Дроша - Drosha
Дроша это класс 2 рибонуклеаза III фермент [5] что у людей кодируется ДРОША (ранее РНАСЕН) ген.[6][7][8]
Функция
Члены надсемейства рибонуклеаз III двухцепочечный (ds) РНК -специфический эндорибонуклеазы участвовать в разнообразных РНК пути созревания и распада в эукариотический и прокариотический клетки.[9] РНКаза III Дроша - это ядро нуклеаза который выполняет этап инициации микроРНК (miRNA) в ядро.[8][10]
Образующиеся таким образом микроРНК короткие. РНК молекулы, которые регулируют широкий спектр других генов, взаимодействуя с РНК-индуцированный комплекс сайленсинга (RISC), чтобы вызвать расщепление дополнительный информационная РНК (мРНК) как часть РНК-интерференция путь. Молекула микроРНК синтезируется как длинная РНК. первичная стенограмма известный как при-миРНК, который раскалывается Дрошей для получения характерного стебель-петля структура около 70 пар оснований долго, известный как пре-миРНК.[10] Дроша существует как часть белковый комплекс называется Микропроцессорный комплекс, который также содержит белок, связывающий двухцепочечную РНК DGCR8 (называется Паша в D. melanogaster и C. elegans ).[11] DGCR8 необходим для активности Drosha и способен связывать одноцепочечные фрагменты pri-miRNA, которые необходимы для правильного процессинга.[12]
Человека Дроша клонировали в 2000 году[нужна цитата ], когда он был идентифицирован как ядерная дцРНК-рибонуклеаза, участвующая в процессинге рибосомная РНК прекурсоры. Два других фермента человека, которые участвуют в процессинге и активности miRNA, - это Дайсер и Аргонавт белки.
И Drosha, и DGCR8 локализованы на ядро клетки, где происходит процессинг pri-miRNA в pre-miRNA. Эта последняя молекула затем обрабатывается РНКазой. Дайсер в зрелые миРНК в клетке цитоплазма.[10] Также существует изоформа Drosha, которая не содержит сигнала ядерной локализации, что приводит к генерации c-Drosha.[13][14] Было показано, что этот вариант локализуется в ячейке цитоплазма скорее, чем ядро, но эффекты на процессинг pri-miRNA пока неясны.
И Дроша, и Дайсер также участвуют в Ответ на повреждение ДНК.[15]
Клиническое значение
Дроша и другие ферменты процессинга miRNA могут быть важны для прогноза рака.[16] И Дроша, и Дайсер может функционировать как главные регуляторы процессинга miRNA и, как было обнаружено, подавляется при некоторых типах рак молочной железы.[17] Альтернативные схемы склейки Дроши в Атлас генома рака также указали, что ц-дроша, по-видимому, способствует развитию различных типов рака груди, рак толстой кишки, и рак пищевода.[14] Однако точный характер связи между процессингом микроРНК и туморогенез неясно,[18] но его функция может быть эффективно изучена путем нокдауна siRNA на основе независимой проверки.[19]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113360 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022191 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Филиппов В., Соловьев В., Филиппова М., Гилл С.С. (март 2000 г.). «Новый тип белков семейства РНКазы III у эукариот». Ген. 245 (1): 213–21. Дои:10.1016 / s0378-1119 (99) 00571-5. PMID 10713462.
- ^ Филиппов В., Соловьев В., Филиппова М., Гилл С.С. (март 2000 г.). «Новый тип белков семейства РНКазы III у эукариот». Ген. 245 (1): 213–21. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00571-5. PMID 10713462.
- ^ Ву Х, Сюй Х, Миралья LJ, Crooke ST (ноябрь 2000 г.). «Человеческая РНКаза III представляет собой белок массой 160 кДа, участвующий в процессинге прерибосомной РНК». Журнал биологической химии. 275 (47): 36957–65. Дои:10.1074 / jbc.M005494200. PMID 10948199.
- ^ а б «Ген Entrez: рибонуклеаза III RNASEN, ядерная».
