HLA-A32 - HLA-A32
HLA-A32 | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
(MHC Класс I, А антиген клеточной поверхности) | ||||||||||||||||
HLA-A32 | ||||||||||||||||
О | ||||||||||||||||
Протеин | трансмембранный рецептор /лиганд | |||||||||||||||
Структура | αβ гетеродимер | |||||||||||||||
Подразделения | HLA-A *3201, β2-микроглобулин | |||||||||||||||
Старые имена | «А19» | |||||||||||||||
Подтипы | ||||||||||||||||
| ||||||||||||||||
Ссылка на все аллели на IMGT / HLA база данных в EBI |
HLA-A32 (A32) - это человеческий лейкоцитарный антиген серотип в HLA-A группа серотипа. Серотип определяется по распознаванию антителом α32 подмножество α-цепей HLA-A. Для A32 альфа-цепь "A" кодируется HLA-A*32 аллельная группа и β-цепь кодируются B2M локус.[1] В настоящее время в этой группе преобладает A * 3201. A32 и A*32 почти синонимичны по смыслу. A32 - это расщепленный антиген из широкий антиген серотип A19. A32 - сестринский серотип A29, A30, A31, A33, иA74.
Серотип
А * 32 | A32 | Образец |
аллель | % | размер (N) |
*3201 | 94 | 3441 |
A32 Эффективность серотипирования для преобладающего аллеля хорошая. Известно 16 аллестов, приводящих к образованию 15 изоформ HLA-A32. Одна изоформа может быть плохо экспрессирована.[3].
Распределение
Изучение населения | Freq. (в %)[4] |
---|---|
Оман | 11.4 |
Пакистан Брахуи | 9.2 |
Италия Сардиния | 8.7 |
Болгария | 8.2 |
Буркина-Фасо Фулани | 8.2 |
Пакистан Карачи Парси | 7.8 |
Пакистанские калаши | 7.5 |
Юго-Восток Франции | 7.2 |
Пакистанский белудж | 7.1 |
Греция Северная | 7.0 |
Грузия Тибилиси Курды | 6.7 |
Иран Белудж | 6.7 |
Испания Северная Кантабрия | 6.0 |
Италия Бергамо | 5.9 |
Индия Северные индусы | 5.8 |
Хорватия | 5.7 |
Франция Корсика | 5.5 |
Шотландия Оркнейские острова | 5.5 |
Суданский | 5.5 |
Испания Восточная Андалусия | 5.4 |
Алжир1 | 5.1 |
Азорские острова Санта-Мария и Са ... | 5.1 |
Пакистан Патан | 5.1 |
Пакистанский синдхи | 5.1 |
румынский | 5.0 |
Македония | 4.9 |
Кабо-Верде, северо-запад I… | 4.8 |
Грузия Тибилиси Грузинская… | 4.8 |
Сербия | 4.6 |
Южная Ирландия | 4.4 |
Англия Ланкастер | 4.4 |
Азорские острова Терсейра | 4.3 |
США Кавказская поп2 | 4.3 |
Болгария цыганская | 4.2 |
Кабо-Верде Юго-восток I… | 4.0 |
Израильские арабские друзы | 4.0 |
Центр Португалии | 4.0 |
Буркина-Фасо-Мосси | 3.8 |
Гвинея-Бисау | 3.8 |
Испания Северный Кабуэрниго | 3.8 |
Бельгия | 3.7 |
Россия Чуваши | 3.7 |
Швеция Стокгольм | 3.5 |
Уэльс | 3.5 |
Англия Шеффилд | 3.5 |
Англия Лидс | 3.4 |
Австралия Новый Южный Уэльс | 3.4 |
Марокко Бербер Надор Мета… | 3.4 |
Ирландия Северная | 3.2 |
Иордания Амман | 3.1 |
Индия Хандеш Павра | 3.0 |
Индия Нью-Дели | 3.0 |
Парсы западного побережья Индии | 3.0 |
США испаноязычный | 3.0 |
индюк | 2.8 |
Швеция округ Упсала | 2.7 |
Индия Северный Дели | 2.7 |
Марокко | 2.7 |
Пакистан Бурушо | 2.7 |
Кения Луо | 2.6 |
Южноафриканский Натал Зулу | 2.5 |
Китай Северная Хань | 2.4 |
Чехия | 2.4 |
Лондонские евреи-ашкенази | 2.4 |
Мексика Местис | 2.4 |
Саудовская Аравия Гурайат и… | 2.4 |
Китай Пекин | 2.2 |
Финляндия | 2.2 |
Уганда Кампала | 2.2 |
Россия Тува поп 2 | 2.1 |
США Уроженец Северной Америки… | 2.1 |
Бразилия | 2.0 |
Камерун Бети | 2.0 |
Перу Арекипа | 2.0 |
Россия Архангельск Поморы | 2.0 |
Италия Северная поп 1 | 1.9 |
Россия Северо-Запад | 1.8 |
Немецкий Эссен | 1.8 |
Испания Пас Вэлли | 1.6 |
США Африканская Америка | 1.6 |
Тунис | 1.5 |
Грузия Сванети Сваны | 1.3 |
Новая Каледония | 1.2 |
Южная Африка Тсвана | 1.2 |
Частоты аллелей представлены, только |
A32 наиболее распространен в районе Персидского залива и Средиземноморского бассейна. Он имеет постоянное присутствие в Европе. Частота встречаемости A32 у более изолированных (генетически) народов Европы предполагает, что рост A32 в Средиземном море может быть лишь частично связан с недавними миграциями из ближневосточного региона. В южной части Европы есть узел вокруг Ионического моря, в котором повышены специфические европейские гаплотипы A32.
