HLA A1-B8-DR3-DQ2 - HLA A1-B8-DR3-DQ2
Мультигенный гаплотип, человек | |||
---|---|---|---|
Область HLA на хромосоме 6 | |||
HLA A1-B8-DR3-DQ2 | |||
Никнеймы | «Супер-В8», «АН8.1», «наследственный MHC 8.1» | ||
Loci | Ген | Аллель | Серотип |
I класс | HLA-A | *0101 | A1 |
HLA-C | *0701 | Cw7 | |
HLA-B | *0801 | B8 | |
HLA-DR | HLA-DRB1 | *0301 | DR3 |
HLA-DRB3 | *0101 | DR52 | |
HLA-DQ | HLA-DQA1 | *0501 | |
HLA-DQB1 | *0201 | DQ2 | |
Узлы | |||
численность населенияМаксима | Freq.Максимум | ||
Западный Ирландия | >11.0% | ||
Размер и расположение | |||
Гены | Место расположения | размер (кбит / с) | |
311 | 6 | 6п21.3 | 4700 |
Сопутствующие заболевания | |||
Гаплотип (ген) | Заболевания | ||
DQ2.5 | Глютеновая болезнь | ||
DR3-DQ2 | Ювенильный диабет, Саркоидоз | ||
B8 :: DQ2 | Аутоиммунный гепатит, Первичный билиарный цирроз, Миастения, Герпетиформный дерматит |
Гаплотип HLA A1-B8-DR3-DQ2 (Также: AH8.1, СОХ,[1] Супер B8, наследственный MHC 8.1[2] или же 8.1 предковый гаплотип[3]) является мультигенным гаплотип который охватывает большинство человеческих главный комплекс гистосовместимости на хромосома 6 (не путать с HLA-DQ гетеродимер DQ8.1 ). Мультигенный гаплотип - это набор наследуемых аллели охватывающие несколько генов или генов-аллелей; общие мультигенные гаплотипы, как правило, являются результатом общего происхождения (имеют недавнего общего предка для этого сегмента хромосомы). Хромосомная рекомбинация фрагментирует мультигенные гаплотипы по мере того, как расстояние до этого предка увеличивается в количестве поколений.
Гаплотип можно записать в расширенной форме, охватывающей основные локусы гистосовместимости, следующим образом:
HLA A*0101 : Cw*0701 : B*0801 : DRB1*0301 : DQA1*0501 : DQB1*0201 или стенография A1 :: DQ2
Внутри гаплотипа есть много других генов-аллелей, в том числе более 250 кодирующих места которые производят стенограммы.
4,7 миллиона нуклеотиды по длине A1 :: DQ2 - второй по длине гаплотип, идентифицированный в человеческий геном.[1] A1 :: DQ2 создает головоломку для эволюционного изучения рекомбинация. Длина гаплотипа примечательна, поскольку высокая скорость эволюции в локусе HLA должна приводить к деградации таких длинных гаплотипов. A1 :: DQ2 трудно отследить, выдвигались предположения об общем предке в Иберии или Африке. Хотя место его происхождения не определено, существует согласие, что носители европейского AH8.1 несут гаплотип, связанный общим происхождением.[3] A1 :: DQ2 - наиболее частый гаплотип своей длины, встречающийся у кавказцев в США, ~ 15% несут этот общий гаплотип.[4]
Исследования показывают, что выдающееся положение A1 :: DQ2, вероятно, связано с положительным отбором в период до неолита и изоляцией в странах, где пшеница не была популярным злаком. Вне DR3-DQ2 с известными ассоциациями с аутоиммунное заболевание другие факторы в пределах A1 :: DQ2, как полагают, также способствуют аутоиммунному заболеванию.[3] Также дюжина воспалительных заболеваний иммунной системы может приписать гаплотип некоторый риск. Некоторые заболевания, такие как глютеновая болезнь, в первую очередь ассоциировать с определенными генами. В то время как другие заболевания, такие как диабет 1 типа, могут иметь несколько очень разных генов, которые определяют риск. Другие болезни, такие как миастения, не имеют определенной связи с гаплотипом.
Динамика рекомбинации
У каждого человека уникальный хромосомы, если они не идентичные близнецы. Эти уникальные хромосомы образуются путем рекомбинации каждой уникальной хромосомы, передаваемой каждым дедушкой и бабушкой каждому родителю. Эти хромосомы химеризуются в репродуктивных клетках каждого родителя, которые затем передаются развивающемуся человеку во время оплодотворения. Рекомбинация, которая создает эти смешанные хромосомы, происходит почти случайным образом по длине, 1 Морган на поколение. В пределах 100 поколений людей (около 2100 лет в древности) можно ожидать, что несколько сотен таких «смешанных» событий произойдут на одной хромосоме, средний размер составляет 1 сантиметр моргана (или 1 сМ). Средняя длина этих «гаплотипов» составляет около 1 миллиона нуклеотидов.
Мультигенные гаплотипы, следующие стандартной динамике, существуют только в устойчивых популяциях в течение короткого времени, среднее расстояние между генами составляет около 200000 нт, что означает, что в течение 250 поколений (~ 5000 лет) ожидается, что 1/2 соседних генов будет иметь новые ген-аллели. , если только гены не маленькие и очень близко друг к другу. Эта динамика может измениться, если популяция будет быстро увеличиваться из нескольких особей, которые жили изолированно, пока сохраняются другие гаплотипы.
A1 :: DQ2 не следует ожидаемой динамике. Другие гаплотипы существуют в регионе Европы, где этот гаплотип сформировался и расширился, некоторые из этих гаплотипов также являются предковыми и также довольно крупными. При длине 4,7 миллиона нуклеотидов и ~ 300 генах локус сопротивлялся эффектам рекомбинации либо как следствие обструкции рекомбинации внутри ДНК, как следствие повторного отбора для всего гаплотипа, либо как следствие того и другого.
Структура
A1 :: DQ2 имеет длину 4 731 878 нуклеотидов.[1] Гаплотип начинается до TRIM27 локус примерно 28,8 миллионов нуклеотидов от теломер более короткого плеча хромосомы 6. AH8.1 выходит за пределы SYNGAP1 около 33,5 миллионов нуклеотидов из теломера. Однако заметное ухудшение происходит после гена DQB1 на 32,8 миллиона нуклеотидов. A1 :: DQ2 - не самый длинный гаплотип, а самый длинный, HLA A3-Cw7-B7-DR15-DQ6 (A3 :: DQ6), уже подверглись значительной рекомбинации и по частоте почти равны HLA A2-Cw7 :: DQ6 несущей версии. У европеоидов США 57% гаплотипов с основным компонентом, Cw7-B8, простираются от локуса HLA-A1 к локусу DQ2. Это для сравнения с 25% Cw7-B7, которые распространяются на A3 :: DQ6. [4] Из 25 потенциальных генетических рекомбинантов A1 :: DQ2 ни один не превышает 10% от частоты Cw * 0702-B * 0801. Два рекомбинанта A24-Cw7 ~ DQ2, A1 :: B8-DR1-DQ5 примечательны. Таким образом, гаплотип A1 :: DQ2 является длинным и демонстрирует больший дефицит рекомбинации (так называемое неравновесие по сцеплению).
Эволюция
Развитие A1 :: DQ2, по-видимому, является ключом к его структуре. Гаплотип, содержащий 4,7 миллиона нуклеотидов, существует в популяции с другими гаплотипами, которые при объединении превышают A1 :: DQ2 по частоте. Генетика рекомбинации у людей предполагает, что общие гаплотипы такой длины, что компонент Cw7-B8, должны быть в других гаплотипах, Ax-Cw7 :: DQ2, A1-B8-DRx-DQx или A1-B8-DR3-DQx (где Ax - не A1, DRx не является DR3 или DQx не является DQ2). Для гаплотипа такой длины процесс происходит быстро, потеря 50% полного гаплотипа в течение 500 лет. И все же гаплотип обнаруживается в основном у людей, которые переселились из Европы сотни лет назад.
Устойчивость к рекомбинации
A1 :: DQ2 находится в Исландии, Поморы Северной России, сербов северного славянского происхождения, басков и районов Мексики, где басков поселились в больших количествах. Большое количество гаплотипов в наиболее изолированном географическом регионе Западной Европы, Ирландии, у скандинавов и Швейцарии, предполагает, что низкая численность во Франции и латинизированной Иберии является результатом смещений, имевших место после Неолит начало. Это подразумевает присутствие в Европе более 8000 лет. SNP-анализ гаплотипа предполагает потенциальный эффект основания в течение 20 000 лет в Европе, хотя теперь очевидны конфликты в интерпретации этой информации. Последней возможной точкой сужения климата была Младший дриас до 11 500 календарных лет назад, и поэтому гаплотип принял различные формы названия, Ancestral European Haplotype, в последнее время названный Ancestral Haplotype A1-B8 (AH8.1). Это один из четырех, которые кажутся обычными для западных европейцев и других азиатов. Если предположить, что частота гаплотипов составляла 50% в период позднего дриаса и снижалась на 50% каждые 500 лет, то гаплотипы должны присутствовать только ниже 0,1% в любой европейской популяции. Следовательно, это почти в 100 раз превышает ожидаемую частоту для основополагающего гаплотипа.
Диета в эволюции
Помимо частых интерпретаций этой природы, мало что известно о том, почему гаплотип не подвергся уравновешиванию. Гаплотип оказался резистентным к рекомбинации, по-видимому, он также прошел положительный отбор по сравнению с другими гаплотипами в Европе, хотя в настоящее время случаи заболевания предполагают, что действует отрицательный отбор на основе злаков. Одно возможное объяснение исходит из изучения останков донеолита. Если еда выбирает гаплотип сейчас, возможно, еда также положительно выбирала гаплотип в прошлом. В ранний период европейского заселения остатки прибрежных поселений свидетельствуют о высоком потреблении калорийности морской пищи и, в частности, моллюсков. Морской углеродный компонент западноевропейской диеты снизился от мезолита до настоящего времени, однако гаплотип не подвергся уравновешиванию, поэтому диета сама по себе не может объяснить его устойчивость к рекомбинации.
Формирование
Из упомянутых выше гаплотипов, A24-Cw * 0702 :: DQ2 или A1 :: B8-DR1-DQ5, ни один не является предком A1 :: DQ2. A1 :: DQ2 появляется в Индии, однако его основные антигенные гены внешне напоминают европейский A1-B8, и он, по-видимому, является гомопластическим рекомбинантным от общего предка DR3-DQ2, примерно 70 000 лет назад.[5] Компоненты гаплотипа встречаются в Европе (у басков есть два основных гаплотипа DR3-DQ2), а A1-B8 индийского происхождения имеет очень низкую частоту. В Марокко B8 :: DQ2, в Западной Сахаре гаплотип A1-B8, если он обнаружен, а также DQ2.5 обнаруживается с высокой частотой, но не как единственный гаплотип. В Кении два слегка изменчивых аллеля HLA-A и B для гаплотипа A1-B8. Одна из возможностей состоит в том, что народы из Центральной Азии или Ближнего Востока мигрировали в Иберию, когда народы из Африки пересеклись в Иберию с юга до неолита, произошла рекомбинация, которая привела к гаплотипу, и носители благополучно расширились в Европу до голоцена. Другая возможность состоит в том, что, если он образовался в Западной Африке, но поскольку он был менее избирательным в африканском голоцене по сравнению с европейским голоценовым климатом / культурой, гаплотип подвергся уравновешиванию в Северной Африке. Одна гипотеза, подтвержденная частотами в Иберии и Северной Африке, предполагает, что A1 :: DQ2 образовался из A1 :: B8-DR7-DQ2 с источником, несущим DR3. Один из возможных источников - HLA Cw*1701 : B*4201 : DRB1*0302 (Наиболее распространенный гаплотип у афроамериканцев - это расширенный гаплотип). Однако возможно, это потребует введения модифицированного аллеля * 0505. Вдобавок индийская / европейская ветвь DQ2.5 намного старше, поэтому кажется, что для формирования гаплотипа потребовались по крайней мере 2 основных рекомбинантных этапа, и после его образования эволюция заметно замедлилась.
Варианты
Есть вариант A1 ← → B8, найденный в Индии.[5] Этот вариант несет другой Cw * 07 (Cw * 0702 - очень древний аллель, который отличается от Cw * 0701 A1 :: DQ2). Он несет C4A другой аллель DRB3, а также ряд других отличий. Этот вариант, вероятно, произошел от A24 или A26-Cw * 0702-B * 0801-DR3-DQ2, которые независимо появились и развились в Индии.
Составные части
Большие гаплотипы можно рассматривать как ступеньки между соседними локусами. Например, A1-Cw * 0701, Cw * 0701-B8, B8 до DR3 и DR3-DQ2 - это шаги. Каждый шаг является самостоятельным гаплотипом, однако, чем ближе два локуса вместе, тем больше времени требуется рекомбинации, чтобы изменить шаг. Оба Cw-B и DR-DQ находятся близко друг к другу, A-Cw и B-DR далеко друг от друга. В результате компоненты гаплотипа развиваются с разной скоростью.
A1-Cw7-B8
Ранние исследования семей по всей Европе показали, что большинство ассоциаций HLA уже показали, что существует наследственная (генетическая) связь между A1 и B1, которая была распространена на локус Cw7.[6]
И хотя уровень связи A-B в целом не был близок к связи Cw-B, связь между A1-Cw7-B8 была достаточно сильной.
B8-DR3
Область между B8 и DR3 включительно несет в себе ряд генов, представляющих интерес для изучения болезней человека. Наиболее важным из них является TNF (факторы некроза опухоли) с 3 локусами в регионе. Начиная с B8, сразу за ними следуют MICA и MICB, которые обозначают I-подобную цепь MHC A и B. Эти две молекулы функционального класса I экспрессируются на интероцитах кишечника и могут иметь интерес к аутоиммунным заболеваниям, они вариабельны, но мутанты MICA до сих пор обнаруженные, похоже, не коррелируют с аутоиммунными заболеваниями желудочно-кишечного тракта.
HLA DR3-DQ2
DR3-DQ2 является известным или очень подозрительным фактором большинства аутоиммунных заболеваний, которые связаны с гаплотипом A1 :: DQ2.
Значение для медицины
При трансплантации органов
A1 :: DQ2 был в авангарде науки о гистосовместимости, A1 был первым числовым антигеном HL-A1, идентифицированным в конце 1960-х годов. HL-A8, второй уточненный B-серотип, который предстоит раскрыть, стал HLA-B8. Из-за частоты гаплотипа гомозиготы являются обычными, около 0,6% в популяции, что делает его полезным для создания клеточных линий, которые можно использовать для тестирования антител серотипирования. В результате HLA-A1 и B8 продуцируют одни из лучших серотипирующих антител. Это помогло в правильной идентификации совпадений трансплантата до эры тестирования генов ПЦР.
Мультигенный гаплотип, человек | |||
---|---|---|---|
B8-DR3 | |||
Никнеймы | «Б8-ДР3»; «Б8-ДР3» «B * 0801: DRB1 * 0301» » | ||
Loci | Ген | Аллель | Изоформа |
область центомерного класса I | HLA-B | В * 0801 | B8 |
MICA | *0801 | MICA5.1 | |
MICB | *0801 | MICB24 | |
RCCX HVR, III класс | TNFA | - | - |
TNFB | - | - | |
C4A | Ноль | C4AQ0 | |
C4B | C4BS | ||
CYP21 | |||
DR Loci | HLA-DRB3 | *0101 | DR52 |
HLA-DRB1 | *0301 | DR3 | |
Узлы | |||
численность населенияМаксима | Freq.Максимум | ||
Западная Ирландия | >15.0% | ||
Размер и расположение | |||
Гены | Место расположения | размер (кбит / с) | |
- | 6 | 6п21.3 | 1400 |
Сопутствующие заболевания | |||
Гаплотип (ген) | Заболевания | ||
B8 :: DQ2 | Аутоиммунный гепатит, Первичный билиарный цирроз, Ювенильный диабет | ||
B8 :: DR3 | Системная красная волчанка |
При целиакии и герпетиформном дерматите
До уточнения типов для HLA-DQ и DR ассоциация с HLA-A1 и B8 была идентифицирована для глютеновая болезнь в 1973 г. и герпетиформный дерматит в 1976 г.[7][8] Благодаря гаплотипу стало возможным выявить генетический риск. хотя гены, вызывающие заболевание, гаплотип DQ2, находились на расстоянии 1,3 миллиона нуклеотидов.
Помимо хорошо изученной связи между DQ2.5 и целиакией, существуют дополнительные факторы риска на гаплотипе B8 :: DQ2, которые увеличивают риск герпетиформного дерматита при целиакии.[9] Нельзя исключить и участие других аллелей гена A1 :: DQ2 в целиакии.[3] Например, MICA и MICB представляют собой гены mhc класса 1, экспрессируемые в эпителии кишечника.
При инсулинозависимом сахарном диабете
В диабет 1 типа и DR3, и DQ2, похоже, играют роль. DR3-DQ2.5 может быть связан с другими генами, такими как TNF-305A (TNF2), что также может повышать риск аутоиммунного заболевания как при глютеновой болезни, так и при диабете 1 типа. У пациентов с системной красной волчанкой (СКВ) HLA DR3-DQ2.5-C4AQ0 был сильно связан с СКВ (отношение шансов [ОШ] 2,8, 95% ДИ 1,7–4,5). В более поздней статье показано, что ген инозитолтрифосфатного рецептора 3, который составляет около 1 миллиона пар оснований центромерных из DQ2.5, также может быть связан с диабетом 1 типа. Кроме того, вариант BAT1 и MICB чаще встречается при диабете 1 типа, когда B8 отсутствует, но присутствует DR3.[10] Эти исследования предполагают, что множественные факторы на B8 :: DQ2, которыми обладают другие гаплотипы, также определяют предрасположенность к диабету 1 типа. Риск диабета 1 типа связан с: вирус Коксаки 4B, существует возможность вовлечения локусов класса I, особенно тех, которые экспрессируются в желудочно-кишечном тракте.
При миастении
В 1975 году связь с «HL-A1,8» (текущее название: HLA A1-B8) была подтверждена серологическим типированием клеток миастеников.[11] Однако в более крупной выборке связь риска была обнаружена ближе к «HL-A8» (текущее название: HLA-B8).[12] Эта ассоциация позже переместилась в область «B8-DRw3» (Текущая: B8-DR3).[13] В Европе существует два основных гаплотипа DR3: A1 :: DQ2 и A30-B18-DR3-DQ2. Связь с заболеванием более твердо может быть отнесена к B8 :: DQ2 части A1 :: DQ2 по сравнению с A30-B18 :: DQ2, указывая на некоторое участие других аллелей гена B8-DR3 в заболевании.[14] Связь области B8 :: DQ2 в первую очередь наблюдается у женщин с возрастом. гиперплазия тимуса. Позже было обнаружено, что уровень антител против рецептора ацетилхолина при заболевании коррелирует с B8 :: DR3.[15] Позже было обнаружено, что и DQ2.5, и DQ2.2 (гаплотип DQ DR7-DQ2) были положительно связаны с заболеванием.[16] Остается спорным, является ли DR3 или DQ2 первичной восприимчивостью к миастении. В некоторых исследованиях не наблюдалось никакой связи ни с одним из них. Чтобы разделить группы болезней, были предприняты попытки дополнительно определить популяцию с наиболее ранним началом (предположительно наиболее восприимчивыми) и женщин. В этих исследованиях связь с B8 была больше, чем DR3, так что восприимчивость переместилась из класса II в локусы класса III или класса I.[3] Связь с классом I была бы необычной, поскольку продукция аутоантител, опосредованная Т-хелперами, характерна для болезни, тогда как цитотоксичность, опосредованная классом I, - нет. MICA и MICB экспрессируются в кишечнике. Есть много генов, которые лежат по обе стороны от HLA-B, TNF-альфа сверхэкспрессируется. Ближе к DR3, C4A не имеет значения в гаплотипе B8-DR3.
При аутоиммунном гепатите
В 1972 г. возникла связь между "HLA A1,8" (в настоящее время: HLA A1-B8) активный хронический гепатит, впоследствии B8 лучше ассоциируется с аутоиммунный гепатит.[17][18] С открытием DR3 связь была расширена на DR3, а затем на DQ2-DP4.[19][20] Хотя HLA A*0101, Cw*0701, и DPB1*0402 связаны с заболеванием, самая сильная связь находится между B8 и DR3-DQ2 или субрегионом B8 :: DQ2.[21][22][23] Другие гены в регионе, C4A -null и TNF может быть связано с аутоиммунным гепатитом[24][25]
Появление антиядерные антитела при аутоиммунном гепатите коррелирует с A1-B8-DR3.[26] Одна из проблем аутоиммунного гепатита - повышенный риск целиакии.[27] Первичный билиарный цирроз, который часто следует за хроническим активным гепатитом, связан с геном DRw3, DR3.[28] Целиакия часто усиливается при аутоиммунном гепатите и наоборот. Недавние исследования указывают на более коварную связь между чувствительностью к глютену и аутоиммунным гепатитом. В одном исследовании 65% пациентов с конечной стадией аутоиммунный гепатит имели глютен-ассоциированный HLA-DQ (DQ2, DQ8), половина из них антитела к трансглутаминазе, но у немногих были эндомизиальные антитела.[29] Это может указывать на связь с субклинический энтеропатия или, альтернативно, результат хронической вирусной инфекции, которая, как известно, также повышает уровень антител против транглутаминазы. Немецкое исследование показало, что риск был больше связан с B8, чем с DQ2, эти противоречивые результаты показывают, что существует как минимум две ассоциации риска в области B8 :: DQ2.[30]
При саркоидозе
Как и эти другие исследования, связь между «HL-A1,8» в конечном итоге приводит к восприимчивости, близкой к локусу DR-DQ, саркоидоз, по-видимому, связан с HLA-DR3-DQ2.
При системной красной волчанке
Было обнаружено, что «фенотип HL-A1,8» связан с тяжелой системной красной волчанкой (СКВ) (поражение почек и центральной нервной системы) у пациентов европеоидной расы.[31] Двухточечный гаплотипический анализ между TNFB (Аллель B * 01) и HLA показывают, что аллель находится в неравновесном сцеплении с HLA-A1, Cw7, B8, C4A (Null), DR3, DQ2.5.[32] Полный гаплотип, A1-Cw7-B8-TNFB * 1-C4A (Null) -DR3-DQ2, повышен у пациентов, и генетическая предрасположенность к СКВ не может быть определена.[33] Связь не может быть расширена до локуса HLA-DPB1.[34] За пределами Европы локусы DRB1 * 0301 и DR3-DQ2 были связаны с заболеванием независимо от гаплотипа A1 :: DQ2.[35] Установлено, что DR3 коррелирует с антителами против Ro / La при СКВ.[36]
В миозит с тельцами включения, полимиозит и дерматомиозит
HLA-DR3 постоянно наблюдается с высокой частотой при миозите с тельцами включения у кавказцев.[37] Было обнаружено, что DR3 также коррелирует с наличием антибоида Jo-1.[38]Исследования спорадического миозита с тельцами включения указывают на связь с гаплотипом A1: DQ2.[39]Более поздние исследования показывают, что риск лежит исключительно между областью B8-DR3, которая включает 3 гена класса I, область гена класса III и 2 гена класса II.[40] В исследовании, опубликованном в октябре 2015 года Национальным институтом наук об окружающей среде, сравнивалось 1710 случаев миозита с началом у взрослых или подростков с 4724 контрольными субъектами. Они обнаружили, что несколько генов, составляющих AH8.1, определяют генетический риск всех типов миозита.[41]
Смотрите также
Рекомендуемое чтение
- Прайс П., Витт С., Оллкок Р. и др. (Февраль 1999 г.). «Генетическая основа ассоциации предкового гаплотипа 8.1 (A1, B8, DR3) с множественными иммунопатологическими заболеваниями». Иммунол. Rev. 167: 257–74. Дои:10.1111 / j.1600-065X.1999.tb01398.x. PMID 10319267. Архивировано из оригинал на 2013-01-05.
- Хортон Р., Гибсон Р., Коггилл П. и др. (Январь 2008 г.). «Вариационный анализ и аннотация генов восьми гаплотипов MHC: проект гаплотипов MHC». Иммуногенетика. 60 (1): 1–18. Дои:10.1007 / s00251-007-0262-2. ЧВК 2206249. PMID 18193213.
- Траэрн Дж. А., Хортон Р., Робертс А. Н. и др. (Январь 2006 г.). «Генетический анализ полностью секвенированных гаплотипов MHC, связанных с заболеванием, выявляет перетасовку сегментов в недавней истории человечества». PLOS Genet. 2 (1): e9. Дои:10.1371 / journal.pgen.0020009. ЧВК 1331980. PMID 16440057.
Рекомендации
- ^ а б c Хортон Р., Гибсон Р., Коггилл П. и др. (Январь 2008 г.). «Вариационный анализ и аннотация генов восьми гаплотипов MHC: проект гаплотипов MHC». Иммуногенетика. 60 (1): 1–18. Дои:10.1007 / s00251-007-0262-2. ЧВК 2206249. PMID 18193213.
