SPRED1 - SPRED1

SPRED1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3SYX
Идентификаторы
Псевдонимы	SPRED1, NFLS, PPP1R147, hSpred1, spred-1, родственный отросткам домен EVH1, содержащий 1, LGSS
Внешние идентификаторы	OMIM: 609291 MGI: 2150016 ГомолоГен: 24919 Генные карты: SPRED1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 15 (человек)
Конец	38,357,249 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	117,182,279 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность ингибитора протеин-серин / треонинкиназы; • связывание фосфатазы; • связывание рецептора фактора стволовых клеток; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание протеинкиназы;
Сотовый компонент	• мембрана; • клеточная мембрана; • Caveola; • цитозоль; • ядро клетки; • цитоплазматический пузырек;
Биологический процесс	• отрицательная регуляция активности фосфатазы; • инактивация активности MAPK; • отрицательная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина; • регуляция деацетилирования белков; • Каскад MAPK; • развитие многоклеточного организма; • сигнальный путь рецептора фактора роста фибробластов; • регулирование передачи сигнала; • положительная регуляция ответа на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53; • васкулогенез, вовлеченный в морфогенез коронарных сосудов; • отрицательная регуляция миграции клеток, участвующих в прорастании ангиогенеза; • отрицательное регулирование каскада МАПК; • отрицательная регуляция активности протеинкиназы; • отрицательная регуляция ангиогенеза; • регулирование каскада МАПК; • отрицательная регуляция каскада ERK1 и ERK2;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	161742
	114715
	ENSG00000166068
	ENSMUSG00000027351
	Q7Z699
	Q924S8
	NM_152594
	NM_001277256; NM_033524
	NP_689807
	NP_001264185; NP_277059
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Связанный с ростками белок 1, содержащий домен EVH1 (Spread-1) - это белок что у людей кодируется SPRED1 ген расположен на хромосоме 15q13.2 и имеет семь кодовых экзоны.^[5]

Функция

SPRED-1 является членом семейства белков Sprouty и фосфорилируется тирозинкиназа в ответ на несколько факторы роста. Кодируемый белок может действовать как гомодимер или как гетеродимер с SPRED2 регулировать активацию Каскад киназ MAP.^[5]

Клинические ассоциации

Дефекты в этом гене являются причиной нейрофиброматоз 1 типа -подобный синдром (NFLS).^[5]

Мутации в этом гене связаны с

Синдром Легиуса.^[6]^[7]
Детство лейкемия^[8]

Мутации

Наблюдались следующие мутации:

Мутация экзона 3 c.46C> T, приводящая к p.Arg16Stop.^[8] Эта мутация может привести к усеченному нефункциональному белку. Анализ бластных клеток показал ту же аномалию, что и мутация зародышевой линии с одним мутировавшим аллелем (не было обнаружено соматической одноточечной мутации SPRED1 или потери гетерозиготности). Фенотип M4 / M5 ОМЛ наиболее тесно связан с Рас путь мутации. Мутации пути Ras также связаны с моносомией 7.
3 ерунда (R16X, E73X, R262X)^[9]
2 кадра (c.1048_c1049 delGG, c.149_1152del 4 bp)^[9]
Миссенс (V44D)^[9]
p.R18X и p.Q194X с измененной пигментацией фенотипа без опухоли.^[10]

База данных болезней

База данных вариантов гена SPRED1

Смотрите также

Нейрофибромин 1
Пациенты без Нейрофибромин 1 или мутации SPRED1 могут иметь SPRED2, SPRED3 или же SPRY1, SPRY2, SPRY3 или же SPRY4 мутации.^[9]

