Гаплогруппа митохондриальной ДНК человека - Human mitochondrial DNA haplogroup

Распределение современных гаплогрупп мтДНК человека на основе анализа 2054 человек из 26 популяций.[1] (а) Круговые диаграммы на карте. (б) Количество гаплогрупп в табличном формате. Подробнее о населении см. Проект 1000 Genomes # образцы генома человека.

В генетика человека, а гаплогруппа митохондриальной ДНК человека это гаплогруппа определяется различиями в митохондриальная ДНК человека. Гаплогруппы используются для обозначения основных точек ветвления на митохондриальном филогенетическом дереве. Понимание эволюционного пути женского происхождения помогло популяционным генетикам проследить по материнской линии наследование современного человека обратно к человеческому происхождению в Африка и последующее распространение по всему миру.

Буквенные названия гаплогрупп (не только гаплогрупп митохондриальной ДНК) идут от А до Я. Поскольку гаплогруппы были названы в порядке их открытия, алфавитный порядок не имеет никакого значения с точки зрения реальных генетических отношений.

Гипотетическая женщина в основе всех этих групп (имеется в виду только гаплогруппы митохондриальной ДНК) - это по материнской линии самый последний общий предок (MRCA) за все живущие сейчас люди. Ее обычно называют Митохондриальная Ева.

Скорость мутации митохондриальной ДНК известна как митохондриальные молекулярные часы. Это область продолжающихся исследований, в одном исследовании сообщается об одной мутации за 8000 лет.[2]

Филогения

Дальнейшая информация: Молекулярная филогения
Дерево гаплогрупп мтДНК и карта распространения.[3] Цифры представляют собой метки гаплогрупп, сообщенные в соответствии с http://www.phylotree.org/ номенклатура,[4] и указать местоположение одной из мутаций, приводящих к производному гаплотипу. (Показан только один маркер, определяющий ветвь, предпочтительно из области кодирования.) Основные географические особенности распределения гаплогрупп выделены цветом.
Часть серия на
Генетическая генеалогия
Концепции
похожие темы

Это филогенетическое древо основано Ван Овеном (2009).[4]

Хронология

Дальнейшая информация: Митохондриальные молекулярные часы человека
Расчетная карта мира миграции людей на основе гаплогрупп мтДНК.
ГаплогруппаСтандартное восточное время. время отправления (кя)[5]Возможное место происхожденияСамые высокие частоты
L200
L1-6170Восточная Африка
L2-6150Восточная Африка
L0150Восточная Африка
L1140Центральная Африка
L3-6130
L5120
L290
L370Восточная Африка
N70Восточная Африка или Западная Азия
M60Восточная Африка, Западная Азия или Южная Азия
р60
U55Северо-Восточная Африка или Индия (Южная Азия)
RT'JT55Средний Восток
JT50Средний Восток
U850Западная Азия
R947
B444
F43
U4'942Центральная Азия
U535Западная Азия
U635Северная Африка
J35
Икс30
K30
U5a27
HV27Ближний Восток
J1a27Ближний Восток
Т27Месопотамия
K127
я26
J124Ближний Восток
W20
U420Центральная Азия
X220
ЧАС20Западная Азия
U5a118Европа
J1b11
V14
X2a13Северная Америка
H112
H312
X110

Географическое распределение

В документе 2004 года было высказано предположение, что наиболее распространенными гаплогруппами в современных европейских популяциях были: H, J, K, N1, T, U4, U5, V, X и W.[6]

Африканские гаплогруппы: L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, T, U5a

Австралийские гаплогруппы: M42a, M42c, M14, M15, Q, S, O, N, P. (ссылки 1, 2, 3, 4, 5, 6)

Азиатские гаплогруппы: F, C, W, M, D, N, K, U, T, A, B, C, Z, U множество вариантов номеров для каждого раздела

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Ришишвар Л., Джордан И.К. (2017). «Последствия эволюции человека и добавки для митохондриальной заместительной терапии». BMC Genomics. 18 (1): 140. Дои:10.1186 / s12864-017-3539-3. ЧВК  5299762. PMID  28178941.
  2. ^ Лоогвали, Ева-Лиис; Кивисилд, Тоомас; Маргус, Тыну; Виллемс, Ричард (2009), О'Рурк, Деннис (редактор), «Объяснение несовершенства молекулярных часов митохондрий гоминидов», PLOS ONE, 4 (12): e8260, Bibcode:2009PLoSO ... 4.8260L, Дои:10.1371 / journal.pone.0008260, ЧВК  2794369, PMID  20041137
  3. ^ Кивисилд Т (2015). «Материнское происхождение и история популяции из целых митохондриальных геномов». Исследование Genet. 6: 3. Дои:10.1186 / s13323-015-0022-2. ЧВК  4367903. PMID  25798216.
  4. ^ а б ван Овен М., Кайзер М. (февраль 2009 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация. 30 (2): E386–94. Дои:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749.
  5. ^ «Поправка на очищающий отбор: Дополнение к усовершенствованным митохондриальным молекулярным часам человека» (PDF). 2009: 82–83 [89]. Архивировано из оригинал (PDF) на 2009-12-29. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  6. ^ Виллемс, Ричард; Усанга, Эсиен; Микерези, Илья; Гельге, Мукаддес; Клаустр, Мирей; Michalodimitrakis, Emmanuel N .; Папа, Каллиопи I .; Anagnou, Николас П .; Шавентре, Андре; Мойзан, Жан-Поль; Ричард, Кристель; Гречанина, Елена; Балановская, Елена В .; Рудан, Павао; Пузырев, Валерий; Степанов, Вадим; Хуснутдинова, Эльза К .; Гусар, Владислава; Балановский, Олег П .; Перичич, Марияна; Барак, Ловорка; Голубенко, Мария; Лункина, Арина; Лаос, Сирль; Пеннарун, Эрван; Парик, Юри; Толк, Хелле-Вийви; Рейдла, Маэре; Тамбец, Кристина; Мецпалу, Эне; Кивисилд, Тоомас; Деренко, Мирослава В .; Малярчук, Борис А .; Роосталу, Урмас; Лоогвяли, Ева-Лийс (1 ноября 2004 г.). «Разъединяющая однородность: пестрый кладистический холст гаплогруппы H мтДНК в Евразии». Молекулярная биология и эволюция. 21 (11): 2012–2021. Дои:10.1093 / молбев / мш209. PMID  15254257 - через Acade.oup.com.

внешняя ссылка

Филогенетическое дерево гаплогруппы митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

 Митохондриальная Ева (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEграммQ ОАSр яWИксY
CZBFR0 pre-JT п U
HVJTK
ЧАСVJТ