Гаплогруппа L5 (мтДНК) - Википедия - Haplogroup L5 (mtDNA)

Гаплогруппа L5
Возможное время происхождения114,200-126,200 YBP[1]
Возможное место происхожденияВосточная Африка, Долина Верхнего Нила
ПредокL2-6
ПотомкиL5a, L5c
Определение мутаций3423, 7972, 12432, 12950[2]

Гаплогруппа L5 это митохондриальная ДНК человека (мтДНК) клады. Ранее он был известен как L1e.

Источник

Распределение

L5 - небольшая гаплогруппа с центром в Восточная Африка. Самая высокая частота в Мбути Пигмеи из восточной части Центральной Африки - 15%.[3]Он присутствует в относительно небольших частотах в Танзании (Сандаве и другие), Кения, Эфиопия, Судан, Нубия, Египет[4][Примечание 1] и Саудовская Аравия.[5]

Гаплогруппа L5 обнаружена среди особей на островном кладбище в г. Кулубнарти, Судан, которые датируются раннехристианским периодом (550–800 гг. н. э.).[6]

Субклады

Дерево

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы L5 основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека[2] и последующие опубликованные исследования.

  • Самый последний общий предок (MRCA)
    • L1-6
      • L2-6
        • L5
          • L5a
            • L5a1
              • L5a1a
              • L5a1b
              • L5a1c
            • L5a2
          • L5c
            • L5c1
            • L5c2

Рекомендации

  1. ^ Соарес, P; Эрмини, L; Томсон, Н. Мормина, М; Рито, Т; Рёль, А; Салас, А; Оппенгеймер, S; Маколей, V (2009). «Поправка на очищающий отбор: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека». Американский журнал генетики человека. 84 (6): 740–59. Дои:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. ЧВК  2694979. PMID  19500773.
  2. ^ а б ван Овен, Маннис; Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация. 30 (2): E386 – E394. Дои:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749. Архивировано из оригинал 4 декабря 2012 г.. Получено 2009-05-20.
  3. ^ Сара А. Тишкофф и др. 2007 г., История щелкающих популяций Африки на основе генетической изменчивости мтДНК и Y-хромосомы. Молекулярная биология и эволюция 2007 24 (10): 2180-2195
  4. ^ Стеванович, А; А. Жиль; Э. Бузаид; Р. Кефи; Ф. Пэрис; Р. П. Гейро; Дж. Л. Спадони; Ф. Эль-Ченауи; Э. Беро-Коломб (29 января 2004 г.). «Разнообразие последовательностей митохондриальной ДНК у оседлого населения из Египта». Анналы генетики человека. 68 (1): 23–39. Дои:10.1046 / j.1529-8817.2003.00057.x. PMID  14748828. S2CID  44901197.
  5. ^ Абу-Амеро и др. 2008 Февраль. «Структура митохондриальной ДНК на Аравийском полуострове», BMC Evolutionary Biology. 8 (45): 52.
  6. ^ Сирак, Кендра; Френандес, Даниэль; Новак, Марио; Ван Гервен, Деннис; Пинхаси, Рон (2016). Тезисы докладов Межконгресса IUAES 2016 - Сообщество разделилось? Выявление генома (ов) сообщества средневековой Кулубнарти с помощью секвенирования следующего поколения. IUAES.CS1 maint: использует параметр авторов (связь)

Примечания

  1. ^ Образец UPE52 является субкладом L5a.

внешняя ссылка

Филогенетическое дерево гаплогруппы митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

 Митохондриальная Ева (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEграммQ ОАSр яWИксY
CZBFR0 pre-JT п U
HVJTK
ЧАСVJТ