WH1 домен - WH1 domain

WH1 домен
Идентификаторы
СимволWH1
PfamPF00568
ИнтерПроIPR000697
УМНАЯWH1
SCOP21evh / Объем / СУПФАМ
CDDcd01205

WH1 домен это эволюционно сохраненный белковый домен.[1] Следовательно, он выполняет важную функцию.

Функция

Домены WH1 обнаруживаются на белках WASP, которые часто участвуют в полимеризации актина. Следовательно, WH1 важен для всех клеточных процессов с участием актина, включая подвижность клеток, перенос клеток, деление и цитокинез клеток, передачу сигналов между клетками, а также создание и поддержание клеточных соединений и формы клеток.[2]

Структура

Третичная структура домена WH1 Mena белок обнаружен структура сходство с Pleckstrin (PH) домен. Общая складывать состоит из компактного параллельного бета-сэндвича, закрытого по одному краю длинным альфа спираль. Очень консервированный кластер из трех ароматических боковые цепи образует сайт узнавания для мишени молекулы лиганды.[3]

Взаимодействия

Семейство белков WASP контролирует полимеризацию актина путем активации комплекса Arp2 / 3. WASP неисправен в Синдром Вискотта – Олдрича (WAS), при этом в большинстве случаев у пациентов большинство точечных мутаций происходит внутри N-концевого домена WH1. Метаботропные рецепторы глутамата mGluR1alpha и mGluR5 связывают белок, называемый гомером, который является гомологом домена WH1.[4][5]

Белки семейства WASP содержат EVH1 (WH1) на своих N-концах, которые связывают богатые пролином последовательности во взаимодействующем с WASP белке. Белки семейства RanBP1 содержат домен WH1 в своей N-концевой области, который, по-видимому, связывает другой мотив последовательности, присутствующий в С-концевой части белка RanGTP.[6][7]

Третичная структура домена WH1 белка Mena выявила структурное сходство с доменом гомологии плекстрина (PH). Общая складка состоит из компактного параллельного бета-сэндвича, закрытого по одному краю длинной альфа-спиралью. Высококонсервативный кластер из трех открытых ароматических боковых цепей образует сайт узнавания для молекул-мишеней лигандов.[3]

EVH1

EVH1
PDB 1мке EBI.jpg
структура комплекса n-wasp evh1 домен-стирание
Идентификаторы
СимволEVH1
PfamPF00568
Pfam кланCL0266
ИнтерПроIPR000697
УМНАЯWH1
SCOP21evh / Объем / СУПФАМ
CDDcd00837

Подмножество доменов WH1 было названо EVH1 домен связывают мотив полипролина. Домен EVH1 (также известный как WH1, RanBP1-WASP, или же включен / домен гомологии VASP 1) также является эволюционно сохраненным белковый домен. Домены EVH1 распознают и связывают богатый пролином мотив FPPPP с низким сродством, после чего между фланкирующими остатками образуются дальнейшие взаимодействия.[5][8]

Домен EVH1 находится в мультидоменном Белки гомологии Ena / Vasp участвует в разнообразной передаче сигналов, ядерный транспорт и цитоскелет События. Этот домен около 115 аминокислоты присутствует у видов от дрожжи к млекопитающие. Многие белки, содержащие EVH1, связаны с актиновыми белками. структуры и играть роль в цитоскелет организация. EVH1 домены распознавать и связывать богатые пролином мотив FPPPP с низким сродством, дальнейшие взаимодействия затем образуются между фланкирующими остатками.[8][9][10]

Примеры

Гены человека, кодирующие белки, содержащие домен WH1 (EVH1), включают:

Рекомендации

  1. ^ Саймонс М., Дерри Дж. М., Карлак Б., Цзян С., Лемахье В., Маккормик Ф., Франк Ю., Або А (март 1996 г.). «Белок синдрома Вискотта-Олдрича, новый эффектор для GTPase CDC42Hs, участвует в полимеризации актина». Клетка. 84 (5): 723–34. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81050-8. PMID  8625410. S2CID  17838931.
  2. ^ Велтман Д.М., Инсалл Р.Х. (2010). «Белки семейства WASP: их эволюция и физиологические последствия». Mol Biol Cell. 21 (16): 2880–93. Дои:10.1091 / mbc.E10-04-0372. ЧВК  2921111. PMID  20573979.
  3. ^ а б Prehoda KE, Lee DJ, Lim WA (май 1999 г.). «Структура комплекса активированный / гомологичный 1 VASP-пептид: ключевой компонент в пространственном контроле сборки актина». Клетка. 97 (4): 471–80. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80757-6. PMID  10338211. S2CID  17078939.
  4. ^ Понтинг С.П., Филлипс С. (1997). «Идентификация гомера как гомолога белка синдрома Вискотта-Олдрича предполагает рецептор-связывающую функцию для доменов WH1». J. Mol. Med. 75 (11–12): 769–71. Дои:10.1007 / s001090050166. PMID  9428607. S2CID  39958754.
  5. ^ а б Нибур К., Эбель Ф., Франк Р., Рейнхард М., Доман Э., Карл Ю. Д., Вальтер Ю., Гертлер Ф. Б., Веланд Дж., Чакраборти Т. (сентябрь 1997 г.). «Новый богатый пролином мотив, присутствующий в ActA Listeria monocytogenes и цитоскелетных белках, является лигандом для домена EVH1, белкового модуля, присутствующего в семействе Ena / VASP». EMBO J. 16 (17): 5433–44. Дои:10.1093 / emboj / 16.17.5433. ЧВК  1170174. PMID  9312002.
  6. ^ Callebaut I, Cossart P, Dehoux P (декабрь 1998 г.). «Домены EVH1 / WH1 белков VASP и WASP принадлежат к большому семейству, включающему Ran-связывающие домены семейства RanBP1». FEBS Lett. 441 (2): 181–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 01541-5. PMID  9883880. S2CID  8527080.
  7. ^ Беддов А.Л., Ричардс С.А., Орем Н.Р., Макара И.Г. (апрель 1995 г.). «Домен, связывающий GTPase Ran / TC4: идентификация путем клонирования экспрессии и характеристики консервативного мотива последовательности». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (8): 3328–32. Дои:10.1073 / пнас.92.8.3328. ЧВК  42159. PMID  7724562.
  8. ^ а б Болл Л.Дж., Ярчау Т., Ошкинат Х, Вальтер У. (февраль 2002 г.). «Домены EVH1: структура, функции и взаимодействия». FEBS Lett. 513 (1): 45–52. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 03291-4. PMID  11911879. S2CID  10368115.
  9. ^ Поусон Т. «Домен EVH1». Лаборатория Поусона. Получено 2011-06-09.
  10. ^ PDB: 1QC6​; Федоров А.А., Федоров Э., Гертлер Ф., Альмо СК (июль 1999 г.). «Структура EVH1, нового пролин-связывающего лиганд-связывающего модуля, участвующего в динамике цитоскелета и нервной функции». Nat. Struct. Биол. 6 (7): 661–5. Дои:10.1038/10717. PMID  10404224. S2CID  22881412.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR000697
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR007875