MRNA наблюдение - MRNA surveillance

механизмы наблюдения за мРНК находятся пути используются организмами для обеспечения точности и качества информационная РНК (мРНК) молекулы. Внутри клеток присутствует ряд механизмов наблюдения. Эти механизмы действуют на различных этапах мРНК. биогенез путь для обнаружения и деградации транскриптов, которые не были должным образом обработаны.

Обзор

В перевод из информационная РНК транскриптов в белки является важной частью центральная догма молекулярной биологии. Однако молекулы мРНК подвержены множеству ошибок точности, которые могут вызвать ошибки в переводе мРНК в качество. белки.[1] Механизмы наблюдения за РНК - это методы, которые клетки используют для обеспечения качества и точности молекул мРНК.[2] Обычно это достигается путем маркировки аберрантной молекулы мРНК для деградация различными эндогенными нуклеазы.[3]

Надзор за мРНК был задокументирован в бактерии и дрожжи. В эукариоты, эти механизмы, как известно, работают как в ядро и цитоплазма.[4] Проверка достоверности молекул мРНК в ядре приводит к деградации неправильно обработанных транскриптов перед экспортом в цитоплазму. После попадания в цитоплазму транскрипты подлежат дальнейшему наблюдению. Механизмы цитоплазматического надзора оценивают мРНК стенограммы на отсутствие или наличие преждевременных стоп-кодонов.[3][4]

В настоящее время известно, что три механизма наблюдения работают в клетки: нонсенс-опосредованный путь распада мРНК (NMD); пути непрерывного опосредованного распада мРНК (NSD); и путь распада мРНК, опосредованный запретом на прием (NGD).

Нонсенс-опосредованный распад мРНК

Основная статья: Нонсенс-опосредованный распад
UPF1 - это сохраненный геликаза который фосфорилируется в процессе NMD. Это фосфорилирование катализируется киназой SMG1. Этот процесс требует UPF2 и UPF3. Дефосфорилирование UPF1 катализируется белками SMG5, SMG6 и SMG7.[5]

Обзор

Нонсенс-опосредованный распад участвует в обнаружении и распаде транскриптов мРНК, которые содержат кодоны преждевременной терминации (PTC). ПТК могут возникать в клетках посредством различных механизмов: зародышевый мутации в ДНК; соматический мутации в ДНК; ошибки в транскрипция; или ошибки в посттранскрипционной обработке мРНК.[5][6] Неспособность распознать и расщепить эти транскрипты мРНК может привести к образованию усеченных белков, которые могут быть вредными для организма. Вызывая распад С-конца усеченный полипептидов, механизм NMD может защищать клетки от вредных доминирующий -отрицательный и усиление функции последствия.[7] ПТК вовлечены примерно в 30% всех унаследованный болезни; как таковой путь NMD играет жизненно важную роль в обеспечении общей выживаемости и приспособленности организма.[8][9]

Комплекс наблюдения, состоящий из различных белков (eRF1, eRF3, Upf1, Upf2 и Upf3), собирается и сканирует мРНК на предмет преждевременных стоп-кодонов.[5] Сборка этого комплекса запускается преждевременным прекращением трансляции. Если обнаружен преждевременный стоп-кодон, то транскрипт мРНК сигнализируется о деградации - происходит соединение обнаружения с деградацией.[3][10][11]

Семь генов smg (smg1-7) и три гена UPF (Upf1-3) были идентифицированы в Saccharomyces cerevisiae и Caenorhabditis elegans как важные транс-действующие факторы, способствующие активности НПРО.[12][13] Все эти гены консервированный в Drosophila melanogaster и другие млекопитающие, где они также играют решающую роль в НПРО. У эукариот есть три компонента, которые сохраняются в процессе NMD.[14] Это комплексы Upf1 / SMG-2, Upf2 / SMG-3 и Upf3 / SMG-4. Upf1 / SMG-2 - это фосфопротеин в многоклеточных организмах, который, как полагают, вносит вклад в NMD за счет своей активности фосфорилирования. Однако точные взаимодействия белков и их роль в NMD в настоящее время оспариваются.[11][12][14][15][16]

