеточной популяции конечна:
тогда как в случае Гомперца скорость распространения неограничена:
Как заметил Steel[12] и Велдоном,[13] скорость пролиферации клеточной популяции в конечном итоге ограничена временем клеточного деления. Таким образом, это может быть доказательством того, что уравнение Гомперца не подходит для моделирования роста небольших опухолей. Более того, совсем недавно было замечено[14] что, включая взаимодействие с иммунной системой, законы Гомперца и другие законы, характеризующиеся неограниченным F (0), исключили бы возможность иммунного надзора.
Рост Gompertz и логистический рост
Дифференциальное уравнение Гомперца
предельный случай обобщенное логистическое дифференциальное уравнение
(куда положительное действительное число), поскольку
Кроме того, есть точка перегиба в графике обобщенного логистическая функция когда
и один на графике функции Гомперца, когда
Закон роста Gomp-ex
Основываясь на приведенных выше соображениях, Велдон[13] предложил математическую модель роста опухоли, названную моделью Gomp-Ex, которая немного изменяет закон Гомперца. В модели Gomp-Ex предполагается, что изначально отсутствует конкуренция за ресурсы, так что клеточная популяция увеличивается по экспоненциальному закону. Однако существует порог критического размера. так что для . Предположение об отсутствии конкуренции за ресурсы справедливо в большинстве сценариев. Однако на это может повлиять ограничивающие факторы, что требует создания субфакторных переменных.
рост следует закону Гомперца:
так что:
Вот несколько числовых оценок[13] за :
- для опухолей человека
- за мышиный (мышиные) опухоли
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Кирквуд, TBL (2015). «Расшифровка смерти: комментарий Гомперца (1825)« О природе функции, выражающей закон человеческой смертности, и о новом способе определения ценности жизненных обстоятельств ».'". Философские труды Лондонского королевского общества B. 370 (1666). Дои:10.1098 / rstb.2014.0379. ЧВК 4360127. PMID 25750242.
- ^ Гомпертц, Бенджамин (1825). «О природе функции, выражающей закон человеческой смертности, и о новом способе определения ценности жизненных обстоятельств». Философские труды Лондонского королевского общества. 115: 513–585. Дои:10.1098 / рстл.1825.0026. S2CID 145157003.
- ^ де Муавр, Авраам (1725). Аннуитеты на жизни…. Лондон, Англия: Фрэнсис Файрам, Бендж. Мотт и У. Пирсон. Второе издание вышло в 1743 году; третье издание вышло в 1750 году; четвертое издание вышло в 1752 году.
- ^ Гринвуд, М. (1928). «Законы смертности с биологической точки зрения». Журнал гигиены. 28 (3): 267–294. Дои:10.1017 / S002217240000961X. ЧВК 2167778. PMID 20475000.
- ^ Макехэм, Уильям Мэтью (1860). «О законе смертности и построении аннуитетных таблиц». Журнал Assurance и Журнал Института актуариев. 8 (6): 301–310. Дои:10.1017 / S204616580000126X.
- ^ Ислам Т., Фибиг Д.Г., Мид Н. (2002). «Моделирование международного спроса на телекоммуникации с ограниченными данными». Международный журнал прогнозирования. 18 (4): 605–624. Дои:10.1016 / S0169-2070 (02) 00073-0.
- ^ Zwietering MH, Jongenburger I, Rombouts FM, van 't Riet K (июнь 1990 г.). «Моделирование кривой роста бактерий». Прикладная и экологическая микробиология. 56 (6): 1875–81. Дои:10.1128 / AEM.56.6.1875-1881.1990. ЧВК 184525. PMID 16348228..
- ^ Сотторива А., Верхофф Дж. Дж., Боровски Т., МакВини С.К., Наумов Л., Медема Дж. П. и др. (Январь 2010 г.). «Модель опухоли раковых стволовых клеток показывает инвазивную морфологию и повышенную фенотипическую гетерогенность». Исследования рака. 70 (1): 46–56. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-3663. PMID 20048071.
- ^ Caravelli F, Sindoni L, Caccioli F, Ududec C (август 2016 г.). «Оптимальные траектории роста с конечной несущей способностью». Физический обзор E. 94 (2–1): 022315. arXiv:1510.05123. Bibcode:2016PhRvE..94b2315C. Дои:10.1103 / PhysRevE.94.022315. PMID 27627325. S2CID 35578084..
- ^ Роча Л.С., Роча Ф.С., Соуза ТТ (2017-10-05). «Является ли государственный сектор вашей страны диффузным заемщиком? Эмпирические данные из Бразилии». PLOS ONE. 12 (10): e0185257. arXiv:1604.07782. Bibcode:2017PLoSO..1285257R. Дои:10.1371 / journal.pone.0185257. ЧВК 5628819. PMID 28981532.
- ^ Laird AK (сентябрь 1964 г.). «Динамика роста опухоли». Британский журнал рака. 13 (3): 490–502. Дои:10.1038 / bjc.1964.55. ЧВК 2071101. PMID 14219541.
- ^ Сталь ГГ (1977). Кинетика роста опухолей. Оксфорд: Clarendon Press. ISBN 0-19-857388-X.
- ^ а б c Велдон Т.Е. (1988). Математические модели в исследованиях рака. Бристоль: Адам Хильгер. ISBN 0-85274-291-6.
- ^ д'Онофрио А (2005). «Общая основа для моделирования конкуренции опухолевой иммунной системы и иммунотерапии: математический анализ и биомедицинские выводы». Physica D. 208 (3–4): 220–235. arXiv:1309.3337. Bibcode:2005PhyD..208..220D. Дои:10.1016 / j.physd.2005.06.032. S2CID 15031322.