FKBP1A - Википедия - FKBP1A
Пептидил-пролил цис-транс-изомераза FKBP1A является фермент что у людей кодируется FKBP1A ген.[5]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, является членом иммунофилин семейство белков, которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включая сворачивание и транспортировку белков. Этот кодируемый белок представляет собой цис-транс-пролилизомеразу, которая связывает иммунодепрессанты. FK506 (такролимус) и рапамицин (сиролимус). Он взаимодействует с несколькими белками передачи внутриклеточного сигнала, включая рецептор TGF-бета I типа. Он также взаимодействует с множеством внутриклеточных каналов высвобождения кальция, включая тетрамерный рианодиновый рецептор скелетных мышц. У мышей делеция этого гомологичного гена вызывает врожденное заболевание сердца, известное как несуплотнение миокарда левого желудочка. Имеются данные о множестве альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов для этого гена, но полноразмерная природа некоторых вариантов не установлена.[6]
Взаимодействия
FKBP1A был показан взаимодействовать с:
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000088832 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032966 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ DiLella AG (сентябрь 1991 г.). «Хромосомная принадлежность гена иммунофилина человека FKBP-12». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 179 (3): 1427–33. Дои:10.1016 / 0006-291X (91) 91732-R. PMID 1930186.
- ^ «Ген Entrez: FKBP1A FK506 связывающий белок 1A, 12 кДа».
- ^ Chambraud B, Radanyi C, Camonis JH, Shazand K, Rajkowski K, Baulieu EE (декабрь 1996 г.). «FAP48, новый белок, который образует специфические комплексы как с иммунофилинами FKBP59, так и с FKBP12. Профилактика с помощью иммунодепрессантов FK506 и рапамицина». Журнал биологической химии. 271 (51): 32923–9. Дои:10.1074 / jbc.271.51.32923. PMID 8955134.
- ^ Neye H (март 2001 г.). «Мутация FKBP-ассоциированного белка 48 (FAP48) в пролине 219 нарушает взаимодействие с FKBP12 и FKBP52». Регуляторные пептиды. 97 (2–3): 147–52. Дои:10.1016 / s0167-0115 (00) 00206-8. PMID 11164950. S2CID 20617551.
- ^ Макмиллан Д., Карри С., Брэдли К.Н., Мьюир Т.С., Маккаррон Дж. Г. (декабрь 2005 г.). «В гладких мышцах FK506-связывающий белок модулирует вызванное рецептором IP3 высвобождение Ca2 + с помощью mTOR и кальциневрина». Журнал клеточной науки. 118 (Pt 23): 5443–51. Дои:10.1242 / jcs.02657. PMID 16278292.
- ^ Cameron AM, Nucifora FC, Fung ET, Livingston DJ, Aldape RA, Ross CA, Snyder SH (октябрь 1997 г.). «FKBP12 связывает инозитол-1,4,5-трифосфатный рецептор с лейцин-пролином (1400-1401) и прикрепляет кальциневрин к этому FK506-подобному домену». Журнал биологической химии. 272 (44): 27582–8. Дои:10.1074 / jbc.272.44.27582. PMID 9346894.
- ^ а б Хасинто Э., Лёвит Р., Шмидт А., Лин С., Рюегг М.А., Зал А, Зал Миннесота (ноябрь 2004 г.). «Комплекс TOR 2 млекопитающих контролирует актиновый цитоскелет и нечувствителен к рапамицину». Природа клеточной биологии. 6 (11): 1122–8. Дои:10.1038 / ncb1183. PMID 15467718. S2CID 13831153.
- ^ а б Сарбасов Д.Д., Али С.М., Ким Д.Х., Гертин Д.А., Латек Р.Р., Эрдджумент-Бромаж Х., Темпст П., Сабатини Д.М. (июль 2004 г.). «Rictor, новый связывающий партнер mTOR, определяет нечувствительный к рапамицину и независимый от хищников путь, регулирующий цитоскелет». Текущая биология. 14 (14): 1296–302. Дои:10.1016 / j.cub.2004.06.054. PMID 15268862. S2CID 4658268.
- ^ Чой Дж., Чен Дж., Шрайбер С.Л., Кларди Дж. (Июль 1996 г.). «Структура комплекса FKBP12-рапамицин, взаимодействующего со связывающим доменом FRAP человека». Наука. 273 (5272): 239–42. Дои:10.1126 / science.273.5272.239. PMID 8662507. S2CID 27706675.
- ^ Люкер К.Э., Смит М.К., Люкер Г.Д., Гаммон С.Т., Пивница-Вормс Х., Пивница-Вормс Д. (август 2004 г.). «Кинетика регулируемых белок-белковых взаимодействий, выявленная с помощью комплементационной визуализации люциферазы светлячков в клетках и живых животных». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12288–93. Дои:10.1073 / pnas.0404041101. ЧВК 514471. PMID 15284440.