Механизм у млекопитающих

Нонсенс-опосредованный распад у млекопитающих опосредуется соединением экзон-экзон. Это соединение отмечено группой белков, которые составляют комплекс экзонных соединений (EJC). EJC рекрутирует UPF1 / SMG с помощью факторов транскрипции eRF1 / eRF3. Взаимодействие этих белков приводит к сборке комплекса наблюдения. Этот комплекс в конечном итоге ответственен за деградацию бессмысленной мРНК.[5]

Преждевременный стоп-кодон должен распознаваться как отличный от нормального стоп-кодона, так что только первый вызывает ответ NMD. Было замечено, что способность бессмысленного кодона вызывать деградацию мРНК зависит от его относительного местоположения по отношению к нижележащему элементу последовательности и связанным с ним белкам.[1] Исследования показали, что нуклеотиды более чем на 50–54 нуклеотидов перед последним соединением экзон-экзон может нацеливаться на мРНК для распада.[1][4][5][6][7][17] Те, кто ниже по течению от этого региона, не могут этого сделать. Таким образом, нонсенс-кодоны лежат более чем на 50-54 нуклеотида выше последнего. экзон граница, тогда как естественные стоп-кодоны расположены внутри терминальных экзонов.[18] Комплексы экзонных соединений (EJC) отмечают границы экзон-экзон. EJCs представляют собой мультибелковые комплексы, которые собираются во время сплайсинга в положении примерно на 20-24 нуклеотида выше места соединения сплайсинга.[19] Именно этот EJC предоставляет информацию о положении, необходимую для отличия преждевременных стоп-кодонов от естественных стоп-кодонов. Распознавание ПТК, по-видимому, зависит от определения соединений экзон-экзон. Это предполагает участие сплайсосомы в NMD млекопитающих.[17][20] Исследования изучили возможность участия сплайсосом в NMD млекопитающих и определили, что это вероятная возможность.[18] Кроме того, было замечено, что механизмы NMD не активируются бессмысленными транскриптами, которые генерируются из генов, которые в природе не содержат интронов (то есть гистона H4, Hsp70, рецептора меланокортина-4).[7]

Когда рибосома достигает PTC, факторы трансляции eRF1 и eRF3 взаимодействуют с сохраненными комплексами EJC через мультипротеиновый мостик.[21] Взаимодействие UPF1 с оконечным комплексом и с UPF2 / UPF3 сохраненных EJC имеет решающее значение. Именно эти взаимодействия нацелены на мРНК для быстрого разлагаться эндогенными нуклеазами[18][21]

Постулируется, что нонсенс-опосредованный распад мРНК у беспозвоночных опосредуется наличием ложной 3'-нетранслируемой области (UTR). Эти искусственные 3'UTR отличаются от естественных 3'UTR, которые следуют за естественными стоп-кодонами. Это происходит из-за отсутствия связывающих белков, которые обычно присутствуют в природном 3'UTR. Эти связывающие белки включают поли (А) -связывающий белок (РАВР).[5]

Механизм у беспозвоночных

Исследования с участием таких организмов, как С. cerevisiae, D.melanogaster и C. elegans показали, что распознавание PTC с участием беспозвоночный организмов не имеет границ экзон-экзон.[20] Эти исследования показывают, что NMD у беспозвоночных возникает независимо от сплайсинга. В результате EJCs, которые отвечают за маркировку границ экзон-экзон, не требуются в NMD у беспозвоночных.[3] Было предложено несколько моделей, чтобы объяснить, как PTCs отличаются от нормальных стоп-кодонов у беспозвоночных. Один из них предполагает, что может существовать расположенный ниже элемент последовательности, который функционирует аналогично соединениям экзонов у млекопитающих.[11] Вторая модель предполагает, что широко присутствующая особенность мРНК, такая как 3 'поли-A хвост, может обеспечивать позиционную информацию, необходимую для распознавания.[22] Другая модель, получившая название «faux 3'UTR model», предполагает, что преждевременное завершение трансляции можно отличить от нормального завершения из-за внутренних особенностей, которые могут позволить ему распознать его присутствие в неподходящей среде.[3] Однако эти механизмы еще предстоит окончательно продемонстрировать.

