HLA-A69 - Википедия - HLA-A69

HLA-A69
(MHC Класс I, А антиген клеточной поверхности)
Иллюстрация HLA-A.png
HLA-A69
О
Протеинтрансмембранный рецептор /лиганд
Структураαβ гетеродимер
ПодразделенияHLA-A *69--, β2-микроглобулин
Старые именаA28
Подтипы
Подтип
аллель
Доступные конструкции
A69*6901
{{{cNick2}}}* 69 {{{cAllele2}}}
{{{cNick3}}}* 69 {{{cAllele3}}}
{{{cNick4}}}* 69 {{{cAllele4}}}
Ссылка на все аллели на IMGT / HLA база данных в EBI

HLA-A69 (A69) - это человеческий лейкоцитарный антиген серотип в HLA-A группа серотипа. Серотип определяется по распознаванию антителом α69 подмножество α-цепей HLA-A. Для A69 альфа-цепь "A" кодируется HLA-A*69 аллельная группа и β-цепь кодируются B2M локус.[1] В настоящее время в этой группе преобладает A * 6901. A69 и A*69 почти синонимы по значению. A69 - это расщепленный антиген из широкий антиген серотип A28. A69 является сестринским серотипом A68.

Дальнейшая информация: История и название лейкоцитарных антигенов человека

A69 чаще встречается в Леванте. A69 (A * 6901) является производным аллеля A * 6801, который подвергся преобразование гена с A * 02. Рекомбинация произошла не более 330000 лет назад.[2].

Серотип

Распознавание A69 некоторых продуктов гена HLA A * 69[3]
А * 69A69А28А68А2Образец
аллель%%%%размер (N)
*690175636289

A69 является плохим, с низкой специфичностью обнаружения, высокой неспецифической идентификацией A28 и ложным распознаванием A68 и A2.

Распределение

HLA A * 6901 частоты
частота
исх.численность населения(%)
[4]North Isl. (Кабо-Верде)4.0
[5]Друзово-арабский (Израиль)3.0
[4]Южный о. (Кабо-Верде)2.4
[6]Мосси (Буркино-Фасо)1.9
[7]Болгария1.8
[8]Еврей (Израиль)1.2
[9]Тунис)1.1
[10]Бергамо (Италия)1.1
[11]Н. Дели (Индия)1.1
[12]Амман (Иордания)1.0
[13]Сардиния (Италия)1.0
[14]Центральная Португалия1.0
[14]Шанхай, Китай)0.7
[15]Жирона (Каталон, Испания)0.6
[16]Белудж (Иран)0.6
[14]Греция0.6
[14]Чешский0.5
[14]ЮВ Франция0.4
[17]Кампала (Уганда)0.3
[14]Северная Греция0.3
[14]Румыния0.3
[14]Суданский0.25
[14]U. Arab Emerates0.25
[14]Япония0.0
[14]Хорватия0.0
[14]Северная Ирландия0.0
[14]Замбия0.0
[14]Луо (Кения)0.0
[14]Нанди (Кения)0.0
[14]Бандиагара (Мали)0.0

Распределение A69 помещает узловой центр в Левант, но высокие уровни в Западная Африка. Модель генетического происхождения человека указывает на первые миграции из Восточной Африки. Однако во многих популяциях Восточной Африки частота A69 равна нулю. Более последовательной моделью распределения A69 является либо последующая миграция из Западной Африки, поддерживаемая A36 и HLA DR3-DQ2. Более высокие уровни в Газа Палестинцы поддерживают эту гипотезу.

Ассоциации болезней

A69 может быть связан с саркоидоз.[18]

