TMEM126B - Википедия - TMEM126B

TMEM126B
Идентификаторы
ПсевдонимыTMEM126B, HT007, трансмембранный белок 126B
Внешние идентификаторыOMIM: 615533 MGI: 1915722 ГомолоГен: 10222 Генные карты: TMEM126B
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

55863

68472

Ансамбль

ENSG00000171204

ENSMUSG00000030614

UniProt

Q8IUX1

Q9D1R1

RefSeq (мРНК)

NM_001193537
NM_001193538
NM_001256546
NM_001256547
NM_018480

NM_026734

RefSeq (белок)

NP_081010

Расположение (UCSC)н / дChr 7: 90.47 - 90.48 Мб
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Трансмембранный белок 126B это белок что у людей кодируется TMEM126B ген.[4][5] TMEM126B - митохондриальный трансмембранный белок который является компонентом комплекса сборки митохондриального комплекса I. В TMEM126B ген законсервирован у млекопитающих.[6] Кодируемый белок служит фактором сборки, который необходим для образования мембранного плеча комплекса. Он взаимодействует с НАДН дегидрогеназа Фактор сборки субкомплекса [убихинон] 1 альфа 13. Встречается в природе мутации в этом гене связаны с изолированным дефицитом комплекса I. А псевдоген этого гена был определен на хромосома 9.[4]

Структура

TMEM126B расположен на q рука из хромосома 11 в позиции 14.1 и имеет 7 экзоны.[4] В TMEM126B ген продуцирует белок 4,6 кДа, состоящий из 54 аминокислоты.[7][8]Это часть митохондриальный комплекс I сборочный (MCIA) комплекс, состоящий из NDUFAF1, ECSIT, и ACAD9 (по сходству). Он ассоциируется с промежуточным субкомплексом 370 кДа не полностью собранного комплекса I.[9] Комплекс I состоит из 45 эволюционно консервативных ядерных субъединиц, включая обе митохондриальная ДНК и субъединицы, кодируемые ядром. Одно из его плеч встроено в внутренняя мембрана митохондрий, а другой встроен в органелла. Два плеча расположены в L-образной конфигурации. Общая молекулярный вес площади комплекса составляет 1МДа.[10] Карикатурное изображение предполагаемой ориентации TMEM126B внутри клеточной мембраны, ориентировочно на основе фосфорилирование[11] и данные гидрофобности[12] показано ниже.

Tmem126B cartoon2.jpg

Функция

В TMEM126B ген кодирует митохондриальный трансмембранный белок который является компонентом комплекса сборки митохондриального комплекса I. Кодируемый белок служит фактором сборки, который необходим для образования мембранного плеча комплекса.[4] TMEM126B совместим с другими факторами сборки, включая ACAD9, CIA30, и ECSIT. В отсутствие TMEM126B такие факторы сборки не использовались в митохондриальная мембрана, и в сложной I сборке не участвовал. Известно, что дисфункция TMEM126B вызывает несколько осложнений в комплексе I, характеризующихся серьезными трудностями в митохондриальное дыхание и полный отказ сложной I сборки. Однако не известно, что он оказывает существенное влияние на ансамбли митохондриальных комплексов III, IV и V.[13]

Клиническое значение

Мутации в TMEM126B как известно, приводит к митохондриальным заболеваниям и связанным с ними нарушениям. Это в основном связано с дефицитом комплекса I, дефицитом первого комплекса митохондриальная дыхательная цепь.[4] Дефицит комплекса I, связанный с дисфункцией митохондриальная дыхательная цепь может вызывать широкий спектр клинических проявлений от летального неонатального заболевания до нейродегенеративных расстройств у взрослых. Фенотипы включают макроцефалия с прогрессивным лейкодистрофия, неспецифический энцефалопатия, кардиомиопатия, Синдром Ли, миопатия, болезнь печени, Наследственная оптическая нейропатия Лебера, и некоторые формы болезнь Паркинсона.[9] Помимо дефицита комплекса I, TMEM126B мутации также показывают связь с тяжелыми мультисистемными расстройствами в младенчестве, такими как хронические почечная недостаточность и кардиомиопатия, и миопатия в детстве или в зрелом возрасте.[13]

Открытие

TMEM126B был впервые обнаружен при изучении экспрессии белка в тканях гипоталамус -гипофиз -надпочечник ось с использованием полного кДНК клонирование.[5] С тех пор он был обнаружен в других тканях.[14]

Ген

TMEM126B находится на хромосома 11 у человека, между которыми находятся следующие гены:[15]

Перевод

Концептуальный перевод белка TMEM126B, включая проекцию вторичная структура,[18] предсказания трансмембранных регионов,[12] и предполагаемое фосфорилирование[11] и сайты гликирования[19] включен ниже:

Белки человека - Концептуальный перевод TMEM126B.png

Распределение тканей

TMEM126B экспрессируется в большинстве ткань типы, за заметными исключениями жировая ткань, ухо ткань, гортань, лимфа ткань, нерв ткань, гипофиз, селезенка, вилочковая железа, щитовидная железа, трахея, и пуповина.[20] Это также, по-видимому, сильно выражено в паращитовидная железа, Костный мозг, и мочевой пузырь ткань.[20] Есть также свидетельства того, что один из изоформы TMEM126B выражается в клеточная мембрана из В-клетки памяти из адаптивная иммунная система.[21]
Tmem126B expression.png

Прогнозируемые свойства

Следующие свойства TMEM126B были предсказаны с использованием биоинформатический анализ:

Взаимодействия

Помимо ко-субъединиц для комплекса I, TMEM126B имеет белок-белковые взаимодействия с ECSIT, NDUFAF1, NDUFC2, NDUFA13, и другие.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030614 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ а б c d е «Ген Энтреза: трансмембранный белок 126B».
  5. ^ а б Ху РМ, Хан З.Г., Сонг ХД, Пэн Ю.Д., Хуанг К.Х., Рен С.Х. и др. (Август 2000 г.). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS ... 97.9543H. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.
  6. ^ «Результаты HomoloGene: трансмембранный белок TMEM126B 126B».
  7. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS и др. (Октябрь 2013). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины с помощью специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
  8. ^ Яо, Даниэль. "Атлас кардиоорганических белков" База знаний (COPaKB) - Информация о белках ". amino.heartproteome.org. Получено 2018-07-27.
  9. ^ а б c «Комплекс I сборочного фактора TMEM126B, митохондриальный». www.uniprot.org. Получено 2018-07-27.
  10. ^ Райн В.Ф., Кэрролл Дж., Динг С., Фернли И.М., Уокер Дж. Э. (июль 2016 г.). «NDUFAF5 гидроксилаты NDUFS7 на ранней стадии сборки человеческого комплекса I». Журнал биологической химии. 291 (28): 14851–60. Дои:10.1074 / jbc.M116.734970. ЧВК  4938201. PMID  27226634.
  11. ^ а б c "Прогнозы NetPhos 2.0 для TMEM126B".
  12. ^ а б Перссон Б., Аргос П. (март 1994 г.). «Прогнозирование трансмембранных сегментов в белках с использованием множественного выравнивания последовательностей». Журнал молекулярной биологии. 237 (2): 182–92. Дои:10.1006 / jmbi.1994.1220. PMID  8126732.
  13. ^ а б Alston CL, Compton AG, Formosa LE, Strecker V, Oláhová M, Haack TB и др. (Июль 2016 г.). «Двуаллельные мутации в TMEM126B вызывают серьезный дефицит комплекса I с различным клиническим фенотипом». Американский журнал генетики человека. 99 (1): 217–27. Дои:10.1016 / j.ajhg.2016.05.021. ЧВК  5005451. PMID  27374774.
  14. ^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, et al. (Декабрь 2002 г.). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
  15. ^ «TMEM126B в Map Viewer».
  16. ^ «Ген Entrez: трансмембранный белок TMEM126A 126A».
  17. ^ «Протеин OMIM Zhangfei».
  18. ^ Берджесс А. В., Поннусвами П. К., Шерага Н. А. (1974). «Анализ конформации аминокислотных остатков и прогноз топографии остова в белках». Израильский химический журнал. 12 (1–2): 239–286. Дои:10.1002 / ijch.197400022.
  19. ^ а б "Прогнозы NetGlycate 1.0 для TMEM126B".
  20. ^ а б "Профиль EST - Hs.525063".
  21. ^ «КЛЕТКИ, ПРИНАДЛЕЖАЩИЕ АДАПТИВНОЙ ИММУННОЙ СИСТЕМЕ, ВЫРАЖАЮЩИЕ PAQ ISOFORM OF TMEM126B».
  22. ^ Брендель В., Бухер П., Нурбахш И. Р., Блейсделл Б. Е., Карлин С. (март 1992 г.). «Методы и алгоритмы статистического анализа белковых последовательностей». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 89 (6): 2002–6. Bibcode:1992PNAS ... 89.2002B. Дои:10.1073 / пнас.89.6.2002. ЧВК  48584. PMID  1549558.
  23. ^ а б «Программа PI (прогнозирование изоэлектрической точки)». Архивировано из оригинал на 2008-10-26.
  24. ^ Бендцен Дж. Д., Нильсен Х., фон Хейне Г., Брунак С. (июль 2004 г.). «Улучшенное предсказание сигнальных пептидов: SignalP 3.0». Журнал молекулярной биологии. 340 (4): 783–95. CiteSeerX  10.1.1.165.2784. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.05.028. PMID  15223320.

дальнейшее чтение