Митохондриальный код позвоночных - Vertebrate mitochondrial code

В митохондриальный код позвоночных (таблица перевода 2) это генетический код найдено в митохондрии из всех позвоночные.

Эволюция

Считалось, что AGA и AGG стали митохондриальными стоп-кодоны рано в эволюции позвоночных.[1] Однако, по крайней мере, у людей в настоящее время показано, что последовательности AGA и AGG не распознаются как кодоны терминации. А -1 миторибосома сдвиг рамки считывания происходит в кодонах AGA и AGG, которые, как предполагается, завершают CO1 и ND6 открытые рамки для чтения (ORF), и, следовательно, обе ORF оканчиваются стандартным кодоном UAG.[2]

Неполные стоп-кодоны

Митохондриальные гены у некоторых позвоночных (включая человека) имеют неполные стоп-кодоны оканчивающиеся на U или UA, которые становятся полными терминирующими кодонами (UAA) при последующих полиаденилирование.[3][4][5][6]

Таблица перевода

Аминокислоты биохимические свойстванеполярныйполярныйбазовыйкислыйПрекращение: стоп-кодон
Стандартный генетический код
1-й
основание
2-я база3-й
основание
UCАграмм
UUUU(Phe / F) ФенилаланинУКУ(Ser / S) СеринUAU(Tyr / Y) ТирозинUGU(Cys / C) ЦистеинU
UUCUCCОАКUGCC
UUA(Лей / л) ЛейцинУЦАUAAОстанавливатьсяUGA(Трп / Вт) Триптофан     А
UUGUCGUAGUGGграмм
CCUUCCU(Pro / P) ПролинCAU(Его / H) ГистидинCGU(Arg / R) АргининU
CUCCCCСАСCGCC
CUACCACAA(Gln / Q) ГлутаминCGAА
CUGCCGCAGCGGграмм
АAUU(Иль / Я) ИзолейцинACU(Thr / T) Треонин         AAU(Asn / N) АспарагинAGU(Ser / S) СеринU
AUCАККAACAGCC
AUA(Мет / М) МетионинACAAAA(Лиз / К) ЛизинAGAОстанавливатьсяА
AUG[A]АЧГAAGAGGграмм
граммГУ(Val / V) ВалинGCU(Ала / А) АланинГАУ(Asp / D) Аспарагиновая кислотаГГУ(Gly / G) ГлицинU
GUCGCCGACGGCC
GUAGCAGAA(Клей) Глютаминовая кислотаGGAА
GUGGCGGAGGGGграмм
А Кодон AUG и кодирует метионин, и служит сайтом инициации: первый AUG в мРНК Кодирующая область - это место, где начинается трансляция в белок.[7]

Отличия от стандартного кода

Кодоны ДНККодоны РНКЭтот код (2)Стандартный код (1)
AGAAGAСТОП = Тер (*)Arg (Р)
AGGAGGСТОП = Тер (*)Arg (Р)
ATAAUAВстретились (М)Иль (Я)
TGAUGATrp (Вт)СТОП = Тер (*)

Альтернативные кодоны инициации

Смотрите также

Рекомендации

  • Эта статья содержит текст из общественного достояния из NCBI страницу составили Анджей (Анджай) Эльзановски и Джим Остелл.[9]
  1. ^ С. Осава, Т. Охама, Т. Х. Джукс и К. Ватанабэ (сентябрь 1989 г.). «Эволюция митохондриального генетического кода. I. Происхождение серина и стоп-кодонов AGR в митохондриях многоклеточных животных». Дж Мол Эвол. 29 (3): 202–7. Дои:10.1007 / bf02100203. PMID  2506356. S2CID  21051869.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
  2. ^ Р. Дж. Темперли; Р. Рихтер; S Dennerlein; R N Lightowlers; Z M Chrzanowska-Lightowlers (январь 2010 г.). «Голодные кодоны способствуют сдвигу рамки считывания в митохондриальных рибосомах человека». Наука. 327 (5963): 301. Дои:10.1126 / наука.1180674. PMID  20075246. S2CID  206522983.
  3. ^ Temperley, R.J .; Wydro, M; Lightowlers, R. N .; Chrzanowska-Lightowlers, З. М. (2010). «Человеческие митохондриальные мРНК - как члены всех семейств, похожие, но разные». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика. 1797 (6–7): 1081–5. Дои:10.1016 / j.bbabio.2010.02.036. ЧВК  3003153. PMID  20211597.
  4. ^ WR Hou, Y. Chen, X. Wu, JC Hu, ZS Peng, J. Yang, ZX Tang, CQ Zhou, YM Li, SK Yang, YJ Du, LL Kong, ZL Ren, HY Zhang и SS Shuai (декабрь 2006 г.) ). «Полная последовательность митохондриального генома азиатского черного медведя сычуаньского подвида (Ursus thibetanus mupinensis)». Int J Biol Sci. 3 (2): 85–90. Дои:10.7150 / ijbs.3.85. ЧВК  1752227. PMID  17205108.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
  5. ^ О, Д. Дж .; Kim, J. Y .; Lee, J. A .; Yoon, W. J .; Park, S. Y .; Юнг, Ю. Х. (2007). «Полный митохондриальный геном рыбы-кролика Siganus fuscescens (Perciformes, Siganidae)». Последовательность ДНК. 18 (4): 295–301. Дои:10.1080/10425170701248525. PMID  17541835. S2CID  38458668.
  6. ^ Ki, J. S .; Hwang, D. S .; Парк, Т. Дж .; Han, S. H .; Ли, Дж. С. (2009). «Сравнительный анализ полного митохондриального генома евразийской выдры Lutra lutra (Carnivora; Mustelidae)». Отчеты по молекулярной биологии. 37 (4): 1943–55. Дои:10.1007 / s11033-009-9641-0. PMID  19757186. S2CID  24233602.
  7. ^ Накамото Т. (март 2009 г.). «Эволюция и универсальность механизма инициирования синтеза белка». Ген. 432 (1–2): 1–6. Дои:10.1016 / j.gene.2008.11.001. PMID  19056476.
  8. ^ П. Дежарден и Р. Мораис (февраль 1991 г.). «Нуклеотидная последовательность и эволюция кодирующих и некодирующих участков митохондриального генома перепела». Дж Мол Эвол. 32 (2): 153–161. Дои:10.1007 / bf02515387. PMID  1706782. S2CID  1974138.
  9. ^ Генетические коды

внешняя ссылка