C-ДНК - C-DNA

Не путать с комплементарная ДНК, также известная как кДНК.

C-ДНК также известен как C образуют ДНК. Это одна из многих возможных двойных спиральных структур. ДНК. Эта форма ДНК может наблюдаться при некоторых условиях, например при относительно низкой влажность и наличие определенных ионы, например Ли+ или Mg2+.

Недавние исследования показывают, что и C-ДНК, и B-ДНК состоят из двух разных нуклеотидов конформации, B-I и B-II. Соотношение конформации B-II в C-ДНК составляет более 40%. Однако соотношение конформации B-II в B-ДНК составляет всего около 10%, то есть 9,33 п.н. / оборот. Эта форма ДНК не очень устойчива и не очень распространена. У него правая спираль.

В предыдущем проведенном эксперименте было отмечено, что противоионы, такие как первичные амиды, в основных условиях использовались, чтобы показать взаимосвязь между B и C формами ДНК.[1] Общая форма и ориентация ДНК сильно зависят от ее первичной последовательности и водородных связей между ее парами оснований, которые стабилизируют и удерживают подтверждение двойных спиралей. Было показано, что C-ДНК сохраняет свое подтверждение без воды и способна образовываться при дегидратации [1]. Некоторые амиды в основных условиях и при низкой влажности показали подтверждение С-формы, но плавно переходили в ДНК-форму В по мере увеличения влажности [1]. Это может указывать на сильную корреляцию между C-формой и B-формой ДНК, которая также наблюдалась при использовании литиевой соли при низкой влажности.[2][3][4][5]

также

Примечания

  1. ^ Portugal, J .; Субирана, Дж. (Сентябрь 1985 г.). «Противоионы, благоприятствующие С-форме ДНК». Журнал EMBO. 4 (9): 2403–2408. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1985.tb03946.x. ISSN  0261-4189. ЧВК  554517.
  2. ^ Marvin, D.A .; Спенсер, М .; Wilkins, M.H.F .; Гамильтон, Л. (Октябрь 1961 г.). «Молекулярная конфигурация дезоксирибонуклеиновой кислоты III. Рентгеноструктурное исследование С-формы литиевой соли». Журнал молекулярной биологии. 3 (5): 547 – IN14. Дои:10.1016 / с0022-2836 (61) 80021-1. ISSN  0022-2836.
  3. ^ Португалия, Франклин Х. (1977). Век ДНК: история открытия структуры и функции генетической субстанции. MIT Press. ISBN  978-0-262-16067-4. OCLC  2964854.
  4. ^ Гош, Бансал, Анирбан, Манджу (2003). «Глоссарий структур ДНК от А до Я». Acta Crystallographica Раздел D. 59 (4): 620–6. Дои:10.1107 / S0907444903003251. PMID  12657780.
  5. ^ Циммерман, С. Б. (1982). «Трехмерная структура ДНК». Ежегодный обзор биохимии. 51: 395–427. Дои:10.1146 / annurev.bi.51.070182.002143. PMID  7051961.

Рекомендации

  • Л. ван Дам, М. Х. Левитт (2000). «Нуклеотиды BII в формах B и C полимерной ДНК с естественной последовательностью: новая модель для формы C ДНК». Журнал молекулярной биологии. 304 (4): 541–61. Дои:10.1006 / jmbi.2000.4194. PMID  11099379.