Механизм у растений

У растений есть два механизма распознавания PTC: в зависимости от расстояния от EJC (как у позвоночных) или от поли-A-хвоста. Механизм NMD у растений вызывает распад мРНК, содержащих 3’NTR длиной более 300 нуклеотидов, поэтому доля мРНК с более длинными 3’NTRs у растений намного ниже, чем у позвоночных.[23][24]

Избегание НПРО

Обычно считается, что мРНК с нонсенс-мутациями нацелены на распад через пути NMD. Присутствие этого преждевременного стоп-кодона примерно в 50-54 нуклеотидах 5 'от соединения экзонов, по-видимому, является триггером для быстрого распада; однако было замечено, что некоторые молекулы мРНК с преждевременным стоп-кодоном способны избегать обнаружения и распада.[17][25] Как правило, эти молекулы мРНК обладают стоп-кодоном очень рано в рамке считывания (то есть PTC является AUG-проксимальным). Это, по-видимому, противоречит общепринятой в настоящее время модели NMD, поскольку это положение значительно 5 'от соединения экзон-экзон.[26]

Это было продемонстрировано в β-глобулине. МРНК β-глобулина, содержащие нонсенс-мутацию в начале первого экзона гена, более стабильны, чем молекулы мРНК, чувствительные к NMD. Точный механизм предотвращения обнаружения в настоящее время неизвестен. Было высказано предположение, что поли-A-связывающий белок (PABP), по-видимому, играет роль в этой стабильности.[27] В других исследованиях было продемонстрировано, что присутствие этого белка вблизи AUG-проксимальных PTCs, по-видимому, способствует стабильности этих мРНК, чувствительных к NMD. Было замечено, что этот защитный эффект не ограничивается только промотором β-глобулина.[25] Это предполагает, что этот механизм избегания NMD может преобладать в других типах тканей для множества генов. Текущая модель НПРО, возможно, потребуется пересмотреть после дальнейших исследований.

Непрерывный опосредованный распад мРНК

Основная статья: Безостановочный распад

Обзор

Непрерывно опосредованная мРНК. Трансляция мРНК без стоп-кодона приводит к трансляции рибосомы в 3'-концевую область поли-A. это приводит к остановке рибосомы. Рибосома спасается двумя разными путями. Механизмы зависят от отсутствия или присутствия белка Ski7.[28]

Непрерывный опосредованный распад (NSD) участвует в обнаружении и распаде транскриптов мРНК, в которых отсутствует стоп-кодон.[29][30] Эти транскрипты мРНК могут возникать в результате многих различных механизмов, таких как преждевременное 3'-аденилирование или скрытые сигналы полиаденилирования в кодирующей области гена.[31] Отсутствие стоп-кодона создает серьезные проблемы для клеток. Рибосомы, транслирующие мРНК, в конечном итоге переводятся в область 3'-поли-A-хвоста транскриптов и киосков. В результате он не может выбросить мРНК.[32] Таким образом, рибосомы могут стать изолированными, связанными с непрерывной мРНК, и будут недоступны для трансляции других молекул мРНК в белки. Непрерывный опосредованный распад решает эту проблему как за счет освобождения застрявших рибосом, так и за счет маркировки непрерывной мРНК для деградации в клетке нуклеазами. Непрерывный опосредованный распад состоит из двух различных путей, которые, вероятно, действуют согласованно для непрерывного распада мРНК.[29][30]

Трасса Ski7

Этот путь активен, когда белок Ski7 доступен в клетке. Считается, что белок Ski7 связывается с пустым сайтом А рибосомы. Это связывание позволяет рибосоме вытолкнуть застрявшую безостановочную молекулу мРНК - это даже освобождает рибосому и позволяет ей транслировать другие транскрипты. Ski7 теперь связан с непрерывной мРНК, и именно эта ассоциация нацелена на непрерывную мРНК для распознавания цитозольной экзосома. Комплекс Ski7-экзосома быстро деаденилирует молекулу мРНК, что позволяет экзосоме распадать транскрипт с 3 'на 5'.[29][30]

