GLD-2 - GLD-2

Эта статья включает Список ссылок, связанное чтение или внешняя ссылка, но его источники остаются неясными, потому что в нем отсутствует встроенные цитаты. Пожалуйста, помогите улучшать эта статья введение более точные цитаты. (Март 2016 г.) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения)

ТЕНТ2
Идентификаторы
Псевдонимы	ТЕНТ2, GLD2, TUT2, связанный с PAP домен, содержащий 4, поли (A) РНК-полимераза D4, неканоническая, PAPD4, терминальная нуклеотидилтрансфераза 2, APD4, GLD-2
Внешние идентификаторы	OMIM: 614121 MGI: 2140950 ГомолоГен: 44022 Генные карты: ТЕНТ2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q14.1 Начинать 79,612,120 бп[1] Конец 79,686,648 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 C3 Начинать 93,146,282 бп[2] Конец 93,192,385 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • активность полинуклеотида аденилилтрансферазы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • связывание ионов металлов • Активность 5'-3 'РНК-полимеразы • активность аденилилтрансферазы Сотовый компонент • ядерная РНК-направленная РНК-полимеразный комплекс • цитоплазма • цитозоль • ядро клетки Биологический процесс • катаболический процесс мРНК гистонов • обработка мРНК • Полиаденилирование РНК • дифференцировка гемопоэтических клеток-предшественников • развитие гиппокампа • дифференциация нейронов • развитие сетчатки глаза камерного типа • темная адаптация • Стабилизация РНК • отрицательная регуляция катаболического процесса miRNA Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	167153	100715
Ансамбль	ENSG00000164329	ENSMUSG00000042167
UniProt	Q6PIY7	Q91YI6
RefSeq (мРНК)	NM_001114393 NM_001114394 NM_001297744 NM_001297745 NM_173797 NM_001349548 NM_001349549 NM_001349550 NM_001349551 NM_001349552 NM_001349553 NM_001349554	NM_133905 NM_001361536 NM_001361537
RefSeq (белок)	NP_001107865 NP_001107866 NP_001284673 NP_001284674 NP_776158 NP_001336477 NP_001336478 NP_001336479 NP_001336480 NP_001336481 NP_001336482 NP_001336483	NP_598666 NP_001348465 NP_001348466
Расположение (UCSC)	Chr 5: 79.61 - 79.69 Мб	Chr 13: 93.15 - 93.19 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

GLD-2 (что означает Развитие зародышевой линии 2) представляет собой цитоплазматическую поли (А) полимеразу (cytoPAP), которая добавляет последовательные AMP мономеры на 3 ’конце определенных РНК, образуя поли (A) хвост, что является процессом, известным как полиаденилирование.

Для специфичности РНК GLD-2 ассоциируется с РНК-связывающим белком, обычно с GLD-3, с образованием гетеродимер который действует как цитоплазматический PAP. Этот белок выполняет ферментативную функцию и принадлежит к семейству (семейство ДНК-полимераз типа B), которое включает несколько подобных ферментов, таких как GLD-1, GLD-3 и GLD-4.

Это семейство цитоплазматических PAP было описано у нескольких различных видов, включая Homo sapiens, Caenorhabditis elegans, Xenopus, Mus musculus и Дрозофила. Более того, поскольку это цитоплазматический PAP, он отличается от ядерных PAP в некоторых аспектах. В то время как ядерные PAP содержат каталитический домен и РНК-связывающий домен, члены семейства GLD-2 имеют только каталитический домен.

Локализация

GLD-2 - распространенный и широко распространенный, но пока еще довольно неизвестный белок, который уже был обнаружен в каждом из пять королевств. В животном мире это было специально обнаружено у Homo sapiens, Дрозофила, Xenopus и Mus musculus. Однако также было замечено присутствие GLD-2 в Arabidopsis thaliana который принадлежит царству растений; Кишечная палочка в Монере и грибковые микроорганизмы албиканс в грибах.

У людей он в основном выражается в головном мозге и внутри него, в мозжечке, гиппокампе и продолговатом мозге. Мы также можем найти их в некоторых других исходных тканях, таких как фибробласты, клетки HeLa, клетки MCF-7, клеточная линия меланомы и вилочковая железа. Внутри этих клеток он может находиться в ядре и митохондрия поскольку его основная функция связана с полиаденилированием ДНК, и эти клеточные органеллы - единственные, в которых ДНК может быть обнаружена. Однако в цитозоле также присутствуют растворимые GLD-2, хотя причина их появления до сих пор не ясна.

В Кишечная палочка, этот ферментный белок можно найти в клеточной мембране и в цитозоль, тогда как в Drosophila melanogaster, он преобладает в ядре и цитоплазме мозга, яйцеклетках, яичниках и семенниках. Наконец, в Arabidopsis thaliana, он находится в ядре цветка, клетках корня, ствола и листа.

Связанные функции

GLD-2 в первую очередь стабилизирует мРНК, которые подавляются трансляцией, а также сильно способствует массовому полиаденилированию. Удивительно, но эти функции, по-видимому, мало влияют на динамизацию эффективной трансляции мРНК-мишени, поскольку это эффективная поли (A) полимераза, которая помогает развивать активность полиаденилирования. Эта активность стимулируется его взаимодействием с предполагаемым РНК-связывающим белком: GLD-3. Некоторые исследования предполагают, что GLD-3 стимулирует GLD-2, рекрутируя его в РНК. Если это так, то приведение GLD-2 к РНК другими способами также должно стимулировать ее активность.

Молекулярная функция

Связывание АТФ

GLD-2, как поли (A) полимераза (PAP), действует, включая АТФ на 3'-конце мРНК независимым от матрицы образом.

Ферментативная активность: активность полинуклеотида аденилилтрансферазы.

Было обнаружено, что этот белок обладает каталитической активностью, другими словами, он обладает способностью увеличивать скорость химических реакций, которые не могли бы происходить так быстро. Это известно катализ следующая реакция (для которой требуется следующий кофактор: Mg (2+)):

                            АТФ + РНК (n) ⇄ дифосфат + РНК (n + 1)

В зависимости от окружающей среды оптимальный pH варьируется от 8 в цитоплазме до 8,3 в ядре.

Биологический процесс

Дифференцировка гемопоэтических клеток-предшественников

Белок GLD-2 вместе с еще 136 белками участвует в молекулярном процессе кроветворный дифференцировка клеток-предшественников в протеоме человека. Это процесс, при котором тип клеток-предшественников приобретает особые черты гематопоэтических клеток-предшественников, разновидностей клеток, включая миелоидные клетки-предшественники и лимфоидные клетки-предшественники.

Обработка мРНК полиаденилированием РНК

Активность GLD-2 по полиаденилированию, как мы уже упоминали, стимулируется физическим взаимодействием с РНК-связывающим белком, GLD-3. Чтобы проверить, может ли GLD-3 стимулировать GLD-2 путем привлечения его к РНК, в некоторых исследованиях GLD-2 C. elegans был привязан к мРНК в Xenopus ооциты с использованием белка оболочки MS2. Привязанный GLD-2 добавляет поли (А) и стимулирует трансляцию мРНК, демонстрируя, что рекрутирование достаточно для стимуляции активности полиаденилирования. Гетеродимер PAP, в котором GLD-2 содержит активный сайт, а GLD-3 обеспечивает специфичность связывания РНК. Белок оболочки MS2 был присоединен к GLD-2, чтобы привлечь его к РНК.

Кроме того, активность GLD-2 также важна для поддержания или повышения уровня множества мРНК, поскольку цитоплазматическое полиаденилирование играет важную роль в активации материнской трансляция мРНК во время раннего развития. В позвоночные, для реакции требуется CPEB, РНК-связывающий белок и поли (A) полимераза GLD-2.

В Xenopus Фермент, который существует в двух близкородственных формах, полиаденилирует РНК, с которыми он связан, и усиливает их трансляцию. Аналогичным образом он взаимодействует с факторами цитоплазматического полиаденилирования, включая Фактор специфичности расщепления и полиаденилирования и CPEB, и с целевыми мРНК. Эти данные подтверждают и расширяют недавнее сообщение о том, что фермент GLD-2 является давно искомым PAP, ответственным за цитоплазматическое полиаденилирование в ооцитах.

Кроме того, считается, что формирование долговременной памяти не контролирует трансляцию локализованных мРНК. У млекопитающих дендрит мРНК сохраняются в подавленном состоянии и активируются при повторяющейся стимуляции. Считается, что несколько регуляторных белков, необходимых для контроля трансляции на раннем этапе развития, необходимы для формирования памяти, что предполагает сходные молекулярные механизмы. В эксперименте с использованием Дрозофилабыл обнаружен фермент, ответственный за удлинение поли (A) в головном мозге, и также было продемонстрировано, что его активность необходима именно для долговременной памяти. Эти находки предоставляют убедительные доказательства того, что цитоплазматическое полиаденилирование критически важно для формирования памяти и что GLD2 является ответственным ферментом.

Медицинские последствия

Также было обнаружено, что GLD2 имеет медицинское применение.

Например, такой фермент сверхэкспрессируется у пациентов, страдающих рак; поэтому его можно использовать как прогностический фактор для раннего появления у больных раком груди. Более того, активность PAP используется для измерения эффекта противоопухолевых препаратов. этопозид и кордицепин в двоем карцинома Сотовые линии: HeLa, который является эпителиоидной карциномой шейки матки человека, и MCF-7 (рак груди человека). Однако, несмотря на его полезность, он также может быть вовлечен в проявление нескольких распространенных заболеваний, таких как: лейкемия, цирроз печени, травмы головного мозга, гепатит и в некоторых случаях бесплодие у пациентов мужского пола.

Рекомендации

дальнейшее чтение