Домен RhoGEF - RhoGEF domain

DH / PH домен RhoGEF
PDB 1dbh EBI.jpg
Структура домена RhoGEF из Сына Семиless человека, пример домена RhoGEF DH / PH.[1]
Идентификаторы
СимволRhoGEF
PfamPF00621
ИнтерПроIPR035899 IPR000219, IPR035899
УМНАЯRhoGEF
SCOP21 дБ / ч / Объем / СУПФАМ
Белок OPM1xd4
CDDcd00160
Выявитель цитокинеза (DOCK) домен RhoGEF
Идентификаторы
СимволRhoGEF
PfamPF06920
ИнтерПроIPR010703 IPR026791, IPR010703
SCOP21wg7 / Объем / СУПФАМ
CDDcd11684

Домен RhoGEF описывает два различных структурные области с фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) деятельность по регулированию малые GTPases в Семья Ро. Rho малые ГТФазы неактивны при связывании с ВВП но активен, когда привязан к GTP; Домены RhoGEF в белках способны способствовать высвобождению GDP и связыванию GTP для активации определенных членов семейства Rho, включая RhoA, Rac1 и Cdc42.

Самый большой класс RhoGEF состоит из белков, содержащих "Dbl -гомология »(DH), который почти всегда находится вместе с плекстрин-гомология (PH) домен для формирования комбинированной доменной структуры DH / PH.[2][3]

Отдельным классом RhoGEF являются белки, содержащие ДОК / ЧЖ / ДХР-2 домен. Эта структура не имеет сходства последовательностей с доменами гомологии DBL.[4]

Белки человека, содержащие домен DH / PH RhoGEF

ABR; AKAP13 / ARHGEF13 / Lbc; ALS2; ALS2CL; ARHGEF1 / p115-RhoGEF; ARHGEF10; ARHGEF10L; ARHGEF11 / PDZ-RhoGEF.; ARHGEF12 / LARG; ARHGEF15; ARHGEF16; ARHGEF17; ARHGEF18; ARHGEF19; ARHGEF2; ARHGEF25; ARHGEF26; ARHGEF28; ARHGEF3; ARHGEF33; ARHGEF35; ARHGEF37; ARHGEF38; ARHGEF39; ARHGEF4; ARHGEF40; ARHGEF5; ARHGEF6 / альфа-PIX; ARHGEF7 / бета-PIX; ARHGEF9; BCR; DNMBP; ECT2; ECT2L; FARP1; FARP2; FGD1; FGD2; FGD3; FGD4; FGD5; FGD6; ITSN1 / Интерсектин 1; ITSN2 / Интерсектин 2; КАЛРН / Калирин; MCF2; MCF2L; MCF2L2; NET1; NGEF; OBSCN; ПЛЕХГ1; ПЛЕХГ2; ПЛЕХГ3; ПЛЕХГ4; PLEKHG4B; ПЛЕХГ5; ПЛЕХГ6; PREX1; PREX2; RASGRF1; RASGRF2; SPATA13; TIAM1; TIAM2; ТРИО; VAV1; VAV2; VAV3.

Белки человека, содержащие домен DOCK / CZH RhoGEF

DOCK1 / DOCK180; DOCK2; DOCK3 / MOCA; DOCK4; DOCK5; DOCK6 / ZIR1; DOCK7 / ZIR2; DOCK8 / ZIR3; DOCK9 / Zizimin1; DOCK10 / Zizimin2; DOCK11 / Zizimin3

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Суассон С.М., Нимнуал А.С., Уй М., Бар-Саги Д., Куриян Дж. (Октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура доменов гомологии Dbl и плекстрина из человеческого Сына седьмого белка». Клетка. 95 (2): 259–68. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81756-0. PMID  9790532. S2CID  11868669.
  2. ^ Fort P, Blangy A (июнь 2017 г.). «Эволюционный ландшафт Dbl-подобных семейств RhoGEF: адаптация эукариотических клеток к сигналам окружающей среды». Геномная биология и эволюция. 9 (6): 1471–1486. Дои:10.1093 / gbe / evx100. ЧВК  5499878. PMID  28541439.
  3. ^ Cerione RA, Zheng Y (апрель 1996 г.). «Семейство онкогенов Dbl». Текущее мнение в области клеточной биологии. 8 (2): 216–22. Дои:10.1016 / s0955-0674 (96) 80068-8. PMID  8791419.
  4. ^ Côté JF, Vuori K (декабрь 2002 г.). «Идентификация эволюционно консервативного суперсемейства DOCK180-родственных белков с активностью обмена гуаниновых нуклеотидов». Журнал клеточной науки. 115 (Пт 24): 4901–13. Дои:10.1242 / jcs.00219. PMID  12432077.

дальнейшее чтение

  • Харт М.Дж., Ева А., Эванс Т., Ааронсон С.А., Церион Р.А. (ноябрь 1991 г.). «Катализ обмена гуаниновых нуклеотидов на белке CDC42Hs с помощью продукта онкогена dbl». Природа. 354 (6351): 311–4. Дои:10.1038 / 354311a0. PMID  1956381. S2CID  4240053.
  • Тан ЕС, Леунг Т., Мансер Э, Лим Л. (декабрь 1993 г.). «Ген, связанный с областью кластера активной точки разрыва человека, кодирует белок мозга, гомологичный белкам обмена гуаниновых нуклеотидов и белкам, активирующим GTPase». Журнал биологической химии. 268 (36): 27291–8. PMID  8262969.
  • Суассон С.М., Нимнуал А.С., Уй М., Бар-Саги Д., Куриян Дж. (Октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура доменов гомологии Dbl и плекстрина из человеческого Сына седьмого белка». Клетка. 95 (2): 259–68. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81756-0. PMID  9790532. S2CID  11868669.