дальнейшее чтение

Батц К., Хасле Х., Бергстрэссер Э., ван ден Хеувель-Эйбринк М.М., Зекка М., Нимейер С.М., Флото С. (март 2010 г.). «Вносит ли SPRED1 вклад в лейкемогенез при ювенильном миеломоноцитарном лейкозе (JMML)?» (PDF). Кровь. 115 (12): 2557–8. Дои:10.1182 / кровь-2009-12-260901. PMID 20339110.
Lock P, I ST, Straffon AF, Schieb H, Hovens CM, Stylli SS (декабрь 2006 г.). «Устойчивые уровни Spred-2 регулируются фосфорилированием и Cbl-опосредованным убиквитинированием». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 351 (4): 1018–23. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.10.150. PMID 17094949.
Pasmant E, Sabbagh A, Hanna N, Masliah-Planchon J, Jolly E, Goussard P, Ballerini P, Cartault F, Barbarot S, Landman-Parker J, Soufir N, Parfait B, Vidaud M, Wolkenstein P, Vidaud D, France РН (июль 2009 г.). «Мутации зародышевой линии SPRED1 вызвали перекрывающийся фенотип нейрофиброматоза 1 типа» (PDF). Журнал медицинской генетики. 46 (7): 425–30. Дои:10.1136 / jmg.2008.065243. PMID 19366998. S2CID 21323989.
Нонами А., Такэтоми Т., Кимура А., Саеки К., Такаки Х., Санада Т., Танигучи К., Харада М., Като Р., Йошимура А. (сентябрь 2005 г.). «Родственный Sprouty белок, Spred-1, локализуется в липидном рафте / кавеоле и ингибирует активацию ERK в сотрудничестве с кавеолином-1». Гены в клетки. 10 (9): 887–95. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2005.00886.x. PMID 16115197.
Шафрански К., Шиндлер С., Таудиен С., Хиллер М., Хусе К., Ян Н., Шрайбер С., Бакофен Р., Платцер М. (2007). «Нарушение правил сплайсинга: динуклеотиды TG функционируют как альтернативные 3'-сайты сплайсинга в U2-зависимых интронах». Геномная биология. 8 (8): R154. Дои:10.1186 / gb-2007-8-8-r154. ЧВК 2374985. PMID 17672918.
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК 1356129. PMID 16344560.
Чандрамули С., Ю. CY, Юсофф П., Лаосский Д.Х., Леонг Х.Ф., Мизуно К., Гай Г.Р. (январь 2008 г.). «Tesk1 взаимодействует с Spry2, чтобы отменить его ингибирование фосфорилирования ERK ниже передачи сигналов рецепторной тирозинкиназы». Журнал биологической химии. 283 (3): 1679–91. Дои:10.1074 / jbc.M705457200. PMID 17974561.
Джон Ч., Матения Д., Ли XY, Тимм Т., Балусами К., Мандельков Э.М. (апрель 2008 г.). «Spred1 и TESK1 - два новых партнера по взаимодействию киназы MARKK / TAO1, которые связывают микротрубочки и актиновый цитоскелет». Молекулярная биология клетки. 19 (4): 1391–403. Дои:10.1091 / mbc.E07-07-0730. ЧВК 2291396. PMID 18216281.
Нонами А., Като Р., Танигучи К., Йошига Д., Такэтоми Т., Фукуяма С., Харада М., Сасаки А., Йошимура А. (декабрь 2004 г.). «Spred-1 отрицательно регулирует опосредованную интерлейкином-3 активацию киназы ERK / митоген-активированного протеина (MAP) в гемопоэтических клетках». Журнал биологической химии. 279 (50): 52543–51. Дои:10.1074 / jbc.M405189200. PMID 15465815.
Талмуд П.Дж., Дренос Ф., Шах С., Шах Т., Палмен Дж., Верзилли К., Гаунт Т.Р., Паллас Дж., Ловеринг Р., Ли К., Касас Дж. П., Софат Р., Кумари М., Родригес С., Джонсон Т., Ньюхаус С.Дж., Доминикзак А. , Самани Нью-Джерси, Колфилд М., Север П., Стэнтон А., Шилдс, округ Колумбия, Падманабхан С., Меландер О, Хасти С., Деллес С., Эбрахим С., Мармот М.Г., Смит Г.Д., Лоулор Д.А., Манро ПБ, Дэй IN, Кивимаки М., Уиттакер Дж., Хамфрис С.Е., Хингорани А.Д. (ноябрь 2009 г.). «Генноцентрические ассоциативные сигналы липидов и аполипопротеинов, идентифицированные с помощью HumanCVD BeadChip». Американский журнал генетики человека. 85 (5): 628–42. Дои:10.1016 / j.ajhg.2009.10.014. ЧВК 2775832. PMID 19913121.
Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК 442148. PMID 15231748.
Brems H, Chmara M, Sahbatou M, Denayer E, Taniguchi K, Kato R, Somers R, Messiaen L, De Schepper S, Fryns JP, Cools J, Marynen P, Thomas G, Yoshimura A, Legius E (сентябрь 2007 г.). «Мутации с потерей функции зародышевой линии в SPRED1 вызывают фенотип, подобный нейрофиброматозу 1». Природа Генетика. 39 (9): 1120–6. Дои:10,1038 / ng2113. PMID 17704776. S2CID 35709088.
Йошида Т, Хисамото Т, Акиба Дж, Кога Х, Накамура К., Токунага Й, Ханада С., Кумемура Х, Маэяма М, Харада М, Огата Х, Яно Х, Кодзиро М, Уэно Т, Йошимура А, Сата М (октябрь 2006 г. ). «Spreds, ингибиторы передачи сигнала Ras / ERK, не регулируются в гепатоцеллюлярной карциноме человека и связаны со злокачественным фенотипом опухолей». Онкоген. 25 (45): 6056–66. Дои:10.1038 / sj.onc.1209635. PMID 16652141.
King JA, Straffon AF, D'Abaco GM, Poon CL, I ST, Smith CM, Buchert M, Corcoran NM, Hall NE, Callus BA, Sarcevic B, Martin D, Lock P, Hovens CM (июнь 2005 г.). «Четкие требования к домену Sprouty для функциональной активности белков Spred». Биохимический журнал. 388 (Pt 2): 445–54. Дои:10.1042 / BJ20041284. ЧВК 1138951. PMID 15683364.
Бейли С.Д., Се С., До Р., Монпетит А., Диас Р., Мохан В., Кивни Б., Юсуф С., Герштейн ХК, Энгерт Дж. К., Ананд С. (октябрь 2010 г.). «Вариация локуса NFATC2 увеличивает риск отека, вызванного тиазолидиндионом, в исследовании« Оценка снижения диабета с применением рамиприла и розиглитазона »(DREAM)». Уход за диабетом. 33 (10): 2250–3. Дои:10.2337 / dc10-0452. ЧВК 2945168. PMID 20628086.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166068 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027351 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] а ^б ^c "Entrez Gene: ростки".

