FKBP3 - FKBP3

FKBP3
Белок FKBP3 PDB 1pbk.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыFKBP3, FKBP-25, FKBP-3, FKBP25, PPIase, FK506-связывающий белок 3, FKBP пролилизомераза 3
Внешние идентификаторыOMIM: 186947 MGI: 1353460 ГомолоГен: 1525 Генные карты: FKBP3
Расположение гена (человек)
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человек)[1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное расположение FKBP3
Геномное расположение FKBP3
Группа14q21.2Начните45,115,599 бп[1]
Конец45,135,319 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE FKBP3 218003 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

2287

30795

Ансамбль

ENSG00000100442

ENSMUSG00000020949

UniProt

Q00688

Q62446

RefSeq (мРНК)

NM_002013

NM_013902

RefSeq (белок)

NP_002004

NP_038930

Расположение (UCSC)Chr 14: 45.12 - 45.14 МбChr 12: 65.06 - 65.07 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

FK506-связывающий белок 3 это белок что у людей кодируется FKBP3 ген.[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков иммунофилинов, которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включая сворачивание и транспортировку белка. Этот кодируемый белок представляет собой цис-транс-пролилизомеразу, которая связывает иммунодепрессанты FK506 и рапамицин. Он имеет более высокое сродство к рапамицину, чем к FK506, и, следовательно, может быть важной молекулой-мишенью для иммуносупрессии рапамицином.[7]

Взаимодействия

FKBP3 был показан взаимодействовать с участием YY1,[8] HDAC1,[8] Гистоновая деацетилаза 2,[8] ДНК,[9] и Mdm2.[10]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100442 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000020949 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Hung DT, Schreiber SL (июнь 1992 г.). «Клонирование кДНК человеческого FK506 25 кДа и рапамицин-связывающего белка». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 184 (2): 733–8. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 90651-Z. PMID  1374240.
  6. ^ Порат Р., Пуциака Д.Д., Миллер Л.К., Грановиц Е.В., Динарелло, Калифорния (май 1992 г.). «Блокада рецептора интерлейкина-1 (ИЛ-1) снижает синтез ИЛ-8, стимулированный эндотоксином и Borrelia burgdorferi, в мононуклеарных клетках человека». FASEB J. 6 (7): 2482–6. PMID  1532945.
  7. ^ а б «Ген Entrez: FKBP3 FK506 связывающий белок 3, 25 кДа».
  8. ^ а б c Ян В.М., Яо Ю.Л., Сето Э. (сентябрь 2001 г.). «FK506-связывающий белок 25 функционально связывается с гистоновыми деацетилазами и с фактором транскрипции YY1». EMBO J. 20 (17): 4814–25. Дои:10.1093 / emboj / 20.17.4814. ЧВК  125595. PMID  11532945.
  9. ^ Пракаш А, Шин Дж, Раджан С., Юн Х.С. (2016). «Структурные основы распознавания нуклеиновой кислоты FK506-связывающим белком 25 (FKBP25), ядерным иммунофилином». Нуклеиновые кислоты Res. 44 (6): 2909–25. Дои:10.1093 / nar / gkw001. ЧВК  4824100. PMID  26762975.
  10. ^ Очока А.М., Кампанис П., Николь С., Альенде-Вега Н., Кокс М., Маркар Л., Милн Д., Фуллер-Пейс Ф., Мик Д. (февраль 2009 г.). «FKBP25, новый регулятор пути p53, вызывает деградацию MDM2 и активацию p53». FEBS Lett. 583 (4): 621–6. Дои:10.1016 / j.febslet.2009.01.009. PMID  19166840.

дальнейшее чтение

  • Джин YJ, Burakoff SJ, Бирер BE (1992). «Молекулярное клонирование высокоаффинного связывающего рапамицин белка массой 25 кДа, FKBP25». J. Biol. Chem. 267 (16): 10942–5. PMID  1375932.
  • Видеррехт Г., Мартин М.М., Сигал Н.Х., Сикерка Дж.Дж. (1992). «Выделение кДНК человека, кодирующей 25 кДа FK-506 и рапамицин-связывающий белок». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 185 (1): 298–303. Дои:10.1016 / S0006-291X (05) 80990-8. PMID  1376117.
  • Джин YJ, Burakoff SJ (1993). «Белок, связывающий FK506 с массой 25 кДа, локализуется в ядре и связывается с казеинкиназой II и нуклеолином». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 90 (16): 7769–73. Дои:10.1073 / пнас.90.16.7769. ЧВК  47224. PMID  7689229.
  • Кросс С.Х., Чарльтон Дж. А., Нэн Х, Берд А. П. (1994). «Очистка CpG-островков с использованием колонки для связывания метилированной ДНК». Nat. Genet. 6 (3): 236–44. Дои:10.1038 / ng0394-236. PMID  8012384.
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
  • Мэн Х, Чен Дж, Ян Цюй, Ван С., Чао И, Инь К., Се И, Мао И (2002). «Клонирование и идентификация новой кДНК, которая может быть связана с FKBP25». Biochem. Genet. 40 (9–10): 303–10. Дои:10.1023 / А: 1020256718720. PMID  12392168.
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.

внешние ссылки

  • PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для пептидил-пролил цис-транс-изомеразы человека FKBP3
  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для мышиной пептидил-пролил цис-транс-изомеразы FKBP3