- ^ Фортин К. Р., Николсон Р. Х., Николсон А. В. (август 2002 г.). «Рибонуклеаза III мыши. Структура кДНК, анализ экспрессии и расположение в хромосоме». BMC Genomics. 3 (1): 26. Дои:10.1186/1471-2164-3-26. ЧВК 122089. PMID 12191433.
- ^ а б c Ли Й, Ан С, Хан Дж, Чой Х, Ким Дж, Йим Дж, Ли Дж, провост П., Родмарк О, Ким С., Ким В.Н. (сентябрь 2003 г.). «Ядерная РНКаза III Дроша инициирует процессинг микроРНК». Природа. 425 (6956): 415–9. Дои:10.1038 / природа01957. PMID 14508493. S2CID 4421030.
- ^ Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (ноябрь 2004 г.). «Обработка первичных микроРНК микропроцессорным комплексом». Природа. 432 (7014): 231–5. Дои:10.1038 / природа03049. PMID 15531879. S2CID 4425505.
- ^ Хан Дж., Ли Й, Йом К. Х., Нам Дж. У., Хео И., Ри Дж. К., Сон С. Ю., Чо Й, Чжан Б. Т., Ким В. Н. (июнь 2006 г.). «Молекулярная основа распознавания первичных микроРНК комплексом Drosha-DGCR8». Клетка. 125 (5): 887–901. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.043. PMID 16751099. S2CID 453021.
- ^ Link S, Grund SE, Diederichs S (май 2016 г.). «Альтернативный сплайсинг влияет на субклеточную локализацию Дроша». Исследования нуклеиновых кислот. 44 (11): 5330–43. Дои:10.1093 / нар / gkw400. ЧВК 4914122. PMID 27185895.
- ^ а б Дай Л., Чен К., Юнгрен Б., Кулина Дж., Ян А., Го З., Ли Дж., Ю П, Гу С. (июль 2016 г.). «Цитоплазматическая активность Дроша, вызванная альтернативным сплайсингом». Исследования нуклеиновых кислот. 44 (21): 10454–10466. Дои:10.1093 / нар / gkw668. ЧВК 5137420. PMID 27471035.
- ^ Francia S, Michelini F, Saxena A, Tang D, de Hoon M, Anelli V, Mione M, Carninci P, d'Adda di Fagagna F (август 2012 г.). «Сайт-специфичные РНК-продукты DICER и DROSHA контролируют реакцию на повреждение ДНК». Природа. 488 (7410): 231–5. Дои:10.1038 / природа11179. ЧВК 3442236. PMID 22722852.
- ^ Slack FJ, Weidhaas JB (декабрь 2008 г.). «МикроРНК в прогнозе рака». Медицинский журнал Новой Англии. 359 (25): 2720–2. Дои:10.1056 / NEJMe0808667. PMID 19092157.
- ^ Томсон Дж. М., Ньюман М., Паркер Дж. С., Морин-Кенсики Э. М., Райт Т., Хаммонд С. М. (август 2006 г.). «Обширная посттранскрипционная регуляция микроРНК и ее значение для рака». Гены и развитие. 20 (16): 2202–7. Дои:10.1101 / gad.1444406. ЧВК 1553203. PMID 16882971.
- ^ Иорио М.В., Кроче С.М. (июнь 2012 г.). «Участие микроРНК в раке человека». Канцерогенез. 33 (6): 1126–33. Дои:10.1093 / carcin / bgs140. ЧВК 3514864. PMID 22491715.
- ^ Мункачи, Дьёнджи; Штупински, Жофия; Герман, Петер; Бан, Бенце; Пензвальто, Жофия; Сарвас, Нора; Дьёрфи, Балаж (01.01.2016). «Подтверждение эффективности подавления РНКи с использованием данных массива генов показывает 18,5% отказов в 429 независимых экспериментах». Молекулярная терапия - нуклеиновые кислоты. 5 (9): e366. Дои:10.1038 / mtna.2016.66. ISSN 2162-2531. ЧВК 5056990. PMID 27673562.