[pmid19920235-6] Messiaen L, Yao S, Brems H, Callens T, Sathienkijkanchai A, Denayer E, Spencer E, Arn P, Babovic-Vuksanovic D, Bay C, Bobele G, Cohen BH, Escobar L, Eunpu D, Grebe T, Greenstein R, Хачен Р., Айронс М., Кронн Д., Лемир Е., Леппиг К., Лим С., Макдональд М., Нараянан В., Пирн А., Педерсен Р., Пауэлл Б., Шапиро Л. Р., Скидмор Д., Тегай Д., Тизе Х., Закай Е. Х., Виджелаар Р. , Танигучи К., Аяда Т., Окамото Ф., Йошимура А., Паррет А, Корф Б., Легиус Э (ноябрь 2009 г.). «Клинический и мутационный спектр нейрофиброматозного синдрома 1 типа». JAMA. 302 (19): 2111–8. Дои:10.1001 / jama.2009.1663. PMID 19920235. Сложить резюме – Medscape.

[urlwww.aruplab.com-7] «Синдром Легиуса (SPRED1) секвенирование и (NF1) секвенирование экзона 22 (экзона 17)» (PDF). ARUP лаборатории. 2010. Получено 2011-06-07.

[Pasmant_2009-8] а ^б Pasmant E, Ballerini P, Lapillonne H, Perot C, Vidaud D, Leverger G, Landman-Parker J (июль 2009 г.). «Расстройство SPRED1 и предрасположенность к лейкемии у детей». Кровь. 114 (5): 1131. Дои:10.1182 / кровь-2009-04-218503. PMID 19643996.

[Spurlock_2009-9] а ^б ^c ^d Сперлок Дж., Беннетт Е., Чужанова Н., Томас Н., Джим ХП, Сайд Л., Дэвис С., Хаан Е., Керр Б., Хусон С. М., Упадхьяя М. (июль 2009 г.). «Мутации SPRED1 (синдром Легиуса): еще один клинически полезный генотип для анализа фенотипа нейрофиброматоза 1 типа». Журнал медицинской генетики. 46 (7): 431–7. Дои:10.1136 / jmg.2008.065474. PMID 19443465.

[pmid20179001-10] Мурам-Зборовски TM, Стивенсон Д.А., Вискочил Д.Х., Дрис, округ Колумбия, Уилсон, АР (октябрь 2010 г.). «Мутации SPRED 1 в клинике нейрофиброматоза». Журнал детской неврологии. 25 (10): 1203–9. Дои:10.1177/0883073809359540. ЧВК 3243064. PMID 20179001.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]