- ^ Рокка П., коды L, Шевалье М., Трепо С., Зулим Ф. (ноябрь 2004 г.). «[Аутоиммунизация, вызванная терапией интерфероном альфа при хроническом гепатите C]». Гастроэнтерол. Clin. Биол. (На французском). 28 (11): 1173–6. Дои:10.1016 / S0399-8320 (04) 95201-3. PMID 15657545.
- ^ а б c d е Прайс П., Витт С., Оллкок Р. и др. (Февраль 1999 г.). «Генетическая основа ассоциации предкового гаплотипа 8.1 (A1, B8, DR3) с множеством иммунопатологических заболеваний». Иммунол. Rev. 167: 257–74. Дои:10.1111 / j.1600-065X.1999.tb01398.x. PMID 10319267.
- ^ а б Майерс М., Грагерт Л., Клитц В. (сентябрь 2007 г.). «Аллели и гаплотипы HLA высокого разрешения в популяции Соединенных Штатов». Гм. Иммунол. 68 (9): 779–88. Дои:10.1016 / j.humimm.2007.04.005. PMID 17869653.
- ^ а б Каур Г., Кумар Н., Силаджи А. и др. (Июль 2008 г.). «Аутоиммунно-ассоциированные гаплотипы HLA-B8-DR3 у азиатских индейцев уникальны по количеству копий гена комплемента C4 и HSP-2 1267A / G». Гм. Иммунол. 69 (9): 580–7. Дои:10.1016 / j.humimm.2008.06.007. PMID 18657583.
- ^ Хиллер С., Бишофф М., Шмидт А., Бендер К. (апрель 1978 г.). «Анализ неравновесия сцепления HLA-ABC: уменьшение силы гаметической ассоциации с увеличением расстояния карты». Гм. Genet. 41 (3): 301–12. Дои:10.1007 / BF00284764. PMID 649158.
- ^ Людвиг Х., Полименидис З., Грандич Дж., Вик Дж. (Ноябрь 1973 г.). «[Связь HL-A1 и HL-A8 с детской глютеновой болезнью]». Z Immunitatsforsch Exp Клин Иммунол (на немецком). 146 (2): 158–67. PMID 4282973.
- ^ Реунала Т., Сало О.П., Тииликайнен А., Маттила М.Дж. (февраль 1976 г.). «Антигены гистосовместимости и герпетиформный дерматит с особым упором на аномалии тощей кишки и фенотип ацетилирования». Br. J. Dermatol. 94 (2): 139–43. Дои:10.1111 / j.1365-2133.1976.tb04362.x. PMID 1252348.
- ^ Ахмед А.Р., Юнис Дж. Дж., Маркус-Бэгли Д. и др. (Декабрь 1993 г.). «Основные гены восприимчивости комплекса гистосовместимости для герпетиформного дерматита по сравнению с генами чувствительной к глютену энтеропатии». J. Exp. Med. 178 (6): 2067–75. Дои:10.1084 / jem.178.6.2067. ЧВК 2191293. PMID 8245782.
- ^ Cheong KY, Allcock RJ, Eerligh P и др. (Декабрь 2001 г.). «Локализация центральных генов MHC, влияющих на диабет I типа». Гм. Иммунол. 62 (12): 1363–70. Дои:10.1016 / S0198-8859 (01) 00351-2. PMID 11756005.
- ^ Хаммарстрём Л., Смит Е., Мёллер Е., Франкссон К., Мателл Г., Фон Рейс Г. (август 1975 г.). «Миастения гравис: исследования HL-A-антигенов и субпопуляций лимфоцитов у пациентов с миастенией гравис». Clin. Exp. Иммунол. 21 (2): 202–15. ЧВК 1538268. PMID 1081023.
- ^ Пирсканен Р. (январь 1976 г.). «Генетические ассоциации между миастенией и системой HL-A». J. Neurol. Нейрохирургия. Психиатрия. 39 (1): 23–33. Дои:10.1136 / jnnp.39.1.23. ЧВК 492209. PMID 1255208.
- ^ Кизи Дж., Наим Ф., Линдстрем Дж., Целлер Э., Херрманн С., Уолфорд Р. (1978). «Корреляция между титром антител к рецептору ацетилхолина и антигенами HLA-B8 и HLA-DRw3 при миастении гравис». Trans Am Neurol Assoc. 103: 188–90. PMID 757055.
- ^ Виейра М.Л., Кайлат-Цукман С., Гайдос П., Коэн-Камински С., Кастер А., Бах Дж. Ф. (сентябрь 1993 г.). «Идентификация геномным типированием генов не-DR3 HLA класса II, связанных с миастенией гравис». J. Neuroimmunol. 47 (2): 115–22. Дои:10.1016 / 0165-5728 (93) 90021-П. PMID 8370765.
- ^ Наим Ф., Кизи Дж. К., Херрманн С., Линдстрем Дж., Целлер Э., Уолфорд Р. Л. (ноябрь 1978 г.). «Ассоциация HLA-B8, DRw3 и антител против рецептора ацетилхолина при миастении гравис». Тканевые антигены. 12 (5): 381–6. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01347.x. PMID 85353.
