Марк Бородовский - Mark Borodovsky
Марк Бородовский (русский: Марк Бородовский) это Риджентс 'Профессор при присоединении Уоллес Х. Коултер, Отдел биомедицинской инженерии из Технологический институт Джорджии и Университет Эмори и директор Центра биоинформатики и вычислительной геномики Технологического института Джорджии.[1] Он также является заведующим кафедрой биоинформатики в Московский физико-технический институт в Москве, Россия.
Бородовский заинтересован в продвижении биоинформатика образование. Он является основателем Технологической биоинформатической школы Джорджии, магистра наук. и к.т.н. Program, член образовательного комитета Международного общества вычислительной биологии, а также организатор серии международных конференций по биоинформатике в Технологическом институте Джорджии, начатой в 1997 году.
Исследование
Бородовский начал исследования в области биоинформатики в Институте молекулярной генетики Академии наук СССР в 1985 году. В 1986 году он ввел использование моделей неоднородных цепей Маркова для эффективного моделирования областей, кодирующих белок; этот подход стал стандартной функцией алгоритмов поиска генов. В 1990 году он основал лабораторию биоинформатики в Технологическом институте Джорджии в Атланте. Бородовский внес большой вклад в разработку алгоритмов поиска генов, в частности, в программу GeneMark (1993), которая оказала влияние в этой области и использовалась для аннотации первых полностью секвенированных геномов Haemophilus influenzae и Methanococcus jannaschii. Опыт из первых рук в ряде геномных проектов мотивировал дальнейшую разработку передовых алгоритмов, применимых к вирусным, прокариотическим, эукариотическим геномам и метагеномам.[2] Эти алгоритмы в настоящее время используются во многих исследовательских лабораториях в США и за рубежом, а также в крупных центрах секвенирования и аннотации, таких как Broad Institute, DOE Joint Genome Institute и NIH National Center for Biotechnology Information.
Образование
Бородовский получил степень магистра физики и исследований операций и доктора прикладной математики в Московский физико-технический институт.
Почести
Бородовский был избран членом Международное общество вычислительной биологии в 2020 году.[3]
Рекомендации
внешняя ссылка
- Прогнозирование генов в новых геномах грибов с использованием алгоритма ab initio с обучением без учителя, Геномные исследования
- Идентификация генов в новых геномах эукариот с помощью алгоритма самообучения, Исследования нуклеиновых кислот
- GeneMark: веб-программа для поиска генов у прокариот, эукариот и вирусов Исследования нуклеиновых кислот
- GeneMarkS: метод самообучения для предсказания начала генов в микробных геномах. Значение для поиска мотивов последовательности в регуляторных областях, Исследования нуклеиновых кислот
- Эвристический подход к построению моделей для поиска генов, Исследования нуклеиновых кислот
- GeneMark.hmm: новые решения для поиска генов, Исследования нуклеиновых кислот
- GenMark: параллельное распознавание генов обеих нитей ДНК Компьютеры и химия