Список секвенированных геномов водорослей - Википедия - List of sequenced algae genomes

Этот список секвенированных геномов водорослей содержит виды водорослей, о которых известно, что они имеют общедоступные полные последовательности генома, которые были собраны, аннотированы и опубликованы. Несобранные геномы не включены, как и последовательности, состоящие только из органелл. Для геномов растений см. список секвенированных геномов растений. Для последовательностей пластид см. список секвенированных пластомов. Для всех королевств см. список секвенированных геномов.

Динофлагелляты (Альвеолаты )

Смотрите также Список секвенированных геномов протистов.

Организм

напряжение

ТипАктуальностьРазмер геномаЧисло

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Breviolum minutum (Симбиодиниум минута; клады B1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт1,5 Гб47,014Окинавский институт науки и технологий2013[1]ПроектМорская геномика OIST[2]
Cladocopium goreaui (Симбиодиниум Goreaui; клады C, тип C1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт1.19 Гб35,913Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / Университет Квинсленда2018[3]ПроектReFuGe 2020[4]
Кладокопиум C92 штамм Y103 (Симбиодиниум sp. клады C; предполагаемый тип C92)ДинофлагеллятаСимбионт фораминиферНеизвестно (размер сборки 0,70 Гб)65,832Окинавский институт науки и технологий2018[5]ПроектМорская геномика OIST[2]
Fugacium kawagutii CS156 = CCMP2468 (Симбиодиниум Кавагути; клады F1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт?1.07 Гб26,609Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / Университет Квинсленда2018[3]ПроектReFuGe 2020[4]
Fugacium kawagutii CCMP2468 (Симбиодиниум Кавагути; клады F1)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт?1.18 Гб36,850Университет Коннектикута / Сямэньский университет2015[6]ПроектС. кавагути геномный проект[7]
Polarella glacialis CCMP1383ДинофлагеллятаПсихрофил, Антарктика3,02 ГБ (диплоид), 1,48 ГБ (гаплоид)58,232Университет Квинсленда2020[8]ПроектUQ eSpace[9]
Polarella glacialis CCMP2088ДинофлагеллятаПсихрофил, Арктика2,65 Гб (диплоид), 1,30 Гб (гаплоид)51,713Университет Квинсленда2020[8]ПроектUQ eSpace[9]
Симбиодиниум микроадриатикум (клад А)ДинофлагеллятаКоралловый симбионт1.1 Гб49,109Университет науки и технологий короля Абдаллы2016[10]ПроектРифовая геномика[11]
Симбиодиниум Штамм A3 Y106 (Симбиодиниум sp. клады A3)ДинофлагеллятасимбионтНеизвестно (размер сборки 0,77 Гб)69,018Окинавский институт науки и технологий2018[5]ПроектМорская геномика OIST[2]

Криптомонады

Организм

напряжение

ТипАктуальностьРазмер геномаЧисло

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Cryptophyceae sp. CCMP2293НанофлагеллятаНуклеоморф, Психрофил534,5 Мб33,051Объединенный институт генома2016[12]Портал генома JGI[13]
Гиллардия тетаЭукариот Эндосимбиоз87,2 Мб24, 840Университет Далхаузи2012[14]Теплица[15]

Глаукофит

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Цианофора

парадокс

Модель

Организм

70,2 Мб3,900Университет Рутгерса2012[16]Проект v1Теплица[15]

Проект генома цианофоры[17]

Цианофора

парадокс

Модель

Организм

99.94 Мб25,831Университет Рутгерса2019[18]Проект v2Проект генома цианофоры[19]

Зеленые водоросли

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Астерохлорис sp. Cgr / DA1phoФотобионт55,8 Мб10,025Университет Дьюка2011[20]Портал генома JGI[13]
Auxenochlorella protothecoidesБиотопливо22.9 Мб7,039Университет Цинхуа2014[21]Теплица[15]
Батикокк празиносСравнительный анализ15,1 Мб7,900Объединенный институт генома2012[22]Портал генома JGI[13]
Хламидомонада Reinhardtii CC-503

cw92 mt +

Модельный организм111,1 Мб17,741Объединенный институт генома2017[23]Фитозом[24]