- ^ Hjelmström P, Giscombe R, Lefvert AK, et al. (1995). «Различные HLA-DQ положительно и отрицательно связаны у шведских пациентов с миастенией гравис». Аутоиммунитет. 22 (1): 59–65. Дои:10.3109/08916939508995300. PMID 8882423.
- ^ Маккей И. Р., Моррис П. Дж. (Октябрь 1972 г.). «Ассоциация аутоиммунного хронического активного гепатита с HL-A1,8». Ланцет. 2 (7781): 793–5. Дои:10.1016 / S0140-6736 (72) 92149-6. PMID 4116233.
- ^ Фройденберг Дж., Бауманн Х., Арнольд В., Бергер Дж., Бюшенфельде К. Х. (1977). «HLA при различных формах хронического активного гепатита. Сравнение взрослых пациентов и детей». Пищеварение. 15 (4): 260–70. Дои:10.1159/000198011. PMID 863130.
- ^ Donaldson PT, Doherty DG, Hayllar KM, McFarlane IG, Johnson PJ, Williams R (апрель 1991 г.). «Восприимчивость к аутоиммунному хроническому активному гепатиту: лейкоцитарные антигены человека DR4 и A1-B8-DR3 являются независимыми факторами риска». Гепатология. 13 (4): 701–6. Дои:10.1002 / hep.1840130415. PMID 2010165.
- ^ Манабе К., Дональдсон П.Т., Андерхилл Дж. А. и др. (Декабрь 1993 г.). «Человеческий лейкоцитарный антиген A1-B8-DR3-DQ2-DPB1 * 0401 расширенный гаплотип при аутоиммунном гепатите». Гепатология. 18 (6): 1334–7. Дои:10.1002 / hep.1840180608. PMID 8244257.
- ^ Strettell MD, Thomson LJ, Donaldson PT, Bunce M, O'Neill CM, Williams R (октябрь 1997 г.). «Гены HLA-C и предрасположенность к аутоиммунному гепатиту 1 типа». Гепатология. 26 (4): 1023–6. Дои:10.1002 / hep.510260434. PMID 9328330.
- ^ Андерхилл Дж. А., Дональдсон П. Т., Доэрти Д. Г., Манабе К., Уильямс Р. (апрель 1995 г.). «Полиморфизм HLA DPB при первичном склерозирующем холангите и первичном билиарном циррозе». Гепатология. 21 (4): 959–62. Дои:10.1002 / hep.1840210411. PMID 7705806.
- ^ Muratori P, Czaja AJ, Muratori L, et al. (Март 2005 г.). «Генетические различия между аутоиммунным гепатитом в Италии и Северной Америке». Мир J. Гастроэнтерол. 11 (12): 1862–6. Дои:10.3748 / wjg.v11.i12.1862. ЧВК 4305892. PMID 15793882. Архивировано из оригинал 29 сентября 2011 г.
- ^ Скалли Л.Дж., Тозе С., Сенгар Д.П., Гольдштейн Р. (май 1993 г.). «Ранний аутоиммунный гепатит связан с делецией гена C4A». Гастроэнтерология. 104 (5): 1478–84. Дои:10.1016 / 0016-5085 (93) 90359-К. PMID 8482459.
- ^ Куксон С., Константини П.К., Клэр М. и др. (Октябрь 1999 г.). "Частота и природа полиморфизма генов цитокинов при аутоиммунном гепатите 1 типа". Гепатология. 30 (4): 851–6. Дои:10.1002 / hep.510300412. PMID 10498633.
- ^ Czaja AJ, Carpenter HA, Santrach PJ, Moore SB (январь 1995 г.). «Иммунологические особенности и ассоциации HLA при хроническом вирусном гепатите». Гастроэнтерология. 108 (1): 157–64. Дои:10.1016/0016-5085(95)90020-9. PMID 7806037.
- ^ Volta U, De Franceschi L, Molinaro N и др. (Октябрь 1998 г.). «Частота и значение антиглиадиновых и антиэндомизиальных антител при аутоиммунном гепатите» (PDF). Копать землю. Dis. Наука. 43 (10): 2190–5. Дои:10.1023 / А: 1026650118759. PMID 9790453.
- ^ Эрсилла Дж., Парес А., Арриага Ф. и др. (Ноябрь 1979 г.). «Первичный билиарный цирроз печени, связанный с HLA-DRw3». Тканевые антигены. 14 (5): 449–52. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1979.tb00874.x. PMID 12731577.
- ^ Рубио-Тапиа А., Абдулкарим А.С., Визнер Р.Х., Мур С.Б., Краузе П.К., Мюррей Дж. А. (апрель 2008 г.). «Аутоантитела к целиакии при тяжелом аутоиммунном заболевании печени и эффект трансплантации печени». Печень Инт. 28 (4): 467–76. Дои:10.1111 / j.1478-3231.2008.01681.x. ЧВК 2556252. PMID 18339073.
- ^ Тойфель А., Вёрнс М., Вайнманн А. и др. (Сентябрь 2006 г.). «Генетическая ассоциация аутоиммунного гепатита и лейкоцитарного антигена человека у немецких пациентов». Мир J. Гастроэнтерол. 12 (34): 5513–6. Дои:10.3748 / wjg.v12.i34.5513. ЧВК 4088235. PMID 17006990. Архивировано из оригинал 29 сентября 2011 г.
- ^ Голдберг М.А., Арнетт Ф.С., Биас В.Б., Шульман Л.Е. (1976). «Антигены гистосовместимости при системной красной волчанке». Ревматоидный артрит. 19 (2): 129–32. Дои:10.1002 / арт.1780190201. PMID 1259797.
- ^ Паркс К.Г., Панди Дж. П., Дули М.А. и др. (Июнь 2004 г.). «Генетические полиморфизмы фактора некроза опухоли (TNF) -альфа и TNF-бета в популяционном исследовании системной красной волчанки: ассоциации и взаимодействие с полиморфизмом интерлейкина-1альфа-889 C / T». Гм. Иммунол. 65 (6): 622–31. Дои:10.1016 / j.humimm.2004.03.001. PMID 15219382.
- ^ Беттинотти М.П., Хартунг К., Дейчер Х. и др. (1993). «Полиморфизм гена фактора некроза опухоли бета при системной красной волчанке: гаплотипы TNFB-MHC». Иммуногенетика. 37 (6): 449–54. Дои:10.1007 / BF00222469. PMID 8436420.
- ^ Бишоф Н.А., Велч Т.Р., Бейшель Л.С., Карсон Д., Доннелли, Пенсильвания (июнь 1993 г.). «Полиморфизм DP в расширенных гаплотипах HLA-A1, -B8, -DR3, связанных с мембранопролиферативным гломерулонефритом и системной красной волчанкой». Педиатр. Нефрол. 7 (3): 243–6. Дои:10.1007 / BF00853205. PMID 8100139.
- ^ Кастаньо-Родригес Н., Диас-Галло Л.М., Пинеда-Тамайо Р., Рохас-Вильяррага А., Анайя Дж. М. (февраль 2008 г.). «Мета-анализ полиморфизмов HLA-DRB1 и HLA-DQB1 у латиноамериканских пациентов с системной красной волчанкой». Аутоиммунный Rev. 7 (4): 322–30. Дои:10.1016 / j.autrev.2007.12.002. PMID 18295738.
- ^ Кристиан Н., Смикл М.Ф., ДеЦеллер К., Дэниэлс Л., Валравенс М.Дж., Бартон Э.Н. (март 2007 г.). «Антинуклеарные антитела и аллели HLA класса II у ямайских пациентов с системной красной волчанкой». West Indian Med J. 56 (2): 130–3. Дои:10.1590 / S0043-31442007000200005. PMID 17910142.
- ^ Хирш Т.Дж., Энлоу Р.В., Биас В.Б., Арнетт ФК (октябрь 1981 г.). «HLA-D-родственные (DR) антигены при различных видах миозита». Гм. Иммунол. 3 (2): 181–6. Дои:10.1016/0198-8859(81)90055-0. PMID 6948801.
- ^ Арнетт ФК, Хирш Т.Дж., Биас В.Б., Нишикаи М., Райхлин М. (1981). «Система антител Jo-1 при миозите: связь с клиническими особенностями и HLA». J. Rheumatol. 8 (6): 925–30. PMID 6977032.
- ^ Прайс П, Сантосо Л., Масталья Ф и др. (Ноябрь 2004 г.). «Два основных гаплотипа комплекса гистосовместимости влияют на восприимчивость к спорадическому миозиту с тельцами включения: критическая оценка связи с HLA-DR3». Тканевые антигены. 64 (5): 575–80. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2004.00310.x. PMID 15496200.
- ^ О'Хэнлон Т.П., Каррик Д.М., Арнетт Ф.К. и др. (Ноябрь 2005 г.). «Иммуногенетические факторы риска и защитные факторы для идиопатических воспалительных миопатий: различные аллельные профили и мотивы HLA-A, -B, -Cw, -DRB1 и -DQA1 определяют клинико-патологические группы кавказцев». Медицина (Балтимор). 84 (6): 338–49. Дои:10.1097 / 01.md.0000189818.63141.8c. PMID 16267409.
- ^ Миллер Ф.В., Чен В., О'Ханлон Т.П., Купер Р.Г., Венковски Дж., Райдер Л.Г., Данко К., Веддерберн Л.Р., Лундберг И.Е., Пахман Л.М., Рид А.М., Иттерберг С.Р., Падюков Л., Сельва-О'Каллаган А., Радстейк Т.Р. , Изенберг Д.А., Чиной Х., Оллиер В.Е., Шит П., Пэн Б., Ли А., Бьюн Дж., Лэмб Дж. А., Грегерсен П. К., Амос К. И. (2015). «Полногеномное ассоциативное исследование идентифицирует аллели предкового гаплотипа HLA 8.1 как основные генетические факторы риска фенотипов миозита». Гены и иммунитет. 16 (7): 470–80. Дои:10.1038 / gene.2015.28. ЧВК 4840953. PMID 26291516.