COQ7 - COQ7
Митохондриальная 5-деметоксиубихинон гидроксилаза (DMQ гидроксилаза), также известный как коэнзим Q7, гидроксилаза, является фермент что у людей кодируется COQ7 ген. В clk-1 (часы-1) ген кодирует это белок это необходимо для убихинон биосинтез у червя Caenorhabditis elegans и другие эукариоты. В мышь версия гена называется mclk-1 и гомолог человека, плодовой мухи и дрожжей COQ7 (белок биосинтеза кофермента Q 7).[5][6]
CLK-1 не следует путать с неродственным человеческим белком. CLK1 который играет роль в Сплайсинг РНК.
Структура
Белок имеет два повтора примерно по 90 аминокислоты, которые содержат два консервативных мотива, которые, как предполагается, важны для координации железа. Структура и функция гена высоко консервативны у разных видов.[7]
В C. elegans белок содержит 187 аминокислотных остатков (20 килодальтон ), у человеческого гомолога 217 аминокислотных остатков (24 килодальтона, ген, состоящий из шести экзоны охватывающий 11 кб и расположенный на хромосома 16 ).[8]
Митохондриальная функция
Убихинон является небольшой окислительно-восстановительной активностью липид который содержится в большинстве клеточных мембран, где он действует как кофактор в многочисленных клеточных окислительно-восстановительных процессах, в том числе митохондриальный электронный транспорт. В качестве кофактора убихинон часто участвует в процессах, которые производят активные формы кислорода (ROS). Кроме того, убихинон является одним из основных эндогенных антиоксидантов клетки. Фермент CLK-1 отвечает за гидроксилирование 5-деметоксиубихинона до 5-гидроксиубихинона.
Было показано, что мутации в гене связаны с увеличением срок жизни.[5][7] Дефекты гена замедляют различные процессы развития и физиологические процессы, включая клеточный цикл, эмбриогенез, постэмбриональный рост, ритмическое поведение и старение.[9]
Ядерная функция
CLK-1 и COQ7 преимущественно локализуются в митохондриях, чтобы участвовать в пути биосинтеза убихинона, который там находится. Однако небольшой пул CLK-1 и COQ7 перемещается в ядро в ответ на продукцию ROS нормально функционирующими митохондриями как в клетках червей, так и в клетках человека соответственно.[10] Транслокация CLK-1 и COQ7 представляет собой ретроградный путь передачи сигналов от митохондрий к ядру, который подавляет митохондриальные стрессовые реакции. Считается, что митохондриальный и ядерный пулы CLK-1 независимо вносят вклад в регуляцию продолжительности жизни червей. Считается, что ядерная форма CLK-1 и COQ7 регулирует экспрессию генов посредством неустановленного механизма.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000167186 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030652 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б Ewbank JJ, Barnes TM, Lakowski B, Lussier M, Bussey H, Hekimi S (февраль 1997 г.). «Структурное и функциональное сохранение гена времени clk-1 Caenorhabditis elegans». Наука. 275 (5302): 980–3. Дои:10.1126 / science.275.5302.980. PMID 9020081. S2CID 32191959.
- ^ «Ген Entrez: гомолог коэнзима Q7 COQ7, убихинон (дрожжи)».
- ^ а б Лю X, Цзян Н., Хьюз Б., Биграс Е., Шубридж Е., Хекими С. (октябрь 2005 г.). «Эволюционное сохранение clk-1-зависимого механизма долголетия: потеря mclk1 увеличивает приспособленность клеток и продолжительность жизни у мышей». Genes Dev. 19 (20): 2424–34. Дои:10.1101 / гад.1352905. ЧВК 1257397. PMID 16195414.
- ^ Асауми С., Куроянаги Х., Секи Н., Ширасава Т. (июнь 1999 г.). "Ортологи гена долголетия Caenorhabditis elegans clk-1 у мышей и людей". Геномика. 58 (3): 293–301. Дои:10.1006 / geno.1999.5838. PMID 10373327.
- ^ Felkai S, Ewbank JJ, Lemieux J, Labbé JC, Brown GG, Hekimi S (апрель 1999 г.). «CLK-1 контролирует дыхание, поведение и старение нематоды Caenorhabditis elegans». EMBO J. 18 (7): 1783–92. Дои:10.1093 / emboj / 18.7.1783. ЧВК 1171264. PMID 10202142.
- ^ Монаган Р.М., Барнс Р.Г., Фишер К., Андреу Т., Руни Н., Пулин Г.Б., Уитмарш А.Дж. (июнь 2015 г.). «Ядерная роль респираторного фермента CLK-1 в регуляции митохондриальных стрессовых реакций и долголетия». Природа клеточной биологии. 17 (6): 782–92. Дои:10.1038 / ncb3170. ЧВК 4539581. PMID 25961505.
дальнейшее чтение
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Йонассен Т., Профт М., Рандес-Гил Ф. и др. (1998). «Гомолог дрожжевого Clk-1 (Coq7 / Cat5) представляет собой митохондриальный белок, участвующий в синтезе кофермента Q». J. Biol. Chem. 273 (6): 3351–7. Дои:10.1074 / jbc.273.6.3351. PMID 9452453.
- Асауми С., Куроянаги Х., Секи Н., Ширасава Т. (1999). "Ортологи гена долголетия Caenorhabditis elegans clk-1 у мышей и людей". Геномика. 58 (3): 293–301. Дои:10.1006 / geno.1999.5838. PMID 10373327.
- Вайо З., Кинг Л. М., Йонассен Т. и др. (2000). «Сохранение гена времени clk-1 Caenorhabditis elegans от дрожжей до человека: ген, необходимый для биосинтеза убихинона с потенциальными последствиями для старения». Мамм. Геном. 10 (10): 1000–4. Дои:10.1007 / s003359901147. PMID 10501970. S2CID 13800512.
- Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
- Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК 1083732. PMID 11256614.
- Стенмарк П., Грюнлер Дж., Матссон Дж. И др. (2001). «Новый член семейства белков карбоксилата железа. Coq7 (clk-1), мембраносвязанная гидроксилаза, участвующая в биосинтезе убихинона». J. Biol. Chem. 276 (36): 33297–300. Дои:10.1074 / jbc.C100346200. PMID 11435415.
- Такахаши М., Асауми С., Хонда С. и др. (2001). «Мышиный ортолог coq7 / clk-1 спас замедленное ритмическое поведение и увеличил продолжительность жизни мутанта clk-1 longevity у Caenorhabditis elegans». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 286 (3): 534–40. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5439. PMID 11511092.
- Ри С. (2002). «CLK-1 / Coq7p - это монооксигеназа DMQ и новый член семейства белков карбоксилата железа». FEBS Lett. 509 (3): 389–94. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 03099-X. PMID 11749961. S2CID 28650687.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
- Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК 1347501. PMID 16381901.
внешняя ссылка
- COQ7 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
- COQ7 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.
 | Эта статья о ген на хромосома человека 16 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |