HLA-A80 - HLA-A80
HLA-A80 | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
(MHC Класс I, А антиген клеточной поверхности) | ||||||||||||||||
HLA-A80 | ||||||||||||||||
Около | ||||||||||||||||
Протеин | трансмембранный рецептор /лиганд | |||||||||||||||
Структура | αβ гетеродимер | |||||||||||||||
Подразделения | HLA-A *8001, β2-микроглобулин | |||||||||||||||
Старые имена | AX "BG" | |||||||||||||||
Подтипы | ||||||||||||||||
| ||||||||||||||||
Ссылка на все аллели на IMGT / HLA база данных в EBI |
HLA-A80 (A80) - это человеческий лейкоцитарный антиген серотип в HLA-A группа серотипа. Серотип определяется по распознаванию антителом α80 подмножество α-цепей HLA-A. Для A80 альфа-цепочка "A" кодируется HLA-A*80 аллельная группа и β-цепь кодируются B2M локус.[1] В настоящее время в этой группе преобладает A * 8001. A80 и A*80 почти синонимы по смыслу.
A80 чаще встречается в Западной Центральной Африке. A80 - наименее распространенная группа аллелей HLA-A.
Серотип
А * 80 | A80 | А10 | Образец |
аллель | % | % | размер (N) |
*8001 | 36 | 10 | 505 |
A80 HLA-A80 плохо набирает. Большая часть типирования выполняется с помощью SSP-PCR. Большинство 8001 обнаруживается с "пустым" серотипом.
Распределение
Изучение населения | Freq. (в %)[3] |
---|---|
Сенегал Ниохоло Манденка | 3.8 |
Замбия Лусака | 2.3 |
Камерун Бамилеке | 1.9 |
Мали Бандиагара | 1.5 |
Южная Африка Тсвана | 1.2 |
Испания Менорка | 1.1 |
Камерунский пигмей бакола | 1.0 |
Буркина-Фасо Фулани | 1.0 |
Тринидадские африканцы | 1.0 |
Тунис | 1.0 |
Болгария | 0.9 |
Кабо-Верде Юго-восток I… | 0.8 |
Гвинея-Бисау | 0.8 |
Афроамериканцы США | 0.8 |
Перу Арекипа | 0.7 |
Индейка I класса | 0.7 |
Камерун Бети | 0.6 |
Испания Каталония Жирона | 0.6 |
Кавказцы США (3) | 0.6 |
Бразилия | 0.5 |
Бразилия Белу-Оризонти | 0.5 |
Бразилия Штат Пернамбуку | 0.5 |
Хорватия pop2 | 0.5 |
Гватемала Майя | 0.4 |
Монголия Бурят | 0.4 |
Частоты аллелей представлены, только |
дальнейшее чтение
- Торимиро Дж. Н., Карр Дж. К., Вулф Н. Д. и др. (2006). «Разнообразие HLA класса I среди жителей сельских тропических лесов Камеруна: идентификация гаплотипа A * 2612-B * 4407». Тканевые антигены. 67 (1): 30–7. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2005.00527.x. PMID 16451198.
- Санчес-Мазас A, Штайнер QG, Grundschober C, Tiercy JM (октябрь 2000 г.). «Молекулярное определение аллелей HLA-Cw в Манденке (Западная Африка) показывает тесную генетическую связь между африканцами и европейцами». Тканевые антигены. 56 (4): 303–12. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2000.560402.x. PMID 11098930.
- Цао К., Мурманн А.М., Лайк К.Е. и др. (Апрель 2004 г.). «Дифференциация африканских популяций подтверждается разнообразием аллелей и гаплотипов локусов HLA класса I». Тканевые антигены. 63 (4): 293–325. Дои:10.1111 / j.0001-2815.2004.00192.x. PMID 15009803.
- Торимиро Дж. Н., Карр Дж. К., Вулф Н. Д. и др. (Январь 2006 г.). «Разнообразие HLA класса I среди жителей сельских тропических лесов Камеруна: идентификация гаплотипа A * 2612-B * 4407». Тканевые антигены. 67 (1): 30–7. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2005.00527.x. PMID 16451198.
- Креспи С., Мила Дж., Мартинес-Помар Н. и др. (Октябрь 2002 г.). «Полиморфизм HLA у населения Майорки еврейского происхождения: сравнение с Майоркой, Меноркой, Ибицей (Балеарские острова) и другими еврейскими общинами». Тканевые антигены. 60 (4): 282–91. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2002.600402.x. PMID 12472657.
Рекомендации
- ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены. 11 (2): 96–112. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID 77067.
- ^ Аллельная форма запроса IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Миддлтон, Д .; Menchaca, L .; Rood, H .; Комеровский, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net». Тканевые антигены. 61 (5): 403–407. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660.