- ^ Банашинский Л.А., Лю CW, Wandless TJ (апрель 2005 г.). «Характеристика тройного комплекса FKBP.rapamycin.FRB». Журнал Американского химического общества. 127 (13): 4715–21. Дои:10.1021 / ja043277y. PMID 15796538.
- ^ Sabers CJ, Martin MM, Brunn GJ, Williams JM, Dumont FJ, Wiederrecht G, Abraham RT (январь 1995 г.). «Выделение белка-мишени комплекса FKBP12-рапамицин в клетках млекопитающих». Журнал биологической химии. 270 (2): 815–22. Дои:10.1074 / jbc.270.2.815. PMID 7822316.
- ^ Авила Г., Ли Э. Х., Перес К. Ф., Аллен П. Д., Дирксен Р. Т. (июнь 2003 г.). «Связывание FKBP12 с RyR1 модулирует сцепление возбуждения и сокращения в скелетных мышечных трубках мышей». Журнал биологической химии. 278 (25): 22600–8. Дои:10.1074 / jbc.M205866200. PMID 12704193.
- ^ Bultynck G, De Smet P, Rossi D, Callewaert G, Missiaen L, Sorrentino V, De Smedt H, Parys JB (март 2001 г.). «Характеристика и картирование сайта связывания 12 кДа FK506-связывающего белка (FKBP12) на различных изоформах рецептора рианодина и рецептора инозитол-1,4,5-трифосфата». Биохимический журнал. 354 (Pt 2): 413–22. Дои:10.1042 / bj3540413. ЧВК 1221670. PMID 11171121.
- ^ Габурякова М., Габурякова Дж., Рейкен С., Хуанг Ф., Маркс С.О., Роземблит Н., Маркс А.Р. (май 2001 г.). «Связывание FKBP12 модулирует стробирование канала рианодинового рецептора». Журнал биологической химии. 276 (20): 16931–5. Дои:10.1074 / jbc.M100856200. PMID 11279144.
- ^ Ван Т., Донахью П.К., Зервос А.С. (июль 1994 г.). «Специфическое взаимодействие рецепторов типа I семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12». Наука. 265 (5172): 674–6. Дои:10.1126 / science.7518616. PMID 7518616.
- ^ Лю Ф., Вентура Ф., Дуди Дж., Массагуэ Дж. (Июль 1995 г.). «Рецептор человеческого типа II для костных морфогенных белков (BMP): расширение модели двухкиназного рецептора на BMP». Молекулярная и клеточная биология. 15 (7): 3479–86. Дои:10.1128 / mcb.15.7.3479. ЧВК 230584. PMID 7791754.
дальнейшее чтение
- Schiene-Fischer C, Yu C. (апрель 2001 г.). «Вспомогательные ферменты-помощники складывания рецепторов: функциональная роль пептидилпролил цис / транс-изомераз». Письма FEBS. 495 (1–2): 1–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02326-2. PMID 11322937. S2CID 42263861.
- Дилелла А.Г., Хокинс А., Крейг Р.Дж., Шрайбер С.Л., Гриффин, Калифорния (декабрь 1992 г.). «Присвоение хромосомных полос генов, кодирующих человеческие FKBP12 и FKBP13». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 189 (2): 819–23. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 92276-4. PMID 1281998.
- Jayaraman T, Brillantes AM, Timerman AP, Fleischer S, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Marks AR (май 1992 г.). «Связывающий белок FK506, связанный с каналом высвобождения кальция (рецептор рианодина)». Журнал биологической химии. 267 (14): 9474–7. PMID 1374404.
- Лепре Калифорния, Томсон Дж. А., Мур Дж. М. (май 1992 г.). «Структура решения FK506, связанного с FKBP-12». Письма FEBS. 302 (1): 89–96. Дои:10.1016 / 0014-5793 (92) 80292-О. PMID 1375171. S2CID 41469360.
- Маки Н., Секигучи Ф., Нисимаки Дж., Мива К., Хаяно Т., Такахаши Н., Судзуки М. (июль 1990 г.). «Комплементарная ДНК, кодирующая человеческий Т-клеточный FK506-связывающий белок, пептидилпролил цис-транс-изомеразу, отличную от циклофилина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 87 (14): 5440–3. Дои:10.1073 / pnas.87.14.5440. ЧВК 54340. PMID 1695378.
