Дроша - Drosha

ДРОША
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыДРОША, ETOHI2, HSA242976, RANSE3L, RN3, RNASE3L, RNASEN, рибонуклеаза дроша III
Внешние идентификаторыOMIM: 608828 MGI: 1261425 ГомолоГен: 8293 Генные карты: ДРОША
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение DROSHA
Геномное расположение DROSHA
Группа5п13.3Начинать31,400,497 бп[1]
Конец31,532,196 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE RNASEN 218269 at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001100412
NM_013235
NM_001382508

NM_001130149
NM_026799

RefSeq (белок)

NP_001093882
NP_037367
NP_001369437

NP_001123621
NP_081075

Расположение (UCSC)Chr 5: 31,4 - 31,53 МбChr 15: 12,82 - 12,94 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Дроша это класс 2 рибонуклеаза III фермент [5] что у людей кодируется ДРОША (ранее РНАСЕН) ген.[6][7][8]

Функция

Члены надсемейства рибонуклеаз III двухцепочечный (ds) РНК -специфический эндорибонуклеазы участвовать в разнообразных РНК пути созревания и распада в эукариотический и прокариотический клетки.[9] РНКаза III Дроша - это ядро нуклеаза который выполняет этап инициации микроРНК (miRNA) в ядро.[8][10]

Образующиеся таким образом микроРНК короткие. РНК молекулы, которые регулируют широкий спектр других генов, взаимодействуя с РНК-индуцированный комплекс сайленсинга (RISC), чтобы вызвать расщепление дополнительный информационная РНК (мРНК) как часть РНК-интерференция путь. Молекула микроРНК синтезируется как длинная РНК. первичная стенограмма известный как при-миРНК, который раскалывается Дрошей для получения характерного стебель-петля структура около 70 пар оснований долго, известный как пре-миРНК.[10] Дроша существует как часть белковый комплекс называется Микропроцессорный комплекс, который также содержит белок, связывающий двухцепочечную РНК DGCR8 (называется Паша в D. melanogaster и C. elegans ).[11] DGCR8 необходим для активности Drosha и способен связывать одноцепочечные фрагменты pri-miRNA, которые необходимы для правильного процессинга.[12]

Человека Дроша клонировали в 2000 году[нужна цитата ], когда он был идентифицирован как ядерная дцРНК-рибонуклеаза, участвующая в процессинге рибосомная РНК прекурсоры. Два других фермента человека, которые участвуют в процессинге и активности miRNA, - это Дайсер и Аргонавт белки.

И Drosha, и DGCR8 локализованы на ядро клетки, где происходит процессинг pri-miRNA в pre-miRNA. Эта последняя молекула затем обрабатывается РНКазой. Дайсер в зрелые миРНК в клетке цитоплазма.[10] Также существует изоформа Drosha, которая не содержит сигнала ядерной локализации, что приводит к генерации c-Drosha.[13][14] Было показано, что этот вариант локализуется в ячейке цитоплазма скорее, чем ядро, но эффекты на процессинг pri-miRNA пока неясны.

И Дроша, и Дайсер также участвуют в Ответ на повреждение ДНК.[15]

