HLA-A32 - HLA-A32

HLA-A32
(MHC Класс I, А антиген клеточной поверхности)
Иллюстрация HLA-A.png
HLA-A32
О
Протеинтрансмембранный рецептор /лиганд
Структураαβ гетеродимер
ПодразделенияHLA-A *3201, β2-микроглобулин
Старые имена«А19»
Подтипы
Подтип
аллель
Доступные конструкции
A19*3201
{{{cNick2}}}* 32 {{{cAllele2}}}
{{{cNick3}}}* 32 {{{cAllele3}}}
{{{cNick4}}}* 32 {{{cAllele4}}}
Ссылка на все аллели на IMGT / HLA база данных в EBI

HLA-A32 (A32) - это человеческий лейкоцитарный антиген серотип в HLA-A группа серотипа. Серотип определяется по распознаванию антителом α32 подмножество α-цепей HLA-A. Для A32 альфа-цепь "A" кодируется HLA-A*32 аллельная группа и β-цепь кодируются B2M локус.[1] В настоящее время в этой группе преобладает A * 3201. A32 и A*32 почти синонимичны по смыслу. A32 - это расщепленный антиген из широкий антиген серотип A19. A32 - сестринский серотип A29A30A31A33, иA74.


Серотип

Распознавание A32 некоторых продуктов гена HLA A * 32[2]
А * 32A32Образец
аллель%размер (N)
*3201943441

A32 Эффективность серотипирования для преобладающего аллеля хорошая. Известно 16 аллестов, приводящих к образованию 15 изоформ HLA-A32. Одна изоформа может быть плохо экспрессирована.[3].

Распределение

HLA A * 3201 частоты
Изучение населенияFreq.
 (в %)[4]
Оман11.4
Пакистан Брахуи9.2
Италия Сардиния8.7
Болгария8.2
Буркина-Фасо Фулани8.2
Пакистан Карачи Парси7.8
Пакистанские калаши7.5
Юго-Восток Франции7.2
Пакистанский белудж7.1
Греция Северная7.0
Грузия Тибилиси Курды6.7
Иран Белудж6.7
Испания Северная Кантабрия6.0
Италия Бергамо5.9
Индия Северные индусы5.8
Хорватия5.7
Франция Корсика5.5
Шотландия Оркнейские острова5.5
Суданский5.5
Испания Восточная Андалусия5.4
Алжир15.1
Азорские острова Санта-Мария и Са ...5.1
Пакистан Патан5.1
Пакистанский синдхи5.1
румынский5.0
Македония4.9
Кабо-Верде, северо-запад I…4.8
Грузия Тибилиси Грузинская…4.8
Сербия4.6
Южная Ирландия4.4
Англия Ланкастер4.4
Азорские острова Терсейра4.3
США Кавказская поп24.3
Болгария цыганская4.2
Кабо-Верде Юго-восток I…4.0
Израильские арабские друзы4.0
Центр Португалии4.0
Буркина-Фасо-Мосси3.8
Гвинея-Бисау3.8
Испания Северный Кабуэрниго3.8
Бельгия3.7
Россия Чуваши3.7
Швеция Стокгольм3.5
Уэльс3.5
Англия Шеффилд3.5
Англия Лидс3.4
Австралия Новый Южный Уэльс3.4
Марокко Бербер Надор Мета…3.4
Ирландия Северная3.2
Иордания Амман3.1
Индия Хандеш Павра3.0
Индия Нью-Дели3.0
Парсы западного побережья Индии3.0
США испаноязычный3.0
индюк2.8
Швеция округ Упсала2.7
Индия Северный Дели2.7
Марокко2.7
Пакистан Бурушо2.7
Кения Луо2.6
Южноафриканский Натал Зулу2.5
Китай Северная Хань2.4
Чехия2.4
Лондонские евреи-ашкенази2.4
Мексика Местис2.4
Саудовская Аравия Гурайат и…2.4
Китай Пекин2.2
Финляндия2.2
Уганда Кампала2.2
Россия Тува поп 22.1
США Уроженец Северной Америки…2.1
Бразилия2.0
Камерун Бети2.0
Перу Арекипа2.0
Россия Архангельск Поморы2.0
Италия Северная поп 11.9
Россия Северо-Запад1.8
Немецкий Эссен1.8
Испания Пас Вэлли1.6
США Африканская Америка1.6
Тунис1.5
Грузия Сванети Сваны1.3
Новая Каледония1.2
Южная Африка Тсвана1.2
Частоты аллелей представлены, только

A32 наиболее распространен в районе Персидского залива и Средиземноморского бассейна. Он имеет постоянное присутствие в Европе. Частота встречаемости A32 у более изолированных (генетически) народов Европы предполагает, что рост A32 в Средиземном море может быть лишь частично связан с недавними миграциями из ближневосточного региона. В южной части Европы есть узел вокруг Ионического моря, в котором повышены специфические европейские гаплотипы A32.

Гаплотипы

Частоты гаплотипа HLA A32
частота
исх.численность населения(%)
A32-B7
(A * 3201: B * 0702)
албанский2.2
Кубинец1.9
[5]Натал Зулу (Южная Африка)1.0
Критский0.7
Критский0.2
A32-B8
(A * 3201: B * 0801)
Северная Португалия2.2
Оман1.8
A32-B14
(A * 3201: B * 14)
! кунг1.9
Тунис1.8
Натал Зулу (Южная Африка)1.0
Португалия1.1
Ирландский0.7
Итальянский0.6
A32-B27
(A * 3201: B27)
Цыганский (испанский)6.0
E Черное море (Турция)2.3
Немецкий0.3
A32-B35
(A * 3201: C * 0401: B * 3501)
Греческий3.5
UA Эмираты2.8
Сардинский2.6
Брахуи (Пакистан)2.5
Тунис1.8
Армянский1.7
Итальянский1.5
Оман1.3
Португалия1.1
Немецкий0.3
A32-B61 (40)
(A * 3201: B * 40)
Тунис1.2
Греческий1.2
Французский0.6
Немецкий0.4
A32-B44
(A * 3201: B * 4402)
Австрийский2.4
Бельгия2.0
албанский1.8
Южная Португалия1.0
Ирландский0.7
Немецкий0.6
нидерландский язык0.6
Сенегал0.5
Итальянский0.4
A32-B51
(A * 3201: C * 1201: B * 5101)
болгарский1.8
Немецкий0.3
(A * 3201: C * 1502: B * 5101)
Оман5.0
Белудж (Пакистан)3.2
Калаш2.9
UA Эмираты1.9
Белудж (Иран)1.1
(A * 3201: C * 1401: B * 5101)
Парсы (Карачи)4.9
Калаш2.9

Общий гаплотип A32 A * 3201-B * 5101 можно найти в Омане, Объединенных Арабских Эмиратах, юго-восточной части Ирана, Болгарии и Португалии. Второй, A * 3201-B * 3501, может находиться в Омане, ОАЭ и Португалии.

Рекомендации

  1. ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены. 11 (2): 96–112. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID  77067.
  2. ^ Аллельная форма запроса IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
  3. ^ Тан Т.Ф., Хоу Л., Ту Б. и др. (2006). «Идентификация девяти новых аллелей HLA класса I у добровольцев из реестров доноров стволовых клеток Сингапура». Тканевые антигены. 68 (6): 518–20. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2006.00707.x. PMID  17176443.
  4. ^ Миддлтон, Д .; Menchaca, L .; Rood, H .; Комеровский, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net». Тканевые антигены. 61 (5): 403–407. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID  12753660.
  5. ^ В * 0705