HLA-A34 - HLA-A34

HLA-A34
(MHC Класс I, А антиген клеточной поверхности)
Иллюстрация HLA-A.png
HLA-A34
О
Протеинтрансмембранный рецептор /лиганд
Структураαβ гетеродимер
ПодразделенияHLA-A *34--, β2-микроглобулин
Старые именаA10
Подтипы
Подтип
аллель
Доступные конструкции
A34.1*3401
A34.2*3402
{{{cNick3}}}* 34 {{{cAllele3}}}
{{{cNick4}}}* 34 {{{cAllele4}}}
Ссылка на все аллели на IMGT / HLA база данных в EBI

HLA-A34 (A34) - это человеческий лейкоцитарный антиген серотип в HLA-A группа серотипа. Серотип определяется по распознаванию антителом α34 подмножество α-цепей HLA-A. Для A34 альфа-цепь "A" кодируется HLA-A.*34 аллельная группа и β-цепь кодируются B2M локус.[1] A34 и A*34 почти синонимичны по значению. A34 - это расщепленный антиген из широкий антиген серотип A10. A34 - сестринский серотип A25A26A43, иA66.

A34 больше всего похож на A66..

Серотип

Распознавание A34 некоторых продуктов гена HLA A * 34[2]
А * 34A34А10Образец
аллель%%размер (N)
*3401675269
*3402892996

Серотипирование A34 скромное ..

Частоты аллеля A34

А * 3401

HLA A * 3401 частоты
частота
исх.численность населения(%)
[3]Кимберли (Индиг. Австрия)68.1
[3]Юендуму (Индиг. Австралия)44.0
[3]Гроот Эйландт (Индиг. Австралия)32.0
[3]Рабаул (Новая Британия, PNG)30.2
[3]Западные хребты Шредера (PNG)29.2
[3]Кейп-Йорк-Пенин. (Индиг. Austr.)29.1
[3]Ами (Индиг. Тайвань)21.9
[3]Горока (Э. Хайлендс, PNG)20.5
[3]Новая Каледония15.5
[3]Маданг (PNG)13.6
[3]Иватан (Северные острова, Филиппины)13.0
[3]Ванигела (PNG)12.7
[3]американское Самоа10.0
[3]Восера (PNG)9.0
[3]Риау малайский (Сингапур)6.0
[3]Плато Каримуи (PNG)4.8
[3]Пуюма (Индиг. Тайвань)4.0
[3]Яванский (Сингапур)3.0
[3]Испания Каталония Жирона1.1
[3]Тайский (Сингапур)1.0
[3]Пайвань (Индиг. Тайвань)1.0
[3]Тайваньская хакка0.9
[3]Кения0.7
[3]Таиланд0.7
[3]Китай Южный Хан0.5
[3]Индия Северный Дели0.5
[3]Китайский (Гонконг)0.3
[3]Китайский (Сингапур)0.3
[3]Зимбабве Хараре Шона0.2

A * 3401 при обнаружении за пределами Африка в основном встречается в Южная Азия, Austronesia и южной / центральной части Западно-Тихоокеанский регион (WPR). Похоже, он добрался до Восточного Тайвань коренные племена (ами, Ями ), но не севернее этого региона. Он не обнаружен ни в одной выборке Япония. На большей части территории Восточно-Тихоокеанского региона, где он встречается, он ограничен 1 или 2 обычными гаплотипы в сильном неравновесном сцеплении. Это указывает на то, что его присутствие в регионе WPR является результатом недавних миграций.[4]

Миграция A * 3401 из Африки поддерживается его присутствием в Восточная Африка и Южная Африка и текущими моделями человеческая миграция, этот аллель, вероятно, был представлен у иммигрантов первой волны. Однако в районах, где обычно встречаются смеси этих аллелей, Персидский залив В регионе и Индии A * 3401 относительно редко встречается, встречается редко или отсутствует. Исключение составляет Саудовская Аравия, в котором A34 составляет 2,8% и среди Израильские евреи на 8,8%. Некоторые сообщают, что и A * 3401, и A * 3402 находятся в этом регионе, но сомнительно, что они поддерживаются постоянно. аллель частоты просто недавние мигранты.

А * 3402

HLA A * 3402 частоты
частота
исх.численность населения(%)
[3]Натал Зулу (Южная Африка)5.5
[3]Гвинея-Бисау5.4
[3]Бандиагара (Мали)3.6
[3]Шона (Зимбабве)3.3
[3]Кения2.8
[3]Тунис Тунис2.8
[3]Уганда Кампала2.8
[3]Камерун Бамилеке2.6
[3]Сенегал Ниохоло Манденка2.2
[3]Марокко Надор Металса2.1
[3]Замбия Лусака1.2
[3]Суданский1.0
[3]Израильские арабские друзы0.5
[3]Юго-Восток Франции0.4
[3]Иордания Амман0.3
[3]Англия Ланкастер0.1
[3]Ирландия Северная0.1

A * 3402 чаще встречается на западе, он встречается в Иберии и вдоль Средиземного моря, но его частота невысока, за исключением Леванта, но неясно, является ли это A * 3401 или A * 3402.

Гаплотипы A34-B

A34 находится в состоянии сильного неравновесия по связям во многих регионах мира, но особенно в Азии и Европе. Океания. Наиболее заметным из этих гаплотипов является A34-Cw11 (1) -B56. Этот гаплотип находится из Западная Австралия в Тайвань в Новая Зеландия что указывает на недавнюю генетическую связь между этими народами.

Другой часто встречающийся гаплотип - это гаплотип A34-B61 (A * 3401: Cw * 04: B * B4002). Этот гаплотип имеет такое же распределение, как A34-B56.

Эти гаплотипы указывают на то, что в доисторические времена австронезии (поздний палеолит) происходили дальние / наблюдающие миграции.

HLA A34-Cw11-B56
A * 3401: Cw * 0102: B * 5601
частота
исх.численность населения(%)
[3]Ами (Индиг. Тайвань)19.9
Горцы (PNG)10.6
Маори (Новая Зеландия)5.6
Коренная Австралия4.1
[3]Пуюма (Индиг. Тайвань)4.0

Рекомендации

  1. ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены. 11 (2): 96–112. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID  77067.
  2. ^ Аллельная форма запроса IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
  3. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль являюсь ан ао ap водный ар в качестве в au средний Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Н., Комеровски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей». Тканевые антигены. 61 (5): 403–407. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID  12753660.
  4. ^ Пробст, К. (2000). «Полиморфизм HLA и оценка вклада европейцев, африканцев и индейцев в популяцию белых и мулатов». Человеческая биология. 72 (4): 597–617. JSTOR  41465861. PMID  11048789.