Рекомендации

  1. ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены. 11 (2): 96–112. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID  77067.
  2. ^ Холмс Н., Пархэм П. (1985). «Перестановка экзонов in vivo может генерировать новые молекулы HLA класса I». EMBO J. 4 (11): 2849–2854. ЧВК  554588. PMID  3877632.
  3. ^ Аллельная форма запроса IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
  4. ^ а б Спинола Х, Брюгге-Армас Дж, Миддлтон Д., Брем А (2005). «Полиморфизмы HLA в Кабо-Верде и Гине-Бисау, выведенные из типизации на основе последовательностей». Гм. Иммунол. 66 (10): 1082–1092. Дои:10.1016 / j.humimm.2005.09.001. PMID  16386651.
  5. ^ Материалы семинара IHW, Сиэтл, 2002 г., через http://www.allelefrequencies.net через Миддлтон, Д .; Menchaca, L .; Rood, H .; Комеровский, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net». Тканевые антигены. 61 (5): 403–407. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID  12753660.
  6. ^ Модиано Д., Луони Г., Петрарка В. и др. (2001). «Класс HLA I в трех западноафриканских этнических группах: генетические расстояния от популяций южнее Сахары и европеоидов». Тканевые антигены. 57 (2): 128–137. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2001.057002128.x. PMID  11260507.
  7. ^ Иванова М, Роземуллер Э, Тюфекчиев Н, Михайлова А, Тиланус М, Наумова Э (2002). «Полиморфизм HLA у болгар, определенный методами типирования с высоким разрешением, по сравнению с другими популяциями». Тканевые антигены. 60 (6): 496–504. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2002.600605.x. PMID  12542743.
  8. ^ Maccabi Healthcare Services Департамент гистосовместимости, Израиль, регистр костного мозга, через http://www.allelefrequencies.net
  9. ^ Hajjej A, Kâabi H, Sellami MH, et al. (2006). «Вклад аллелей и гаплотипов HLA I и II класса в исследование эволюционной истории тунисцев». Тканевые антигены. 68 (2): 153–162. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2006.00622.x. PMID  16866885.
  10. ^ DW, Gjertson; П.И., Терасаки (1998). HLA 1998: материалы двенадцатого Международного семинара и конференции по гистосовместимости. ASHI. через http://www.allelefrequencies.net
  11. ^ Рани Р., Маркос К., Лазаро А.М., Чжан Ю., Стастны П. (2007). «Молекулярное разнообразие аллелей HLA-A, -B и -C в популяции Северной Индии, как определено с помощью PCR-SSOP». Int. J. Immunogenet. 34 (3): 201–208. Дои:10.1111 / j.1744-313X.2007.00677.x. PMID  17504510.
  12. ^ Санчес-Веласко П., Карадшех Н.С., Гарсия-Мартин А., Руис де Алегрия С., Лейва-Кобиан Ф. (2001). «Молекулярный анализ частот аллелей и гаплотипов HLA у иорданцев и сравнение с другими родственными популяциями». Гм. Иммунол. 62 (9): 901–909. Дои:10.1016 / S0198-8859 (01) 00289-0. PMID  11543892.
  13. ^ Гримальди М.С., Кроу-Рой Б., Аморос Дж. П. и др. (2001). «Острова Западного Средиземноморья (Корсика, Балеарские острова, Сардиния) и баскское население: вклад молекулярных маркеров HLA класса I в их эволюционную историю». Тканевые антигены. 58 (5): 281–292. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2001.580501.x. PMID  11844138.
  14. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п Миддлтон, Д .; Menchaca, L .; Rood, H .; Комеровский, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net». Тканевые антигены. 61 (5): 403–407. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID  12753660.
  15. ^ Комас Д., Матеу Э., Калафель Ф. и др. (1998). «Типирование ДНК HLA класса I и класса II и происхождение басков». Тканевые антигены. 51 (1): 30–40. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1998.tb02944.x. PMID  9459501.
  16. ^ Фарджадиан С., Нарус Т., Кавата Х., Гадери А., Бахрам С., Иноко Х. (2004). «Молекулярный анализ частот и гаплотипов аллелей HLA у белуджей в Иране по сравнению с родственными популяциями Пакистана». Тканевые антигены. 64 (5): 581–587. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2004.00302.x. PMID  15496201.
  17. ^ Цао К., Мурманн А.М., Лайк К.Е. и др. (2004). «Дифференциация африканских популяций подтверждается разнообразием аллелей и гаплотипов локусов HLA класса I». Тканевые антигены. 63 (4): 293–325. Дои:10.1111 / j.0001-2815.2004.00192.x. PMID  15009803.
  18. ^ Билир М., Сипахи С., Йилмаз Э. и др. (2007). «Анализ антигенов HLA у пациентов с турецким саркоидозом». Юг. Med. J. 100 (4): 356–359. Дои:10.1097 / SMJ.0b013e31802f3763. PMID  17458393.