Клиническое значение

Дроша и другие ферменты процессинга miRNA могут быть важны для прогноза рака.[16] И Дроша, и Дайсер может функционировать как главные регуляторы процессинга miRNA и, как было обнаружено, подавляется при некоторых типах рак молочной железы.[17] Альтернативные схемы склейки Дроши в Атлас генома рака также указали, что ц-дроша, по-видимому, способствует развитию различных типов рака груди, рак толстой кишки, и рак пищевода.[14] Однако точный характер связи между процессингом микроРНК и туморогенез неясно,[18] но его функция может быть эффективно изучена путем нокдауна siRNA на основе независимой проверки.[19]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113360 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022191 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Филиппов В., Соловьев В., Филиппова М., Гилл С.С. (март 2000 г.). «Новый тип белков семейства РНКазы III у эукариот». Ген. 245 (1): 213–21. Дои:10.1016 / s0378-1119 (99) 00571-5. PMID  10713462.
  6. ^ Филиппов В., Соловьев В., Филиппова М., Гилл С.С. (март 2000 г.). «Новый тип белков семейства РНКазы III у эукариот». Ген. 245 (1): 213–21. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00571-5. PMID  10713462.
  7. ^ Ву Х, Сюй Х, Миралья LJ, Crooke ST (ноябрь 2000 г.). «Человеческая РНКаза III представляет собой белок массой 160 кДа, участвующий в процессинге прерибосомной РНК». Журнал биологической химии. 275 (47): 36957–65. Дои:10.1074 / jbc.M005494200. PMID  10948199.
  8. ^ а б «Ген Entrez: рибонуклеаза III RNASEN, ядерная».
  9. ^ Фортин К. Р., Николсон Р. Х., Николсон А. В. (август 2002 г.). «Рибонуклеаза III мыши. Структура кДНК, анализ экспрессии и расположение в хромосоме». BMC Genomics. 3 (1): 26. Дои:10.1186/1471-2164-3-26. ЧВК  122089. PMID  12191433.
  10. ^ а б c Ли Й, Ан С, Хан Дж, Чой Х, Ким Дж, Йим Дж, Ли Дж, провост П., Родмарк О, Ким С., Ким В.Н. (сентябрь 2003 г.). «Ядерная РНКаза III Дроша инициирует процессинг микроРНК». Природа. 425 (6956): 415–9. Дои:10.1038 / природа01957. PMID  14508493. S2CID  4421030.
  11. ^ Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (ноябрь 2004 г.). «Обработка первичных микроРНК микропроцессорным комплексом». Природа. 432 (7014): 231–5. Дои:10.1038 / природа03049. PMID  15531879. S2CID  4425505.
  12. ^ Хан Дж., Ли Й, Йом К. Х., Нам Дж. У., Хео И., Ри Дж. К., Сон С. Ю., Чо Й, Чжан Б. Т., Ким В. Н. (июнь 2006 г.). «Молекулярная основа распознавания первичных микроРНК комплексом Drosha-DGCR8». Клетка. 125 (5): 887–901. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.043. PMID  16751099. S2CID  453021.
  13. ^ а б Дай Л., Чен К., Юнгрен Б., Кулина Дж., Ян А., Го З., Ли Дж., Ю П, Гу С. (июль 2016 г.). «Цитоплазматическая активность Дроша, вызванная альтернативным сплайсингом». Исследования нуклеиновых кислот. 44 (21): 10454–10466. Дои:10.1093 / нар / gkw668. ЧВК  5137420. PMID  27471035.
  14. ^ Francia S, Michelini F, Saxena A, Tang D, de Hoon M, Anelli V, Mione M, Carninci P, d'Adda di Fagagna F (август 2012 г.). «Сайт-специфичные РНК-продукты DICER и DROSHA контролируют реакцию на повреждение ДНК». Природа. 488 (7410): 231–5. Дои:10.1038 / природа11179. ЧВК  3442236. PMID  22722852.
  15. ^ Slack FJ, Weidhaas JB (декабрь 2008 г.). «МикроРНК в прогнозе рака». Медицинский журнал Новой Англии. 359 (25): 2720–2. Дои:10.1056 / NEJMe0808667. PMID  19092157.
  16. ^ Томсон Дж. М., Ньюман М., Паркер Дж. С., Морин-Кенсики Э. М., Райт Т., Хаммонд С. М. (август 2006 г.). «Обширная посттранскрипционная регуляция микроРНК и ее значение для рака». Гены и развитие. 20 (16): 2202–7. Дои:10.1101 / gad.1444406. ЧВК  1553203. PMID  16882971.
  17. ^ Иорио М.В., Кроче С.М. (июнь 2012 г.). «Участие микроРНК в раке человека». Канцерогенез. 33 (6): 1126–33. Дои:10.1093 / carcin / bgs140. ЧВК  3514864. PMID  22491715.
  18. ^ Мункачи, Дьёнджи; Штупински, Жофия; Герман, Петер; Бан, Бенце; Пензвальто, Жофия; Сарвас, Нора; Дьёрфи, Балаж (01.01.2016). «Подтверждение эффективности подавления РНКи с использованием данных массива генов показывает 18,5% отказов в 429 независимых экспериментах». Молекулярная терапия - нуклеиновые кислоты. 5 (9): e366. Дои:10.1038 / mtna.2016.66. ISSN  2162-2531. ЧВК  5056990. PMID  27673562.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9NRR4 (Рибонуклеаза 3) на PDBe-KB.