- Standaert RF, Galat A, Verdine GL, Schreiber SL (август 1990 г.). «Молекулярное клонирование и сверхэкспрессия человеческого FK506-связывающего белка FKBP». Природа. 346 (6285): 671–4. Дои:10.1038 / 346671a0. PMID 1696686. S2CID 4368221.
- Сикерка Дж., Видеррехт Дж., Грейлих Х, Боултон Д., Хунг С.Х., Крайан Дж., Ходжес П.Дж., Сигал Н.Х. (декабрь 1990 г.). «Цитозольный связывающий белок для иммунодепрессанта FK-506 представляет собой как повсеместную, так и высококонсервативную пептидил-пролил цис-транс-изомеразу». Журнал биологической химии. 265 (34): 21011–5. PMID 1701173.
- Michnick SW, Rosen MK, Wandless TJ, Karplus M, Schreiber SL (май 1991 г.). «Структура раствора FKBP, фермента ротамазы и рецептора для FK506 и рапамицина». Наука. 252 (5007): 836–9. Дои:10.1126 / science.1709301. PMID 1709301. S2CID 28289138.
- Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (май 1991 г.). «Атомная структура FKBP-FK506, иммунофилин-иммунодепрессантный комплекс». Наука. 252 (5007): 839–42. Дои:10.1126 / science.1709302. PMID 1709302. S2CID 32539611.
- Розен М.К., Михник С.В., Карплюс М., Шрайбер С.Л. (май 1991 г.). «Последовательное назначение протонов и азота и определение вторичной структуры человеческого FK506 и связывающего рапамицин белка». Биохимия. 30 (19): 4774–89. CiteSeerX 10.1.1.559.2890. Дои:10.1021 / bi00233a020. PMID 1709363.
- Джин Ю.Дж., Альберс М.В., Лейн В.С., Бирер Б.Э., Шрайбер С.Л., Буракофф С.Дж. (август 1991 г.). «Молекулярное клонирование ассоциированного с мембраной человеческого FK506 и рапамицин-связывающего белка, FKBP-13». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (15): 6677–81. Дои:10.1073 / pnas.88.15.6677. ЧВК 52151. PMID 1713687.
- DiLella AG, Craig RJ (сентябрь 1991 г.). «Экзонная организация человеческого гена FKBP-12: корреляция со структурными и функциональными доменами белка». Биохимия. 30 (35): 8512–7. Дои:10.1021 / bi00099a002. PMID 1716149.
- Harding MW, Galat A, Uehling DE, Schreiber SL (октябрь 1989 г.). «Рецептором иммунодепрессанта FK506 является цис-транс-пептидил-пролилизомераза». Природа. 341 (6244): 758–60. Дои:10.1038 / 341758a0. PMID 2477715. S2CID 4349152.
- Ван Т., Донахью П.К., Зервос А.С. (июль 1994 г.). «Специфическое взаимодействие рецепторов типа I семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12». Наука. 265 (5172): 674–6. Дои:10.1126 / science.7518616. PMID 7518616.
- Peattie DA, Hsiao K, Benasutti M, Lippke JA (декабрь 1994 г.). «Три различных матричных РНК могут кодировать человеческий иммунодепрессант-связывающий белок FKBP12». Ген. 150 (2): 251–7. Дои:10.1016/0378-1119(94)90434-0. PMID 7529739.
- Ян В.М., Иноуэ CJ, Сето Э. (июнь 1995 г.). «Циклофилин A и FKBP12 взаимодействуют с YY1 и изменяют его транскрипционную активность». Журнал биологической химии. 270 (25): 15187–93. Дои:10.1074 / jbc.270.25.15187. PMID 7541038.
- Кавамура А. Су М.С. (июнь 1995 г.). «Взаимодействие FKBP12-FK506 с кальциневрином A в домене связывания субъединицы B». Журнал биологической химии. 270 (26): 15463–6. Дои:10.1074 / jbc.270.26.15463. PMID 7541044.
- Гриффит Дж. П., Ким Дж. Л., Ким Е. Е., Синтчак, М. Д., Томсон, Дж. А., Фицгиббон, М. Дж., Флеминг, М. А., Карон, ПР, Сяо К., Navia MA (август 1995 г.). «Рентгеновская структура кальциневрина ингибируется комплексом иммунофилин-иммунодепрессант FKBP12-FK506». Клетка. 82 (3): 507–22. Дои:10.1016/0092-8674(95)90439-5. PMID 7543369. S2CID 15502270.
- Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (январь 1993 г.). «Атомные структуры комплексов человеческого иммунофилина FKBP-12 с FK506 и рапамицином». Журнал молекулярной биологии. 229 (1): 105–24. Дои:10.1006 / jmbi.1993.1012. PMID 7678431.
PDB галерея | |
|---|---|
|
