Фосфопентомутаза - Phosphopentomutase

фосфопентомутаза
Идентификаторы
Номер ЕС5.4.2.7
Количество CAS9026-77-1
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO

В энзимология, а фосфопентомутаза (EC 5.4.2.7 ) является фермент который катализирует то химическая реакция

альфа-D-рибоза 1-фосфат D-рибоза 5-фосфат

Следовательно, у этого фермента есть один субстрат, альфа-D-рибоза 1-фосфат, и один товар, D-рибозо-5-фосфат.

Этот фермент принадлежит к семейству изомеразы, в частности, фосфотрансферазы (фосфомутазы), которые переносят фосфатные группы внутри молекулы. В систематическое название этого класса ферментов альфа-D-рибоза 1,5-фосфомутаза. Другие широко используемые имена включают фосфодезоксирибомутаза, дезоксирибоза фосфомутаза, дезоксирибомутаза, фосфорибомутаза, альфа-D-глюкозо-1,6-бисфосфат: дезокси-D-рибозо-1-фосфат, фосфотрансфераза, и D-рибоза 1,5-фосфомутаза. Этот фермент участвует в пентозофосфатный путь и метаболизм пуринов. Имеет 3 кофакторы: D-рибозо-1,5-бисфосфат, альфа-D-1,6-бисфосфат глюкозы, и 2-дезокси-D-рибоза 1,5-бисфосфат.

Структурные исследования

Первое опубликованное описание структура прокариотической фосфопентомутазы было в 2011 г.[1] Структуры Bacillus cereus фосфопентомутаза, как она была очищена, после активации, связанная с рибозо-5-фосфатом и связанная с глюкозо-1,6-бисфосфатом, откладывается в PDB с кодами доступа 3M8W, 3M8Y, 3М8З и 3OT9, соответственно.

Рекомендации

  1. ^ Паносян, Т. Д., Наннеман, Д. П., Уоткинс, Г., Фален В. В., Макдональд В. Х., Вадзински Б. Э., Бахманн Б. О., Айверсон Т. М. 2011. Фосфопентомтуаза Bacillus cereus - член семейства щелочных фосфатаз с измененной точкой входа в каталитический цикл. J. Biol. Chem. 286 (8043-8054).Panosian, Timothy D .; Nannemann, David P .; Уоткинс, Гай Р .; Фелан, Ванесса В .; Макдональд, У. Хейс; Wadzinski, Brian E .; Бахманн, Брайан О .; Айверсон, Тина М. (март 2011 г.). «Фосфопентомутаза Bacillus cereus является членом семейства щелочных фосфатаз, который имеет измененную точку входа в каталитический цикл». Журнал биологической химии. 286 (10): 8043–54. Дои:10.1074 / jbc.M110.201350. ЧВК  3048691. PMID  21193409.
  • Хаммер-Джесперсен К., Мунк-Петерсен А. (1970). «Фосфодезоксирибомутаза из Escherichia coli. Очистка и некоторые свойства». Евро. J. Biochem. 17 (3): 397–407. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1970.tb01179.x. PMID  4992818.
  • Каммен Х.О., Ку Р. (1969). «Фосфопентомутазы. I. Идентификация двух активностей в тканях кролика». J. Biol. Chem. 244 (18): 4888–93. PMID  5824563.
  • Бойер, П. (Ред.), Ферменты, 3-е изд., Т. 6, 1972, с. 407-477.