Теплица[15]

Хлорелла сорокиниана ул. 1228Биотопливо61,4 МбНациональная лаборатория Лос-Аламоса2018[25]Теплица[15]
Хлорелла сорокиниана UTEX 1230Биотопливо58,5 МбНациональная лаборатория Лос-Аламоса2018[26]Теплица[15]
Хлорелла сорокиниана DOE1412Биотопливо57,8 МбНациональная лаборатория Лос-Аламоса2018[27]Теплица[15]
Хлорелла вариабилис NC64AБиотопливо46,2 Мб9,7912010[28]Теплица[15]
Хлорелла обыкновеннаяБиотопливо37,3 МбНациональная возобновляемая энергия

Энергетическая лаборатория

2015[29]Теплица[15]
Coccomyxa subellipsoidea

sp. С-169

Биотопливо48,8 Мб9839Объединенный институт генома2012[30]Фитозом[24]

Теплица[15]

Дуналиелла салина

CCAP19 / 18

Галофил

Биотопливо

Бета-каротин и глицерин производство

343,7 Мб16,697Объединенный институт генома2017[31]Фитозом[24]
Евдорина sp.Многоклеточные водоросли,

модельный организм

~ 180 МбТокийский университет2018[32]
Micromonas commoda NOUM17 (RCC288)морской фитопланктон21.0 Мб10,262Научно-исследовательский институт аквариума Монтерей-Бэй2013[33][34]Портал генома JGI[13]
Микромонас

пустышка CCMP-1545

морской

фитопланктон

21.9 Мб10,575Микромонас

Геном

Консорциум

2009[35]Фитозом[24]

Теплица[15]

Микромонас

пустышка

RCC299 / NOUM17

морской

фитопланктон

20.9 Мб10,056Совместный геном

Институт

2009[35]Фитозом[24]

В

Теплица[15]

Монорафидиум

пренебрежение

Биотопливо69,7 Мб16,755Билефельд

Университет

2013[36]В

Теплица[15]

Остреококк

люцимарин

CCE9901

Маленький геном13.2 Мб7,603Объединенный институт генома2007[37]Фитозом[24]
Остреококк

тавр OTH95

Маленький геном12.9 Мб7,699CNRS2014[38]Теплица[15]
Остреококк sp.

RCC809

Маленький геном13.3 Мб7,492Совместный геном

Институт

2009[39]JGI[40]
Пикохлорум

солоэцизм

DOE101

Биотопливо15.2 Мб7,844Лос-Аламос

Национальная лаборатория

2017[41]Теплица[15]
Пикохлорум

SENEW3

Биотопливо13,5 Мб7,367Университет Рутгерса2014[42]Теплица[15]
Scenedesmus

косой DOE0152Z

Биотопливо210,3 МбБруклинский колледж2017[43]Теплица[15]
Symbiochloris reticulata (Метагеном)Фотобионт58,6 Мб12,720Объединенный институт генома2018[44]Портал генома JGI[13]
Tetraselmis sp.Биотопливо228 МбЛос-Аламос

Национальная лаборатория

2018[15]Теплица[15]
Volvox carteriМногоклеточные водоросли,

модельный организм

131,2 Мб14,247Совместный геном

Институт

2010[45]Фитозом[24]

В

Теплица[15]

Ямагишиелла unicoccaМногоклеточные водоросли,

модельный организм

~ 140 МбТокийский университет2018[32]