Трасса Non-Ski7

Второй тип NSD был обнаружен у дрожжей. В этом механизме отсутствие Ski7 приводит к потере белков PABP, связывающих поли-A-хвост, под действием трансляционной рибосомы. Удаление этих белков PABP приводит к потере защитного Крышка 5 футов 7 г. Потеря кэпа приводит к быстрой деградации транскрипта эндогенной 5'-3'-экзонуклеазой, такой как XrnI.[30]

Беспроигрышный распад

Нет-опосредованный распад мРНК.

Непрерывный распад (NGD) - это самый последний обнаруженный механизм наблюдения.[33] Как таковой, в настоящее время он недостаточно изучен. Хотя подлинные мишени NGD плохо изучены, они, по-видимому, состоят в основном из транскриптов мРНК, на которых рибосомы остановились во время трансляции. Это срыв может быть вызвано множеством факторов, в том числе сильным второстепенные конструкции, что может физически заблокировать механизм перевода от перемещения по транскрипту.[33] Dom34 / Hbs1, вероятно, связывается рядом с сайтом А застопорившихся рибосом и может способствовать рециклингу комплексов.[34] В некоторых случаях транскрипт также расщепляется эндонуклеолитическим способом около места остановки; однако идентичность ответственной эндонуклеазы остается спорным. В фрагментированный Затем молекулы мРНК полностью разлагаются экзосомой в диапазоне от 3 до 5 футов и Xrn1 в диапазоне от 5 до 3 футов.[33]В настоящее время неизвестно, как этот процесс высвобождает мРНК из рибосом, однако Hbs1 тесно связан с белком Ski7, который играет четкую роль в высвобождении рибосом в NSD, опосредованном Ski7. Предполагается, что Hbs1 может играть аналогичную роль в NGD.[5][35]

Эволюция

Есть возможность определить эволюционный история этих механизмов, наблюдая за сохранением ключевых белков, участвующих в каждом механизме. Например: Dom34 / Hbs1 связаны с NGD;[33] Ski7 ассоциируется с NSD;[29] и белки eRF связаны с NMD.[6] С этой целью обширные ВЗРЫВ были проведены поиски для определения преобладания белков в различных типах организмов. Было установлено, что NGD Hbs1 и NMD eRF3 обнаруживаются только у эукариот. Однако NGD Dom34 универсален у эукариот и археи. Это предполагает, что NGD, по-видимому, был первым эволюционировавшим механизмом наблюдения за мРНК. Белок NSD Ski7, по-видимому, строго ограничен видами дрожжей, что позволяет предположить, что NSD является самым недавно разработанным механизмом наблюдения. Это по умолчанию оставляет NMD в качестве второго развитого механизма наблюдения.[36]

Предлагаемый эволюционный механизм развития белков компонентов наблюдения за мРНК.[36]