дальнейшее чтение
- Gunther M, Laithier M, Brison O (июль 2000 г.). «Набор белков, взаимодействующих с фактором транскрипции Sp1, идентифицированный в результате двухгибридного скрининга». Молекулярная и клеточная биохимия. 210 (1–2): 131–42. Дои:10.1023 / А: 1007177623283. PMID 10976766. S2CID 1339642.
- Фортин К. Р., Николсон Р. Х., Николсон А. В. (август 2002 г.). «Рибонуклеаза III мыши. Структура кДНК, анализ экспрессии и расположение в хромосоме». BMC Genomics. 3 (1): 26. Дои:10.1186/1471-2164-3-26. ЧВК 122089. PMID 12191433.
- Ли Й, Ан С, Хан Дж, Чой Х, Ким Дж, Йим Дж, Ли Дж, провост П., Родмарк О, Ким С., Ким В.Н. (сентябрь 2003 г.). «Ядерная РНКаза III Дроша инициирует процессинг микроРНК». Природа. 425 (6956): 415–9. Дои:10.1038 / природа01957. PMID 14508493. S2CID 4421030.
- Грегори Р.И., Ян К.П., Амутан Г., Чендримада Т., Доратотадж Б., Куч Н., Шихаттар Р. (ноябрь 2004 г.). «Микропроцессорный комплекс опосредует генезис микроРНК». Природа. 432 (7014): 235–40. Дои:10.1038 / природа03120. PMID 15531877. S2CID 4389261.
- Цзэн Й., Йи Р., Каллен Б. Р. (январь 2005 г.). «Распознавание и расщепление первичных предшественников микроРНК ферментом процессинга ядер Дроша». Журнал EMBO. 24 (1): 138–48. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600491. ЧВК 544904. PMID 15565168.
- Хан Дж, Ли Й, Йом К. Х., Ким Ю. К., Джин Х, Ким В. Н. (декабрь 2004 г.). «Комплекс Дроша-DGCR8 в процессинге первичной микроРНК». Гены и развитие. 18 (24): 3016–27. Дои:10.1101 / gad.1262504. ЧВК 535913. PMID 15574589.
- Ландталер М., Ялчин А., Тушл Т. (декабрь 2004 г.). «Ген 8 критической области синдрома ДиДжорджи человека и его гомолог D. melanogaster необходимы для биогенеза miRNA». Текущая биология. 14 (23): 2162–7. Дои:10.1016 / j.cub.2004.11.001. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-EB83-3. PMID 15589161. S2CID 13266269.
- Цзэн Й., Каллен Б.Р. (июль 2005 г.). «Эффективная обработка шпилек первичной микроРНК с помощью Дроша требует фланкирования неструктурированных последовательностей РНК». Журнал биологической химии. 280 (30): 27595–603. Дои:10.1074 / jbc.M504714200. PMID 15932881.
- Резюме Ирвина-Уилсона, Чаудхури Г. (2006). «Альтернативное инициирование и сплайсинг в экспрессии гена дайсера в клетках груди человека». Исследование рака груди. 7 (4): R563–9. Дои:10.1186 / bcr1043. ЧВК 1175071. PMID 15987463.
- Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Й, Ирие Р, Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК 1356129. PMID 16344560.
- Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Сугито Н., Исигуро Х., Кувабара Й., Кимура М., Мицуи А., Курехара Х., Андо Т., Мори Р., Такашима Н., Огава Р., Фуджи Y (декабрь 2006 г.). «RNASEN регулирует пролиферацию клеток и влияет на выживаемость у больных раком пищевода». Клинические исследования рака. 12 (24): 7322–8. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-06-0515. PMID 17121874.
- Ким Ю.К., Ким В.Н. (февраль 2007 г.). «Обработка интронных микроРНК». Журнал EMBO. 26 (3): 775–83. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601512. ЧВК 1794378. PMID 17255951.
- Xing L, Kieff E (сентябрь 2007 г.). «Микро- и стабильные РНК BHRF1 вируса Эпштейна-Барра во время латентного периода III и после индукции репликации». Журнал вирусологии. 81 (18): 9967–75. Дои:10.1128 / JVI.02244-06. ЧВК 2045418. PMID 17626073.