HLA-A24 - HLA-A24
| HLA-A24 | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| (MHC Класс I, А антиген клеточной поверхности) | ||||||||||
 | ||||||||||
| О | ||||||||||
| Протеин | трансмембранный рецептор /лиганд | |||||||||
| Структура | αβ гетеродимер | |||||||||
| Подразделения | HLA-A *24--, β2-микроглобулин | |||||||||
| Старые имена | HL-A9 | |||||||||
| Подтипы | ||||||||||
| ||||||||||
| Ссылка на все аллели на IMGT / HLA база данных в EBI | ||||||||||
HLA-A24 (A24) - это человеческий лейкоцитарный антиген серотип в HLA-A группа серотипа. Серотип определяется по распознаванию антителом α24 подмножество α-цепей HLA-A. Для A24 альфа-цепочка "A" кодируется HLA-A.*24 аллельная группа и β-цепь кодируются B2M локус.[1] В настоящее время в этой группе преобладает A * 2402. A24 и A*24 почти синонимы по значению. A24 - это расщепленный антиген из широкий антиген HLA-A9 и это сестринский серотип HLA-A23.
A * 2402 имеет одну из самых высоких частот "А", определенную для ряда народов, включая Папуа-Новой Гвинеи, Коренные тайваньцы (Восточные племена), Юпик и Гренландия Эскимосы. Это распространено на большей части Юго-Восточной Азии. В Евразии он наименее распространен в Ирландии, а A24 относительно редко встречается в Африке, за исключением Северной Африки и Кении.
Серотип
| А * 24 | A24 | А9 | Образец |
| аллель | % | % | размер (N) |
| *2402 | 97 | 3098 | |
| *2403 | 55 | 4 | 282 |
Существует более 90 известных аллелей A * 24, 69 кодов для различных изоформ и 7 нулевых. A * 2403 также можно определить как серотип A2403.
Сопутствующее заболевание
A24 имеет вторичный фактор риска миастения,[3] Болезнь Бюргера.[4] Это также связано с Диабет 1 типа (T1D)[5][6] и системная красная волчанка (СКВ)[7].
Аллели
| Изучение населения | Freq. (в %)[8] |
|---|---|
| Тайвань Пайвань | 86.3 |
| Тайвань Цоу | 78.4 |
| Тайвань Рукай | 76.0 |
| пАпуа Nфу граммuinea Goroka | 74.4 |
| PNG плато Кариму | 74.4 |
| Тайвань Пуюма | 64.0 |
| Тайвань Ами | 62.8 |
| PNG Ванигела | 62.7 |
| Тайвань Атаял | 61.8 |
| Эквадор Каяпа | 61.4 |
| Новая Каледония | 60.7 |
| Венесуэла Perja Mtn. Бари | 60.2 |
| США Аляска коренные жители юпиков | 58.1 |
| Тайваньское Дао | 54.0 |
| PNG Wosera | 51.3 |
| Тайвань Сирая | 47.1 |
| Тайвань Тароко | 44.5 |
| Мексика Чиуауа Тараума… | 37.5 |
| США Аризона Пима | 36.0 |
| Тайвань Пазех | 33.6 |
| Япония Окинава Рюкюань | 33.5 |
| американское Самоа | 33.0 |
| Япония (5) | 32.7 |
| Филиппины Иватан | 32.0 |
| PNG Новая Британия Рабаул | 31.6 |
| Северная Мексика Канончито Навах… | 30.5 |
| Австралия Индиг. Юендуму | 29.8 |
| Австралия Индиг. Groote E… | 29.3 |
| Китайские тибетцы | 27.2 |
| С. Дакота Лакота Сиу | 26.2 |
| Мексика Mixtec Oaxaca | 24.5 |
| Япония Айну Хоккайдо | 24.0 |
| Венесуэла Perija Mtns. Ю ... | 23.3 |
| Мексика Zaptotec Oaxaca | 23.1 |
| США Уроженец Северной Америки… | 22.7 |
| Австралия Индиг. Мыс Йор… | 22.3 |
| Гл. Гуандун Мэйчжоу Хан | 22.2 |
| Россия Тува (2) | 21.5 |
| Сингапур китайский хань | 21.5 |
| Индия Северные индусы | 20.2 |
| Монголия Бурят | 20.0 |
| Китай Внутренняя Монголия | 19.6 |
| США Азиатский | 18.9 |
| Тайвань Миннань (1) | 18.6 |
| Китай Южный Хан | 17.2 |
| Грузия Тибилиси Грузинская… | 17.1 |
| Индия Мумбаи Маратхи | 16.7 |
| Мексика Гвадалахара Местис… | 16.5 |
| Сингапур Риау Малайский | 16.5 |
| Хорватия | 16.0 |
| Индия Хандеш Павра | 16.0 |
| Сингапур яванский индон… | 16.0 |
| Южная Африка Натал Тамил | 16.0 |
| Индия Тамил Наду Надар | 15.6 |
| PNG Маданг | 15.3 |
| Китай Северная Хань | 15.2 |
| США Южный Техас латиноамериканцы | 15.2 |
| PNG Западный хребет Шредера | 14.2 |
| Китай Гуанси Маонан | 13.4 |
| Мексика Местис | 13.4 |
| Грузия Сванети Сваны | 13.1 |
| румынский | 12.7 |
| Пакистан Бурушо | 12.5 |
| США испаноязычный | 12.2 |
| Болгария | 11.8 |
| Грузия Тибилиси Курды | 11.7 |
| Индия Нью-Дели | 11.4 |
| Пакистанский синдхи | 10.7 |
| США Кавказский | 10.7 |
| Юго-Восток Франции | 10.6 |
| Пакистан Патан | 10.2 |
| Камерунский карликовый бака | 10.0 |
| Финляндия | 9.4 |
| Бразилия | 8.6 |
| Австралия Индиг. Кимберли | 8.3 |
| Австралия Новый Южный Уэльс | 8.2 |
| Израильские арабские друзы | 8.0 |
| Пакистанский белудж | 8.0 |
| Центр Португалии | 8.0 |
| Камерун Сава | 7.7 |
| Бразилия Терена | 7.5 |
| Южная Ирландия | 6.8 |
| Тунис | 6.7 |
| Бельгия | 6.6 |
| Марокко Бербер Надор Мета… | 6.2 |
| Иордания Амман | 5.9 |
| Оман | 5.9 |
| Мексика Mixe Oaxaca | 5.7 |
| Северная Португалия | 5.4 |
| Суданский | 5.3 |
| Мексика Сонора Сери | 4.5 |
| Уганда Кампала | 4.3 |
| Таиланд | 3.9 |
| Иран Белудж | 3.4 |
| США Африканская Америка | 2.8 |
| Кения | 2.1 |
| Гвинея-Бисау | 1.5 |
| Чехия | 1.0 |
| Кения Нанди | 1.0 |
| Частоты аллелей представлены, только | |
A * 2402 - вторичный фактор риска,[9] снижает риск диабета 1 типа,[10][11] и аллель, связанный с тимома -индуцированный миастения.
Гаплотипы
| частота | Ранг в | |||
| исх. | численность населения | (%) | Поп. | |
| [12] | Ява (Индонезия) | 8.0 | 1 | 4 |
| [12] | S. Amer. Родные | 6.3 | 1 | 3 |
| [12] | Н. амер. Родные | 5.4 | 1 | 5 |
| [12] | Мексиканский | 4.7 | 1 | |
| [12] | Инуиты | 4.2 | 1 | |
| [12] | Бразильский | 3.8 | 1 | |
| [12] | Австрия | 3.5 | 1 | |
| [12] | португальский | 3.1 | 1 | 3 |
| [12] | Якутский | 2.9 | 1 | |
| [12] | Монгольский | 2.7 | 1 | |
| [12] | Тимор | 2.5 | 1 | 5 |
| [12] | Бхаргавас (Индия) | 2.4 | 1 | |
| [12] | Греческий | 2.3 | 1 | |
| [12] | Итальянский | 2.2 | 1 | |
| [12] | Монгольский | 1.9 | 1 | |
| [12] | вьетнамский | 1.8 | 1 | |
| [12] | Японский | 1.6 | 2 | |
| [12] | Французский | 1.2 | 2 | |
| 1 Cw4. 2 Cw9. | ||||
A24-Cw7-B39
A24-Cw10-B60
A24-Cw10-B61
A24-B48
A24-Cw4-B35
Этот конкретный гаплотип распространен в довольно широком регионе, возможно, это самый распространенный гаплотип A-Cw-B у людей. Cw4-B35 имеет узел в регионе, который когда-то назывался Фракия / Дакия.
A24-Cw * 14-B51
| частота | ||
| исх. | численность населения | (%) |
| [12] | Корейский | 3.5 |
| [12] | Айерс | 3.4 |
| [12] | Монгольский | 2.9 |
| [12] | Японский | 2.6 |
| [12] | румынский | 2.2 |
| [12] | Греческий | 2.1 |
| [12] | Венгерский | 2.0 |
| [12] | Итальянский | 0.6 |
Рекомендации
- ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены. 11 (2): 96–112. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID 77067.
- ^ Аллельная форма запроса IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Machens A, Löliger C, Pichlmeier U, Emskötter T., Busch C, Izbicki JR (июнь 1999 г.). «Корреляция патологии тимуса с HLA при миастении». Клиническая иммунология. 91 (3): 296–301. Дои:10.1006 / Clim.1999.4710. PMID 10370374.
- ^ Нумано Ф., Сасадзуки Т., Кояма Т., Шимокадо К., Такеда Й, Нисимура Й, Муто М. (1986). «HLA при болезни Бюргера». Экспериментальная и клиническая иммуногенетика. 3 (4): 195–200. PMID 3274054.
- ^ Адамашвили И., Макви Р., Гельдер Ф., Готро М., Джарамилло Дж., Роггеро Т., Макдональд Дж. (Июль 1997 г.). «Растворимые антигены HLA класса I у пациентов с диабетом I типа и членов их семей». Иммунология человека. 55 (2): 176–83. Дои:10.1016 / S0198-8859 (97) 00096-7. PMID 9361970.
- ^ Кроненберг Д., Найт Р.Р., Эсторниньо М., Эллис Р.Дж., Кестер М.Г., де Ру А., Эйхманн М., Хуанг Г.К., Паури Дж., Даян К.М., Сковера А., ван Веелен П.А., Пикман М. (июль 2012 г.). «Циркулирующие CD8 T-клетки, специфичные для сигнального пептида препроинсулина, ограниченные молекулой восприимчивости HLA-A24, размножаются в начале диабета 1 типа и убивают β-клетки». Сахарный диабет. 61 (7): 1752–9. Дои:10.2337 / db11-1520. ЧВК 3379678. PMID 22522618.
- ^ Адамашвили И., Вольф Р., Оултман Д., Милфорд Э. Л., Джаффе С., Холл V, Прессли Т., Минагар А., Келли Р. (ноябрь 2003 г.). «Синтез растворимого HLA-I (s-HLA-I) при системной красной волчанке». Rheumatology International. 23 (6): 294–300. Дои:10.1007 / s00296-003-0306-3. PMID 12879264.
- ^ Миддлтон, Д .; Menchaca, L .; Rood, H .; Комеровский, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net». Тканевые антигены. 61 (5): 403–407. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660.
- ^ de Juan MD, Reta A, Belzunegui J, Figueroa M, Maruri N, Cuadrado E (февраль 2004 г.). «HLA-A * 2402 и микросателлит (D6S248) являются вторичными независимыми маркерами предрасположенности к анкилозирующему спондилиту у баскских пациентов». Иммунология человека. 65 (2): 175–80. Дои:10.1016 / j.humimm.2003.11.006. PMID 14969772.
- ^ Noble JA, Valdes AM, Bugawan TL, Apple RJ, Thomson G, Erlich HA (август 2002 г.). «Локус HLA класса I A влияет на восприимчивость к диабету 1 типа». Иммунология человека. 63 (8): 657–64. Дои:10.1016 / S0198-8859 (02) 00421-4. ЧВК 4049513. PMID 12121673.
- ^ Наканиши К., Иноко Х (июнь 2006 г.). «Комбинация HLA-A24, -DQA1 * 03 и -DR9 способствует острому началу и раннему полному разрушению бета-клеток при диабете 1 типа: продольное исследование остаточной функции бета-клеток». Сахарный диабет. 55 (6): 1862–8. Дои:10.2337 / db05-1049. PMID 16731854.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z Сасадзуки, Такехико; Цудзи, Кимиёси; Айзава, Мики (1992). HLA 1991: материалы одиннадцатого Международного семинара и конференции по гистосовместимости, состоявшейся в Иокогаме, Япония, 6-13 ноября 1991 г.. Оксфорд [Оксфордшир]: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-262390-4.