Рекомендации

  1. ^ а б c Амрани Н., Сакс М.С., Якобсон А. (июнь 2006 г.). «Ранняя чепуха: распад мРНК решает проблему трансляции». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология. 7 (6): 415–25. Дои:10.1038 / nrm1942. PMID  16723977.
  2. ^ Мур MJ (сентябрь 2005 г.). «От рождения до смерти: сложная жизнь мРНК эукариот». Наука. 309 (5740): 1514–8. Bibcode:2005Научный ... 309.1514М. Дои:10.1126 / science.1111443. PMID  16141059.
  3. ^ а б c d е Амрани Н., Ганесан Р., Кервестин С., Мангус Д.А., Гош С., Якобсон А. (ноябрь 2004 г.). «Искусственный 3'-UTR способствует аберрантному завершению и запускает нонсенс-опосредованный распад мРНК». Природа. 432 (7013): 112–8. Bibcode:2004Натура.432..112А. Дои:10.1038 / природа03060. PMID  15525991.
  4. ^ а б c Фаскен МБ, Корбетт А.Х. (июнь 2005 г.). «Процесс или смерть: контроль качества в биогенезе мРНК». Структурная и молекулярная биология природы. 12 (6): 482–8. Дои:10.1038 / nsmb945. PMID  15933735.
  5. ^ а б c d е ж грамм Чанг Ю.Ф., Имам Дж.С., Уилкинсон М.Ф. (2007). «Нонсенс-опосредованный путь наблюдения за распадом РНК». Ежегодный обзор биохимии. 76: 51–74. Дои:10.1146 / annurev.biochem.76.050106.093909. PMID  17352659.
  6. ^ а б c Rehwinkel J, Raes J, Izaurralde E (ноябрь 2006 г.). «Нонсенс-опосредованный распад мРНК: гены-мишени и функциональная диверсификация эффекторов». Тенденции в биохимических науках. 31 (11): 639–46. Дои:10.1016 / j.tibs.2006.09.005. PMID  17010613.
  7. ^ а б c Maquat LE (февраль 2004 г.). «Нонсенс-опосредованный распад мРНК: сплайсинг, трансляция и динамика мРНП». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология. 5 (2): 89–99. Дои:10.1038 / nrm1310. PMID  15040442.
  8. ^ Холбрук Дж. А., Ной-Йилик Г., Хентце М. В., Кулозик А. Е. (август 2004 г.). «В клинику приближается распад, вызванный бессмыслицей». Природа Генетика. 36 (8): 801–8. Дои:10,1038 / ng1403. PMID  15284851.
  9. ^ Mendell JT, Sharifi NA, Meyers JL, Martinez-Murillo F, Dietz HC (октябрь 2004 г.). «Неразумный надзор регулирует экспрессию различных классов транскриптов млекопитающих и приглушает геномный шум». Природа Генетика. 36 (10): 1073–8. Дои:10,1038 / ng1429. PMID  15448691.
  10. ^ Lejeune F, Maquat LE (июнь 2005 г.). «Механистические связи между нонсенс-опосредованным распадом мРНК и сплайсингом пре-мРНК в клетках млекопитающих». Текущее мнение в области клеточной биологии. 17 (3): 309–15. Дои:10.1016 / j.ceb.2005.03.002. PMID  15901502.
  11. ^ а б c Conti E, Izaurralde E (июнь 2005 г.). «Нонсенс-опосредованный распад мРНК: молекулярное понимание и механистические вариации у разных видов». Текущее мнение в области клеточной биологии. 17 (3): 316–25. Дои:10.1016 / j.ceb.2005.04.005. PMID  15901503.
  12. ^ а б Кали Б.М., Кучма С.Л., Латам Дж., Андерсон П. (февраль 1999 г.). «smg-7 необходим для наблюдения за мРНК у Caenorhabditis elegans». Генетика. 151 (2): 605–16. ЧВК  1460488. PMID  9927455.
  13. ^ Ямасита А., Кашима И., Оно С. (декабрь 2005 г.). «Роль SMG-1 в нонсенс-опосредованном распаде мРНК». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Белки и протеомика. 1754 (1–2): 305–15. Дои:10.1016 / j.bbapap.2005.10.002. PMID  16289965.
  14. ^ а б Ким Ю.К., Фурик Л., Desgroseillers Л., Maquat LE (январь 2005 г.). «Staufen1 млекопитающих рекрутирует Upf1 на специфические 3'UTR мРНК, чтобы вызвать распад мРНК». Клетка. 120 (2): 195–208. Дои:10.1016 / j.cell.2004.11.050. PMID  15680326.
  15. ^ Longman D, Plasterk RH, Johnstone IL, Cáceres JF (май 2007 г.). «Механистическое понимание и идентификация двух новых факторов в пути NMD C. elegans». Гены и развитие. 21 (9): 1075–85. Дои:10.1101 / gad.417707. ЧВК  1855233. PMID  17437990.
  16. ^ Gatfield D, Unterholzner L, Ciccarelli FD, Bork P, Izaurralde E (август 2003 г.). «Нонсенс-опосредованный распад мРНК у дрозофилы: на пересечении путей дрожжей и млекопитающих». Журнал EMBO. 22 (15): 3960–70. Дои:10.1093 / emboj / cdg371. ЧВК  169044. PMID  12881430.
  17. ^ а б c Надь Э., Макват Л.Е. (июнь 1998 г.). «Правило для положения терминирующего кодона в интронсодержащих генах: когда бессмыслица влияет на количество РНК». Тенденции в биохимических науках. 23 (6): 198–9. Дои:10.1016 / S0968-0004 (98) 01208-0. PMID  9644970.
  18. ^ а б c Игрок TJ, Mills DJ, Horton AA (июнь 1979 г.). «Перекисное окисление липидов микросомальной фракции и экстрагированных микросомальных липидов из DAB-индуцированных гепатом». Британский журнал рака. 39 (6): 773–8. Дои:10.1128 / mcb.18.9.5272. ЧВК  109113. PMID  9710612.
  19. ^ Neu-Yilik G, Gehring NH, Thermann R, Frede U, Hentze MW, Kulozik AE (февраль 2001 г.). «Сплайсинг и образование 3'-концов в определении нонсенс-опосредованных распадом компетентных мРНП бета-глобина человека». Журнал EMBO. 20 (3): 532–40. Дои:10.1093 / emboj / 20.3.532. ЧВК  133467. PMID  11157759.
  20. ^ а б Бем-Ансмант I, Гатфилд Д., Ревинкель Дж., Хильгерс В., Изаурральде Э. (март 2007 г.). «Консервативная роль цитоплазматического поли (A) -связывающего белка 1 (PABPC1) в нонсенс-опосредованном распаде мРНК». Журнал EMBO. 26 (6): 1591–601. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601588. ЧВК  1829367. PMID  17318186.
  21. ^ а б Кашима И., Ямасита А., Изуми Н., Катаока Н., Моришита Р., Хосино С., Оно М., Дрейфус Г., Оно С. (февраль 2006 г.). «Связывание нового комплекса SMG-1-Upf1-eRF1-eRF3 (SURF) с комплексом соединения экзонов запускает фосфорилирование Upf1 и нонсенс-опосредованный распад мРНК». Гены и развитие. 20 (3): 355–67. Дои:10.1101 / gad.1389006. ЧВК  1361706. PMID  16452507.
  22. ^ Паланисвами В., Мораес К.С., Вилуш С.Дж., Вилуш Дж. (Май 2006 г.). «Нуклеофозмин выборочно откладывается на мРНК во время полиаденилирования». Структурная и молекулярная биология природы. 13 (5): 429–35. Дои:10.1038 / nsmb1080. ЧВК  2811576. PMID  16604083.
  23. ^ Шварц А.М., Комарова Т.В., Скулачев М.В., Зверева А.С., Дорохов И., Атабеков Ю.Г. (декабрь 2006 г.). «Стабильность мРНК растений зависит от длины 3'-нетранслируемой области». Биохимия. Биохимия. 71 (12): 1377–84. Дои:10.1134 / с0006297906120145. PMID  17223792.
  24. ^ Nyikó T, Kerényi F, Szabadkai L, Benkovics AH, Major P, Sonkoly B, Mérai Z, Barta E, Niemiec E, Kufel J, Silhavy D (июль 2013 г.). «Растительный нонсенс-опосредованный распад мРНК контролируется различными ауторегуляторными цепями и может быть вызван EJC-подобным комплексом». Исследования нуклеиновых кислот. 41 (13): 6715–28. Дои:10.1093 / nar / gkt366. ЧВК  3711448. PMID  23666629.
  25. ^ а б Инасио А., Сильва А.Л., Пинто Дж., Джи Х, Моргадо А., Алмейда Ф., Фаустино П., Лавинья Дж., Либхабер С.А., Ромао Л. (июль 2004 г.). «Нонсенс-мутации в непосредственной близости от инициирующего кодона не могут запустить полный бессмысленный распад мРНК». Журнал биологической химии. 279 (31): 32170–80. Дои:10.1074 / jbc.m405024200. PMID  15161914.