Гаптофит

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Хризохромулина

парва

Биотопливо65,8 МбЛос-Аламосская национальная лаборатория2018[46]Теплица[15]
Chrysochromulina tobinii CCMP291Модельный организм, Биотопливо59,1 Мб16,765Вашингтонский университет2015[47]Теплица[15]
Эмилиания ХакслиКокколитофораПроизводство алкенона, цветение водорослей167,7 Мб38,554Объединенный институт генома2013[48]Теплица[15]
Павловалес sp. CCMP2436Психрофил165,4 Мб26,034Объединенный институт генома2016[49]Портал генома JGI[13]

Гетероконц /Страменопилы

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Ауреококк

анофагеференс

Вредные водоросли

цвести

50.1 Мб11,522Объединенный институт генома2011[50]Теплица[15]
Ectocarpus siliculosusБурые водорослиМодельный организм198,5 Мб16,269Геноскоп2012[51]Теплица[15]
Fragilariopsis cylindrus CCMP1102Психрофил61,1 Мб21,066Университет Восточной Англии, Объединенный институт генома2017[52]Портал генома JGI[13]
Нанохлоропсис

гадитана

Биотопливо28,5 Мб10,486Университет Падуи2014[53]Теплица[15]
Нанохлоропсис

Oceanica

Биотопливо31,5 МбКитайская Академия Наук, Циндаоский институт биоэнергетики и биотехнологий2016[54]Теплица[15]
Нанохлоропсис Салина CCMP1766Биотопливо24,4 МбКитайская Академия Наук, Циндаоский институт биоэнергетики и биотехнологий2016[55]Теплица[15]
Ochromonadaceae sp. CCMP2298Психрофил61,1 Мб20,195Объединенный институт генома2016[56]Портал генома JGI[13]
Pelagophyceae sp. CCMP2097Психрофил85,2 Мб19,402Объединенный институт генома2016[57]Портал генома JGI[13]
Phaeodactylum tricornutumМодельный организм27,5 Мб10,408Консорциум диатомовых водорослей2008[58]Теплица[15]
Псевдо-ницския многосерийный CLN-47218,7 Мб19,703Объединенный институт генома2011[59]Портал генома JGI[13]
Сахарина японскаяБурые водорослиКоммерческая культура543,4 МбКитайская Академия Наук, Пекинский институт наук о жизни2015[60]Теплица[15]
Thalassiosira oceanica CCMP 1005Модельный организм92,2 Мб34,642Будущий океан2012[61]Теплица[15]
Thalassiosira pseudonanaмодельный организм32,4 Мб11,673Консорциум диатомовых водорослей2009[62]Теплица[15]

Красные водоросли (родофит)

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Chondrus crispusКаррагинан продукция, модельный организм105 Мб9,606Геноскоп2013Теплица[15]
Cyanidioschyzon

мерола 10D

Модель

организм

16,5 Мб4,775Национальный институт

генетики, Япония

2007[63]Теплица[15]
Galdieria sulphurariaЭкстремофил12,1 МбЙоркский университет2016[64]Теплица[15]
Грацилариопсис хордаМезофил92,1 Мб10,806Sungkyunkwan University2018[65]
Порфиридий пурпурныйМезофил19,7 Мб8,355Университет Рутгерса2013[66]
Порфира пупочнаяМарикультура87,6 Мб13,360Университет штата Мэн2017[67]Фитозом[24]
Pyropia yezoensisМарикультура43,5 Мб10,327Национальный исследовательский институт рыбного хозяйства2013[68]

Ризария

Организм

напряжение

ТипАктуальностьГеном

размер

Число

генов

предсказанный

ОрганизацияГод

завершение

сборка

положение дел

Ссылки
Bigelowiella natansМодельный организм94. Мб21,708Университет Далхаузи2012[14]Теплица[15]

Рекомендации

  1. ^ Сёгути Э., Синдзато Ч., Кавасима Т., Гёджа Ф., Мунгпакди С., Коянаги Р. и др. (2013). «Проект сборки Симбиодиниум минутный ядерный геном показывает структуру гена динофлагеллят ». Текущая биология. 25 (15): 1399–1408. Дои:10.1016 / j.cub.2013.05.062. PMID  23850284.
  2. ^ а б c "Морская геномика OIST". marinegenomics.oist.jp. Получено 2018-08-22.
  3. ^ а б Лю Х., Стивенс Т.Г., Гонсалес-Печ Р.А., Белтран В.Х., Лапейре Б., Бонгаертс П. и др. (2018). "Симбиодиниум геномы показывают адаптивную эволюцию функций, связанных с симбиозом кораллов и динофлагеллат ». Биология коммуникации. 1: 95. Дои:10.1038 / с42003-018-0098-3. ЧВК  6123633. PMID  30271976.
  4. ^ а б "Сайт данных ReFuGe 2020". Убежище2020.reefgenomics.org. Получено 2018-08-22.
  5. ^ а б Сегучи Э., Бедесси Дж., Тада I, Хисата К., Кавасима Т., Такеучи Т. и др. (2018). "Два расходящихся Симбиодиниум геномы показывают сохранение кластера генов для биосинтеза солнцезащитного крема и недавно утраченных генов ". BMC Genomics. 19 (1): 458. Дои:10.1186 / s12864-018-4857-9. ЧВК  6001144. PMID  29898658.
  6. ^ Lin S, Cheng S, Song B, Zhong X, Lin X, Li W и др. (2015). "The Симбиодиниум кавагути геном освещает экспрессию гена динофлагеллят и коралловый симбиоз ». Наука. 350 (6261): 691–4. Bibcode:2015Научный ... 350..691Л. Дои:10.1126 / science.aad0408. PMID  26542574.
  7. ^ "С. кавагути сайт данных ". web.malab.cn/symka_new. Получено 2018-08-22.
  8. ^ а б Стивенс Т.Г., Гонсалес-Печ Р.А., Ченг Й., Мохамед А.Р., Берт Д.В., Бхаттачарья Д. и др. (2020). «Геномы динофлагелляты Polarella glacialis кодируют тандемно повторяющиеся гены с одним экзоном с адаптивными функциями ". BMC Биология. 18 (1): 56. Дои:10.1186 / s12915-020-00782-8. ЧВК  7245778. PMID  32448240.
  9. ^ а б Стивенс, Тимоти; Раган, Марк; Бхаттачарья, Дебашиш; Чан, Чеонг Синь (2020). "Polarella сайт данных ". Дои:10.14264 / uql.2020.222. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  10. ^ Аранда М., Ли Ю., Лью Ю.Дж., Баумгартен С., Симаков О., Уилсон М.К. и др. (2016). «Геномы коралловых симбионтов с динофлагеллятами подчеркивают эволюционные адаптации, способствующие симбиотическому образу жизни». Научные отчеты. 6: 39734. Bibcode:2016НатСР ... 639734А. Дои:10.1038 / srep39734. ЧВК  5177918. PMID  28004835.
  11. ^ "Сайт данных Reef Genomics". smic.reefgenomics.org. Получено 2018-08-22.
  12. ^ "Информация - Cryptophyceae sp. CCMP2293 v1.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  13. ^ а б c d е ж грамм час я j «Водоросли». genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  14. ^ а б Кертис Б.А., Танифуджи Г., Бурки Ф., Грубер А., Иримиа М., Маруяма С. и др. (Декабрь 2012 г.). «Геномы водорослей раскрывают эволюционный мозаицизм и судьбу нуклеоморфов». Природа. 492 (7427): 59–65. Bibcode:2012Натура 492 ... 59С. Дои:10.1038 / природа11681. PMID  23201678.
  15. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй "Дом | Теплица". greenhouse.lanl.gov. Получено 2018-07-11.
  16. ^ Price DC, Chan CX, Yoon HS, Yang EC, Qiu H, Weber AP и др. (Февраль 2012 г.). «Геном Cyanophora paradoxa выясняет происхождение фотосинтеза у водорослей и растений». Наука. 335 (6070): 843–7. Bibcode:2012Sci ... 335..843P. Дои:10.1126 / science.1213561. PMID  22344442. S2CID  17190180.
  17. ^ "Проект генома цианофоры". cyanophora.rutgers.edu. Получено 2018-07-12.
  18. ^ Прайс Д.С., Гудинаф Ю.В., Рот Р., Ли Дж. Х., Кариявасам Т., Мутвил М. и др. (Август 2019 г.). "Анализ улучшенного Cyanophora paradoxa сборка генома ". ДНК исследования. 26 (4): 289–299. Дои:10.1093 / dnares / dsz009. ЧВК  6704402. PMID  31098614.
  19. ^ "Проект Cyanophora Genome v2". cyanophora.rutgers.edu/cyanophora_v2018. Получено 2019-08-01.
  20. ^ "Информация - Asterochloris sp. Cgr / DA1pho v2.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  21. ^ Гао Ц., Ван И, Шен И, Ян Д., Хе Х, Дай Дж, Ву Ц. (июль 2014 г.). «Механизмы накопления масла маслянистой микроводоросли Chlorella protothecoides, выявленные через ее геном, транскриптомы и протеомы». BMC Genomics. 15: 582. Дои:10.1186/1471-2164-15-582. ЧВК  4111847. PMID  25012212.
  22. ^ Моро Х., Верхелст Б., Кулу А., Дерелль Е., Ромбо С., Гримсли Н. и др. (Август 2012 г.). «Функции генов и структура генома у Bathycoccus prasinos отражают клеточную специализацию, лежащую в основе зеленой линии». Геномная биология. 13 (8): R74. Дои:10.1186 / gb-2012-13-8-r74. ЧВК  3491373. PMID  22925495.
  23. ^ «Фитозом». phytozome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-12.
  24. ^ а б c d е ж грамм час «Фитозом». phytozome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-12.
  25. ^ «CSI_1228 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  26. ^ «ASM313072v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  27. ^ «ASM311615v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  28. ^ Блан Дж., Дункан Дж., Агаркова И., Бородовский М., Гурнон Дж., Куо А. и др. (Сентябрь 2010 г.). «Геном Chlorella variabilis NC64A показывает адаптацию к фотосимбиозу, коэволюции с вирусами и загадочному полу». Растительная клетка. 22 (9): 2943–55. Дои:10.1105 / tpc.110.076406. ЧВК  2965543. PMID  20852019.
  29. ^ «ASM102112v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  30. ^ «Coccomyxa subellipsoidae v2.0 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  31. ^ «Dsal_v1.0 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-13.
  32. ^ а б Хамаджи, Такаши; Каваи-Тоёока, Хироко; Учимура, Харука; Сузуки, Масахиро; Ногучи, Хидеки; Минакучи, Йохей; Тойода, Ацуши; Фудзияма, Асао; Миягишима, Син-я (2018-03-08). «Анизогамия эволюционировала с уменьшением области определения пола у вольвоциновых зеленых водорослей». Биология коммуникации. 1 (1): 17. Дои:10.1038 / с42003-018-0019-5. ISSN  2399-3642. ЧВК  6123790. PMID  30271904.
  33. ^ «Информация - Micromonas commoda NOUM17 (RCC 299)». genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  34. ^ Worden AZ, Lee JH, Mock T, Rouzé P, Simmons MP, Aerts AL, et al. (Апрель 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas». Наука. 324 (5924): 268–72. Bibcode:2009Sci ... 324..268W. Дои:10.1126 / science.1167222. PMID  19359590. S2CID  206516961.
  35. ^ а б Worden AZ, Lee JH, Mock T, Rouzé P, Simmons MP, Aerts AL, et al. (Апрель 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas». Наука. 324 (5924): 268–72. Bibcode:2009Sci ... 324..268W. Дои:10.1126 / science.1167222. PMID  19359590. S2CID  206516961.
  36. ^ Боген С., Аль-Дилаими А., Альберсмайер А., Вичманн Дж., Грундманн М., Рупп О. и др. (Декабрь 2013). «Реконструкция липидного обмена микроводоросли Monoraphidium neglectum по последовательности ее генома позволяет выявить характеристики, пригодные для производства биотоплива». BMC Genomics. 14: 926. Дои:10.1186/1471-2164-14-926. ЧВК  3890519. PMID  24373495.
  37. ^ Паленик Б., Гримвуд Дж., Аэртс А., Рузе П., Саламов А., Патнэм Н. и др. (Май 2007 г.). «Крошечный эукариот Ostreococcus дает геномное понимание парадокса видообразования планктона». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (18): 7705–10. Bibcode:2007ПНАС..104.7705П. Дои:10.1073 / pnas.0611046104. ЧВК  1863510. PMID  17460045.
  38. ^ Blanc-Mathieu R, Verhelst B, Derelle E, Rombauts S, Bouget FY, Carré I и др. (Декабрь 2014 г.). «Усовершенствованный геном модельной морской водоросли Ostreococcus tauri раскрывается при оценке сборок Illumina de novo». BMC Genomics. 15 (1): 1103. Дои:10.1186/1471-2164-15-1103. ЧВК  4378021. PMID  25494611.
  39. ^ «Информация - Ostreococcus sp. RCC809». genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-16.
  40. ^ «Домашний - Ostreococcus sp. RCC809». genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-26.
  41. ^ Гонсалес-Эскер ЧР, Твари С.Н., Ховде Б.Т., Старкенбург С.Р. (январь 2018 г.). «Picochlorum soloecismus». Анонсы генома. 6 (4): e01498–17. Дои:10.1128 / genomeA.01498-17. ЧВК  5786678. PMID  29371352.
  42. ^ Foflonker F, Price DC, Qiu H, Palenik B, Wang S, Bhattacharya D (февраль 2015 г.). «Геном галотолерантной зеленой водоросли Picochlorum sp. Раскрывает стратегии роста в меняющихся условиях окружающей среды». Экологическая микробиология. 17 (2): 412–26. Дои:10.1111/1462-2920.12541. PMID  24965277. S2CID  23615707.
  43. ^ Starkenburg SR, Polle JE, Hovde B, Daligault HE, Davenport KW, Huang A и др. (Август 2017 г.). "Scenedesmus obliquus Штамм DOE0152z". Анонсы генома. 5 (32). Дои:10.1128 / genomeA.00617-17. ЧВК  5552973. PMID  28798164.
  44. ^ "Информация - Symbiochloris reticulata Africa извлеченный метагеном v1.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  45. ^ Прочник С.Е., Умен Дж., Недельку А.М., Халльманн А., Миллер С.М., Ниший И. и др. (Июль 2010 г.). «Геномный анализ организационной сложности многоклеточной зеленой водоросли Volvox carteri». Наука. 329 (5988): 223–6. Bibcode:2010Sci ... 329..223P. Дои:10.1126 / science.1188800. ЧВК  2993248. PMID  20616280.
  46. ^ «ASM288719v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-11.
  47. ^ «Ctobinv2 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-27.
  48. ^ Прочтите BA, Kegel J, Klute MJ, Kuo A, Lefebvre SC, Maumus F, et al. (Июль 2013). «Пангеном фитопланктона Emiliania лежит в основе его глобального распространения». Природа. 499 (7457): 209–13. Bibcode:2013Натура.499..209.. Дои:10.1038 / природа12221. PMID  23760476.
  49. ^ "Информация - Pavlovales sp. CCMP2436 v1.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-07-31.
  50. ^ Gobler CJ, Berry DL, Dyhrman ST, Wilhelm SW, Salamov A, Lobanov AV, et al. (Март 2011 г.). «Ниша вредоносной водоросли Aureococcus anophagefferens, выявленная с помощью экогеномики». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (11): 4352–7. Bibcode:2011PNAS..108.4352G. Дои:10.1073 / pnas.1016106108. ЧВК  3060233. PMID  21368207.
  51. ^ «ASM31002v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-11.
  52. ^ Mock T, Otillar RP, Strauss J, McMullan M, Paajanen P, Schmutz J, et al. (Январь 2017 г.). «Эволюционная геномика адаптированной к холоду диатомеи Fragilariopsis cylindrus». Природа. 541 (7638): 536–540. Bibcode:2017Натура.541..536М. Дои:10.1038 / природа20803. HDL:10754/622831. PMID  28092920.
  53. ^ Corteggiani Carpinelli E, Telatin A, Vitulo N, Forcato C, D'Angelo M, Schiavon R и др. (Февраль 2014). «Сборка генома в масштабе хромосом и профилирование транскриптома Nannochloropsis gaditana при истощении азота». Молекулярный завод. 7 (2): 323–35. Дои:10.1093 / mp / sst120. PMID  23966634.
  54. ^ «ASM187094v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-26.
  55. ^ «ASM161424v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-26.
  56. ^ "Информация - Ochromonadaceae sp. CCMP2298 v1.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-08-02.
  57. ^ "Информация - Pelagophyceae sp. CCMP2097 v1.0". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-08-02.
  58. ^ "Phaeodactylum tricornutum (ID 418) - Геном - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-26.
  59. ^ "Инфо - Псевдо-нитцския многосерийная CLN-47". genome.jgi.doe.gov. Получено 2018-08-02.
  60. ^ «SJ6.1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-27.
  61. ^ Цзян З, Лю С., Ву И, Цзян Х, Чжоу К. (2017). «Разнообразие млекопитающих Китая (2-е издание)». Наука о биоразнообразии. 25 (8): 886–895. Дои:10.17520 / biods.2017098.
  62. ^ «ASM14940v2 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-27.
  63. ^ Нодзаки Х., Такано Х., Мисуми О, Терасава К., Мацузаки М., Маруяма С. и др. (Июль 2007 г.). «100% полная последовательность выявляет необычно простые геномные особенности красной водоросли Cyanidioschyzon merolae из горячего источника». BMC Биология. 5: 28. Дои:10.1186/1741-7007-5-28. ЧВК  1955436. PMID  17623057.
  64. ^ «ASM170485v1 - Геном - Сборка - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-07-30.
  65. ^ Ли Дж., Ян Э.С., Граф Л., Ян Дж. Х., Цю Х., Зелзион У и др. (2018-04-23). «Анализ проекта генома красных водорослей. Грацилариопсис хорда дает представление об эволюции размера генома у Rhodophyta ". Молекулярная биология и эволюция. 35 (8): 1869–1886. Дои:10.1093 / molbev / msy081. PMID  29688518.
  66. ^ Бхаттачарья Д., Прайс Д.С., Чан С.Х., Цю Х., Роуз Н., Болл С. и др. (2013-06-17). «Геном красной водоросли Porphyridium purpureum». Nature Communications. 4 (1): 1941. Bibcode:2013 НатКо ... 4.1941B. Дои:10.1038 / ncomms2931. ЧВК  3709513. PMID  23770768.
  67. ^ Brawley SH, Blouin NA, Ficko-Blean E, Wheeler GL, Lohr M, Goodson HV и др. (Август 2017 г.). «Porphyra umbilicalis (Bangiophyceae, Rhodophyta)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 114 (31): E6361 – E6370. Дои:10.1073 / pnas.1703088114. ЧВК  5547612. PMID  28716924.
  68. ^ Накамура Ю., Сасаки Н., Кобаяши М., Одзима Н., Ясуике М., Сигенобу Ю. и др. (2013-03-11). «Первая последовательность генома морской красной водоросли Susabi-nori (Pyropia yezoensis), не содержащая симбионтов». PLOS ONE. 8 (3): e57122. Bibcode:2013PLoSO ... 857122N. Дои:10.1371 / journal.pone.0057122. ЧВК  3594237. PMID  23536760.