Гаплотипы
частота | ||
исх. | численность населения | (%) |
A32-B7 (A * 3201: B * 0702) | ||
албанский | 2.2 | |
Кубинец | 1.9 | |
[5] | Натал Зулу (Южная Африка) | 1.0 |
Критский | 0.7 | |
Критский | 0.2 | |
A32-B8 (A * 3201: B * 0801) | ||
Северная Португалия | 2.2 | |
Оман | 1.8 | |
A32-B14 (A * 3201: B * 14) | ||
! кунг | 1.9 | |
Тунис | 1.8 | |
Натал Зулу (Южная Африка) | 1.0 | |
Португалия | 1.1 | |
Ирландский | 0.7 | |
Итальянский | 0.6 | |
A32-B27 (A * 3201: B27) | ||
Цыганский (испанский) | 6.0 | |
E Черное море (Турция) | 2.3 | |
Немецкий | 0.3 | |
A32-B35 (A * 3201: C * 0401: B * 3501) | ||
Греческий | 3.5 | |
UA Эмираты | 2.8 | |
Сардинский | 2.6 | |
Брахуи (Пакистан) | 2.5 | |
Тунис | 1.8 | |
Армянский | 1.7 | |
Итальянский | 1.5 | |
Оман | 1.3 | |
Португалия | 1.1 | |
Немецкий | 0.3 | |
A32-B61 (40) (A * 3201: B * 40) | ||
Тунис | 1.2 | |
Греческий | 1.2 | |
Французский | 0.6 | |
Немецкий | 0.4 | |
A32-B44 (A * 3201: B * 4402) | ||
Австрийский | 2.4 | |
Бельгия | 2.0 | |
албанский | 1.8 | |
Южная Португалия | 1.0 | |
Ирландский | 0.7 | |
Немецкий | 0.6 | |
нидерландский язык | 0.6 | |
Сенегал | 0.5 | |
Итальянский | 0.4 | |
A32-B51 (A * 3201: C * 1201: B * 5101) | ||
болгарский | 1.8 | |
Немецкий | 0.3 | |
(A * 3201: C * 1502: B * 5101) | ||
Оман | 5.0 | |
Белудж (Пакистан) | 3.2 | |
Калаш | 2.9 | |
UA Эмираты | 1.9 | |
Белудж (Иран) | 1.1 | |
(A * 3201: C * 1401: B * 5101) | ||
Парсы (Карачи) | 4.9 | |
Калаш | 2.9 |
Общий гаплотип A32 A * 3201-B * 5101 можно найти в Омане, Объединенных Арабских Эмиратах, юго-восточной части Ирана, Болгарии и Португалии. Второй, A * 3201-B * 3501, может находиться в Омане, ОАЭ и Португалии.
Рекомендации
- ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены. 11 (2): 96–112. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID 77067.
- ^ Аллельная форма запроса IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Тан Т.Ф., Хоу Л., Ту Б. и др. (2006). «Идентификация девяти новых аллелей HLA класса I у добровольцев из реестров доноров стволовых клеток Сингапура». Тканевые антигены. 68 (6): 518–20. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2006.00707.x. PMID 17176443.
- ^ Миддлтон, Д .; Menchaca, L .; Rood, H .; Комеровский, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net». Тканевые антигены. 61 (5): 403–407. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660.
- ^ В * 0705