Nocardiopsis sinuspersici - Nocardiopsis sinuspersici

Nocardiopsis sinuspersici
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Актинобактерии
Класс:
Актинобактерии
Подкласс:
Actinobacteridae
Заказ:
Актиномицеты
Семья:
Nocardiopsaceae
Род:
Нокардиопсис
Разновидность:
Н. sinuspersici

Hamedi et al. 2010 г.[1]
Биномиальное имя
Nocardiopsis sinuspersici
Тип штамма
CCUG 57624, DSM 45277, HM6, UTMC 00102[2]

Nocardiopsis sinuspersici аэробный, Грамм положительный, алкалогалофильный, актиномицет.[3] В то время как виды из рода Нокардиопсис были обнаружены в различных средах, прежде всего в почвах, Н. sinuspersici sp. Нов был изолирован от песчаных ризосферный почвы из Сарбандар и Хорамшехр в Иран.[4][1][5][3]

Рост и морфология

Н. sinuspersici было показано, что они оптимально растут на агаре с дрожжевым экстрактом и менее оптимально на агаре, содержащем овсянку и неорганические крахмалы.[3] Н. sinuspersici обладают несколькими уникальными фенотипическими чертами, которых нет у других представителей Nocardiopsis.[3] N. sisnusci иметь небольшое количество светло-желтого мицелий и "зигзаг" гифея.[3] Со временем эти гифы образуют красные споры.[3] Клеточная мембрана Н. sinuspersici также уникален среди других sinuspersici, наиболее заметным из которых является отсутствие миколиновые кислоты.[3]

Штаммы Н. sinuspersici могут расти в широком диапазоне условий, но было обнаружено, что лучше всего они растут при 28 ° C, pH 7 и концентрации соли 2,5%.[3] Несмотря на большое генетическое сходство с Nocardiopsis quinghaiensis, Nocardiopsis aegyptia, и Нокардиопсис halotolerans, N. sinuspersici демонстрирует отличную скорость роста среди других видов при выращивании при pH 12, концентрации соли 15% и температуре 10 ° C.[3] Н. sinuspersici также отличается от других членов Нокардиопсис среди основных химических соединений, в том числе производство различных сахаров, фосфолипид узоры менахиноны и жирные кислоты.[3] Бактерия также производит сериновая протеаза способен быстро расщеплять молочный протеен.[3] Н. sinuspersici sp. nov использовала источники углерода, включая d-галактоза , лактоза, мелибиоза, глицерин, сахароза, мальтоза, маннитол, d-манноза, l-рамноза, d-ксилоза, инулин, цитрат, малонатный, пируват, и пропионат.[3]

Генетика

Весь геном Н. sinuspersici был упорядочен. В 16S РНК ген Н. sinuspersici показывает высокое сходство с другими представителями рода, включая Nocardiopsis quinghaiensis, Nocardiopsis aegyptia, и Нокардиопсис halotolerans, с идентичностью последовательностей 99,2%, 98,5% и 98,2% соответственно.[3] Из обзора его генома, Н. sinuspersici обладает большим количеством генов, связанных с производством вторичные метаболиты.[6] В частности, Н. sinuspersici показал владение 63 кластеры генов связанных с производством вторичные метаболиты.[6] Последовательности стрельбы из дробовика из Н. sinuspersici можно найти под инвентарным номером MCOK0000000 в GenBank.

Рекомендации

  1. ^ а б «Род Nocardiopsis». Институт Лейбница DSMZ-Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур GmbH (LPSN).
  2. ^ "Nocardiopsis sinuspersici". Straininfo. Архивировано из оригинал 24 ноября 2018 г.
  3. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м Hamedi J, Mohammadipanah F, von Jan M, Pötter G, Schumann P, Spröer C и др. (Октябрь 2010 г.). «Nocardiopsis sinuspersici sp. Nov., Выделенный из песчаной ризосферной почвы». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 60 (Pt 10): 2346–2352. Дои:10.1099 / ijs.0.018366-0. PMID  19933587.
  4. ^ "Nocardiopsis sinuspersici". www.uniprot.org. Получено 2020-10-12.
  5. ^ "DSM 45277: Nocardiopsis sinuspersici". Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen.
  6. ^ а б Токовенко Б., Рюкерт С., Калиновски Дж., Мохаммадипана Ф., Винк Дж., Розенкранцер Б. и др. (Май 2017). «Т), который продуцирует сериновую протеазу». Анонсы генома. 5 (20): e00362–17, e00362–17. Дои:10.1128 / genomeA.00362-17. ЧВК  5477326. PMID  28522715.

внешняя ссылка