  26. ^ Сильва А.Л., Перейра Ф.Дж., Моргадо А., Конг Дж., Мартинс Р., Фаустино П., Либхабер С.А., Ромао Л. (декабрь 2006 г.). «Канонический UPF1-зависимый нонсенс-опосредованный распад мРНК ингибируется в транскриптах, несущих короткую открытую рамку считывания, независимо от контекста последовательности». РНК. 12 (12): 2160–70. Дои:10.1261 / rna.201406. ЧВК  1664719. PMID  17077274.
  27. ^ Сильва А.Л., Рибейро П., Инасиу А., Либхабер С.А., Роман Л. (март 2008 г.). «Близость поли (А) -связывающего белка к кодону преждевременной терминации ингибирует нонсенс-опосредованный распад мРНК у млекопитающих». РНК. 14 (3): 563–76. Дои:10.1261 / rna.815108. ЧВК  2248256. PMID  18230761.
  28. ^ Гарно Н.Л., Вилуш Дж., Вилуш С.Дж. (февраль 2007 г.). «Пути распада мРНК». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология. 8 (2): 113–26. Дои:10.1038 / nrm2104. PMID  17245413.
  29. ^ а б c d ван Хоф А., Фришмейер П.А., Дитц Х.С., Паркер Р. (март 2002 г.). «Опосредованное экзосомами распознавание и деградация мРНК, лишенных кодона терминации». Наука. 295 (5563): 2262–4. Дои:10.1126 / science.1067272. PMID  11910110.
  30. ^ а б c d Frischmeyer PA, van Hoof A, O'Donnell K, Guerrerio AL, Parker R, Dietz HC (март 2002 г.). «Механизм наблюдения за мРНК, который устраняет транскрипты, лишенные терминирующих кодонов». Наука. 295 (5563): 2258–61. Bibcode:2002Наука ... 295.2258F. Дои:10.1126 / science.1067338. PMID  11910109.
  31. ^ Temperley RJ, Seneca SH, Tonska K, Bartnik E, Bindoff LA, Lightowlers RN, Chrzanowska-Lightowlers ZM (сентябрь 2003 г.). «Исследование микроделеции патогенной мтДНК показывает трансляционно-зависимый путь распада деаденилирования в митохондриях человека». Молекулярная генетика человека. 12 (18): 2341–8. Дои:10.1093 / hmg / ddg238. PMID  12915481.
  32. ^ Karzai AW, Roche ED, Sauer RT (июнь 2000 г.). «Система SsrA-SmpB для маркировки белков, направленной деградации и спасения рибосом». Структурная биология природы. 7 (6): 449–55. Дои:10.1038/75843. PMID  10881189.
  33. ^ а б c d Дома МК, Паркер Р. (март 2006 г.). «Эндонуклеолитическое расщепление мРНК эукариот с остановками в элонгации трансляции». Природа. 440 (7083): 561–4. Bibcode:2006Натура.440..561D. Дои:10.1038 / природа04530. ЧВК  1839849. PMID  16554824.
  34. ^ Кобаяси К., Кикуно И., Куроха К., Сайто К., Ито К., Иситани Р., Инада Т., Нуреки О. (октябрь 2010 г.). "Структурная основа для наблюдения за мРНК архей Pelota и GTP-связанным комплексом EF1α". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (41): 17575–9. Bibcode:2010PNAS..10717575K. Дои:10.1073 / pnas.1009598107. ЧВК  2955123. PMID  20876129.
  35. ^ Graille M, Chaillet M, van Tilbeurgh H (март 2008 г.). «Структура дрожжевого Dom34: белок, связанный с фактором терминации трансляции Erf1 и участвующий в распаде No-Go». Журнал биологической химии. 283 (11): 7145–54. Дои:10.1074 / jbc.M708224200. PMID  18180287.
  36. ^ а б Аткинсон ГК, Балдауф С.Л., Хаурилюк В. (октябрь 2008 г.). «Эволюция безостановочного, запретного и бессмысленного распада мРНК и их компонентов, производных от факторов терминации». BMC Эволюционная биология. 8: 290. Дои:10.1186/1471-2148-8-290. ЧВК  2613156. PMID  18947425.

внешняя ссылка