Мотив РНК STAXI - Википедия - STAXI RNA motif
| СТАКСИ РНК | |
|---|---|
 Консенсусная вторичная структура РНК STAXI | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СТАКСИ |
| Рфам | RF01728 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | мРНК |
| Домен (ы) | Энтеробактерии |
| PDB структуры | PDBe |
В Ssbp, топоизомераза, антирестрикция, мотив РНК интегразы XerDC (Мотив РНК STAXI) является сохраняющимся РНК -подобная структура, идентифицированная с помощью биоинформатика.[1] РНК STAXI расположены рядом с гены кодирование белки которые взаимодействуют с ДНК (SSBP, топоизомераза, XerDC интегрировать ) или связаны с такими белками (антиограничение белки, которые подавляют рестрикционные ферменты ). Это наблюдение повысило вероятность того, что экземпляры мотива STAXI функционируют как одноцепочечные молекулы ДНК, возможно, во время Репликация ДНК или же Ремонт ДНК. С другой стороны, мотивы STAXI часто содержат концевые петли, соответствующие стабильному UNCG. тетрапетля, но ДНК-версия этой тетрапетли (TNCG) не особенно стабильна. Мотив STAXI состоит из простого псевдоузел структура, которая повторяется два или более раз (см. диаграмму).
В том же исследовании был идентифицирован ряд других РНК, в том числе:
- Мотив РНК Bacteroidales-1
- Мотив РНК хлороби-1
- JUMPstart РНК-мотив
- Мотив Лактис-плазмиды РНК
- Мотив РНК Ocean-V
- potC РНК-мотив
- мотив psaA РНК
- Два мотива РНКAYGGAY
- ykkC-yxkD лидер
Рекомендации
- ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК 2864571. PMID 20230605.
внешняя ссылка
 | Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |