Рибосомный белок s6 - Ribosomal protein s6

RPS6
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4D5L, 4UJE, 5FLX, 4UJC, 3J7P, 4КЗЗ, 4UJD, 4KZY, 4D61, 3J7R, 4KZX
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS6, S6, рибосомный белок S6
Внешние идентификаторы	OMIM: 180460 MGI: 98159 ГомолоГен: 85949 Генные карты: RPS6
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 9 (человек)
Конец	19,380,236 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 4 (мышь)
Конец	86,857,412 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• структурная составляющая рибосомы; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание протеинкиназы; • Связывание РНК;
Сотовый компонент	• Тело клетки; • цитозоль; • рибосома; • мембрана; • внутриклеточный; • ядрышко; • малая рибосомная субъединица; • цитоплазматическая гранула рибонуклеопротеина; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • полисом; • цитозольная малая рибосомная субъединица; • дендрит; • перинуклеарная область цитоплазмы; • эндоплазматический ретикулум; • рибонуклеопротеин;
Биологический процесс	• вирусная транскрипция; • SRP-зависимый котрансляционный белок, нацеленный на мембрану; • Сигнализация TOR; • положительная регуляция апоптотического процесса; • трансляционная инициация; • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, нонсенс-опосредованный распад; • биосинтез белка; • Фаза G1; • GO: 0007067 митотический клеточный цикл; • плацентация; • Пролиферация Т-клеток, участвующих в иммунном ответе; • обработка рРНК; • вызванная активацией клеточная гибель Т-клеток; • контрольная точка митотического клеточного цикла; • гаструляция; • стадия оогенеза; • Дифференцировка Т-клеток в тимусе; • биогенез малых субъединиц рибосом; • гомеостаз глюкозы; • отрицательная регуляция апоптотического процесса; • развитие эритроцитов; • G1 / S переход митотического клеточного цикла;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6194
	20104
	ENSG00000137154
	ENSMUSG00000028495
	P62753
	P62754
	NM_001010
	NM_009096
	NP_001001
	NP_033122
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Рибосомный белок S6 (rpS6 или eS6) является составной частью 40S рибосомная субъединица и поэтому участвует в перевод. Исследования на мышах показали, что фосфорилирование eS6 участвует в регуляции размер ячейки, распространение клеток, и гомеостаз глюкозы.^[5]^[6]^[7]

Исследования показывают, что киназы рибосомного протеина S6 p70 (S6K1 и S6K2 ) и киназы рибосомного протеина S6 p90 (RSK ) оба фосфорилируют eS6 и что S6K1 и S6K2 преобладают над этой функцией.

Было обнаружено, что пути, ведущие к индукции фосфорирования eS6 человека, усиливают Ил-8 синтез белка. Этот механизм зависит от A / U-богатых проксимальных последовательностей (APS), обнаруженных в 3'UTR IL-8 сразу после стоп-кодона.^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137154 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000028495 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Рувинский И., Шарон Н., Лерер Т., Коэн Х., Столович-Рейн М., Нир Т. и др. (Сентябрь 2005 г.). «Фосфорилирование рибосомного белка S6 является определяющим фактором размера клеток и гомеостаза глюкозы». Гены и развитие. 19 (18): 2199–211. Дои:10.1101 / gad.351605. ЧВК 1221890. PMID 16166381.
^ Рувинский И., Меюхас О. (июнь 2006 г.). «Фосфорилирование рибосомного белка S6: от синтеза белка до размера клетки». Тенденции в биохимических науках. 31 (6): 342–8. Дои:10.1016 / j.tibs.2006.04.003. PMID 16679021.
^ Рувинский И., Кац М., Дриазен А., Гельчинский Ю., Саада А., Фридман Н. и др. (Май 2009 г.). «Мыши с дефицитом фосфорилирования рибосомного белка S6 страдают от мышечной слабости, что отражает дефект роста и дефицит энергии». PLOS ONE. 4 (5): e5618. Bibcode:2009PLoSO ... 4.5618R. Дои:10.1371 / journal.pone.0005618. ЧВК 2682700. PMID 19479038.
^ Анг З., Абди Гунаван Коэн Р., Эр Дж. З., Ли LT, Там Кит Чунг Дж., Го Х, Дин Дж. Л. (2019). «Новые AU-богатые проксимальные последовательности UTR (APS) усиливают синтез CXCL8 после индукции фосфорилирования rpS6». PLOS Genet. 15 (4): e1008077. Дои:10.1371 / journal.pgen.1008077. ЧВК 6476525. PMID 30969964.

внешние ссылки

Рибосомальный + белок + S6 в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P62753 (Человеческий рибосомный белок 40S S6) на PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137154 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000028495 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid16166381-5] Рувинский И., Шарон Н., Лерер Т., Коэн Х., Столович-Рейн М., Нир Т. и др. (Сентябрь 2005 г.). «Фосфорилирование рибосомного белка S6 является определяющим фактором размера клеток и гомеостаза глюкозы». Гены и развитие. 19 (18): 2199–211. Дои:10.1101 / gad.351605. ЧВК 1221890. PMID 16166381.

[6] Рувинский И., Меюхас О. (июнь 2006 г.). «Фосфорилирование рибосомного белка S6: от синтеза белка до размера клетки». Тенденции в биохимических науках. 31 (6): 342–8. Дои:10.1016 / j.tibs.2006.04.003. PMID 16679021.

[7] Рувинский И., Кац М., Дриазен А., Гельчинский Ю., Саада А., Фридман Н. и др. (Май 2009 г.). «Мыши с дефицитом фосфорилирования рибосомного белка S6 страдают от мышечной слабости, что отражает дефект роста и дефицит энергии». PLOS ONE. 4 (5): e5618. Bibcode:2009PLoSO ... 4.5618R. Дои:10.1371 / journal.pone.0005618. ЧВК 2682700. PMID 19479038.

[pmid25633224-8] Анг З., Абди Гунаван Коэн Р., Эр Дж. З., Ли LT, Там Кит Чунг Дж., Го Х, Дин Дж. Л. (2019). «Новые AU-богатые проксимальные последовательности UTR (APS) усиливают синтез CXCL8 после индукции фосфорилирования rpS6». PLOS Genet. 15 (4): e1008077. Дои:10.1371 / journal.pgen.1008077. ЧВК 6476525. PMID 30969964.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]