Рафаэль Ирисарри (ученый) - Rafael Irizarry (scientist)

Рафаэль Анхель Иризарри
Рафаэль Иризарри.jpg
ОбразованиеКалифорнийский университет в Беркли
ИзвестенБиокондуктор
Награды
Научная карьера
ТезисСтатистика и музыка: подгонка локальной гармонической модели к музыкальным звуковым сигналам  (1998)
ДокторантДэвид Бриллинджер

Рафаэль Ирисарри профессор биостатистика на Гарвард Т. Школа общественного здравоохранения Чан и профессор биостатистики и вычислительная биология на Институт рака Даны – Фарбера.[1][2][3] Иризарри известен как один из основателей Биокондуктор проект.

Образование

Иризарри получил степень бакалавра наук в математика от Университет Пуэрто-Рико в Рио-Пьедрас в 1993 г., затем получил степень магистра гуманитарных наук Калифорнийский университет в Беркли в 1994 году. Он продолжил учебу в Беркли, получив в 1998 году докторскую степень по статистике. В его докторской диссертации исследовалось использование статистики для моделирования гармоний в звуковых сигналах.[4][5]

Исследование

Иризарри присоединилась к Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса в 1998 году, где его исследования были сосредоточены на геномика и вычислительная биология.[4] Он работал над анализом и обработкой данных, полученных из микрочип экспериментировал и помог разработать метод робастного многомассивного анализа (RMA) для микроматричный анализ в сотрудничестве со статистиком Терри Спид и коллеги;[6] Позднее этот метод был расширен как метод замороженного RMA (fRMA).[7][8] Он также работал над анализом секвенирование следующего поколения данные.

Иризарри - один из основателей Биокондуктор проект, открытый исходный код и проект программного обеспечения для разработки для анализа геномных данных в Язык программирования R.[9][10][11] Он принимал участие в разработке нескольких наиболее часто используемых пакетов Bioconductor, включая пакет affy для анализа Affymetrix данные микрочипа.[8][12][13]

Иризарри - разработчик и преподаватель онлайн-курса «Анализ данных для наук о жизни» Гарвардского университета. edX Платформа; на этом курсе обучается более 30 000 студентов в год.[8][14]

Награды

2009 Премия президентов COPSS в статистике.[15]

Премия Мортимера Шпигельмана 2009 г. Американская ассоциация общественного здравоохранения[16][17] вручается выдающимся статистикам общественного здравоохранения в возрасте до 40 лет.

2017 Премия Бенджамина Франклина в области биоинформатики за продвижение бесплатных и открытых материалов и методов в науках о жизни.[18][19]

Он был избран членом Международное общество вычислительной биологии в 2020 году.[20]

Рекомендации

  1. ^ "Рафаэль Иризарри". Гарвардский университет, факультет физики. Получено 12 августа 2017.
  2. ^ "Рафаэль Ирисарри, PhD - DF / HCC". Дана-Фарбер / Гарвардский онкологический центр. Получено 12 августа 2017.
  3. ^ Циммер, Карл (1 июля 2016 г.). «Растущие проблемы в области эпигенетики: некоторые требуют капитального ремонта». Нью-Йорк Таймс. Получено 30 августа 2017.
  4. ^ а б Иризарри, Рафаэль. "О". Лаборатория Рафаэля Иризарри.
  5. ^ Иризарри, Рафаэль (1998). «Статистика и музыка: подгонка локальной гармонической модели к музыкальным звуковым сигналам (докторская диссертация)» (PDF). S2CID  58781935. Архивировано из оригинал (PDF) на 2017-08-12. Получено 12 августа 2017. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  6. ^ Певснер, Джонатан (2015). Биоинформатика и функциональная геномика (3-е изд.). Джон Вили и сыновья. п. 488. ISBN  978-1-118-58178-0. Получено 30 августа 2017.
  7. ^ McCall, M.N .; Bolstad, B.M .; Иризарри, Р. А. (22 января 2010 г.). «Замороженный устойчивый многомассивный анализ (fRMA)». Биостатистика. 11 (2): 242–253. Дои:10.1093 / биостатистика / kxp059. ЧВК  2830579. PMID  20097884.
  8. ^ а б c «Объявление лауреата премии Бенджамина Франклина 2017 года». Bioinformatics.org. Получено 12 августа 2017.
  9. ^ "Рафаэль Иризарри". edX. 20 декабря 2013 г.. Получено 12 августа 2017.
  10. ^ Джентльмен, Роберт С; Кэри, Винсент Дж; Бейтс, Дуглас М; Болстад, Бен; Деттлинг, Марсель; Дудуа, Сандрин; Эллис, Байрон; Готье, Лоран; Ге, Юнчао; Джентри, Джефф; Хорник, Курт; Хорн, Торстен; Хубер, Вольфганг; Иак, Стефано; Иризарри, Рафаэль; Лейш, Фридрих; Ли, Ченг; Maechler, Мартин; Россини, Энтони Дж; Савицки, Гюнтер; Смит, Колин; Смит, Гордон; Тирни, Люк; Ян, Жан YH; Чжан, Цзяньхуа (2004). «Биокондуктор: открытая разработка программного обеспечения для вычислительной биологии и биоинформатики». Геномная биология. 5 (10): R80. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r80. ЧВК  545600. PMID  15461798.
  11. ^ Мулекар, Мадхури. "Статистики отмечены за вклад | Новости Амстата". magazine.amstat.org. Получено 30 августа 2017.
  12. ^ «Методы для аффиметричных олигонуклеотидных массивов». Биокондуктор. Получено 12 августа 2017.
  13. ^ Gautier, L .; Cope, L .; Bolstad, B.M .; Иризарри, Р. А. (10 февраля 2004 г.). «affy - анализ данных Affymetrix GeneChip на зондовом уровне». Биоинформатика. 20 (3): 307–315. Дои:10.1093 / биоинформатика / btg405. PMID  14960456.
  14. ^ "Анализ данных для наук о жизни 1: Статистика и R". Гарвардское онлайн-обучение. 2016-04-10. Получено 12 августа 2017.
  15. ^ «Премия президентов». Комитет президентов статистических обществ. Архивировано из оригинал на 2015-12-06. Получено 12 августа 2017.
  16. ^ «Проверка сложной биологии: как массивы могут дополнять ваши данные следующего поколения». Научные вебинары. 5 декабря 2012 г.. Получено 12 августа 2017.
  17. ^ «Премия Мортимера Шпигельмана - РАЗДЕЛ СТАТИСТИКИ APHA». sites.google.com. Получено 30 августа 2017.
  18. ^ «Премия Бенджамина Франклина». Bioinformatics.org. Получено 12 августа 2017.
  19. ^ «Рафаэль Иризарри получил премию Бена Франклина 2017 года». Гарвардская школа общественного здравоохранения им. Т. Х. Чана Департамент биостатистики. 11 апреля 2017. Архивировано с оригинал на 2017-08-12. Получено 12 августа 2017.
  20. ^ «19 февраля 2020 г .: ISCB поздравляет и представляет класс стипендиатов 2020 года!». www.iscb.org. Получено 23 июн 2020.